logo

Genes within 1Mb (chr1:64242055:CT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0935 0.0918 0.229 B L1
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0157 0.0954 0.229 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 5.89e-01 -0.057 0.105 0.229 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 7.36e-01 0.0219 0.0649 0.229 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 3.17e-01 -0.108 0.108 0.229 B L1
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 1.97e-01 -0.102 0.0788 0.229 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00104 0.0873 0.229 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0947 0.101 0.229 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -228074 sc-eQTL 2.21e-01 0.0739 0.0603 0.229 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 5.26e-01 0.0402 0.0633 0.229 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0273 0.091 0.229 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 9.15e-01 0.00939 0.0873 0.229 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 1.04e-01 0.156 0.0957 0.229 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 8.09e-01 -0.025 0.104 0.229 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -228074 sc-eQTL 3.71e-01 0.0469 0.0523 0.229 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 9.63e-01 0.00383 0.0826 0.229 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0631 0.103 0.229 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 1.50e-01 -0.142 0.0984 0.23 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 3.00e-01 0.106 0.102 0.23 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0241 0.114 0.23 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -905494 sc-eQTL 1.70e-01 -0.124 0.0902 0.23 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 1.26e-01 -0.115 0.0749 0.23 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -503040 sc-eQTL 1.54e-01 0.137 0.0961 0.23 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 5.07e-01 0.0662 0.0995 0.23 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 7.08e-01 0.0356 0.0948 0.229 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 9.73e-01 0.0034 0.0989 0.229 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 4.29e-01 0.0808 0.102 0.229 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -905494 sc-eQTL 6.53e-01 0.0434 0.0963 0.229 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 5.68e-01 0.0393 0.0687 0.229 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0797 0.0812 0.227 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 3.84e-01 0.083 0.0953 0.227 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 2.36e-02 -0.236 0.104 0.227 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 1.90e-01 0.064 0.0487 0.227 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 9.75e-01 0.00352 0.114 0.227 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 1.62e-01 -0.129 0.0917 0.229 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 8.77e-01 0.0143 0.0926 0.229 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0903 0.0723 0.229 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 6.09e-01 -0.036 0.0703 0.229 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -503040 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0309 0.102 0.229 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 4.26e-02 -0.226 0.111 0.229 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 9.43e-01 0.0092 0.128 0.23 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 4.07e-01 -0.102 0.122 0.23 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0406 0.117 0.23 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 6.98e-01 0.0455 0.117 0.23 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00608 0.111 0.23 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 8.46e-01 0.021 0.108 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 4.03e-01 0.0922 0.11 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 7.53e-01 0.0334 0.106 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0975 0.0913 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 1.56e-01 -0.149 0.105 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 2.50e-01 -0.124 0.107 0.228 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0246 0.109 0.228 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 3.90e-01 0.0959 0.111 0.228 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 2.64e-01 -0.103 0.0924 0.228 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0241 0.111 0.228 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 2.24e-01 -0.135 0.111 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00286 0.111 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 1.58e-01 -0.154 0.109 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0201 0.0844 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0669 0.116 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 4.64e-02 -0.215 0.107 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0145 0.113 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 1.88e-01 -0.149 0.113 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 2.81e-01 0.0945 0.0875 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 5.06e-01 0.0749 0.113 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 1.86e-01 -0.148 0.112 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0349 0.118 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 6.21e-01 0.0567 0.115 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -228074 sc-eQTL 2.50e-01 0.0479 0.0415 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00744 0.103 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 3.18e-01 -0.109 0.109 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0368 0.0886 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0369 0.0963 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 2.41e-01 -0.12 0.102 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -228074 sc-eQTL 2.60e-01 0.0682 0.0604 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 4.10e-01 0.051 0.0617 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0507 0.101 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 9.40e-02 -0.153 0.091 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0295 0.106 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0278 0.108 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -228074 sc-eQTL 7.10e-01 0.0319 0.0857 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0154 0.0701 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 6.23e-01 0.0515 0.105 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 6.22e-01 0.0543 0.11 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 8.46e-01 0.0214 0.111 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0876 0.108 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -228074 sc-eQTL 1.43e-02 0.163 0.0658 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 8.59e-01 0.0168 0.095 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 2.75e-01 -0.122 0.112 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0879 0.0989 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 5.17e-01 0.0683 0.105 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0447 0.111 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -228074 sc-eQTL 6.48e-01 0.0215 0.0469 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0984 0.0873 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 7.62e-01 0.0343 0.113 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 7.76e-01 0.029 0.102 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 2.66e-02 0.233 0.104 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0259 0.106 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -228074 sc-eQTL 8.19e-01 0.0168 0.0734 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 5.12e-02 0.172 0.0875 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 8.50e-01 0.0189 0.0998 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 2.71e-01 0.127 0.115 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0191 0.117 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 3.44e-01 -0.108 0.113 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -228074 sc-eQTL 3.40e-01 -0.057 0.0596 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 5.02e-01 0.0645 0.0959 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0566 0.116 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 9.08e-01 0.0129 0.112 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 2.88e-01 0.119 0.112 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 2.26e-01 0.137 0.113 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -228074 sc-eQTL 8.01e-01 -0.00582 0.0231 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0163 0.109 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0782 0.11 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0885 0.105 0.229 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 1.02e-01 -0.17 0.103 0.229 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 1.71e-01 -0.144 0.105 0.229 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0715 0.0951 0.229 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -503040 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0786 0.101 0.229 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 3.77e-01 -0.096 0.108 0.229 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0373 0.11 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 1.47e-01 0.163 0.112 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 2.46e-01 0.132 0.113 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0151 0.0716 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 2.98e-01 -0.117 0.112 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0624 0.0847 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 9.76e-01 0.00323 0.108 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 4.96e-02 -0.212 0.107 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 4.25e-01 0.0456 0.057 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 1.35e-01 0.175 0.116 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0739 0.116 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 4.76e-01 0.0859 0.12 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 3.43e-01 -0.107 0.112 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 1.38e-01 -0.111 0.0747 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0529 0.107 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 7.42e-01 0.0302 0.0918 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0188 0.104 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0693 0.102 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 4.53e-02 0.121 0.06 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0978 0.108 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 5.29e-01 0.0804 0.127 0.244 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 8.91e-01 0.0185 0.134 0.244 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0189 0.125 0.244 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 4.88e-01 0.0652 0.0939 0.244 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 2.08e-01 -0.172 0.136 0.244 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 5.04e-02 -0.197 0.1 0.224 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00283 0.103 0.224 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 3.31e-04 0.32 0.0877 0.224 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0703 0.0712 0.224 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -503040 sc-eQTL 6.14e-01 0.0475 0.0941 0.224 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 1.02e-01 -0.171 0.104 0.224 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 5.44e-01 0.0643 0.106 0.229 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 4.89e-01 0.0783 0.113 0.229 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0257 0.111 0.229 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -228074 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0213 0.0839 0.229 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 5.31e-01 0.0561 0.0893 0.229 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 6.41e-01 0.0496 0.106 0.229 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 2.60e-01 -0.118 0.105 0.224 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 6.01e-01 0.0557 0.106 0.224 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0483 0.115 0.224 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -905494 sc-eQTL 1.51e-01 -0.138 0.0956 0.224 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0103 0.0897 0.224 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -503040 sc-eQTL 4.36e-01 0.0769 0.0984 0.224 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 8.09e-01 0.0224 0.0925 0.224 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0532 0.0992 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0186 0.0994 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0484 0.104 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -905494 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0582 0.0981 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00853 0.0893 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 2.03e-01 0.138 0.108 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 5.76e-01 0.0614 0.11 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 3.87e-01 0.086 0.0993 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -905494 sc-eQTL 5.50e-01 0.0587 0.0981 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 1.78e-01 0.122 0.0903 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 6.41e-01 -0.058 0.124 0.233 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0113 0.132 0.233 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 1.66e-01 -0.182 0.131 0.233 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0706 0.132 0.233 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -503040 sc-eQTL 1.49e-01 0.167 0.116 0.233 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0162 0.129 0.233 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 1.80e-01 0.149 0.111 0.227 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0624 0.103 0.227 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 2.74e-01 -0.121 0.111 0.227 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -905494 sc-eQTL 1.91e-01 0.128 0.0976 0.227 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 8.23e-01 0.0204 0.0906 0.227 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0345 0.101 0.224 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0588 0.111 0.224 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 2.41e-02 0.24 0.106 0.224 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -905494 sc-eQTL 2.24e-01 -0.113 0.093 0.224 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0775 0.0753 0.224 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0953 0.117 0.223 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 7.17e-02 0.206 0.113 0.223 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 7.63e-01 0.0356 0.118 0.223 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -905494 sc-eQTL 6.36e-01 0.0336 0.071 0.223 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 1.85e-01 -0.126 0.0943 0.223 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -503040 sc-eQTL 2.55e-01 0.122 0.106 0.223 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 3.43e-02 0.219 0.103 0.223 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00658 0.101 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 5.41e-01 0.0685 0.112 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 6.94e-01 0.0407 0.103 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 7.97e-01 -0.021 0.0816 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 1.70e-01 -0.148 0.107 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 7.27e-02 -0.194 0.107 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0223 0.111 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 1.18e-01 -0.175 0.112 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 6.06e-01 0.0421 0.0814 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 9.09e-01 0.0129 0.113 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00322 0.1 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 7.30e-01 0.0336 0.0972 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 6.15e-01 0.0504 0.1 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -905494 sc-eQTL 6.28e-01 0.048 0.0988 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 6.14e-01 0.0418 0.0827 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 3.08e-01 0.0993 0.0972 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0287 0.111 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 2.27e-01 0.131 0.108 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -905494 sc-eQTL 5.83e-01 0.0527 0.0959 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0579 0.0645 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 648644 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0641 0.0821 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 874480 sc-eQTL 7.84e-01 0.0271 0.0987 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 648334 sc-eQTL 2.12e-02 -0.24 0.103 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -825699 sc-eQTL 1.85e-01 0.0658 0.0495 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 718683 sc-eQTL 5.05e-01 0.0771 0.115 0.228 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000185483 ROR1 468038 pQTL 0.0452 0.0314 0.0157 0.0 0.0 0.227

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina