logo

Genes within 1Mb (chr1:64326183:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0808 0.0972 0.212 B L1
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 3.89e-01 0.087 0.101 0.212 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 6.33e-01 0.0534 0.112 0.212 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 6.82e-01 0.0282 0.0687 0.212 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0901 0.114 0.212 B L1
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0924 0.0833 0.212 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00174 0.0922 0.212 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0269 0.107 0.212 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -143946 sc-eQTL 5.40e-01 0.0392 0.0638 0.212 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 8.19e-01 0.0153 0.0669 0.212 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0775 0.0958 0.212 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 8.86e-01 0.0132 0.0924 0.212 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 6.05e-01 0.0527 0.102 0.212 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 6.87e-01 0.0442 0.11 0.212 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -143946 sc-eQTL 7.96e-02 0.097 0.0551 0.212 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 9.12e-01 0.00965 0.0874 0.212 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 2.43e-01 -0.127 0.109 0.212 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 9.16e-02 -0.173 0.102 0.214 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 3.67e-02 0.22 0.105 0.214 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 7.09e-01 0.0444 0.119 0.214 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -821366 sc-eQTL 6.21e-02 -0.175 0.0933 0.214 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 1.88e-01 -0.103 0.0779 0.214 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -418912 sc-eQTL 1.22e-01 0.155 0.0997 0.214 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 2.26e-01 0.125 0.103 0.214 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 2.01e-01 -0.128 0.0994 0.212 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 3.35e-01 -0.1 0.104 0.212 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 9.47e-02 0.179 0.107 0.212 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -821366 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0717 0.101 0.212 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 7.37e-01 0.0243 0.0723 0.212 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 1.48e-01 -0.123 0.085 0.21 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 3.37e-01 0.0962 0.0999 0.21 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 1.88e-01 -0.145 0.11 0.21 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 7.81e-01 0.0143 0.0513 0.21 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0866 0.119 0.21 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 5.51e-02 -0.185 0.0958 0.212 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 8.26e-01 0.0214 0.097 0.212 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0616 0.0759 0.212 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 5.12e-01 0.0484 0.0736 0.212 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -418912 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0769 0.107 0.212 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 3.26e-01 -0.115 0.117 0.212 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 6.70e-01 0.0568 0.133 0.207 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0293 0.128 0.207 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 6.95e-01 0.0479 0.122 0.207 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0131 0.122 0.207 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 9.30e-01 0.0102 0.116 0.207 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 2.63e-01 0.13 0.116 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 1.86e-01 0.156 0.118 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 5.91e-01 0.0612 0.114 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0948 0.0979 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0161 0.113 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0911 0.114 0.211 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 1.38e-01 0.172 0.116 0.211 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 3.78e-01 0.105 0.118 0.211 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 9.87e-01 0.00155 0.0985 0.211 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0485 0.118 0.211 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0758 0.116 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0109 0.116 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0101 0.114 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 6.99e-01 0.0341 0.0881 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0675 0.122 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 3.00e-01 -0.117 0.113 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 9.56e-01 0.00649 0.118 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 3.60e-01 -0.109 0.118 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 1.44e-01 0.134 0.0915 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 8.16e-01 0.0275 0.118 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 3.56e-01 -0.109 0.118 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0421 0.125 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 2.52e-01 0.138 0.12 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -143946 sc-eQTL 2.37e-01 0.052 0.0438 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 3.54e-01 0.1 0.108 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 3.51e-01 -0.107 0.115 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0771 0.0932 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0262 0.101 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0807 0.108 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -143946 sc-eQTL 4.80e-01 0.0451 0.0637 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 4.44e-01 0.0499 0.065 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0759 0.107 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0419 0.0965 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 7.29e-01 0.0389 0.112 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 3.73e-01 0.102 0.114 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -143946 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0773 0.0902 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0623 0.0738 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 3.55e-01 -0.102 0.11 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 8.73e-01 0.0184 0.115 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 4.71e-01 0.0833 0.115 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0419 0.113 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -143946 sc-eQTL 9.16e-01 0.00741 0.0698 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 4.18e-01 0.0804 0.0991 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 5.99e-01 0.0616 0.117 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0383 0.105 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 9.19e-01 0.0113 0.112 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0247 0.117 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -143946 sc-eQTL 9.57e-01 0.0027 0.0498 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0698 0.0929 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0892 0.12 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 6.89e-01 -0.043 0.107 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 3.24e-01 0.11 0.111 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 7.15e-01 0.0408 0.112 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -143946 sc-eQTL 1.09e-01 0.124 0.077 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 9.24e-02 0.157 0.0926 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 9.49e-01 0.00673 0.105 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 3.54e-01 0.111 0.119 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 5.97e-01 -0.064 0.121 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00792 0.117 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -143946 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0212 0.0616 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 3.17e-01 0.0993 0.0989 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0683 0.12 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 7.34e-01 0.0411 0.121 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 3.36e-01 0.117 0.121 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 2.61e-02 0.271 0.121 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -143946 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0104 0.0249 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 3.42e-01 0.112 0.117 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 2.88e-01 -0.126 0.118 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 7.07e-02 -0.2 0.11 0.212 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 3.49e-01 -0.103 0.11 0.212 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0556 0.111 0.212 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 9.12e-01 0.0112 0.101 0.212 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -418912 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0761 0.107 0.212 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 7.15e-01 -0.042 0.115 0.212 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 3.13e-01 -0.114 0.113 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 3.35e-01 0.112 0.116 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 7.99e-01 0.0298 0.117 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00876 0.0737 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 1.75e-01 -0.156 0.115 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 1.63e-01 -0.123 0.0877 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0155 0.112 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 2.68e-01 -0.125 0.112 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 9.56e-01 0.00327 0.0594 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 3.01e-01 0.126 0.121 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 9.28e-01 -0.011 0.121 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000288 0.126 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0489 0.117 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0327 0.0785 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 5.85e-01 0.0611 0.112 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 4.63e-01 0.0713 0.097 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 6.98e-01 0.0427 0.11 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0603 0.108 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 2.33e-01 0.0764 0.0639 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 1.79e-01 -0.154 0.114 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 4.02e-01 -0.12 0.142 0.23 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 5.36e-01 0.0928 0.15 0.23 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 3.88e-01 0.12 0.139 0.23 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 2.39e-01 0.124 0.105 0.23 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 3.68e-01 -0.138 0.153 0.23 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 1.53e-01 -0.149 0.104 0.209 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 8.02e-01 0.0265 0.106 0.209 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 5.42e-02 0.179 0.0924 0.209 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0228 0.0735 0.209 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -418912 sc-eQTL 6.18e-01 0.0484 0.097 0.209 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0246 0.108 0.209 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 6.15e-01 0.0559 0.111 0.212 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0105 0.119 0.212 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 4.81e-01 0.0821 0.116 0.212 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -143946 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0392 0.088 0.212 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 4.80e-01 0.0662 0.0937 0.212 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0346 0.111 0.212 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 2.98e-01 -0.115 0.11 0.21 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 2.71e-01 0.124 0.112 0.21 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0604 0.121 0.21 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -821366 sc-eQTL 8.76e-02 -0.173 0.101 0.21 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 9.78e-01 0.00261 0.0946 0.21 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -418912 sc-eQTL 5.63e-01 0.0602 0.104 0.21 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 1.50e-01 0.14 0.097 0.21 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 4.44e-02 -0.208 0.103 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0754 0.104 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 6.64e-01 0.0476 0.109 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -821366 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0644 0.103 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 6.17e-01 0.0467 0.0934 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 5.31e-01 0.0718 0.114 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 5.64e-01 0.0669 0.116 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 1.98e-01 0.135 0.105 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -821366 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0853 0.104 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 2.05e-01 0.121 0.0954 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0671 0.129 0.203 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 3.91e-01 -0.118 0.137 0.203 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0747 0.137 0.203 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0169 0.137 0.203 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -418912 sc-eQTL 8.62e-01 -0.021 0.121 0.203 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 3.30e-01 0.131 0.134 0.203 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 5.91e-01 0.0623 0.116 0.211 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 6.76e-02 -0.197 0.107 0.211 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0931 0.116 0.211 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -821366 sc-eQTL 6.31e-01 0.0492 0.102 0.211 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0373 0.0946 0.211 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0889 0.106 0.206 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 3.90e-01 -0.1 0.117 0.206 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 1.19e-02 0.28 0.111 0.206 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -821366 sc-eQTL 1.66e-01 -0.136 0.0975 0.206 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0356 0.0792 0.206 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0508 0.123 0.209 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 2.65e-02 0.264 0.118 0.209 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 5.64e-01 0.0712 0.123 0.209 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -821366 sc-eQTL 7.53e-01 0.0234 0.0743 0.209 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 1.50e-01 -0.143 0.0986 0.209 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -418912 sc-eQTL 2.47e-02 0.25 0.11 0.209 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 1.17e-01 0.171 0.108 0.209 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 4.61e-01 0.0791 0.107 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 2.87e-02 0.259 0.117 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 2.77e-01 0.119 0.109 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0175 0.0864 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 6.37e-01 -0.054 0.114 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0787 0.113 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0287 0.116 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0582 0.117 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 2.54e-01 0.0968 0.0846 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 8.65e-01 -0.02 0.118 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 2.31e-01 -0.127 0.106 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00268 0.103 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 2.73e-01 0.116 0.106 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -821366 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0695 0.104 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 5.15e-01 0.057 0.0874 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00357 0.101 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 1.16e-01 -0.18 0.114 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 1.66e-01 0.156 0.112 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -821366 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0296 0.0997 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0613 0.067 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 732772 sc-eQTL 1.90e-01 -0.113 0.086 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 958608 sc-eQTL 6.12e-01 0.0526 0.104 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 732462 sc-eQTL 1.69e-01 -0.151 0.109 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -741571 sc-eQTL 7.61e-01 0.0159 0.0521 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 802811 sc-eQTL 9.76e-01 0.0036 0.121 0.211 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000158966 CACHD1 -143946 eQTL 0.0118 -0.0927 0.0367 0.0 0.0 0.201
ENSG00000185483 ROR1 552166 pQTL 0.0289 0.0349 0.016 0.0 0.0 0.212
ENSG00000231485 AL357078.1 -741554 eQTL 0.0678 -0.0886 0.0484 0.00102 0.0 0.201

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000231485 AL357078.1 -741554 2.77e-07 1.36e-07 5.82e-08 2.05e-07 1.03e-07 8.33e-08 1.81e-07 5.62e-08 1.5e-07 6.75e-08 1.59e-07 1.11e-07 1.79e-07 7.64e-08 5.72e-08 7.89e-08 4.31e-08 1.56e-07 7.12e-08 4.92e-08 1.27e-07 1.31e-07 1.58e-07 3.22e-08 1.72e-07 1.23e-07 1.12e-07 1.04e-07 1.31e-07 1.06e-07 1.07e-07 3.03e-08 3.68e-08 8.89e-08 3.81e-08 2.69e-08 5.7e-08 9.17e-08 6.58e-08 3.67e-08 5.28e-08 1.48e-07 5.08e-08 1.43e-08 3.41e-08 1.77e-08 9.29e-08 1.89e-09 4.81e-08