logo

Genes within 1Mb (chr1:64230394:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 7.94e-01 0.0235 0.09 0.205 B L1
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 7.04e-01 0.0355 0.0933 0.205 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 7.66e-01 0.0308 0.103 0.205 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 7.29e-01 -0.022 0.0635 0.205 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 6.62e-01 0.0462 0.106 0.205 B L1
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 1.66e-01 0.106 0.0766 0.205 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 1.69e-01 0.117 0.0845 0.205 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0205 0.0985 0.205 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -239735 sc-eQTL 1.55e-01 0.0835 0.0585 0.205 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 3.61e-01 0.0563 0.0615 0.205 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0111 0.0885 0.205 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0925 0.0852 0.205 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 2.47e-01 0.109 0.0938 0.205 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 2.97e-01 0.106 0.101 0.205 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -239735 sc-eQTL 2.74e-01 0.0561 0.0511 0.205 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 4.05e-01 0.0673 0.0807 0.205 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0666 0.101 0.205 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 4.53e-01 0.0726 0.0966 0.205 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 8.97e-01 -0.013 0.0998 0.205 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0942 0.112 0.205 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -917155 sc-eQTL 3.38e-01 0.0849 0.0884 0.205 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0292 0.0737 0.205 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -514701 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00325 0.0945 0.205 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 3.61e-01 -0.089 0.0972 0.205 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 4.58e-01 0.069 0.0928 0.205 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 7.19e-01 0.0349 0.097 0.205 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 8.34e-01 -0.021 0.1 0.205 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -917155 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0643 0.0944 0.205 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0551 0.0673 0.205 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 1.05e-01 -0.128 0.0784 0.204 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 5.74e-01 -0.052 0.0924 0.204 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 5.30e-01 0.0638 0.102 0.204 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0402 0.0473 0.204 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 3.62e-01 0.101 0.11 0.204 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 4.78e-01 0.0637 0.0897 0.205 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 6.00e-02 -0.169 0.0895 0.205 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 3.06e-01 0.0724 0.0706 0.205 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00149 0.0685 0.205 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -514701 sc-eQTL 3.17e-01 0.0996 0.0993 0.205 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 2.21e-01 -0.134 0.109 0.205 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 7.83e-02 -0.213 0.12 0.196 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0867 0.116 0.196 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 3.29e-01 0.109 0.111 0.196 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0633 0.111 0.196 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 5.11e-02 -0.204 0.104 0.196 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 8.46e-02 0.188 0.109 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 8.54e-01 0.0204 0.111 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0734 0.107 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 9.25e-01 0.00866 0.0924 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0611 0.106 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 4.41e-01 0.082 0.106 0.207 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 7.35e-01 0.0367 0.108 0.207 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0433 0.11 0.207 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 6.63e-01 -0.04 0.0917 0.207 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0137 0.11 0.207 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0405 0.107 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0663 0.108 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 4.03e-01 0.0883 0.105 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 7.01e-01 0.0314 0.0816 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 7.02e-02 0.203 0.112 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0527 0.104 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 2.14e-01 -0.135 0.108 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 6.35e-01 0.0517 0.109 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 3.44e-01 0.08 0.0843 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 3.56e-01 0.1 0.108 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 4.80e-01 0.0773 0.109 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 4.71e-02 0.229 0.115 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 5.08e-01 0.0742 0.112 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -239735 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0476 0.0405 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 4.26e-01 -0.08 0.1 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 7.31e-01 0.0366 0.106 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 3.77e-01 0.0765 0.0865 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 5.99e-01 0.0495 0.094 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 7.07e-01 0.0376 0.0999 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -239735 sc-eQTL 9.28e-02 0.0992 0.0588 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0143 0.0604 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 8.53e-01 0.0184 0.0992 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 1.88e-01 0.118 0.0897 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 3.28e-01 0.102 0.104 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0351 0.106 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -239735 sc-eQTL 1.31e-01 0.127 0.0838 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 1.94e-01 0.0895 0.0687 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 5.60e-01 -0.06 0.103 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0218 0.106 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 6.81e-02 0.195 0.106 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 3.15e-02 -0.224 0.103 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -239735 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0082 0.0647 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 1.76e-01 0.124 0.0916 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 4.55e-01 0.0811 0.108 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 1.70e-01 -0.133 0.0963 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 6.48e-02 0.189 0.102 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 5.81e-01 0.0596 0.108 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -239735 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0481 0.0457 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 5.19e-01 0.0552 0.0854 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 1.62e-01 0.154 0.11 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 6.49e-02 -0.18 0.097 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0437 0.101 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 2.97e-01 0.106 0.102 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -239735 sc-eQTL 3.43e-01 0.0669 0.0704 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 8.09e-01 0.0205 0.0849 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 6.92e-01 -0.038 0.0959 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00744 0.11 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 4.14e-01 0.0913 0.111 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00406 0.108 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -239735 sc-eQTL 4.73e-02 0.112 0.0563 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0627 0.0913 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 1.98e-01 -0.142 0.11 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0284 0.11 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0112 0.111 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 1.05e-02 -0.284 0.11 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -239735 sc-eQTL 2.29e-01 0.0274 0.0227 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00361 0.107 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 1.31e-01 -0.163 0.108 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 1.78e-01 -0.14 0.104 0.206 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0439 0.103 0.206 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 4.79e-01 0.0737 0.104 0.206 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0639 0.094 0.206 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -514701 sc-eQTL 2.82e-01 0.108 0.1 0.206 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00347 0.107 0.206 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 8.41e-01 0.0212 0.106 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 6.38e-03 -0.293 0.106 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 8.75e-02 -0.186 0.108 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 4.27e-01 0.0547 0.0687 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 3.10e-01 0.109 0.107 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0655 0.0824 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 2.02e-01 0.133 0.104 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 4.99e-01 0.0712 0.105 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 7.74e-01 -0.016 0.0556 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 6.97e-01 0.0443 0.114 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 6.19e-02 -0.21 0.112 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 9.66e-01 0.00507 0.117 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 5.50e-01 0.0654 0.109 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 7.61e-01 0.0223 0.0731 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 1.93e-01 -0.136 0.104 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0963 0.0888 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0475 0.101 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 9.89e-02 0.163 0.0981 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0198 0.0588 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 2.71e-01 0.116 0.105 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 1.29e-01 -0.212 0.139 0.196 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 7.14e-02 0.264 0.145 0.196 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 2.35e-01 0.163 0.136 0.196 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 3.02e-01 0.107 0.103 0.196 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 1.52e-01 -0.215 0.149 0.196 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 1.02e-01 0.161 0.0983 0.209 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0934 0.1 0.209 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0104 0.0887 0.209 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 1.99e-01 0.0898 0.0697 0.209 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -514701 sc-eQTL 2.36e-01 -0.109 0.092 0.209 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 8.55e-01 0.0188 0.103 0.209 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 4.36e-01 0.081 0.104 0.205 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 6.62e-01 0.0486 0.111 0.205 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 3.54e-01 -0.101 0.109 0.205 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -239735 sc-eQTL 2.07e-01 0.104 0.0821 0.205 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 4.41e-02 0.176 0.087 0.205 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0423 0.104 0.205 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 4.14e-01 0.0842 0.103 0.21 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0422 0.104 0.21 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 2.58e-01 -0.128 0.112 0.21 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -917155 sc-eQTL 5.77e-01 0.0527 0.0941 0.21 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0663 0.0878 0.21 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -514701 sc-eQTL 3.19e-01 0.0963 0.0964 0.21 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00408 0.0907 0.21 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 6.09e-01 0.0505 0.0986 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 2.00e-01 -0.127 0.0984 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 2.44e-01 0.121 0.103 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -917155 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0276 0.0976 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0593 0.0886 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 9.63e-01 0.00495 0.108 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 1.65e-01 0.151 0.109 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 6.97e-01 0.0385 0.0987 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -917155 sc-eQTL 1.67e-01 0.135 0.0971 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0765 0.0898 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 7.16e-01 0.0453 0.124 0.185 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 2.20e-01 -0.162 0.132 0.185 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 8.70e-02 -0.225 0.13 0.185 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 3.88e-01 -0.114 0.132 0.185 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -514701 sc-eQTL 5.28e-01 0.0736 0.116 0.185 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 1.66e-01 -0.179 0.129 0.185 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 7.03e-01 0.0418 0.109 0.198 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00174 0.102 0.198 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 1.76e-01 -0.148 0.109 0.198 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -917155 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0827 0.0965 0.198 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0757 0.0892 0.198 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 3.36e-01 0.0944 0.0977 0.206 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 1.60e-01 -0.151 0.107 0.206 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00919 0.104 0.206 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -917155 sc-eQTL 6.95e-02 -0.163 0.0895 0.206 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 5.61e-01 0.0425 0.073 0.206 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 4.08e-01 0.0999 0.12 0.209 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 1.05e-01 -0.19 0.116 0.209 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 8.37e-01 0.0249 0.121 0.209 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -917155 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00951 0.0728 0.209 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0113 0.0972 0.209 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -514701 sc-eQTL 8.09e-02 -0.191 0.108 0.209 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 2.47e-01 -0.124 0.106 0.209 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 2.21e-01 0.124 0.101 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 6.16e-01 0.0563 0.112 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0609 0.103 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 6.25e-01 -0.04 0.0816 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0619 0.108 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0809 0.104 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 2.77e-01 -0.117 0.107 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 4.08e-01 0.0895 0.108 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 4.77e-01 0.0559 0.0784 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 4.86e-02 0.214 0.108 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 3.79e-01 0.0877 0.0995 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0194 0.0965 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 5.88e-01 0.0539 0.0993 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -917155 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0407 0.0982 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 2.20e-01 -0.101 0.0819 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 4.69e-01 0.068 0.0939 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0667 0.107 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0973 0.104 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -917155 sc-eQTL 8.28e-02 -0.16 0.0919 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 8.78e-01 0.0096 0.0623 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 636983 sc-eQTL 9.66e-02 -0.133 0.0798 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 862819 sc-eQTL 7.62e-01 0.0292 0.0964 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 636673 sc-eQTL 2.53e-01 0.117 0.102 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -837360 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0266 0.0485 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 707022 sc-eQTL 4.65e-01 0.0826 0.113 0.203 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000185483 ROR1 456377 pQTL 0.028 -0.0378 0.0172 0.0 0.0 0.172

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina