logo

Genes within 1Mb (chr1:64319450:C:CA):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 5.42e-02 0.21 0.109 0.135 B L1
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0519 0.113 0.135 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 4.88e-02 0.246 0.124 0.135 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0526 0.0772 0.135 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 2.11e-01 0.161 0.128 0.135 B L1
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 1.50e-01 0.136 0.0943 0.135 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 3.29e-02 0.222 0.103 0.135 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 1.24e-01 0.186 0.121 0.135 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -150679 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0563 0.0723 0.135 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 3.12e-02 -0.163 0.0751 0.135 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 4.33e-01 0.0855 0.109 0.135 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 5.59e-02 0.198 0.103 0.135 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 1.76e-01 0.155 0.114 0.135 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 3.07e-01 0.126 0.123 0.135 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -150679 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0839 0.0621 0.135 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 8.88e-03 -0.255 0.0967 0.135 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 1.97e-01 0.159 0.122 0.135 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 3.20e-01 0.115 0.115 0.135 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0883 0.119 0.135 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 5.86e-01 0.0728 0.133 0.135 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -828099 sc-eQTL 3.83e-02 0.218 0.105 0.135 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 9.48e-01 0.0057 0.0879 0.135 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -425645 sc-eQTL 3.51e-01 -0.105 0.112 0.135 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 1.40e-02 0.284 0.114 0.135 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 1.25e-01 0.174 0.113 0.135 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 1.24e-02 -0.295 0.117 0.135 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 2.22e-01 0.15 0.122 0.135 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -828099 sc-eQTL 6.48e-01 0.0529 0.116 0.135 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 6.28e-01 -0.04 0.0825 0.135 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 6.91e-02 0.176 0.0962 0.135 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0113 0.114 0.135 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 4.41e-01 0.0963 0.125 0.135 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 6.94e-02 -0.105 0.0578 0.135 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 7.91e-01 0.0361 0.136 0.135 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 7.98e-01 0.0282 0.11 0.135 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0482 0.111 0.135 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 5.15e-01 0.0566 0.0869 0.135 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 8.57e-01 0.0152 0.0843 0.135 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -425645 sc-eQTL 9.69e-03 0.315 0.121 0.135 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 7.66e-01 0.04 0.134 0.135 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 7.23e-03 0.389 0.143 0.14 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 1.17e-01 -0.219 0.139 0.14 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 4.65e-01 0.098 0.134 0.14 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0305 0.134 0.14 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0174 0.127 0.14 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 8.92e-02 0.22 0.129 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 9.21e-01 0.0132 0.132 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 2.44e-01 0.148 0.127 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0324 0.11 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 3.31e-01 0.122 0.125 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 7.32e-02 0.229 0.127 0.136 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 1.62e-01 0.182 0.13 0.136 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 4.65e-01 0.0974 0.133 0.136 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 1.77e-01 0.149 0.11 0.136 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 5.45e-01 -0.08 0.132 0.136 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 6.14e-01 0.0651 0.129 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 7.99e-01 0.033 0.13 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 2.84e-02 0.277 0.125 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0922 0.0979 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 3.77e-02 0.28 0.134 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 2.27e-01 0.154 0.127 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 2.22e-02 -0.303 0.131 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 2.35e-01 0.158 0.133 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 5.45e-02 -0.198 0.103 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 3.52e-01 -0.124 0.133 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 2.75e-01 0.142 0.129 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 1.83e-01 0.182 0.137 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 1.19e-01 -0.207 0.132 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -150679 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0496 0.0481 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 2.22e-01 -0.145 0.119 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0394 0.126 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 6.05e-01 0.0549 0.106 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 2.71e-02 0.253 0.114 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 8.77e-02 0.208 0.121 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -150679 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0635 0.0723 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 5.49e-02 -0.141 0.0733 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 4.77e-01 0.0863 0.121 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 1.57e-02 0.267 0.109 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 1.52e-01 0.185 0.128 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 6.20e-01 0.065 0.131 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -150679 sc-eQTL 8.50e-01 0.0197 0.104 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 1.98e-01 -0.109 0.0847 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 6.49e-02 0.234 0.126 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0692 0.129 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 5.24e-01 0.0828 0.13 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 7.74e-02 0.224 0.126 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -150679 sc-eQTL 5.02e-01 0.0527 0.0784 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 9.53e-02 -0.186 0.111 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 9.13e-01 0.0144 0.131 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 7.46e-01 0.0388 0.119 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 1.88e-01 0.167 0.126 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 5.61e-01 0.0775 0.133 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -150679 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0595 0.0564 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0453 0.106 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 2.37e-01 0.161 0.136 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 3.90e-01 0.103 0.119 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 4.23e-01 0.099 0.123 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 3.22e-01 0.123 0.124 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -150679 sc-eQTL 1.75e-01 -0.117 0.0857 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 2.09e-04 -0.378 0.1 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 9.07e-01 0.0136 0.117 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 4.36e-01 0.103 0.132 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 6.87e-01 0.0538 0.133 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0239 0.129 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -150679 sc-eQTL 7.22e-01 0.0242 0.0679 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 3.41e-01 -0.104 0.109 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 7.30e-01 0.0456 0.132 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 3.71e-01 0.122 0.136 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 4.68e-01 0.0992 0.137 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 8.44e-01 0.0271 0.138 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -150679 sc-eQTL 9.74e-02 0.0465 0.0279 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0824 0.133 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 7.37e-02 0.239 0.133 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 8.87e-01 0.0181 0.127 0.136 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 6.43e-01 0.0581 0.125 0.136 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 4.66e-01 0.0924 0.127 0.136 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 2.71e-01 0.126 0.114 0.136 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -425645 sc-eQTL 4.91e-03 0.34 0.12 0.136 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 7.66e-01 0.0389 0.131 0.136 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 6.61e-01 0.0566 0.129 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 9.56e-02 -0.22 0.131 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 4.52e-01 -0.1 0.133 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 6.35e-01 0.0399 0.0839 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 1.55e-01 0.187 0.131 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 3.69e-02 0.211 0.1 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 2.61e-01 0.145 0.128 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 4.10e-01 0.107 0.129 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 7.38e-02 -0.122 0.0677 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 4.16e-01 0.114 0.139 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 3.73e-01 0.126 0.141 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 9.65e-01 0.00651 0.147 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 9.64e-01 0.00626 0.137 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 2.32e-01 0.11 0.0914 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 7.50e-01 0.0417 0.131 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 4.58e-01 0.0824 0.111 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0744 0.125 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 2.75e-01 0.134 0.123 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 1.80e-01 -0.0983 0.073 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0561 0.131 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 7.27e-01 0.0569 0.162 0.119 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 8.17e-02 -0.296 0.168 0.119 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0255 0.159 0.119 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00606 0.12 0.119 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 2.80e-01 0.188 0.174 0.119 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 3.77e-01 0.105 0.119 0.135 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 9.51e-01 0.0074 0.121 0.135 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 3.95e-01 -0.091 0.107 0.135 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 6.94e-01 0.0333 0.0843 0.135 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -425645 sc-eQTL 6.96e-01 0.0436 0.111 0.135 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 6.36e-02 0.23 0.123 0.135 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 3.61e-01 0.114 0.125 0.135 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 2.74e-01 -0.146 0.133 0.135 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0203 0.131 0.135 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -150679 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0899 0.099 0.135 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 3.09e-01 -0.108 0.105 0.135 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0505 0.126 0.135 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 4.87e-01 0.0854 0.123 0.139 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0922 0.124 0.139 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 4.15e-01 0.11 0.134 0.139 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -828099 sc-eQTL 1.94e-03 0.344 0.109 0.139 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0717 0.105 0.139 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -425645 sc-eQTL 7.99e-01 0.0294 0.115 0.139 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 1.29e-02 0.267 0.106 0.139 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 1.16e-01 0.186 0.118 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 1.11e-02 -0.301 0.117 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 1.70e-02 0.297 0.123 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -828099 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0145 0.118 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 2.23e-01 -0.13 0.107 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 3.46e-01 0.124 0.131 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 7.34e-02 -0.238 0.132 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 5.62e-01 0.0701 0.121 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -828099 sc-eQTL 4.19e-01 0.0963 0.119 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 3.72e-01 0.0982 0.11 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 6.37e-01 0.0646 0.137 0.145 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 5.60e-02 -0.277 0.144 0.145 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0202 0.145 0.145 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 3.87e-02 -0.299 0.143 0.145 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -425645 sc-eQTL 2.36e-01 -0.152 0.128 0.145 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 3.21e-01 -0.142 0.142 0.145 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0469 0.133 0.129 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 7.15e-01 0.0452 0.124 0.129 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 2.05e-01 -0.168 0.132 0.129 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -828099 sc-eQTL 4.03e-01 0.0982 0.117 0.129 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0907 0.108 0.129 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 7.27e-01 0.0419 0.12 0.136 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 2.05e-01 -0.167 0.131 0.136 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 1.73e-01 0.172 0.126 0.136 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -828099 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0562 0.11 0.136 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 1.69e-01 -0.123 0.0889 0.136 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 4.42e-01 0.111 0.144 0.141 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 2.30e-02 -0.317 0.138 0.141 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 9.68e-01 0.00577 0.145 0.141 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -828099 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0793 0.087 0.141 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 4.14e-01 0.0953 0.116 0.141 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -425645 sc-eQTL 1.32e-01 -0.197 0.13 0.141 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00157 0.128 0.141 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 6.83e-03 0.325 0.119 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 3.59e-01 0.123 0.134 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 3.40e-01 0.118 0.123 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 7.16e-01 0.0355 0.0974 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 8.13e-01 0.0305 0.129 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 3.32e-01 0.122 0.126 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 3.31e-01 -0.126 0.13 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 2.08e-02 0.301 0.129 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 5.48e-02 -0.182 0.0942 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 1.94e-01 0.171 0.131 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 1.18e-01 0.19 0.121 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 2.20e-03 -0.358 0.115 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 3.22e-02 0.259 0.12 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -828099 sc-eQTL 7.08e-01 0.0451 0.12 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0267 0.101 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 6.57e-01 0.0516 0.116 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0114 0.132 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0595 0.129 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -828099 sc-eQTL 7.03e-01 0.0435 0.114 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 1.44e-01 -0.112 0.0765 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 726039 sc-eQTL 9.68e-02 0.163 0.0977 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 951875 sc-eQTL 6.18e-01 0.0589 0.118 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 725729 sc-eQTL 2.20e-01 0.153 0.125 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -748304 sc-eQTL 3.89e-02 -0.122 0.0588 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 sc-eQTL 9.39e-01 0.0105 0.138 0.134 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 eQTL 4.57e-03 -0.1 0.0353 0.00173 0.0 0.124
ENSG00000226891 LINC01359 -683039 eQTL 0.0356 -0.0874 0.0415 0.0 0.0 0.124

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 \N 726039 1.3e-06 7.56e-07 2.4e-07 4.31e-07 1.12e-07 3.22e-07 8.7e-07 5.4e-08 5.49e-07 1.05e-07 5.29e-07 1.31e-07 9.77e-07 1.23e-07 1.26e-07 2.99e-07 9.3e-08 5.2e-07 1.51e-07 7.84e-08 2.8e-07 4.79e-07 7.63e-07 3.67e-08 7.72e-07 2.29e-07 2.43e-07 2.24e-07 8e-07 8.43e-07 3.66e-07 4.1e-08 3.56e-08 1.01e-07 4.78e-08 1.21e-07 5.8e-08 8.57e-08 6.55e-08 3.6e-08 4e-08 1.47e-06 6.37e-08 2.09e-08 7.79e-08 8.76e-09 9.46e-08 4.2e-09 4.79e-08
ENSG00000203965 EFCAB7 796078 1.24e-06 5.7e-07 3.21e-07 3.58e-07 9.82e-08 2.64e-07 6.52e-07 5.19e-08 3.66e-07 7.6e-08 3.47e-07 1.08e-07 7.36e-07 1.01e-07 7.79e-08 2.14e-07 5.57e-08 4.39e-07 8.68e-08 6.58e-08 2.57e-07 3.34e-07 5.21e-07 3.42e-08 4.67e-07 1.82e-07 1.78e-07 1.67e-07 5.56e-07 6.98e-07 2.6e-07 3.8e-08 3.73e-08 9.52e-08 3.4e-08 6.52e-08 4.99e-08 8.71e-08 7.23e-08 3.92e-08 3.84e-08 1.26e-06 4.3e-08 1.07e-08 8.16e-08 9.44e-09 9.26e-08 4.33e-09 4.77e-08
ENSG00000226891 LINC01359 -683039 1.28e-06 8.78e-07 3e-07 3.81e-07 9.6e-08 3.69e-07 1.08e-06 5.53e-08 6.71e-07 1.15e-07 7.32e-07 1.59e-07 1.07e-06 1.52e-07 1.71e-07 4.14e-07 1.69e-07 5.48e-07 1.81e-07 1.17e-07 3.91e-07 5.49e-07 9.22e-07 5.11e-08 9.82e-07 2.42e-07 2.71e-07 2.59e-07 9.65e-07 9.45e-07 4.08e-07 3.98e-08 4.27e-08 1.27e-07 6.87e-08 1.82e-07 4.28e-08 6.98e-08 6.57e-08 5.13e-08 4.19e-08 1.64e-06 6.58e-08 1.94e-08 6.38e-08 1.35e-08 1.03e-07 4.04e-09 4.85e-08