logo

Genes within 1Mb (chr1:64338058:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 4.55e-02 0.211 0.105 0.143 B L1
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0903 0.11 0.143 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 3.03e-02 0.262 0.12 0.143 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 6.40e-01 -0.035 0.0747 0.143 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 1.38e-01 0.184 0.124 0.143 B L1
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 6.46e-02 0.169 0.0912 0.143 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 4.58e-01 0.0754 0.101 0.143 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 3.78e-02 0.244 0.117 0.143 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -132071 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0598 0.0701 0.143 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 2.57e-02 -0.163 0.0727 0.143 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 6.77e-01 0.0441 0.106 0.143 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 2.78e-02 0.221 0.0998 0.143 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 1.14e-01 0.176 0.111 0.143 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 3.00e-01 0.124 0.119 0.143 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -132071 sc-eQTL 1.31e-01 -0.0915 0.0603 0.143 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 4.16e-03 -0.271 0.0937 0.143 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 7.41e-02 0.213 0.118 0.143 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 4.93e-01 0.0768 0.112 0.142 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 3.72e-01 -0.103 0.115 0.142 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 5.80e-01 0.0717 0.129 0.142 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -809491 sc-eQTL 4.84e-02 0.202 0.102 0.142 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 9.58e-01 0.00445 0.0854 0.142 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -407037 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0901 0.109 0.142 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 7.31e-02 0.202 0.112 0.142 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 3.94e-01 0.0945 0.111 0.143 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 2.29e-02 -0.262 0.114 0.143 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 5.17e-02 0.231 0.118 0.143 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -809491 sc-eQTL 4.23e-01 0.0902 0.112 0.143 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0307 0.0803 0.143 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 9.26e-02 0.158 0.0933 0.144 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 9.46e-01 0.0074 0.11 0.144 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 9.51e-01 0.00744 0.121 0.144 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 1.08e-01 -0.0904 0.056 0.144 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 6.05e-01 0.0681 0.131 0.144 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 5.42e-01 0.0656 0.107 0.143 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0496 0.108 0.143 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00972 0.0846 0.143 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0115 0.0819 0.143 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -407037 sc-eQTL 2.35e-02 0.268 0.118 0.143 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0357 0.13 0.143 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 4.55e-02 0.283 0.14 0.148 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 8.66e-02 -0.233 0.135 0.148 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 3.22e-01 0.129 0.13 0.148 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0238 0.13 0.148 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0495 0.123 0.148 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 2.09e-01 0.158 0.126 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 5.28e-01 0.0808 0.128 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 1.47e-01 0.179 0.123 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0107 0.106 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 2.42e-01 0.143 0.122 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 3.59e-02 0.263 0.124 0.144 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 1.46e-01 0.186 0.127 0.144 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 3.50e-01 0.122 0.13 0.144 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 1.22e-01 0.167 0.108 0.144 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00101 0.129 0.144 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 4.45e-01 0.0953 0.124 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 9.59e-01 0.00647 0.125 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 4.48e-02 0.245 0.121 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 2.73e-01 -0.104 0.0945 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 5.77e-02 0.247 0.13 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 5.08e-01 0.0818 0.123 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 7.77e-03 -0.34 0.127 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 8.58e-02 0.221 0.128 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 1.97e-01 -0.129 0.0998 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 7.26e-01 -0.045 0.129 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 2.92e-01 0.132 0.125 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 2.57e-01 0.15 0.132 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 1.80e-01 -0.172 0.128 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -132071 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0498 0.0465 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 3.18e-01 -0.115 0.115 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0395 0.122 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 3.29e-01 0.101 0.103 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 2.56e-01 0.127 0.112 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 2.24e-02 0.27 0.117 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -132071 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0678 0.0703 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 3.35e-02 -0.152 0.0711 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 7.27e-01 0.0413 0.118 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 1.23e-02 0.267 0.106 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 4.88e-01 0.0867 0.125 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 5.03e-01 0.0851 0.127 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -132071 sc-eQTL 9.56e-01 0.00553 0.101 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 1.71e-01 -0.113 0.082 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 5.43e-02 0.236 0.122 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0701 0.125 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0214 0.126 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 2.18e-01 0.152 0.123 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -132071 sc-eQTL 2.28e-01 0.0919 0.076 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 1.37e-01 -0.161 0.108 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0472 0.128 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 5.71e-01 0.0657 0.116 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 5.40e-01 0.0755 0.123 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 2.64e-01 0.144 0.129 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -132071 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0599 0.0547 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0493 0.102 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 1.61e-01 0.185 0.132 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 2.00e-01 0.149 0.116 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 1.28e-01 0.183 0.12 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 5.27e-01 0.0766 0.121 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -132071 sc-eQTL 7.14e-02 -0.151 0.0832 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 5.08e-04 -0.346 0.098 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 9.39e-01 0.00875 0.114 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 4.15e-01 0.103 0.126 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 4.37e-01 0.0996 0.128 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 8.66e-01 -0.021 0.124 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -132071 sc-eQTL 8.68e-01 0.0108 0.0653 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 2.77e-01 -0.114 0.105 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 3.02e-01 0.131 0.126 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 2.64e-01 0.147 0.131 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 1.40e-01 0.195 0.131 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 6.64e-01 0.058 0.133 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -132071 sc-eQTL 1.13e-01 0.0429 0.027 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 2.12e-01 -0.16 0.128 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 1.16e-01 0.203 0.128 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 7.30e-01 0.0426 0.123 0.145 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 7.63e-01 0.0369 0.122 0.145 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 8.24e-01 0.0276 0.124 0.145 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 2.53e-01 0.128 0.111 0.145 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -407037 sc-eQTL 1.64e-02 0.284 0.117 0.145 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 1.00e+00 2.4e-05 0.127 0.145 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 7.79e-01 0.0353 0.126 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 7.20e-02 -0.231 0.128 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0474 0.13 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 7.90e-01 0.0218 0.0819 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 2.66e-01 0.143 0.128 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 6.82e-02 0.178 0.0974 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 3.35e-01 0.12 0.124 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 8.92e-01 0.0171 0.125 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 7.72e-02 -0.117 0.0656 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 4.33e-01 0.106 0.135 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 4.72e-01 0.0982 0.136 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 7.36e-01 0.0477 0.141 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0199 0.132 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 4.48e-01 0.067 0.0882 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 9.92e-01 0.00125 0.126 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 3.96e-01 0.0914 0.107 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0329 0.122 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 3.03e-01 0.123 0.119 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 2.08e-01 -0.0894 0.0708 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0354 0.127 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 3.21e-01 0.16 0.161 0.126 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 3.64e-02 -0.352 0.166 0.126 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0188 0.158 0.126 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0522 0.119 0.126 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 3.39e-01 0.165 0.172 0.126 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 2.75e-01 0.127 0.116 0.141 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 9.34e-01 0.00977 0.118 0.141 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 2.88e-01 -0.111 0.104 0.141 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 7.76e-01 0.0235 0.0822 0.141 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -407037 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0112 0.109 0.141 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 1.56e-01 0.172 0.121 0.141 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 1.85e-01 0.162 0.122 0.143 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 4.00e-01 -0.11 0.13 0.143 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 7.76e-01 0.0364 0.128 0.143 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -132071 sc-eQTL 5.02e-01 -0.065 0.0968 0.143 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0836 0.103 0.143 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0164 0.123 0.143 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 7.39e-01 0.0399 0.12 0.144 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0853 0.121 0.144 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 2.86e-01 0.14 0.131 0.144 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -809491 sc-eQTL 6.34e-03 0.296 0.107 0.144 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0975 0.102 0.144 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -407037 sc-eQTL 5.32e-01 0.0703 0.112 0.144 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 2.99e-02 0.228 0.104 0.144 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 3.30e-01 0.112 0.115 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 8.96e-03 -0.3 0.114 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 3.15e-03 0.355 0.119 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -809491 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0223 0.114 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 3.30e-01 -0.101 0.104 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 7.20e-01 0.0459 0.128 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 1.02e-01 -0.211 0.129 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 3.50e-01 0.11 0.117 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -809491 sc-eQTL 1.79e-01 0.156 0.115 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 4.58e-01 0.0795 0.107 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 4.82e-01 0.0945 0.134 0.155 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 5.23e-02 -0.276 0.141 0.155 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0794 0.142 0.155 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 2.06e-02 -0.329 0.14 0.155 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -407037 sc-eQTL 3.72e-01 -0.113 0.126 0.155 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 1.87e-01 -0.184 0.139 0.155 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0571 0.129 0.138 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 5.55e-01 0.0711 0.12 0.138 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0756 0.129 0.138 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -809491 sc-eQTL 1.68e-01 0.157 0.113 0.138 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 2.50e-01 -0.121 0.105 0.138 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 6.77e-01 0.0485 0.116 0.143 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 3.25e-01 -0.126 0.128 0.143 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 1.22e-01 0.19 0.122 0.143 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -809491 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0909 0.107 0.143 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 1.49e-01 -0.125 0.0864 0.143 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 4.56e-01 0.105 0.14 0.15 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 2.08e-02 -0.314 0.134 0.15 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0365 0.14 0.15 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -809491 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0647 0.0846 0.15 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 4.79e-01 0.0802 0.113 0.15 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -407037 sc-eQTL 1.23e-01 -0.196 0.127 0.15 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00963 0.124 0.15 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 1.52e-02 0.285 0.116 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 2.94e-01 0.137 0.13 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 2.07e-01 0.151 0.12 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 3.83e-01 0.0828 0.0947 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 5.20e-01 0.0807 0.125 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 3.86e-01 0.106 0.122 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 1.49e-01 -0.182 0.126 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 1.62e-02 0.304 0.125 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 9.74e-02 -0.152 0.0916 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 9.96e-02 0.21 0.127 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 4.64e-01 0.0867 0.118 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 2.92e-03 -0.338 0.112 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 5.56e-03 0.325 0.116 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -809491 sc-eQTL 5.33e-01 0.0727 0.117 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0166 0.0977 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 5.50e-01 0.0674 0.113 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 8.25e-01 0.0284 0.128 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 7.67e-01 0.0372 0.125 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -809491 sc-eQTL 6.59e-01 0.049 0.111 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 8.43e-02 -0.129 0.0742 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 744647 sc-eQTL 1.04e-01 0.155 0.0949 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 970483 sc-eQTL 5.77e-01 0.0641 0.115 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 744337 sc-eQTL 5.82e-01 0.0669 0.121 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -729696 sc-eQTL 6.31e-02 -0.107 0.0572 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 sc-eQTL 8.22e-01 0.0302 0.134 0.142 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 eQTL 7.85e-03 -0.0898 0.0337 0.00155 0.0 0.136

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 \N 744647 7.76e-07 2.4e-07 9.49e-08 4.31e-07 1.07e-07 2.63e-07 4.25e-07 7.12e-08 2.35e-07 1.65e-07 3.32e-07 2.28e-07 5.39e-07 1.01e-07 1.24e-07 1.33e-07 6.63e-08 2.96e-07 1.62e-07 9.17e-08 1.48e-07 2.48e-07 2.2e-07 9.63e-08 6.39e-07 1.94e-07 2.43e-07 2.19e-07 2.66e-07 2.97e-07 1.86e-07 5.32e-08 5.38e-08 1.39e-07 3.52e-07 5.14e-08 8.87e-08 7.98e-08 4.78e-08 7.55e-08 1.23e-07 3.43e-07 3.55e-08 4.19e-08 9.95e-08 1.48e-08 1.07e-07 7.25e-09 5.71e-08
ENSG00000203965 EFCAB7 814686 5.85e-07 1.76e-07 7.87e-08 3.77e-07 1.1e-07 2.01e-07 3.44e-07 5.89e-08 1.94e-07 1.28e-07 2.38e-07 1.82e-07 4.05e-07 8.55e-08 8.45e-08 1.06e-07 4.63e-08 2.66e-07 9.97e-08 7.54e-08 1.33e-07 2.07e-07 1.81e-07 4.91e-08 4.46e-07 1.65e-07 1.83e-07 1.77e-07 1.87e-07 2e-07 1.43e-07 4.77e-08 5.17e-08 1.21e-07 3.07e-07 3.5e-08 6.48e-08 6.31e-08 5.27e-08 8.2e-08 8.35e-08 2.65e-07 1.65e-08 2.64e-08 7.89e-08 1.22e-08 8.01e-08 2.89e-09 4.66e-08
ENSG00000226891 \N -664431 9.83e-07 3.35e-07 1.29e-07 3.04e-07 1.1e-07 3.18e-07 5.49e-07 8.37e-08 3.03e-07 2.26e-07 5.29e-07 3.48e-07 7.93e-07 1.49e-07 1.78e-07 1.96e-07 1.18e-07 3.79e-07 2.42e-07 1.73e-07 1.91e-07 3.49e-07 3.03e-07 1.36e-07 9.71e-07 2.33e-07 3.26e-07 2.74e-07 3.99e-07 5.17e-07 2.55e-07 8.25e-08 4.62e-08 1.73e-07 3.23e-07 6.85e-08 1.05e-07 1.08e-07 4.17e-08 5.32e-08 1.45e-07 5.44e-07 5.98e-08 8.1e-08 1.34e-07 4.38e-08 1.3e-07 2.35e-08 6.03e-08