logo

Genes within 1Mb (chr1:64320729:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 6.72e-02 0.198 0.107 0.141 B L1
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0885 0.112 0.141 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 3.22e-02 0.265 0.123 0.141 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0633 0.0763 0.141 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 1.27e-01 0.194 0.126 0.141 B L1
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 1.07e-01 0.152 0.0939 0.141 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 3.66e-01 0.0942 0.104 0.141 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 1.76e-02 0.286 0.119 0.141 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -149400 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0732 0.072 0.141 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 2.61e-02 -0.167 0.0748 0.141 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 6.05e-01 0.0562 0.109 0.141 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 7.67e-02 0.183 0.103 0.141 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 7.28e-02 0.205 0.113 0.141 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 1.19e-01 0.192 0.122 0.141 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -149400 sc-eQTL 8.75e-02 -0.106 0.0618 0.141 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 8.80e-04 -0.323 0.0956 0.141 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 1.44e-01 0.179 0.122 0.141 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 2.17e-01 0.142 0.115 0.14 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 3.79e-01 -0.105 0.119 0.14 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 7.90e-01 0.0355 0.133 0.14 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -826820 sc-eQTL 6.06e-02 0.198 0.105 0.14 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00361 0.0878 0.14 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -424366 sc-eQTL 3.66e-01 -0.102 0.112 0.14 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 7.92e-03 0.306 0.114 0.14 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 1.95e-01 0.147 0.113 0.141 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 2.61e-02 -0.263 0.117 0.141 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 9.66e-02 0.203 0.122 0.141 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -826820 sc-eQTL 3.84e-01 0.101 0.115 0.141 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0474 0.0824 0.141 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 7.98e-02 0.169 0.0961 0.142 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 9.49e-01 0.00731 0.114 0.142 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 5.41e-01 0.0763 0.125 0.142 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 7.51e-02 -0.103 0.0577 0.142 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 7.21e-01 0.0484 0.135 0.142 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 7.00e-01 0.0424 0.11 0.141 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0347 0.11 0.141 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 9.93e-01 0.000808 0.0866 0.141 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0191 0.0839 0.141 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -424366 sc-eQTL 1.56e-02 0.293 0.12 0.141 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0525 0.134 0.141 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 5.85e-02 0.277 0.145 0.145 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 8.30e-02 -0.243 0.139 0.145 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 2.16e-01 0.166 0.134 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000813 0.134 0.145 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 8.10e-01 0.0308 0.127 0.145 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 1.70e-01 0.178 0.129 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 7.02e-01 0.0504 0.131 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 2.27e-01 0.153 0.126 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0498 0.109 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 2.98e-01 0.13 0.125 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 3.69e-02 0.268 0.128 0.142 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 1.35e-01 0.196 0.131 0.142 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 3.15e-01 0.135 0.134 0.142 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 1.84e-01 0.148 0.111 0.142 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 7.86e-01 0.0361 0.133 0.142 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 6.09e-01 0.0654 0.128 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0106 0.128 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 4.96e-02 0.246 0.124 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 1.32e-01 -0.146 0.0966 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 4.87e-02 0.263 0.133 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 4.63e-01 0.0931 0.126 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 1.05e-02 -0.336 0.13 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 5.59e-02 0.252 0.131 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 1.35e-01 -0.153 0.102 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0774 0.132 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 2.12e-01 0.162 0.129 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 1.46e-01 0.199 0.137 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 2.89e-01 -0.141 0.132 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -149400 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0468 0.0481 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 3.02e-01 -0.123 0.119 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000177 0.126 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 4.93e-01 0.0727 0.106 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 2.24e-01 0.14 0.115 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 1.10e-02 0.309 0.12 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -149400 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0756 0.0721 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 4.40e-02 -0.148 0.0731 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 6.27e-01 0.0589 0.121 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 2.00e-02 0.256 0.109 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 3.92e-01 0.11 0.128 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 