Genes within 1Mb (chr1:64295832:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 4.51e-01 -0.071 0.0939 0.22 B L1
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0177 0.0975 0.22 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0833 0.108 0.22 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00628 0.0664 0.22 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 2.79e-01 -0.12 0.11 0.22 B L1
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0752 0.0809 0.22 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0672 0.0893 0.22 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0385 0.104 0.22 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -174297 sc-eQTL 4.19e-01 0.05 0.0618 0.22 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0168 0.0649 0.22 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0459 0.0931 0.22 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 6.19e-01 0.0442 0.0889 0.22 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 1.99e-01 0.126 0.0977 0.22 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 9.48e-01 0.00695 0.106 0.22 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -174297 sc-eQTL 2.59e-01 0.0603 0.0532 0.22 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 9.30e-01 0.00743 0.0842 0.22 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0536 0.105 0.22 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0641 0.101 0.223 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 8.32e-02 0.18 0.103 0.223 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0325 0.117 0.223 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -851717 sc-eQTL 7.89e-02 -0.162 0.0917 0.223 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 1.28e-01 -0.117 0.0764 0.223 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -449263 sc-eQTL 2.23e-01 0.12 0.0981 0.223 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 4.88e-01 0.0704 0.101 0.223 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00856 0.096 0.22 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0503 0.1 0.22 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 4.15e-01 0.0845 0.103 0.22 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -851717 sc-eQTL 6.98e-01 -0.038 0.0976 0.22 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 8.06e-01 0.0171 0.0696 0.22 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0452 0.0836 0.219 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 2.34e-01 0.117 0.0978 0.219 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 5.28e-02 -0.208 0.107 0.219 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 6.95e-01 0.0197 0.0502 0.219 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 5.28e-01 -0.074 0.117 0.219 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 9.92e-02 -0.154 0.093 0.22 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 8.93e-01 0.0127 0.0941 0.22 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0836 0.0735 0.22 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 6.55e-01 0.032 0.0714 0.22 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -449263 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0511 0.104 0.22 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 5.93e-02 -0.214 0.113 0.22 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 9.54e-01 0.0076 0.13 0.217 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 3.79e-01 -0.11 0.125 0.217 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0659 0.119 0.217 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00529 0.119 0.217 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 7.77e-01 0.0321 0.113 0.217 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00339 0.111 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 5.26e-01 0.0712 0.112 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00796 0.108 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 2.56e-01 -0.106 0.093 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0766 0.107 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0531 0.111 0.22 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 6.93e-01 0.0446 0.113 0.22 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 6.57e-01 0.0513 0.115 0.22 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0491 0.0956 0.22 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 7.93e-01 0.03 0.114 0.22 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0843 0.113 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0515 0.113 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 2.21e-01 -0.136 0.111 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0589 0.0858 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 2.86e-01 -0.126 0.118 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 8.92e-02 -0.186 0.109 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 8.91e-01 0.0157 0.114 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 1.69e-01 -0.158 0.114 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 2.65e-01 0.0992 0.0888 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 5.92e-01 0.0613 0.114 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 2.36e-01 -0.135 0.114 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0901 0.121 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 3.96e-01 0.0993 0.117 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -174297 sc-eQTL 7.30e-02 0.076 0.0422 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 7.61e-01 0.032 0.105 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 2.96e-01 -0.116 0.111 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0198 0.0906 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0541 0.0983 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0709 0.104 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -174297 sc-eQTL 4.86e-01 0.0432 0.0618 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 6.52e-01 0.0285 0.0631 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0379 0.104 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0771 0.0932 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0565 0.108 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 4.69e-01 0.0799 0.11 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -174297 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0765 0.0872 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0896 0.0713 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00238 0.107 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 5.42e-01 0.0684 0.112 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0533 0.113 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0586 0.11 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -174297 sc-eQTL 5.77e-01 0.038 0.068 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 3.52e-01 0.0901 0.0966 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 3.21e-01 -0.113 0.114 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0234 0.101 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00905 0.107 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00159 0.113 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -174297 sc-eQTL 9.99e-01 8.79e-05 0.0478 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0971 0.089 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 7.07e-01 0.0434 0.115 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00914 0.104 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 3.99e-02 0.22 0.107 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0127 0.108 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -174297 sc-eQTL 5.45e-01 0.0455 0.0749 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 6.22e-02 0.168 0.0895 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 7.92e-01 0.0269 0.102 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 6.74e-01 0.0498 0.118 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 9.68e-01 0.0048 0.12 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0498 0.116 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -174297 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0746 0.0607 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 5.83e-01 0.0539 0.0979 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 7.23e-01 -0.042 0.118 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 4.23e-01 0.0913 0.114 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 2.79e-01 0.124 0.114 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 3.42e-01 0.11 0.115 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -174297 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0116 0.0235 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 7.46e-01 0.036 0.111 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0772 0.112 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 9.98e-02 -0.176 0.106 0.221 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 2.07e-01 -0.134 0.106 0.221 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 1.89e-01 -0.141 0.107 0.221 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 9.95e-01 0.000606 0.0968 0.221 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -449263 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0965 0.103 0.221 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0867 0.11 0.221 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 5.40e-01 -0.068 0.111 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 2.57e-01 0.129 0.113 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 2.63e-01 0.128 0.114 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0504 0.0722 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 2.93e-01 -0.119 0.113 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 4.98e-01 -0.059 0.0868 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 8.55e-01 0.0202 0.11 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 7.01e-02 -0.2 0.11 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00685 0.0586 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 4.22e-01 0.0962 0.12 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0296 0.118 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 6.88e-01 0.049 0.122 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0982 0.114 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 1.43e-01 -0.111 0.0758 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0219 0.109 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 1.75e-01 0.127 0.0933 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 7.04e-01 0.0402 0.106 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0754 0.104 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 2.59e-01 0.0698 0.0617 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0959 0.111 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 5.32e-01 0.0814 0.13 0.237 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00995 0.137 0.237 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 8.52e-01 0.0237 0.127 0.237 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 3.76e-01 0.085 0.0956 0.237 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 4.28e-01 -0.111 0.139 0.237 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 1.30e-01 -0.154 0.102 0.215 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0286 0.104 0.215 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 5.27e-03 0.253 0.0898 0.215 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0453 0.0721 0.215 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -449263 sc-eQTL 6.39e-01 0.0448 0.0952 0.215 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 1.04e-01 -0.173 0.106 0.215 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 8.83e-01 0.0159 0.108 0.22 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0117 0.115 0.22 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00928 0.113 0.22 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -174297 sc-eQTL 9.80e-01 0.00209 0.0853 0.22 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 4.93e-01 0.0624 0.0908 0.22 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0633 0.108 0.22 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0826 0.107 0.217 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 2.63e-01 0.122 0.108 0.217 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0589 0.117 0.217 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -851717 sc-eQTL 7.13e-02 -0.176 0.0973 0.217 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00722 0.0916 0.217 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -449263 sc-eQTL 4.87e-01 0.07 0.101 0.217 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 4.54e-01 0.0707 0.0943 0.217 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 4.05e-01 -0.084 0.101 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0749 0.101 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 5.40e-01 -0.065 0.106 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -851717 sc-eQTL 1.55e-01 -0.141 0.0992 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00826 0.0907 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 2.19e-01 0.134 0.109 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 3.91e-01 0.0953 0.111 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 3.79e-01 0.0884 0.1 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -851717 sc-eQTL 6.67e-01 0.0428 0.0992 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 1.38e-01 0.136 0.0912 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0477 0.127 0.215 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 4.29e-01 -0.107 0.135 0.215 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 4.02e-01 -0.113 0.134 0.215 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0271 0.135 0.215 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -449263 sc-eQTL 4.10e-01 0.098 0.119 0.215 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 8.73e-01 0.0212 0.132 0.215 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 1.39e-01 0.167 0.112 0.22 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0842 0.105 0.22 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0515 0.113 0.22 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -851717 sc-eQTL 1.54e-01 0.142 0.0992 0.22 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0328 0.0922 0.22 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0824 0.103 0.215 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 3.21e-01 -0.112 0.113 0.215 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 7.81e-03 0.287 0.107 0.215 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -851717 sc-eQTL 8.79e-02 -0.161 0.094 0.215 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0567 0.0765 0.215 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 8.58e-01 0.0213 0.119 0.212 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 3.32e-02 0.245 0.114 0.212 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0348 0.119 0.212 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -851717 sc-eQTL 9.44e-01 0.00501 0.0718 0.212 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 9.71e-02 -0.159 0.095 0.212 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -449263 sc-eQTL 1.31e-01 0.163 0.107 0.212 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 1.75e-01 0.143 0.105 0.212 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 9.90e-01 0.00134 0.104 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 4.86e-01 0.0799 0.114 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0181 0.106 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 9.88e-01 0.00126 0.0833 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0817 0.11 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 2.17e-01 -0.136 0.11 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0552 0.113 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 9.85e-02 -0.188 0.113 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 9.67e-01 0.0034 0.0827 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0355 0.115 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0159 0.102 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 8.87e-01 0.0141 0.0992 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 8.84e-01 0.0149 0.102 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -851717 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0452 0.101 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 8.11e-01 0.0202 0.0845 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 4.79e-01 0.0698 0.0985 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0941 0.112 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 8.11e-02 0.191 0.109 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -851717 sc-eQTL 5.43e-01 0.0592 0.097 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0754 0.0652 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 702421 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0343 0.0843 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 928257 sc-eQTL 4.79e-01 0.0717 0.101 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 702111 sc-eQTL 3.57e-02 -0.225 0.106 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -771922 sc-eQTL 7.78e-01 0.0144 0.0509 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 772460 sc-eQTL 9.88e-01 0.00184 0.119 0.22 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000185483 ROR1 521815 pQTL 0.00665 0.0438 0.0161 0.0 0.0 0.21


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina