logo

Genes within 1Mb (chr1:64314954:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 3.61e-02 -0.183 0.0868 0.282 B L1
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 1.86e-01 0.12 0.0905 0.282 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000482 0.101 0.282 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00375 0.0619 0.282 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 9.59e-01 0.00531 0.103 0.282 B L1
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0941 0.0752 0.282 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0104 0.0833 0.282 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0288 0.0967 0.282 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -155175 sc-eQTL 2.67e-01 0.064 0.0575 0.282 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 2.56e-01 0.0687 0.0603 0.282 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 5.11e-01 0.0571 0.0867 0.282 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 3.07e-03 -0.246 0.0822 0.282 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 3.53e-01 -0.086 0.0924 0.282 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 8.97e-01 0.0129 0.0996 0.282 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -155175 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0545 0.0503 0.282 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 2.12e-01 0.0991 0.0791 0.282 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 3.86e-01 0.0861 0.0991 0.282 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0196 0.0951 0.277 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0129 0.0981 0.277 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 2.97e-01 -0.115 0.11 0.277 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -832595 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0445 0.0871 0.277 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 4.36e-01 0.0564 0.0724 0.277 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -430141 sc-eQTL 5.02e-01 0.0625 0.0927 0.277 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 1.61e-01 -0.134 0.0953 0.277 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00712 0.0921 0.282 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 2.56e-01 0.109 0.0958 0.282 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 1.63e-01 -0.138 0.0988 0.282 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -832595 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0344 0.0936 0.282 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 9.75e-01 0.0021 0.0668 0.282 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 3.35e-02 -0.166 0.0774 0.281 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0305 0.0917 0.281 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 2.62e-01 0.113 0.101 0.281 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0134 0.047 0.281 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 5.13e-01 0.0716 0.109 0.281 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 2.66e-01 0.0991 0.0889 0.282 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 8.88e-02 -0.152 0.089 0.282 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 7.71e-02 0.124 0.0697 0.282 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 9.95e-01 0.000384 0.068 0.282 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -430141 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0561 0.0987 0.282 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0526 0.108 0.282 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 1.70e-02 -0.284 0.118 0.278 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 4.05e-01 0.0955 0.114 0.278 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 4.45e-01 0.0838 0.109 0.278 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 9.13e-01 0.012 0.109 0.278 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0616 0.104 0.278 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0814 0.107 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00935 0.108 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0376 0.104 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 7.09e-01 0.0337 0.0902 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00707 0.104 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 1.12e-01 -0.164 0.103 0.282 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 7.82e-01 0.029 0.105 0.282 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0903 0.107 0.282 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 9.98e-02 -0.146 0.0884 0.282 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 9.84e-01 0.00211 0.106 0.282 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 1.30e-01 -0.161 0.106 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 1.33e-01 0.16 0.106 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 4.24e-01 0.0837 0.104 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 2.27e-01 0.0976 0.0805 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 8.88e-01 0.0157 0.111 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 2.31e-01 -0.125 0.104 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 9.77e-01 0.00309 0.109 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 8.82e-01 0.0162 0.109 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 4.34e-01 0.0662 0.0844 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 4.82e-01 0.0764 0.108 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 8.04e-01 0.0262 0.105 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 4.98e-01 0.0757 0.111 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 9.84e-01 0.00217 0.108 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -155175 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0212 0.0392 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0321 0.0966 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 6.57e-02 0.188 0.102 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 8.67e-02 -0.145 0.0843 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 2.67e-01 -0.102 0.092 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 7.31e-01 0.0336 0.0979 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -155175 sc-eQTL 3.61e-01 0.053 0.0579 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 8.78e-01 0.00908 0.0592 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 3.61e-01 0.0889 0.0971 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0587 0.0878 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 4.51e-01 0.077 0.102 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 2.82e-01 -0.112 0.104 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -155175 sc-eQTL 2.45e-01 0.0956 0.082 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 6.57e-02 0.124 0.0668 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0802 0.1 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0544 0.104 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 6.51e-01 0.0475 0.105 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0137 0.103 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -155175 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0517 0.0633 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 2.27e-01 0.109 0.0899 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 6.87e-01 0.0428 0.106 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 1.19e-01 -0.148 0.0941 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 1.27e-01 -0.153 0.1 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0203 0.106 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -155175 sc-eQTL 2.10e-01 0.0562 0.0447 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 4.57e-01 0.0623 0.0836 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 2.32e-01 0.129 0.108 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 2.34e-02 -0.216 0.0944 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 5.62e-02 -0.188 0.0981 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0109 0.0994 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -155175 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0458 0.0689 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0413 0.0829 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0773 0.0936 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0211 0.105 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 5.55e-01 -0.063 0.106 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 4.21e-01 0.0832 0.103 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -155175 sc-eQTL 7.41e-01 0.0179 0.0543 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0345 0.0872 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 8.94e-01 0.014 0.105 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0631 0.11 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0397 0.11 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 1.51e-01 -0.16 0.111 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -155175 sc-eQTL 3.04e-01 0.0233 0.0226 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 3.01e-01 0.111 0.107 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 4.09e-01 0.0891 0.108 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 5.21e-01 0.0655 0.102 0.279 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00846 0.101 0.279 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 3.67e-02 0.213 0.101 0.279 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 5.39e-01 0.0568 0.0923 0.279 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -430141 sc-eQTL 2.61e-01 -0.111 0.0982 0.279 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 6.09e-01 0.054 0.105 0.279 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 7.94e-01 0.0269 0.103 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 7.70e-02 -0.186 0.105 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0536 0.106 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00567 0.067 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 5.83e-01 0.0576 0.105 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 3.93e-02 -0.168 0.0811 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 2.29e-01 0.125 0.104 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 2.24e-01 0.127 0.104 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 9.98e-01 0.000109 0.0552 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 3.42e-01 -0.107 0.113 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0848 0.108 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 8.10e-01 0.027 0.112 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 3.79e-01 0.092 0.104 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00864 0.0699 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 8.25e-01 -0.022 0.0995 0.292 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 1.08e-01 -0.14 0.0869 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0688 0.0987 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 8.21e-01 0.022 0.097 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0368 0.0577 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 3.55e-01 0.0955 0.103 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0178 0.127 0.289 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 6.55e-01 0.0595 0.133 0.289 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 2.32e-01 0.148 0.123 0.289 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0075 0.0933 0.289 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0527 0.136 0.289 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 1.60e-01 0.136 0.0962 0.285 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 5.02e-01 -0.066 0.0982 0.285 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000773 0.0866 0.285 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 5.29e-01 0.043 0.0682 0.285 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -430141 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0818 0.09 0.285 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 1.90e-01 -0.132 0.1 0.285 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 7.26e-01 -0.035 0.0999 0.282 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 5.52e-01 0.0636 0.107 0.282 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 8.27e-02 -0.182 0.104 0.282 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -155175 sc-eQTL 3.44e-03 0.23 0.0776 0.282 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 1.99e-01 0.108 0.0841 0.282 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 5.93e-01 0.0536 0.1 0.282 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 7.41e-01 -0.034 0.103 0.283 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 4.79e-01 0.0738 0.104 0.283 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 4.61e-02 -0.224 0.111 0.283 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -832595 sc-eQTL 8.48e-02 -0.162 0.0933 0.283 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 8.26e-01 0.0193 0.0878 0.283 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -430141 sc-eQTL 8.15e-01 0.0226 0.0965 0.283 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0644 0.0904 0.283 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0621 0.0966 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 4.62e-01 0.0712 0.0966 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0315 0.102 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -832595 sc-eQTL 4.21e-01 0.0769 0.0955 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0216 0.0869 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0369 0.106 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 1.05e-01 0.174 0.107 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 4.24e-02 -0.197 0.0963 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -832595 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0451 0.096 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 8.30e-01 -0.019 0.0887 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 7.01e-01 0.0457 0.119 0.288 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 8.65e-01 0.0215 0.127 0.288 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0429 0.126 0.288 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 9.88e-01 0.0019 0.127 0.288 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -430141 sc-eQTL 2.47e-01 0.129 0.111 0.288 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 9.49e-02 -0.206 0.123 0.288 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0822 0.107 0.282 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0151 0.0993 0.282 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0716 0.107 0.282 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -832595 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0775 0.094 0.282 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 1.80e-01 0.117 0.0867 0.282 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0345 0.0954 0.285 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0557 0.105 0.285 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 4.05e-01 -0.084 0.101 0.285 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -832595 sc-eQTL 3.11e-01 -0.089 0.0877 0.285 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 3.72e-02 0.148 0.0703 0.285 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 5.19e-01 0.0748 0.116 0.285 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 3.04e-01 -0.116 0.112 0.285 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 4.73e-01 0.0833 0.116 0.285 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -832595 sc-eQTL 9.53e-01 0.00415 0.0699 0.285 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 3.33e-01 0.0904 0.0931 0.285 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -430141 sc-eQTL 6.08e-01 0.054 0.105 0.285 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 1.01e-01 -0.168 0.102 0.285 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 5.82e-02 -0.185 0.0969 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00136 0.108 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0416 0.0996 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 1.80e-01 -0.105 0.0783 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 9.17e-01 0.0108 0.104 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 4.44e-02 -0.206 0.102 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 3.02e-01 0.109 0.106 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 4.26e-01 0.0852 0.107 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 2.08e-01 0.0975 0.0772 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 5.43e-01 0.0654 0.107 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00115 0.0978 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 2.45e-01 0.11 0.0944 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 1.29e-01 -0.148 0.097 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -832595 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0221 0.0964 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0291 0.0806 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 5.98e-01 -0.049 0.0928 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0972 0.105 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0643 0.103 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -832595 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0888 0.0913 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 1.67e-02 0.146 0.0607 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 721543 sc-eQTL 2.73e-02 -0.176 0.079 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 947379 sc-eQTL 7.19e-01 0.0345 0.0959 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 721233 sc-eQTL 1.54e-01 0.145 0.101 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -752800 sc-eQTL 9.97e-01 0.000194 0.0483 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 791582 sc-eQTL 9.59e-01 0.00577 0.112 0.282 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116652 DLEU2L 767872 eQTL 0.0336 0.0562 0.0264 0.00106 0.0 0.339
ENSG00000162434 JAK1 -651595 eQTL 0.0234 0.034 0.015 0.0 0.0 0.339
ENSG00000185483 ROR1 540937 pQTL 0.000176 -0.0529 0.0141 0.0 0.0 0.324

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162433 \N -832595 2.76e-07 1.27e-07 4.98e-08 1.82e-07 1.01e-07 9.91e-08 1.6e-07 5.43e-08 1.45e-07 5.67e-08 1.52e-07 1.01e-07 1.59e-07 7.13e-08 6.18e-08 7.5e-08 4.01e-08 1.4e-07 6.07e-08 4.3e-08 1.21e-07 1.24e-07 1.45e-07 2.91e-08 1.55e-07 1.25e-07 1.1e-07 9.74e-08 1.2e-07 1.05e-07 1.02e-07 3.06e-08 3.89e-08 8.56e-08 4.84e-08 3.2e-08 5.37e-08 8.93e-08 6.86e-08 4.19e-08 5.34e-08 1.46e-07 5.2e-08 1.32e-08 4.25e-08 1.86e-08 1.21e-07 3.79e-09 5.04e-08