logo

Genes within 1Mb (chr1:64322572:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0808 0.0972 0.212 B L1
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 3.89e-01 0.087 0.101 0.212 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 6.33e-01 0.0534 0.112 0.212 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 6.82e-01 0.0282 0.0687 0.212 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0901 0.114 0.212 B L1
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0924 0.0833 0.212 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00174 0.0922 0.212 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0269 0.107 0.212 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -147557 sc-eQTL 5.40e-01 0.0392 0.0638 0.212 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 8.19e-01 0.0153 0.0669 0.212 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0775 0.0958 0.212 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 8.86e-01 0.0132 0.0924 0.212 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 6.05e-01 0.0527 0.102 0.212 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 6.87e-01 0.0442 0.11 0.212 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -147557 sc-eQTL 7.96e-02 0.097 0.0551 0.212 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 9.12e-01 0.00965 0.0874 0.212 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 2.43e-01 -0.127 0.109 0.212 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 9.16e-02 -0.173 0.102 0.214 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 3.67e-02 0.22 0.105 0.214 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 7.09e-01 0.0444 0.119 0.214 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -824977 sc-eQTL 6.21e-02 -0.175 0.0933 0.214 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 1.88e-01 -0.103 0.0779 0.214 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -422523 sc-eQTL 1.22e-01 0.155 0.0997 0.214 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 2.26e-01 0.125 0.103 0.214 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 2.01e-01 -0.128 0.0994 0.212 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 3.35e-01 -0.1 0.104 0.212 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 9.47e-02 0.179 0.107 0.212 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -824977 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0717 0.101 0.212 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 7.37e-01 0.0243 0.0723 0.212 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 1.48e-01 -0.123 0.085 0.21 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 3.37e-01 0.0962 0.0999 0.21 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 1.88e-01 -0.145 0.11 0.21 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 7.81e-01 0.0143 0.0513 0.21 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0866 0.119 0.21 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 5.51e-02 -0.185 0.0958 0.212 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 8.26e-01 0.0214 0.097 0.212 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0616 0.0759 0.212 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 5.12e-01 0.0484 0.0736 0.212 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -422523 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0769 0.107 0.212 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 3.26e-01 -0.115 0.117 0.212 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 6.70e-01 0.0568 0.133 0.207 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0293 0.128 0.207 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 6.95e-01 0.0479 0.122 0.207 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0131 0.122 0.207 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 9.30e-01 0.0102 0.116 0.207 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 2.63e-01 0.13 0.116 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 1.86e-01 0.156 0.118 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 5.91e-01 0.0612 0.114 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0948 0.0979 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0161 0.113 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0911 0.114 0.211 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 1.38e-01 0.172 0.116 0.211 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 3.78e-01 0.105 0.118 0.211 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 9.87e-01 0.00155 0.0985 0.211 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0485 0.118 0.211 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0758 0.116 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0109 0.116 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0101 0.114 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 6.99e-01 0.0341 0.0881 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0675 0.122 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 3.00e-01 -0.117 0.113 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 9.56e-01 0.00649 0.118 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 3.60e-01 -0.109 0.118 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 1.44e-01 0.134 0.0915 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 8.16e-01 0.0275 0.118 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 3.56e-01 -0.109 0.118 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0421 0.125 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 2.52e-01 0.138 0.12 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -147557 sc-eQTL 2.37e-01 0.052 0.0438 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 3.54e-01 0.1 0.108 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 3.51e-01 -0.107 0.115 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0771 0.0932 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0262 0.101 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0807 0.108 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -147557 sc-eQTL 4.80e-01 0.0451 0.0637 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 4.44e-01 0.0499 0.065 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0759 0.107 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0419 0.0965 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 7.29e-01 0.0389 0.112 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 3.73e-01 0.102 0.114 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -147557 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0773 0.0902 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0623 0.0738 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 3.55e-01 -0.102 0.11 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 8.73e-01 0.0184 0.115 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 4.71e-01 0.0833 0.115 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0419 0.113 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -147557 sc-eQTL 9.16e-01 0.00741 0.0698 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 4.18e-01 0.0804 0.0991 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 5.99e-01 0.0616 0.117 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0383 0.105 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 9.19e-01 0.0113 0.112 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0247 0.117 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -147557 sc-eQTL 9.57e-01 0.0027 0.0498 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0698 0.0929 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0892 0.12 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 6.89e-01 -0.043 0.107 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 3.24e-01 0.11 0.111 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 7.15e-01 0.0408 0.112 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -147557 sc-eQTL 1.09e-01 0.124 0.077 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 9.24e-02 0.157 0.0926 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 9.49e-01 0.00673 0.105 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 3.54e-01 0.111 0.119 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 5.97e-01 -0.064 0.121 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00792 0.117 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -147557 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0212 0.0616 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 3.17e-01 0.0993 0.0989 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0683 0.12 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 7.34e-01 0.0411 0.121 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 3.36e-01 0.117 0.121 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 2.61e-02 0.271 0.121 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -147557 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0104 0.0249 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 3.42e-01 0.112 0.117 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 2.88e-01 -0.126 0.118 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 7.07e-02 -0.2 0.11 0.212 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 3.49e-01 -0.103 0.11 0.212 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0556 0.111 0.212 