logo

Genes within 1Mb (chr1:64326549:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 3.37e-01 0.0936 0.0973 0.199 B L1
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0938 0.101 0.199 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 1.71e-01 -0.153 0.111 0.199 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 5.16e-03 0.191 0.0676 0.199 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 5.65e-01 -0.066 0.114 0.199 B L1
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 4.58e-01 0.0635 0.0855 0.199 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0328 0.0945 0.199 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0482 0.11 0.199 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -143580 sc-eQTL 6.83e-02 -0.119 0.0649 0.199 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 4.40e-01 0.053 0.0685 0.199 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 8.38e-01 0.0201 0.0984 0.199 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 4.07e-01 0.0776 0.0934 0.199 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 7.25e-01 0.0363 0.103 0.199 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0859 0.111 0.199 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -143580 sc-eQTL 8.38e-01 0.0115 0.0562 0.199 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 1.28e-01 0.135 0.088 0.199 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0747 0.111 0.199 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 6.02e-01 0.0552 0.106 0.198 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00668 0.109 0.198 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 1.97e-01 0.158 0.122 0.198 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -821000 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0936 0.0967 0.198 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 1.75e-01 0.109 0.0802 0.198 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -418546 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0668 0.103 0.198 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 9.93e-01 0.000909 0.106 0.198 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 3.08e-01 -0.103 0.101 0.199 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 1.27e-01 0.161 0.105 0.199 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 6.15e-01 0.0549 0.109 0.199 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -821000 sc-eQTL 4.61e-01 0.0759 0.103 0.199 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 5.15e-01 0.0479 0.0734 0.199 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 8.53e-01 0.0163 0.0875 0.2 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0792 0.103 0.2 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 8.25e-01 -0.025 0.113 0.2 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 2.47e-01 0.0608 0.0524 0.2 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00426 0.123 0.2 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0413 0.0965 0.199 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0204 0.097 0.199 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0902 0.0758 0.199 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0311 0.0736 0.199 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -418546 sc-eQTL 1.62e-01 -0.149 0.107 0.199 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 8.07e-03 0.309 0.115 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 4.85e-01 0.0908 0.13 0.196 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 3.82e-01 0.109 0.124 0.196 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 5.97e-02 -0.223 0.118 0.196 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 3.12e-01 0.12 0.119 0.196 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 8.23e-01 0.0252 0.113 0.196 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0723 0.117 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 2.21e-01 -0.145 0.118 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0718 0.114 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 1.63e-02 0.235 0.0972 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0544 0.113 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 8.69e-01 0.0191 0.116 0.2 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 3.31e-02 -0.25 0.116 0.2 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 3.09e-01 -0.122 0.12 0.2 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 3.70e-02 0.207 0.0987 0.2 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 7.62e-01 0.0361 0.119 0.2 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 3.71e-01 0.104 0.116 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0648 0.117 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 2.99e-01 -0.119 0.114 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 5.74e-03 0.243 0.0869 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 4.61e-01 -0.09 0.122 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 7.43e-02 0.203 0.113 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 6.38e-01 0.0559 0.119 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0146 0.119 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 2.01e-01 0.118 0.092 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 3.21e-01 -0.118 0.118 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 2.31e-01 0.142 0.118 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0812 0.125 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 2.37e-01 -0.143 0.121 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -143580 sc-eQTL 5.69e-01 0.0251 0.044 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0862 0.108 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 1.49e-01 -0.166 0.114 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 2.80e-01 0.105 0.0968 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0238 0.105 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0758 0.112 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -143580 sc-eQTL 1.19e-01 -0.103 0.066 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 3.52e-01 0.063 0.0676 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 7.06e-01 0.042 0.111 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 7.61e-01 -0.03 0.0986 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0204 0.115 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 8.22e-01 0.0263 0.116 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -143580 sc-eQTL 8.30e-01 0.0198 0.0923 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 4.04e-01 0.063 0.0754 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 8.20e-01 0.0256 0.113 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 6.29e-01 0.0559 0.115 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0855 0.116 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 5.27e-02 -0.219 0.112 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -143580 sc-eQTL 3.20e-01 0.0697 0.0699 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 9.45e-01 0.00689 0.0997 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00691 0.117 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 4.08e-01 0.0871 0.105 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 6.20e-01 0.0554 0.112 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 2.28e-01 0.142 0.117 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -143580 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0248 0.0497 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 3.19e-01 0.0926 0.0927 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 1.08e-01 -0.193 0.12 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 4.29e-02 0.22 0.108 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 2.82e-01 0.121 0.112 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 3.73e-01 -0.101 0.113 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -143580 sc-eQTL 8.36e-01 0.0163 0.0785 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 6.38e-02 0.175 0.0937 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 2.45e-01 0.124 0.106 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 1.02e-01 -0.193 0.117 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 7.04e-01 0.0455 0.12 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 1.84e-01 0.154 0.115 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -143580 sc-eQTL 5.04e-01 0.0407 0.0608 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 2.36e-01 0.116 0.0976 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 9.98e-01 0.000299 0.118 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00138 0.12 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0128 0.121 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 5.73e-01 0.0688 0.122 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -143580 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0219 0.0248 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0713 0.117 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0581 