3.92e-01 0.112 0.13 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -149400 sc-eQTL 7.67e-01 0.0308 0.103 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 1.02e-01 -0.138 0.0841 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 8.74e-02 0.216 0.125 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0944 0.129 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0174 0.13 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 1.78e-01 0.17 0.126 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -149400 sc-eQTL 2.06e-01 0.0989 0.078 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 1.60e-01 -0.156 0.111 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0583 0.131 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 7.30e-01 0.0413 0.119 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 3.40e-01 0.121 0.127 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 3.59e-01 0.122 0.133 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -149400 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0624 0.0563 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 3.00e-01 -0.109 0.105 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 2.46e-01 0.158 0.136 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 3.65e-01 0.108 0.119 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 1.84e-01 0.164 0.123 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 2.16e-01 0.153 0.124 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -149400 sc-eQTL 8.13e-02 -0.15 0.0855 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 3.50e-04 -0.365 0.101 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0216 0.117 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 5.24e-01 0.0837 0.131 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 3.83e-01 0.116 0.133 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 1.00e+00 -3.79e-05 0.129 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -149400 sc-eQTL 8.45e-01 0.0132 0.0677 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 1.96e-01 -0.141 0.108 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 3.29e-01 0.128 0.131 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 3.38e-01 0.126 0.131 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 1.62e-01 0.185 0.132 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 6.14e-01 0.0673 0.133 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -149400 sc-eQTL 1.01e-01 0.0444 0.027 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 1.07e-01 -0.206 0.128 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 9.58e-02 0.215 0.128 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 6.97e-01 0.0495 0.127 0.143 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 8.45e-01 0.0245 0.126 0.143 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 6.64e-01 0.0552 0.127 0.143 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 4.01e-01 0.0963 0.115 0.143 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -424366 sc-eQTL 1.57e-02 0.294 0.121 0.143 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0299 0.131 0.143 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 8.14e-01 0.0305 0.129 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 3.89e-02 -0.273 0.131 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0569 0.134 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 7.24e-01 0.0298 0.0842 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 1.47e-01 0.191 0.131 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 5.26e-02 0.195 0.1 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 3.10e-01 0.13 0.128 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 5.05e-01 0.0862 0.129 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 6.58e-02 -0.125 0.0676 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 4.14e-01 0.114 0.139 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 5.37e-01 0.0871 0.141 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 6.39e-01 0.0686 0.146 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0242 0.136 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 5.57e-01 0.0536 0.0911 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0068 0.13 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 5.08e-01 0.0733 0.111 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0215 0.125 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 2.12e-01 0.153 0.122 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 1.64e-01 -0.102 0.0728 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0865 0.131 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 2.88e-01 0.17 0.159 0.13 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 7.31e-02 -0.3 0.166 0.13 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 8.48e-01 -0.03 0.156 0.13 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0573 0.118 0.13 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 2.79e-01 0.186 0.171 0.13 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 5.56e-01 0.07 0.119 0.139 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 8.83e-01 0.0178 0.121 0.139 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 4.25e-01 -0.085 0.106 0.139 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 8.21e-01 0.019 0.084 0.139 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -424366 sc-eQTL 9.31e-01 0.00963 0.111 0.139 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 1.76e-01 0.167 0.123 0.139 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 2.63e-01 0.14 0.125 0.141 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 3.66e-01 -0.121 0.134 0.141 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 5.98e-01 0.0693 0.131 0.141 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -149400 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0652 0.0993 0.141 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 2.88e-01 -0.113 0.106 0.141 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0545 0.126 0.141 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 4.06e-01 0.103 0.124 0.141 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0917 0.125 0.141 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 3.61e-01 0.124 0.135 0.141 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -826820 sc-eQTL 7.76e-03 0.299 0.111 0.141 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0686 0.106 0.141 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -424366 sc-eQTL 5.59e-01 0.0679 0.116 0.141 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 1.18e-02 0.272 0.107 0.141 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 1.41e-01 0.174 0.118 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 1.49e-02 -0.287 0.117 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 9.42e-03 0.321 0.122 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -826820 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00646 0.117 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 2.05e-01 -0.135 0.106 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 5.85e-01 0.0716 0.131 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 5.57e-02 -0.253 0.132 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 2.72e-01 0.132 0.12 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -826820 sc-eQTL 1.49e-01 0.171 0.118 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 6.08e-01 0.0563 0.11 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 6.16e-01 0.07 0.139 0.148 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 1.03e-01 -0.241 0.147 0.148 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0911 0.148 0.148 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 1.24e-02 -0.368 0.145 0.148 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -424366 sc-eQTL 2.67e-01 -0.145 0.13 0.148 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 2.54e-01 -0.166 0.145 0.148 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0353 0.133 0.136 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 3.21e-01 0.123 0.123 0.136 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 3.61e-01 -0.121 0.132 0.136 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -826820 sc-eQTL 4.20e-01 0.0946 0.117 0.136 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 1.56e-01 -0.154 0.108 0.136 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 5.65e-01 0.0695 0.121 0.14 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 2.63e-01 -0.148 0.132 0.14 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 1.30e-01 0.193 0.127 0.14 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -826820 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0524 0.111 0.14 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 1.03e-01 -0.146 0.0894 0.14 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 5.68e-01 0.0829 0.145 0.144 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 2.80e-02 -0.308 0.139 0.144 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0797 0.145 0.144 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -826820 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0755 0.0872 0.144 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 8.79e-01 0.0178 0.117 0.144 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -424366 sc-eQTL 1.88e-01 -0.173 0.131 0.144 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 8.39e-01 0.026 0.128 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 1.41e-02 0.295 0.119 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 3.47e-01 0.126 0.133 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 2.40e-01 0.145 0.123 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 5.34e-01 0.0605 0.0972 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 4.21e-01 0.103 0.128 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 5.23e-01 0.0801 0.125 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 1.53e-01 -0.185 0.129 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 1.81e-02 0.306 0.128 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 3.78e-02 -0.195 0.0934 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 1.16e-01 0.205 0.13 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 2.42e-01 0.142 0.121 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 3.12e-03 -0.343 0.115 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 1.08e-02 0.306 0.119 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -826820 sc-eQTL 4.46e-01 0.0909 0.119 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0507 0.0998 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 4.72e-01 0.0836 0.116 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 6.57e-01 0.0587 0.132 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0137 0.129 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -826820 sc-eQTL 6.09e-01 0.0586 0.114 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 6.17e-02 -0.143 0.0763 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 727318 sc-eQTL 1.07e-01 0.158 0.0977 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 953154 sc-eQTL 4.74e-01 0.0846 0.118 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 727008 sc-eQTL 2.54e-01 0.143 0.125 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -747025 sc-eQTL 4.48e-02 -0.119 0.0588 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 sc-eQTL 9.72e-01 0.00492 0.138 0.14 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 eQTL 1.17e-02 -0.0869 0.0344 0.00133 0.0 0.132

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 \N 727318 2.67e-07 1.3e-07 9.16e-08 1.81e-07 8.83e-08 9.71e-08 1.53e-07 5.24e-08 1.4e-07 4.38e-08 1.62e-07 8.03e-08 1.59e-07 6.56e-08 5.69e-08 7.17e-08 4.63e-08 1.18e-07 5.21e-08 3.88e-08 1.05e-07 1.23e-07 1.26e-07 4.98e-08 1.4e-07 1.13e-07 1.08e-07 9.15e-08 1.05e-07 1.07e-07 9.91e-08 3.52e-08 2.74e-08 8.34e-08 8.98e-08 3.97e-08 4.78e-08 9.26e-08 8.19e-08 3.05e-08 3.55e-08 6.81e-07 5.22e-08 1.95e-08 9.88e-08 1.66e-08 1.45e-07 4.82e-09 4.61e-08
ENSG00000203965 EFCAB7 797357 2.64e-07 1.19e-07 7.72e-08 1.84e-07 8.92e-08 9.57e-08 1.44e-07 5.24e-08 1.41e-07 4.24e-08 1.56e-07 8.02e-08 1.47e-07 6.38e-08 6.25e-08 7.26e-08 4.94e-08 1.14e-07 5.19e-08 3.89e-08 1.06e-07 1.27e-07 1.3e-07 4.99e-08 1.32e-07 1.13e-07 1.12e-07 8.71e-08 1.03e-07 1.12e-07 9.73e-08 3.59e-08 2.74e-08 8.68e-08 8.99e-08 3.87e-08 4.99e-08 8.91e-08 8.42e-08 3.09e-08 3.77e-08 4.68e-07 5.22e-08 2.49e-08 1.01e-07 1.68e-08 1.45e-07 4.82e-09 4.61e-08
ENSG00000226891 \N -681760 2.69e-07 1.34e-07 1.08e-07 1.89e-07 9.01e-08 9.61e-08 1.6e-07 5.21e-08 1.44e-07 4.38e-08 1.54e-07 7.88e-08 1.87e-07 6.76e-08 5.62e-08 7.3e-08 4.48e-08 1.26e-07 5.36e-08 4.03e-08 1.04e-07 1.27e-07 1.32e-07 4.98e-08 1.5e-07 1.15e-07 1.06e-07 9.32e-08 1.09e-07 1.03e-07 9.7e-08 3.72e-08 2.74e-08 8e-08 8.74e-08 3.76e-08 4.67e-08 9.35e-08 8e-08 3.01e-08 3.44e-08 9.14e-07 5.39e-08 3.36e-08 9.21e-08 1.83e-08 1.44e-07 4.7e-09 4.74e-08