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 9.12e-01 0.0112 0.101 0.212 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -422523 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0761 0.107 0.212 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 7.15e-01 -0.042 0.115 0.212 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 3.13e-01 -0.114 0.113 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 3.35e-01 0.112 0.116 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 7.99e-01 0.0298 0.117 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00876 0.0737 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 1.75e-01 -0.156 0.115 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 1.63e-01 -0.123 0.0877 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0155 0.112 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 2.68e-01 -0.125 0.112 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 9.56e-01 0.00327 0.0594 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 3.01e-01 0.126 0.121 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 9.28e-01 -0.011 0.121 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000288 0.126 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0489 0.117 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0327 0.0785 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 5.85e-01 0.0611 0.112 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 4.63e-01 0.0713 0.097 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 6.98e-01 0.0427 0.11 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0603 0.108 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 2.33e-01 0.0764 0.0639 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 1.79e-01 -0.154 0.114 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 4.02e-01 -0.12 0.142 0.23 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 5.36e-01 0.0928 0.15 0.23 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 3.88e-01 0.12 0.139 0.23 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 2.39e-01 0.124 0.105 0.23 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 3.68e-01 -0.138 0.153 0.23 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 1.53e-01 -0.149 0.104 0.209 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 8.02e-01 0.0265 0.106 0.209 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 5.42e-02 0.179 0.0924 0.209 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0228 0.0735 0.209 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -422523 sc-eQTL 6.18e-01 0.0484 0.097 0.209 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0246 0.108 0.209 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 6.15e-01 0.0559 0.111 0.212 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0105 0.119 0.212 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 4.81e-01 0.0821 0.116 0.212 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -147557 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0392 0.088 0.212 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 4.80e-01 0.0662 0.0937 0.212 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0346 0.111 0.212 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 2.98e-01 -0.115 0.11 0.21 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 2.71e-01 0.124 0.112 0.21 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0604 0.121 0.21 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -824977 sc-eQTL 8.76e-02 -0.173 0.101 0.21 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 9.78e-01 0.00261 0.0946 0.21 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -422523 sc-eQTL 5.63e-01 0.0602 0.104 0.21 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 1.50e-01 0.14 0.097 0.21 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 4.44e-02 -0.208 0.103 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0754 0.104 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 6.64e-01 0.0476 0.109 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -824977 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0644 0.103 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 6.17e-01 0.0467 0.0934 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 5.31e-01 0.0718 0.114 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 5.64e-01 0.0669 0.116 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 1.98e-01 0.135 0.105 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -824977 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0853 0.104 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 2.05e-01 0.121 0.0954 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0671 0.129 0.203 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 3.91e-01 -0.118 0.137 0.203 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0747 0.137 0.203 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0169 0.137 0.203 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -422523 sc-eQTL 8.62e-01 -0.021 0.121 0.203 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 3.30e-01 0.131 0.134 0.203 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 5.91e-01 0.0623 0.116 0.211 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 6.76e-02 -0.197 0.107 0.211 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0931 0.116 0.211 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -824977 sc-eQTL 6.31e-01 0.0492 0.102 0.211 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0373 0.0946 0.211 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0889 0.106 0.206 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 3.90e-01 -0.1 0.117 0.206 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 1.19e-02 0.28 0.111 0.206 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -824977 sc-eQTL 1.66e-01 -0.136 0.0975 0.206 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0356 0.0792 0.206 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0508 0.123 0.209 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 2.65e-02 0.264 0.118 0.209 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 5.64e-01 0.0712 0.123 0.209 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -824977 sc-eQTL 7.53e-01 0.0234 0.0743 0.209 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 1.50e-01 -0.143 0.0986 0.209 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -422523 sc-eQTL 2.47e-02 0.25 0.11 0.209 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 1.17e-01 0.171 0.108 0.209 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 4.61e-01 0.0791 0.107 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 2.87e-02 0.259 0.117 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 2.77e-01 0.119 0.109 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0175 0.0864 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 6.37e-01 -0.054 0.114 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0787 0.113 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0287 0.116 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0582 0.117 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 2.54e-01 0.0968 0.0846 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 8.65e-01 -0.02 0.118 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 2.31e-01 -0.127 0.106 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00268 0.103 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 2.73e-01 0.116 0.106 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -824977 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0695 0.104 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 5.15e-01 0.057 0.0874 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00357 0.101 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 1.16e-01 -0.18 0.114 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 1.66e-01 0.156 0.112 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -824977 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0296 0.0997 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0613 0.067 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 729161 sc-eQTL 1.90e-01 -0.113 0.086 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 954997 sc-eQTL 6.12e-01 0.0526 0.104 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 728851 sc-eQTL 1.69e-01 -0.151 0.109 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -745182 sc-eQTL 7.61e-01 0.0159 0.0521 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 799200 sc-eQTL 9.76e-01 0.0036 0.121 0.211 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000158966 CACHD1 -147557 eQTL 0.0118 -0.0927 0.0367 0.0 0.0 0.201
ENSG00000185483 ROR1 548555 pQTL 0.0286 0.035 0.016 0.0 0.0 0.212
ENSG00000231485 AL357078.1 -745165 eQTL 0.0675 -0.0887 0.0484 0.00102 0.0 0.201

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000231485 AL357078.1 -745165 3.02e-07 1.53e-07 6.26e-08 2.2e-07 1.02e-07 8.89e-08 2.1e-07 5.78e-08 1.59e-07 9.35e-08 1.61e-07 1.31e-07 2.24e-07 8e-08 5.43e-08 8.71e-08 4.45e-08 1.72e-07 7.16e-08 5.48e-08 1.18e-07 1.47e-07 1.64e-07 3.42e-08 2.02e-07 1.39e-07 1.19e-07 1.1e-07 1.32e-07 1.33e-07 1.14e-07 3.68e-08 4.37e-08 9.58e-08 4.04e-08 2.74e-08 4.43e-08 7.25e-08 6.5e-08 5.45e-08 5.87e-08 1.59e-07 3.55e-08 7.3e-09 3.36e-08 8.31e-09 7.97e-08 0.0 4.67e-08