0.118 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 9.73e-01 0.00384 0.112 0.199 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00134 0.111 0.199 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 2.41e-01 -0.132 0.112 0.199 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 1.95e-01 -0.131 0.101 0.199 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -418546 sc-eQTL 3.38e-01 -0.104 0.108 0.199 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 2.34e-01 0.137 0.115 0.199 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 4.13e-01 0.0961 0.117 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 5.69e-02 0.228 0.119 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 8.20e-01 0.0277 0.121 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 6.01e-01 0.04 0.0764 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 9.18e-01 0.0123 0.12 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 6.43e-01 0.0422 0.091 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 6.20e-02 -0.215 0.115 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0662 0.116 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 1.99e-01 0.0787 0.0611 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0693 0.125 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0506 0.123 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 3.54e-01 -0.118 0.127 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 3.37e-01 -0.114 0.119 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 2.22e-01 0.097 0.0792 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0468 0.113 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0892 0.0973 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 8.82e-01 0.0164 0.11 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0332 0.108 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 4.35e-01 0.0503 0.0643 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 6.69e-01 0.0493 0.115 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0774 0.142 0.178 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 2.85e-01 0.159 0.148 0.178 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 4.28e-01 -0.11 0.138 0.178 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 1.00e+00 3.31e-05 0.104 0.178 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0337 0.152 0.178 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 4.70e-02 -0.21 0.105 0.2 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0222 0.108 0.2 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 2.63e-01 -0.106 0.0948 0.2 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0254 0.0749 0.2 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -418546 sc-eQTL 7.72e-01 0.0286 0.0989 0.2 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 6.99e-01 0.0428 0.11 0.2 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0514 0.115 0.199 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 4.51e-01 0.0927 0.123 0.199 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 6.01e-01 0.0631 0.121 0.199 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -143580 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0204 0.0913 0.199 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0935 0.097 0.199 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000607 0.116 0.199 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0639 0.115 0.202 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0546 0.117 0.202 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 3.36e-01 0.121 0.126 0.202 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -821000 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0207 0.105 0.202 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 1.87e-01 0.13 0.0979 0.202 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -418546 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0587 0.108 0.202 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0732 0.101 0.202 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0946 0.106 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 1.48e-01 0.153 0.105 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0353 0.111 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -821000 sc-eQTL 1.47e-01 0.152 0.104 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 2.04e-01 0.121 0.0948 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0119 0.117 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 5.35e-01 0.0738 0.119 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 2.77e-01 0.117 0.107 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -821000 sc-eQTL 1.66e-01 -0.147 0.106 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0855 0.0979 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 3.02e-01 -0.134 0.13 0.203 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 3.67e-01 0.125 0.138 0.203 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 3.87e-01 -0.12 0.138 0.203 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 1.68e-01 0.191 0.138 0.203 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -418546 sc-eQTL 1.37e-01 -0.182 0.121 0.203 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 3.09e-03 0.397 0.132 0.203 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 3.16e-01 0.117 0.116 0.202 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 1.30e-01 0.164 0.108 0.202 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 6.61e-02 0.214 0.116 0.202 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -821000 sc-eQTL 9.14e-01 0.0112 0.103 0.202 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 8.67e-01 0.0159 0.0953 0.202 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 2.29e-01 -0.128 0.106 0.201 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 2.37e-01 0.138 0.116 0.201 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 4.34e-02 -0.226 0.111 0.201 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -821000 sc-eQTL 8.85e-02 0.166 0.0971 0.201 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0238 0.0791 0.201 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0656 0.128 0.215 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 2.78e-01 0.135 0.124 0.215 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0106 0.128 0.215 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -821000 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00509 0.0771 0.215 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 6.58e-01 0.0456 0.103 0.215 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -418546 sc-eQTL 9.23e-01 0.0112 0.116 0.215 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 2.89e-01 0.12 0.113 0.215 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0264 0.109 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 1.45e-02 -0.294 0.119 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0964 0.111 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 1.88e-02 0.205 0.0867 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 9.74e-01 0.00372 0.116 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 1.28e-01 0.173 0.113 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0171 0.117 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 3.40e-01 -0.112 0.118 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 1.59e-02 0.205 0.0844 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 3.40e-01 -0.113 0.118 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 3.28e-01 -0.106 0.108 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 1.45e-01 0.153 0.105 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 5.79e-01 0.0601 0.108 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -821000 sc-eQTL 6.49e-01 0.0488 0.107 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 4.57e-01 0.0667 0.0895 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0958 0.102 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 1.56e-01 0.165 0.116 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0656 0.114 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -821000 sc-eQTL 2.60e-01 0.114 0.101 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 7.80e-01 0.019 0.0679 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 733138 sc-eQTL 7.91e-01 0.0235 0.0887 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 958974 sc-eQTL 1.22e-01 -0.165 0.106 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 732828 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0665 0.113 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -741205 sc-eQTL 2.67e-01 0.0594 0.0534 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 803177 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0287 0.125 0.2 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162433 AK4 -821000 eQTL 0.0489 -0.0534 0.0271 0.0 0.0 0.21
ENSG00000185483 ROR1 552532 pQTL 0.024 0.0365 0.0162 0.0 0.0 0.209

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina