logo

Genes within 1Mb (chr1:64316141:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 3.75e-02 -0.182 0.0869 0.28 B L1
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 2.15e-01 0.113 0.0907 0.28 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 9.93e-01 0.00093 0.101 0.28 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00814 0.062 0.28 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 8.91e-01 0.0142 0.103 0.28 B L1
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 1.62e-01 -0.106 0.0753 0.28 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0143 0.0835 0.28 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0456 0.0969 0.28 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -153988 sc-eQTL 3.02e-01 0.0597 0.0577 0.28 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 3.01e-01 0.0627 0.0604 0.28 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 4.04e-01 0.0725 0.0868 0.28 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 2.47e-03 -0.252 0.0823 0.28 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 3.37e-01 -0.089 0.0925 0.28 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 9.23e-01 0.00966 0.0998 0.28 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -153988 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0535 0.0504 0.28 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 2.09e-01 0.0998 0.0793 0.28 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 3.94e-01 0.0848 0.0993 0.28 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00575 0.0953 0.275 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0108 0.0984 0.275 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 2.93e-01 -0.116 0.11 0.275 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -831408 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0576 0.0873 0.275 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 4.92e-01 0.05 0.0726 0.275 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -428954 sc-eQTL 4.58e-01 0.0691 0.093 0.275 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 1.26e-01 -0.147 0.0954 0.275 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00467 0.0922 0.28 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 3.06e-01 0.0986 0.096 0.28 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 1.40e-01 -0.147 0.0989 0.28 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -831408 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0428 0.0937 0.28 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 8.59e-01 0.0119 0.0669 0.28 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 5.84e-02 -0.148 0.0777 0.279 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0152 0.0918 0.279 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 2.87e-01 0.107 0.101 0.279 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0114 0.047 0.279 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 5.21e-01 0.0704 0.11 0.279 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 3.44e-01 0.0846 0.0891 0.28 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 5.93e-02 -0.169 0.089 0.28 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 1.05e-01 0.114 0.0699 0.28 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 8.53e-01 0.0126 0.0681 0.28 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -428954 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0473 0.099 0.28 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0686 0.108 0.28 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 2.48e-02 -0.267 0.118 0.276 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 4.31e-01 0.0904 0.115 0.276 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 5.52e-01 0.0654 0.11 0.276 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0247 0.11 0.276 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0477 0.104 0.276 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0913 0.107 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0225 0.109 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0298 0.105 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 6.83e-01 0.0369 0.0902 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00606 0.104 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 7.88e-02 -0.181 0.103 0.28 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 7.02e-01 0.0402 0.105 0.28 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0881 0.107 0.28 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 8.53e-02 -0.153 0.0884 0.28 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 9.19e-01 0.0108 0.106 0.28 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 1.53e-01 -0.152 0.106 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 1.37e-01 0.158 0.106 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 4.19e-01 0.0845 0.104 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 2.60e-01 0.0909 0.0805 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 8.96e-01 0.0145 0.111 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 2.15e-01 -0.129 0.104 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00883 0.109 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 9.51e-01 0.00671 0.109 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 5.00e-01 0.0573 0.0847 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 4.23e-01 0.0872 0.109 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 7.43e-01 0.0346 0.105 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 6.87e-01 0.0449 0.111 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00704 0.108 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -153988 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0213 0.0391 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0455 0.0965 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 9.24e-02 0.172 0.102 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 5.69e-02 -0.162 0.0844 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 2.77e-01 -0.1 0.0922 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 9.04e-01 0.0119 0.0981 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -153988 sc-eQTL 3.72e-01 0.0519 0.058 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 9.39e-01 0.00456 0.0593 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 2.63e-01 0.109 0.0972 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0626 0.088 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 4.86e-01 0.0713 0.102 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 2.82e-01 -0.112 0.104 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -153988 sc-eQTL 3.15e-01 0.0829 0.0822 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 9.79e-02 0.111 0.067 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 4.69e-01 -0.073 0.101 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 5.47e-01 -0.063 0.104 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 6.24e-01 0.0515 0.105 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0163 0.103 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -153988 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0525 0.0633 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 2.23e-01 0.11 0.0899 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 6.66e-01 0.0459 0.106 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 1.39e-01 -0.14 0.0942 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 8.68e-02 -0.172 0.1 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0211 0.106 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -153988 sc-eQTL 2.06e-01 0.0566 0.0447 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 5.10e-01 0.0552 0.0836 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 2.79e-01 0.117 0.108 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 1.90e-02 -0.223 0.0945 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 5.62e-02 -0.189 0.0983 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0163 0.0996 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -153988 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0438 0.069 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0387 0.083 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0798 0.0937 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0143 0.106 0.285 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 5.13e-01 -0.07 0.107 0.285 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 3.20e-01 0.103 0.103 0.285 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -153988 sc-eQTL 7.09e-01 0.0204 0.0544 0.285 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0197 0.0875 0.285 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 8.98e-01 0.0135 0.106 0.285 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0631 0.11 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0329 0.11 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 1.68e-01 -0.153 0.111 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -153988 sc-eQTL 3.27e-01 0.0222 0.0226 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 4.07e-01 0.0887 0.107 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 5.16e-01 0.0701 0.108 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 5.36e-01 0.0634 0.102 0.277 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0224 0.101 0.277 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 5.09e-02 0.199 0.102 0.277 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 4.27e-01 0.0735 0.0924 0.277 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -428954 sc-eQTL 3.09e-01 -0.1 0.0984 0.277 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 5.84e-01 0.0578 0.105 0.277 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 9.09e-01 0.0118 0.103 0.284 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 1.08e-01 -0.169 0.105 0.284 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0776 0.106 0.284 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 9.44e-01 0.00473 0.0669 0.284 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 6.03e-01 0.0544 0.105 0.284 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 8.34e-02 -0.142 0.0815 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 2.17e-01 0.128 0.104 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 1.65e-01 0.145 0.104 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 9.10e-01 0.00626 0.0553 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0822 0.113 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0848 0.108 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 8.10e-01 0.027 0.112 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 3.79e-01 0.092 0.104 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00864 0.0699 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 8.25e-01 -0.022 0.0995 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 1.40e-01 -0.129 0.0871 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0607 0.0989 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 9.51e-01 0.00593 0.0972 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0372 0.0578 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 4.70e-01 0.0748 0.103 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0229 0.127 0.285 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 8.16e-01 0.0311 0.133 0.285 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 2.19e-01 0.152 0.123 0.285 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000845 0.0935 0.285 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0476 0.136 0.285 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 2.63e-01 0.108 0.0964 0.283 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0628 0.0983 0.283 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00792 0.0867 0.283 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 4.94e-01 0.0467 0.0683 0.283 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -428954 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0855 0.09 0.283 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 1.74e-01 -0.137 0.1 0.283 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0243 0.1 0.28 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 6.50e-01 0.0485 0.107 0.28 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 6.84e-02 -0.191 0.104 0.28 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -153988 sc-eQTL 4.54e-03 0.223 0.0779 0.28 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 2.02e-01 0.108 0.0842 0.28 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 6.91e-01 0.04 0.1 0.28 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0292 0.103 0.28 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 4.74e-01 0.0748 0.104 0.28 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 6.98e-02 -0.204 0.112 0.28 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -831408 sc-eQTL 1.16e-01 -0.148 0.0935 0.28 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 9.52e-01 0.0053 0.0879 0.28 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -428954 sc-eQTL 7.93e-01 0.0254 0.0965 0.28 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0835 0.0903 0.28 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 4.96e-01 -0.066 0.0967 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 5.30e-01 0.061 0.0968 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0368 0.102 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -831408 sc-eQTL 4.19e-01 0.0773 0.0956 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0147 0.087 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0271 0.106 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 9.54e-02 0.179 0.107 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 3.13e-02 -0.209 0.0963 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -831408 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0598 0.0961 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00638 0.0888 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 7.01e-01 0.0457 0.119 0.288 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 8.65e-01 0.0215 0.127 0.288 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0429 0.126 0.288 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 9.88e-01 0.0019 0.127 0.288 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -428954 sc-eQTL 2.47e-01 0.129 0.111 0.288 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 9.49e-02 -0.206 0.123 0.288 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0845 0.106 0.28 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0293 0.0993 0.28 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0791 0.107 0.28 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -831408 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0832 0.094 0.28 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 2.24e-01 0.106 0.0868 0.28 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0286 0.0954 0.283 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 5.36e-01 -0.065 0.105 0.283 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0777 0.101 0.283 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -831408 sc-eQTL 2.47e-01 -0.102 0.0877 0.283 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 3.59e-02 0.149 0.0704 0.283 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 4.92e-01 0.0799 0.116 0.282 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 2.84e-01 -0.121 0.113 0.282 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 4.69e-01 0.0844 0.116 0.282 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -831408 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0108 0.0702 0.282 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 2.82e-01 0.101 0.0934 0.282 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -428954 sc-eQTL 5.89e-01 0.0571 0.106 0.282 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 9.69e-02 -0.171 0.102 0.282 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 4.33e-02 -0.197 0.0969 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00536 0.108 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0378 0.0997 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 1.53e-01 -0.112 0.0783 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 8.69e-01 0.0171 0.104 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 4.78e-02 -0.203 0.102 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 3.31e-01 0.103 0.106 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 4.40e-01 0.0827 0.107 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 2.55e-01 0.0883 0.0774 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 5.27e-01 0.068 0.107 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 9.71e-01 0.00356 0.098 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 2.74e-01 0.104 0.0947 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 1.02e-01 -0.16 0.0971 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -831408 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0257 0.0966 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0155 0.0808 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0507 0.0929 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 2.65e-01 -0.118 0.105 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0653 0.103 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -831408 sc-eQTL 2.69e-01 -0.101 0.0913 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 1.96e-02 0.143 0.0608 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 722730 sc-eQTL 5.13e-02 -0.155 0.0792 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 948566 sc-eQTL 6.14e-01 0.0485 0.0959 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 722420 sc-eQTL 1.61e-01 0.143 0.101 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -751613 sc-eQTL 9.74e-01 0.00158 0.0483 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 792769 sc-eQTL 9.77e-01 0.00319 0.112 0.28 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116652 DLEU2L 769059 eQTL 0.0314 0.057 0.0265 0.00109 0.0 0.339
ENSG00000162434 JAK1 -650408 eQTL 0.0193 0.0352 0.015 0.0 0.0 0.339
ENSG00000185483 ROR1 542124 pQTL 0.000283 -0.0512 0.0141 0.0 0.0 0.324

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162433 \N -831408 2.6e-07 1.16e-07 3.41e-08 1.66e-07 1.03e-07 9.14e-08 1.36e-07 5.29e-08 1.33e-07 3.99e-08 1.59e-07 7.4e-08 1.2e-07 6.1e-08 4.48e-08 7.4e-08 5.2e-08 1.02e-07 4.91e-08 2.93e-08 1.04e-07 1.31e-07 1.31e-07 5.23e-08 1.32e-07 1.03e-07 1.12e-07 8.27e-08 1.04e-07 1.09e-07 9.43e-08 3.29e-08 2.6e-08 8.21e-08 1.06e-07 4.32e-08 3.84e-08 8e-08 8.39e-08 3.96e-08 2.71e-08 1.42e-07 4.33e-08 0.0 1.15e-07 1.86e-08 1.5e-07 4.96e-09 4.72e-08