logo

Genes within 1Mb (chr1:64189409:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0431 0.129 0.103 B L1
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 2.39e-01 -0.158 0.134 0.103 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 5.27e-01 -0.094 0.148 0.103 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 9.70e-01 0.00344 0.0914 0.103 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0201 0.152 0.103 B L1
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 8.23e-01 0.0249 0.111 0.103 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 3.95e-02 0.251 0.121 0.103 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0227 0.142 0.103 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -280720 sc-eQTL 4.12e-01 0.0696 0.0847 0.103 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 8.60e-01 0.0156 0.0889 0.103 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 6.97e-01 0.0498 0.128 0.103 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 5.75e-01 0.0699 0.125 0.103 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 1.25e-01 0.21 0.137 0.103 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 2.18e-01 -0.182 0.147 0.103 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -280720 sc-eQTL 2.07e-01 0.0943 0.0745 0.103 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 3.77e-01 -0.104 0.118 0.103 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 4.35e-01 -0.115 0.147 0.103 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 3.41e-01 -0.129 0.136 0.106 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 6.21e-02 0.261 0.139 0.106 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 3.26e-01 0.154 0.157 0.106 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -958140 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0068 0.124 0.106 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 1.70e-02 -0.246 0.102 0.106 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -555686 sc-eQTL 4.54e-02 0.264 0.131 0.106 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 5.49e-01 0.0821 0.137 0.106 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 3.29e-01 0.13 0.133 0.103 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 6.07e-01 0.0713 0.139 0.103 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 6.22e-01 0.0707 0.143 0.103 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -958140 sc-eQTL 9.92e-01 0.00128 0.135 0.103 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 4.86e-01 0.0671 0.0962 0.103 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 7.95e-01 0.03 0.115 0.103 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 6.09e-03 0.369 0.133 0.103 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 3.28e-02 -0.316 0.147 0.103 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0601 0.0692 0.103 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0767 0.162 0.103 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 1.05e-02 -0.329 0.127 0.103 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 5.59e-01 0.0761 0.13 0.103 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 2.87e-01 0.108 0.102 0.103 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0456 0.0986 0.103 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -555686 sc-eQTL 6.56e-01 -0.064 0.143 0.103 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 5.15e-01 -0.102 0.157 0.103 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0119 0.186 0.099 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 5.74e-01 -0.1 0.178 0.099 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00345 0.17 0.099 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 5.94e-01 0.0905 0.17 0.099 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 3.84e-01 0.14 0.161 0.099 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 2.27e-01 0.184 0.152 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 8.03e-01 0.0387 0.155 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0167 0.149 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0984 0.128 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0169 0.147 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00585 0.149 0.103 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 2.32e-01 -0.181 0.151 0.103 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0136 0.155 0.103 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0528 0.129 0.103 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 4.65e-01 -0.113 0.154 0.103 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 1.76e-01 -0.211 0.155 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 3.61e-01 -0.143 0.156 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 3.73e-01 -0.136 0.153 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 4.18e-01 0.0959 0.118 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 9.89e-01 0.00229 0.163 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0312 0.153 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0875 0.159 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 8.44e-02 -0.275 0.159 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 3.60e-01 0.114 0.124 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 4.46e-01 0.121 0.159 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 6.77e-01 0.0628 0.151 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 3.95e-01 0.135 0.159 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 3.89e-01 0.133 0.154 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -280720 sc-eQTL 6.95e-01 0.0219 0.0559 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0543 0.138 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 1.12e-01 -0.232 0.145 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0291 0.124 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 2.46e-01 0.156 0.134 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0347 0.143 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -280720 sc-eQTL 2.81e-01 0.0912 0.0844 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0113 0.0864 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 2.81e-01 0.153 0.142 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 9.09e-01 0.0148 0.128 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 6.15e-01 0.0751 0.149 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0727 0.152 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -280720 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0257 0.12 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0738 0.0983 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 3.90e-02 -0.302 0.145 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 7.21e-01 0.0555 0.155 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 8.59e-02 0.267 0.155 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0815 0.152 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -280720 sc-eQTL 1.96e-01 0.122 0.0938 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 4.79e-01 0.0949 0.134 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 5.96e-01 0.0837 0.158 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 3.23e-01 -0.137 0.139 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 2.04e-01 0.188 0.147 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0712 0.155 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -280720 sc-eQTL 2.80e-01 0.0711 0.0656 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0585 0.123 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0764 0.159 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 9.66e-02 0.234 0.14 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 6.37e-02 0.27 0.145 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 3.07e-01 -0.15 0.146 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -280720 sc-eQTL 2.06e-01 0.128 0.101 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 7.43e-01 0.0401 0.122 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 6.57e-01 0.0615 0.138 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 5.88e-01 0.0853 0.157 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 7.39e-01 0.0531 0.159 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 4.23e-02 -0.312 0.153 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -280720 sc-eQTL 8.51e-01 0.0152 0.0811 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 1.00e-01 0.214 0.13 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 2.13e-01 0.196 0.157 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 8.42e-02 0.272 0.157 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 1.81e-01 0.212 0.158 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 4.26e-01 -0.128 0.16 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -280720 sc-eQTL 8.40e-01 -0.00658 0.0326 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 5.05e-01 0.103 0.154 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0672 0.155 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 2.35e-01 -0.178 0.149 0.104 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0305 0.148 0.104 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0138 0.15 0.104 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 4.01e-01 -0.114 0.135 0.104 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -555686 sc-eQTL 5.37e-01 0.0892 0.144 0.104 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0792 0.154 0.104 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00434 0.147 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 4.34e-01 0.118 0.151 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 8.07e-01 0.0373 0.152 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 1.90e-01 -0.126 0.0956 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 4.22e-02 -0.304 0.149 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 4.68e-01 0.0871 0.12 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 1.29e-01 0.231 0.151 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 2.48e-02 -0.342 0.151 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0483 0.0807 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 4.68e-01 0.12 0.165 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 6.09e-02 -0.304 0.161 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 5.13e-01 0.11 0.169 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 4.36e-02 -0.317 0.156 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0132 0.105 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 9.49e-02 -0.25 0.149 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 1.62e-01 0.182 0.13 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 2.29e-01 0.177 0.147 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0102 0.145 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 6.18e-01 0.043 0.0861 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 5.59e-01 0.0901 0.154 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0614 0.192 0.089 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 7.09e-01 0.0756 0.202 0.089 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0751 0.188 0.089 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 9.06e-01 0.0169 0.142 0.089 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 1.96e-01 -0.267 0.205 0.089 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 9.21e-03 -0.371 0.141 0.102 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0903 0.146 0.102 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 1.40e-03 0.407 0.126 0.102 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0234 0.101 0.102 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -555686 sc-eQTL 4.68e-01 0.0973 0.134 0.102 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 1.00e+00 -9.11e-06 0.149 0.102 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 1.90e-01 0.195 0.148 0.103 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 9.16e-02 0.268 0.158 0.103 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 2.34e-01 0.185 0.155 0.103 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -280720 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0712 0.118 0.103 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00668 0.126 0.103 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 9.60e-01 0.00753 0.149 0.103 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 4.04e-01 -0.125 0.149 0.1 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 2.43e-01 0.176 0.151 0.1 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0153 0.163 0.1 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -958140 sc-eQTL 4.78e-01 0.0969 0.136 0.1 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 1.35e-01 -0.19 0.127 0.1 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -555686 sc-eQTL 4.27e-01 0.111 0.14 0.1 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 8.75e-01 0.0207 0.131 0.1 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 7.71e-01 0.0407 0.139 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 5.90e-01 0.0753 0.14 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 4.87e-01 -0.102 0.147 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -958140 sc-eQTL 1.92e-01 -0.18 0.137 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0253 0.125 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 1.99e-01 0.198 0.154 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 8.48e-01 0.03 0.157 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 2.42e-01 0.166 0.141 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -958140 sc-eQTL 8.65e-01 0.0239 0.14 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 2.41e-01 0.151 0.129 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 3.82e-01 -0.146 0.166 0.109 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 7.77e-01 0.0503 0.177 0.109 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 2.89e-01 0.187 0.176 0.109 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 1.22e-01 -0.274 0.176 0.109 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -555686 sc-eQTL 4.86e-01 0.109 0.156 0.109 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 5.86e-01 0.0948 0.174 0.109 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 4.05e-01 0.131 0.157 0.098 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0468 0.146 0.098 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 6.80e-02 -0.286 0.156 0.098 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -958140 sc-eQTL 1.18e-01 0.216 0.138 0.098 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 7.10e-01 0.0477 0.128 0.098 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 8.85e-01 0.0202 0.14 0.1 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 9.00e-01 0.0193 0.153 0.1 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 4.38e-01 0.114 0.147 0.1 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -958140 sc-eQTL 2.34e-01 -0.153 0.128 0.1 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0296 0.104 0.1 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 3.70e-01 -0.156 0.173 0.099 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 7.10e-02 0.304 0.167 0.099 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 1.95e-01 0.225 0.173 0.099 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -958140 sc-eQTL 3.77e-01 0.0927 0.105 0.099 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0663 0.14 0.099 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -555686 sc-eQTL 5.25e-03 0.436 0.154 0.099 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 4.57e-02 0.306 0.152 0.099 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 8.69e-01 0.0233 0.141 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0647 0.156 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0133 0.144 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0413 0.114 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0382 0.15 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 3.24e-01 -0.149 0.151 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 2.68e-01 -0.173 0.155 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 1.52e-01 -0.225 0.156 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 3.10e-01 0.116 0.114 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 7.16e-01 0.0576 0.158 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 5.54e-01 0.0836 0.141 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 8.32e-01 0.0291 0.137 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 7.07e-01 0.053 0.141 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -958140 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0447 0.139 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 4.60e-01 0.086 0.116 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 5.78e-01 0.0756 0.136 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 7.64e-01 0.0464 0.154 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00442 0.151 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -958140 sc-eQTL 6.48e-01 0.0611 0.134 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0141 0.09 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 595998 sc-eQTL 6.70e-01 0.0498 0.117 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 821834 sc-eQTL 3.10e-02 0.301 0.139 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 595688 sc-eQTL 1.91e-02 -0.346 0.147 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -878345 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0495 0.0704 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 666037 sc-eQTL 6.02e-01 0.0857 0.164 0.103 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000185483 ROR1 415392 pQTL 0.0381 -0.0438 0.0211 0.0 0.0 0.111

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina