logo

Genes within 1Mb (chr1:64264057:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 2.30e-01 -0.11 0.0911 0.231 B L1
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0225 0.0947 0.231 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0781 0.105 0.231 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 9.02e-01 0.00798 0.0645 0.231 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 3.01e-01 -0.111 0.107 0.231 B L1
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 1.59e-01 -0.11 0.0781 0.231 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 1.00e+00 1.1e-05 0.0866 0.231 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 3.13e-01 -0.101 0.1 0.231 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -206072 sc-eQTL 2.13e-01 0.0747 0.0597 0.231 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 6.05e-01 0.0325 0.0628 0.231 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0482 0.0901 0.231 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 8.50e-01 0.0164 0.0865 0.231 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 2.11e-01 0.119 0.0951 0.231 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0277 0.103 0.231 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -206072 sc-eQTL 4.38e-01 0.0403 0.0519 0.231 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0136 0.0819 0.231 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0602 0.102 0.231 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 2.62e-01 -0.109 0.0971 0.232 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 5.31e-01 0.0631 0.1 0.232 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0401 0.113 0.232 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -883492 sc-eQTL 2.03e-01 -0.113 0.0889 0.232 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 1.26e-01 -0.113 0.0738 0.232 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -481038 sc-eQTL 1.79e-01 0.128 0.0947 0.232 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 5.46e-01 0.0592 0.098 0.232 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 6.00e-01 0.049 0.0935 0.231 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 8.93e-01 0.0131 0.0976 0.231 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 5.06e-01 0.0672 0.101 0.231 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -883492 sc-eQTL 7.06e-01 0.0359 0.095 0.231 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 7.17e-01 0.0246 0.0678 0.231 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0637 0.0808 0.23 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 2.37e-01 0.112 0.0946 0.23 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 2.70e-02 -0.23 0.103 0.23 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 2.54e-01 0.0554 0.0485 0.23 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0497 0.113 0.23 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 1.07e-01 -0.147 0.0906 0.231 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 9.42e-01 0.00663 0.0916 0.231 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0756 0.0716 0.231 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0404 0.0695 0.231 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -481038 sc-eQTL 5.53e-01 -0.06 0.101 0.231 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 3.59e-02 -0.231 0.11 0.231 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 9.31e-01 0.0108 0.126 0.235 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 4.00e-01 -0.101 0.12 0.235 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0587 0.115 0.235 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 7.89e-01 0.0309 0.115 0.235 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0138 0.109 0.235 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 9.35e-01 0.00877 0.107 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 4.18e-01 0.0881 0.109 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 1.00e+00 -1.43e-06 0.105 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 2.35e-01 -0.107 0.0901 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 2.16e-01 -0.128 0.103 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 1.79e-01 -0.143 0.106 0.231 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 7.68e-01 -0.032 0.108 0.231 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 6.13e-01 0.0558 0.11 0.231 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 1.69e-01 -0.126 0.0912 0.231 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0437 0.109 0.231 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 1.77e-01 -0.149 0.11 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0144 0.111 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 1.45e-01 -0.158 0.108 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0268 0.0837 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 5.39e-01 -0.071 0.115 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 8.58e-02 -0.183 0.106 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 9.88e-01 0.00172 0.111 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 1.64e-01 -0.155 0.111 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 2.03e-01 0.11 0.0864 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 4.63e-01 0.0817 0.111 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 1.50e-01 -0.158 0.11 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0444 0.116 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 6.40e-01 0.0528 0.113 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -206072 sc-eQTL 2.86e-01 0.0437 0.0408 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0408 0.101 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 1.99e-01 -0.138 0.107 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0402 0.0878 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0323 0.0954 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 2.17e-01 -0.125 0.101 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -206072 sc-eQTL 2.69e-01 0.0664 0.0599 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 3.97e-01 0.0519 0.0612 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0511 0.101 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 1.27e-01 -0.138 0.0902 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0207 0.105 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0298 0.107 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -206072 sc-eQTL 7.29e-01 0.0294 0.0849 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0319 0.0694 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 8.57e-01 0.0187 0.104 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 9.16e-01 0.0115 0.109 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00299 0.109 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 2.91e-01 -0.113 0.106 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -206072 sc-eQTL 5.72e-02 0.125 0.0655 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 7.95e-01 0.0245 0.0939 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 1.78e-01 -0.149 0.11 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0873 0.0977 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 6.79e-01 0.0431 0.104 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0243 0.109 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -206072 sc-eQTL 6.30e-01 0.0223 0.0463 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 2.40e-01 -0.102 0.0863 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 7.84e-01 0.0308 0.112 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 7.57e-01 0.0312 0.101 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 4.94e-02 0.204 0.103 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0362 0.105 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -206072 sc-eQTL 9.29e-01 0.00647 0.0727 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 7.95e-02 0.153 0.0868 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 6.88e-01 0.0397 0.0988 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 2.73e-01 0.125 0.114 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0764 0.115 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 3.22e-01 -0.111 0.112 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -206072 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0585 0.0587 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 6.15e-01 0.0477 0.0945 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0731 0.114 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 8.27e-01 0.0241 0.11 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 2.05e-01 0.14 0.11 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 3.85e-01 0.0969 0.111 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -206072 sc-eQTL 8.08e-01 -0.00552 0.0227 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0401 0.107 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0699 0.108 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 2.76e-01 -0.113 0.103 0.232 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 1.80e-01 -0.138 0.102 0.232 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 1.52e-01 -0.149 0.103 0.232 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0776 0.0937 0.232 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -481038 sc-eQTL 2.75e-01 -0.109 0.0997 0.232 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0802 0.107 0.232 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0504 0.109 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 1.33e-01 0.167 0.111 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 2.32e-01 0.134 0.112 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0428 0.0706 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 1.81e-01 -0.148 0.11 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0499 0.0839 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 6.40e-01 0.0499 0.106 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 3.72e-02 -0.222 0.106 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 6.06e-01 0.0292 0.0565 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 2.49e-01 0.133 0.115 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0843 0.114 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 5.40e-01 0.0729 0.119 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 1.99e-01 -0.143 0.111 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 9.81e-02 -0.123 0.0737 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0506 0.106 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 4.79e-01 0.0643 0.0907 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0256 0.103 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0528 0.101 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 5.62e-02 0.114 0.0594 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 2.95e-01 -0.112 0.107 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 5.29e-01 0.0804 0.127 0.244 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 8.91e-01 0.0185 0.134 0.244 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0189 0.125 0.244 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 4.88e-01 0.0652 0.0939 0.244 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 2.08e-01 -0.172 0.136 0.244 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 2.84e-02 -0.218 0.0987 0.226 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0387 0.102 0.226 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 6.14e-04 0.303 0.087 0.226 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0802 0.0703 0.226 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -481038 sc-eQTL 5.53e-01 0.0553 0.093 0.226 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 1.00e-01 -0.171 0.103 0.226 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 6.34e-01 0.0498 0.104 0.231 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 5.03e-01 0.0749 0.112 0.231 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0425 0.11 0.231 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -206072 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0447 0.0828 0.231 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 6.64e-01 0.0384 0.0883 0.231 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 9.37e-01 0.00824 0.105 0.231 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 3.89e-01 -0.089 0.103 0.227 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 8.22e-01 0.0236 0.105 0.227 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0524 0.113 0.227 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -883492 sc-eQTL 1.91e-01 -0.123 0.094 0.227 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0159 0.0882 0.227 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -481038 sc-eQTL 5.05e-01 0.0646 0.0968 0.227 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 7.87e-01 0.0246 0.0909 0.227 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0321 0.0981 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0317 0.0982 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0657 0.103 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -883492 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0588 0.097 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0216 0.0882 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 1.73e-01 0.145 0.106 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 3.73e-01 0.0966 0.108 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 4.89e-01 0.0679 0.098 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -883492 sc-eQTL 6.31e-01 0.0466 0.0969 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 1.84e-01 0.119 0.0891 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0306 0.121 0.236 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0742 0.129 0.236 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0952 0.128 0.236 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0842 0.129 0.236 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -481038 sc-eQTL 1.56e-01 0.161 0.113 0.236 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0275 0.126 0.236 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 9.83e-02 0.181 0.109 0.229 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0741 0.102 0.229 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 3.45e-01 -0.103 0.109 0.229 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -883492 sc-eQTL 2.72e-01 0.106 0.0964 0.229 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 9.14e-01 0.00969 0.0894 0.229 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0134 0.0996 0.226 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0481 0.109 0.226 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 2.73e-02 0.231 0.104 0.226 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -883492 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0949 0.0916 0.226 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0926 0.074 0.226 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0586 0.117 0.223 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 1.29e-01 0.174 0.114 0.223 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 8.65e-01 0.02 0.118 0.223 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -883492 sc-eQTL 7.15e-01 0.026 0.071 0.223 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 1.52e-01 -0.135 0.0942 0.223 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -481038 sc-eQTL 1.76e-01 0.144 0.106 0.223 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 4.93e-02 0.204 0.103 0.223 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0361 0.1 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 5.44e-01 0.0674 0.111 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 1.00e+00 3.28e-05 0.102 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0439 0.0807 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 1.75e-01 -0.144 0.106 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 7.61e-02 -0.19 0.106 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0285 0.11 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 1.11e-01 -0.177 0.111 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 6.07e-01 0.0416 0.0806 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 9.64e-01 0.00506 0.112 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 8.64e-01 0.0171 0.0992 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 6.60e-01 0.0423 0.096 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 7.69e-01 0.0291 0.0989 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -883492 sc-eQTL 6.88e-01 0.0393 0.0977 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 7.16e-01 0.0297 0.0818 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 2.10e-01 0.12 0.0957 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0215 0.109 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 2.01e-01 0.137 0.106 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -883492 sc-eQTL 5.83e-01 0.0519 0.0945 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0686 0.0635 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 670646 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0501 0.0815 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 896482 sc-eQTL 5.14e-01 0.064 0.0978 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 670336 sc-eQTL 1.92e-02 -0.242 0.102 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -803697 sc-eQTL 2.69e-01 0.0544 0.0491 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 740685 sc-eQTL 7.88e-01 0.0309 0.115 0.231 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000185483 ROR1 490040 pQTL 0.0357 0.033 0.0157 0.0 0.0 0.226

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina