logo

Genes within 1Mb (chr1:64232728:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 6.02e-02 -0.183 0.0969 0.201 B L1
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 7.34e-01 0.0344 0.101 0.201 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0896 0.112 0.201 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 3.89e-01 0.0594 0.0689 0.201 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 3.31e-01 -0.112 0.115 0.201 B L1
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 1.76e-01 -0.115 0.0845 0.201 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 1.27e-01 0.143 0.0931 0.201 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0483 0.109 0.201 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -237401 sc-eQTL 5.78e-01 0.0361 0.0648 0.201 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 7.02e-01 0.026 0.0679 0.201 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0499 0.0975 0.201 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00127 0.0933 0.201 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 2.15e-01 0.128 0.103 0.201 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0438 0.111 0.201 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -237401 sc-eQTL 6.54e-01 0.0251 0.056 0.201 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 8.34e-01 0.0185 0.0883 0.201 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0805 0.11 0.201 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0581 0.104 0.207 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 1.57e-01 0.152 0.107 0.207 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 1.91e-01 0.158 0.12 0.207 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -914821 sc-eQTL 2.40e-01 -0.112 0.0954 0.207 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0383 0.0796 0.207 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -512367 sc-eQTL 5.14e-02 0.198 0.101 0.207 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 9.37e-02 0.176 0.104 0.207 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 9.44e-01 0.00717 0.102 0.201 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 4.78e-01 0.0756 0.106 0.201 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 2.98e-01 0.114 0.11 0.201 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -914821 sc-eQTL 8.40e-01 0.0209 0.104 0.201 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 6.83e-01 0.0302 0.0739 0.201 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 1.23e-01 -0.134 0.0865 0.202 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 6.03e-01 0.0531 0.102 0.202 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 1.18e-01 -0.175 0.111 0.202 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 8.23e-01 0.0117 0.0522 0.202 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00816 0.122 0.202 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 1.98e-02 -0.231 0.0984 0.201 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00143 0.1 0.201 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 8.09e-01 -0.019 0.0785 0.201 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 4.32e-01 0.0597 0.0759 0.201 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -512367 sc-eQTL 8.88e-01 0.0156 0.111 0.201 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00104 0.121 0.201 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 7.40e-01 0.0443 0.133 0.207 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0455 0.128 0.207 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 4.92e-01 0.0841 0.122 0.207 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 3.36e-01 0.117 0.122 0.207 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00661 0.116 0.207 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0535 0.117 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 7.59e-02 0.21 0.118 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00543 0.114 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0305 0.0985 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 7.63e-02 -0.2 0.112 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 1.25e-01 -0.178 0.115 0.203 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 7.08e-01 0.0442 0.118 0.203 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 2.65e-01 -0.134 0.12 0.203 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000751 0.1 0.203 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 1.96e-01 -0.154 0.119 0.203 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 1.86e-01 -0.156 0.118 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0623 0.118 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 3.10e-01 -0.118 0.116 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 2.09e-01 0.113 0.0894 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 8.26e-01 0.0272 0.124 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 1.55e-01 -0.164 0.115 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0533 0.12 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 1.04e-01 -0.196 0.12 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 5.81e-01 0.0518 0.0937 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 5.61e-01 0.07 0.12 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0898 0.118 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0713 0.125 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0627 0.121 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -237401 sc-eQTL 3.42e-01 0.0417 0.0438 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 9.84e-01 0.0022 0.108 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0472 0.115 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 9.19e-02 -0.16 0.0943 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 8.30e-01 0.0221 0.103 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0989 0.109 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -237401 sc-eQTL 6.89e-01 0.026 0.0648 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 6.02e-01 0.0345 0.0662 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 9.74e-01 0.00354 0.109 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0454 0.0983 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 2.36e-01 0.135 0.114 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 5.50e-01 0.0695 0.116 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -237401 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0598 0.092 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0315 0.0753 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 3.73e-01 -0.1 0.112 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 5.98e-01 -0.062 0.117 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 8.21e-01 0.0267 0.118 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 8.95e-01 0.0153 0.115 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -237401 sc-eQTL 1.31e-01 0.108 0.071 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 2.22e-01 0.124 0.101 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 3.21e-01 -0.119 0.119 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 2.84e-01 -0.113 0.105 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 2.84e-01 0.12 0.112 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 8.62e-01 0.0205 0.118 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -237401 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00207 0.0499 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00247 0.0932 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0723 0.121 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 4.65e-01 0.0789 0.108 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 2.58e-01 0.126 0.111 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0199 0.112 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -237401 sc-eQTL 7.50e-01 0.0248 0.0778 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 5.31e-01 0.0587 0.0935 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 7.56e-01 0.0329 0.106 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 5.18e-01 0.0768 0.118 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 6.40e-01 0.0562 0.12 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 1.63e-01 -0.162 0.116 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -237401 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0467 0.0611 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 9.50e-02 0.164 0.0977 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 7.62e-01 -0.036 0.119 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 3.32e-01 0.116 0.12 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 2.14e-01 0.149 0.12 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 2.53e-01 0.139 0.121 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -237401 sc-eQTL 3.07e-01 0.0253 0.0247 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 6.33e-01 0.0558 0.117 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0793 0.118 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 2.13e-01 -0.141 0.113 0.201 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 3.04e-01 -0.115 0.112 0.201 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0742 0.113 0.201 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 5.78e-01 0.057 0.102 0.201 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -512367 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0104 0.109 0.201 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 8.80e-01 0.0177 0.117 0.201 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00275 0.117 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00583 0.12 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 7.61e-01 0.0368 0.121 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 5.70e-01 0.0432 0.076 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0399 0.119 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 1.60e-01 -0.126 0.0893 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0263 0.114 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 1.37e-01 -0.17 0.114 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0291 0.0604 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 2.51e-01 0.142 0.123 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 3.40e-01 -0.118 0.124 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0717 0.128 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 3.74e-01 -0.107 0.12 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0175 0.0801 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 5.09e-01 0.0755 0.114 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 8.76e-01 0.0155 0.099 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0215 0.112 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0234 0.11 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 2.48e-01 0.0754 0.0651 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0827 0.117 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0786 0.132 0.219 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0353 0.139 0.219 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 9.72e-01 -0.0045 0.129 0.219 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0215 0.0974 0.219 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 1.29e-02 -0.349 0.138 0.219 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 2.42e-02 -0.243 0.107 0.198 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 9.61e-01 0.00542 0.11 0.198 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 2.50e-02 0.217 0.0961 0.198 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0726 0.0765 0.198 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -512367 sc-eQTL 9.13e-01 0.0111 0.101 0.198 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 9.57e-01 0.00608 0.113 0.198 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 9.18e-02 0.19 0.112 0.201 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 4.07e-02 0.246 0.12 0.201 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0566 0.119 0.201 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -237401 sc-eQTL 3.98e-01 0.0758 0.0894 0.201 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 2.97e-01 0.0996 0.0952 0.201 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 3.53e-01 -0.105 0.113 0.201 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0878 0.114 0.202 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 3.86e-01 0.1 0.115 0.202 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 2.49e-01 -0.144 0.124 0.202 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -914821 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0709 0.104 0.202 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 9.35e-01 0.0079 0.0974 0.202 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -512367 sc-eQTL 8.88e-01 0.0151 0.107 0.202 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 1.45e-01 0.146 0.0998 0.202 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0172 0.106 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 8.82e-01 0.0158 0.107 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0606 0.112 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -914821 sc-eQTL 2.86e-01 -0.112 0.105 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0304 0.0957 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 5.90e-01 0.0632 0.117 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 5.58e-01 0.0696 0.119 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 2.71e-02 0.237 0.106 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -914821 sc-eQTL 9.78e-01 -0.003 0.106 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 2.35e-01 0.116 0.0977 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0742 0.134 0.203 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 3.12e-01 -0.145 0.142 0.203 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 8.79e-01 0.0217 0.142 0.203 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 4.43e-01 -0.11 0.143 0.203 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -512367 sc-eQTL 3.33e-01 0.122 0.125 0.203 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0317 0.14 0.203 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 2.34e-01 0.142 0.119 0.198 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 6.40e-01 0.0522 0.111 0.198 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 1.76e-01 -0.162 0.119 0.198 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -914821 sc-eQTL 2.10e-01 0.132 0.105 0.198 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 7.51e-01 0.031 0.0977 0.198 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 8.51e-01 0.0207 0.109 0.197 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 7.33e-01 -0.041 0.12 0.197 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 3.39e-01 0.111 0.115 0.197 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -914821 sc-eQTL 9.08e-01 0.0117 0.101 0.197 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 1.67e-01 -0.113 0.0812 0.197 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 8.69e-01 0.0208 0.126 0.201 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 1.18e-01 0.191 0.121 0.201 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 8.97e-03 0.326 0.123 0.201 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -914821 sc-eQTL 6.27e-01 -0.037 0.0759 0.201 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 4.97e-01 -0.069 0.101 0.201 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -512367 sc-eQTL 1.30e-03 0.362 0.11 0.201 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 2.67e-02 0.245 0.11 0.201 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 2.83e-01 -0.117 0.108 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 4.52e-02 0.24 0.119 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0501 0.111 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000964 0.0875 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 3.19e-02 -0.247 0.114 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 8.12e-02 -0.199 0.113 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0833 0.118 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 1.68e-01 -0.163 0.118 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 2.81e-01 0.0928 0.0858 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 5.45e-01 0.0722 0.119 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0322 0.108 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 6.26e-01 0.0511 0.105 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 2.91e-01 0.114 0.108 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -914821 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0108 0.107 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 6.09e-01 0.0458 0.0893 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 1.99e-01 0.134 0.104 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 5.35e-01 0.0738 0.119 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 9.17e-01 0.0121 0.117 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -914821 sc-eQTL 5.31e-01 0.0647 0.103 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0748 0.0692 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 639317 sc-eQTL 1.49e-01 -0.127 0.0874 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 865153 sc-eQTL 7.94e-01 0.0275 0.105 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 639007 sc-eQTL 1.09e-01 -0.179 0.111 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -835026 sc-eQTL 8.80e-01 -0.00799 0.0531 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 709356 sc-eQTL 5.72e-01 0.0699 0.123 0.203 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000088035 ALG6 865153 eQTL 0.0526 -0.0327 0.0168 0.00108 0.0 0.185

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina