logo

Genes within 1Mb (chr1:64137298:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0471 0.129 0.081 B L1
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0486 0.134 0.081 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 3.41e-01 0.141 0.148 0.081 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0908 0.0909 0.081 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 9.76e-01 0.00457 0.152 0.081 B L1
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 5.02e-01 0.0773 0.115 0.081 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 9.66e-02 0.21 0.126 0.081 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0653 0.147 0.081 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -332831 sc-eQTL 2.81e-01 0.0946 0.0876 0.081 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 5.92e-01 0.0493 0.092 0.081 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0497 0.132 0.081 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0732 0.127 0.081 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 5.19e-02 0.271 0.139 0.081 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 1.45e-01 0.22 0.15 0.081 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -332831 sc-eQTL 5.52e-02 0.146 0.0756 0.081 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 6.35e-01 0.057 0.12 0.081 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 4.78e-01 0.107 0.15 0.081 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 3.75e-01 -0.121 0.136 0.081 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 7.69e-01 0.0414 0.141 0.081 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 8.27e-01 0.0345 0.158 0.081 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 8.60e-01 0.0185 0.104 0.081 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -607797 sc-eQTL 4.29e-01 0.106 0.133 0.081 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 6.75e-01 0.0577 0.138 0.081 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 8.97e-01 0.0174 0.135 0.081 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 5.98e-01 0.0742 0.14 0.081 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 9.18e-01 0.015 0.145 0.081 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0289 0.0976 0.081 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 1.73e-01 0.158 0.115 0.079 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0642 0.136 0.079 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 8.68e-01 0.0248 0.149 0.079 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0484 0.0695 0.079 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 2.02e-02 0.375 0.16 0.079 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 6.75e-01 0.0551 0.131 0.081 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 3.67e-01 -0.119 0.132 0.081 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 7.66e-01 0.0309 0.104 0.081 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 3.86e-01 -0.087 0.1 0.081 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -607797 sc-eQTL 7.41e-01 0.0482 0.146 0.081 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 2.29e-01 -0.192 0.159 0.081 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 4.06e-01 -0.14 0.168 0.082 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 8.48e-01 -0.031 0.161 0.082 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 2.22e-01 0.188 0.153 0.082 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 8.77e-01 0.0239 0.154 0.082 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 2.59e-01 -0.165 0.145 0.082 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 5.96e-01 0.082 0.154 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 2.14e-01 0.195 0.156 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 2.02e-01 0.193 0.151 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0454 0.13 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 9.10e-01 -0.017 0.15 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 8.67e-01 0.0255 0.152 0.082 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 2.69e-01 -0.171 0.154 0.082 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 1.65e-01 -0.218 0.157 0.082 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 7.32e-01 0.0448 0.131 0.082 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 8.95e-01 0.0206 0.156 0.082 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 4.73e-01 -0.11 0.153 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 4.60e-01 -0.114 0.154 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 2.35e-01 0.179 0.15 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0652 0.116 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 1.85e-01 0.213 0.16 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 3.64e-01 -0.138 0.151 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 3.61e-01 -0.144 0.158 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 3.94e-01 0.135 0.158 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00455 0.123 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 2.14e-01 -0.196 0.157 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 3.65e-01 0.144 0.158 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 6.95e-01 0.0659 0.168 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 5.19e-01 -0.105 0.162 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -332831 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0608 0.0588 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 1.16e-01 0.228 0.145 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0643 0.154 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 3.40e-01 0.123 0.129 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 1.83e-01 0.187 0.14 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0344 0.149 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -332831 sc-eQTL 1.29e-01 0.134 0.0878 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00723 0.0902 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0358 0.148 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 7.03e-01 0.0507 0.133 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 6.04e-01 0.0802 0.154 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 8.30e-01 0.0337 0.157 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -332831 sc-eQTL 7.13e-01 0.0459 0.124 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 9.07e-01 0.0119 0.102 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0487 0.152 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 2.19e-01 -0.192 0.156 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 2.60e-02 0.349 0.156 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00989 0.154 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -332831 sc-eQTL 8.50e-01 -0.018 0.0952 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0289 0.135 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 3.68e-01 0.144 0.159 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0304 0.14 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 6.97e-03 0.4 0.147 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 2.27e-01 0.189 0.156 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -332831 sc-eQTL 5.58e-01 0.039 0.0664 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 6.78e-01 0.0515 0.124 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 1.90e-01 0.21 0.16 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 2.20e-01 -0.177 0.144 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 5.96e-01 0.0793 0.149 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 2.84e-01 0.161 0.15 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -332831 sc-eQTL 2.16e-01 0.129 0.104 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0792 0.125 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 4.50e-01 0.107 0.141 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 2.91e-01 -0.169 0.16 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 9.55e-03 0.417 0.159 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 2.07e-01 0.198 0.157 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -332831 sc-eQTL 1.21e-01 0.128 0.0821 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 7.01e-01 0.051 0.133 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0917 0.16 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0647 0.16 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 4.78e-01 -0.114 0.16 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 4.52e-01 -0.122 0.162 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -332831 sc-eQTL 9.79e-01 0.000851 0.033 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 9.12e-01 0.0172 0.156 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 1.15e-01 -0.247 0.156 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 3.78e-01 -0.137 0.155 0.082 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00287 0.154 0.082 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 4.67e-01 0.113 0.156 0.082 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 2.72e-01 -0.155 0.14 0.082 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -607797 sc-eQTL 7.19e-01 0.0541 0.15 0.082 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 3.00e-01 -0.166 0.16 0.082 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 6.03e-01 0.0811 0.156 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 1.65e-01 -0.222 0.159 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00861 0.161 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 9.51e-01 0.00627 0.102 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 6.70e-01 0.068 0.159 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 1.64e-01 0.169 0.121 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 9.22e-01 -0.015 0.154 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 6.51e-01 0.0702 0.155 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0202 0.0817 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 1.46e-01 0.243 0.166 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 9.25e-02 -0.283 0.168 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 6.42e-01 0.0814 0.175 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0253 0.163 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0121 0.109 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 3.15e-01 -0.156 0.155 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 3.18e-01 0.13 0.13 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00227 0.148 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 6.86e-01 0.0586 0.145 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0891 0.086 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 1.65e-02 0.368 0.152 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 9.53e-01 0.0112 0.19 0.074 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 8.20e-01 0.0456 0.199 0.074 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 2.15e-01 0.23 0.184 0.074 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 7.35e-01 0.0474 0.14 0.074 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 4.42e-01 -0.157 0.203 0.074 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 2.24e-01 0.173 0.142 0.08 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 2.05e-01 -0.183 0.144 0.08 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 2.33e-01 -0.152 0.127 0.08 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 2.91e-01 0.106 0.1 0.08 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -607797 sc-eQTL 9.08e-01 0.0153 0.133 0.08 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0539 0.148 0.08 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0591 0.147 0.081 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 7.59e-01 0.0484 0.158 0.081 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 1.60e-01 -0.217 0.154 0.081 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -332831 sc-eQTL 1.05e-01 0.189 0.116 0.081 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 5.17e-01 0.0807 0.124 0.081 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0281 0.148 0.081 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 4.56e-01 -0.107 0.143 0.085 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 9.90e-01 0.00179 0.145 0.085 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 4.37e-01 -0.122 0.157 0.085 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 3.92e-01 -0.105 0.122 0.085 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -607797 sc-eQTL 2.95e-02 0.291 0.133 0.085 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 1.80e-01 0.169 0.126 0.085 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 7.26e-01 0.0492 0.14 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 5.16e-01 0.0913 0.14 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 6.01e-01 0.0771 0.147 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 9.39e-01 0.00967 0.126 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0574 0.155 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0344 0.157 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 6.03e-01 0.0742 0.142 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 2.98e-01 -0.135 0.13 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 1.85e-01 -0.276 0.207 0.064 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 8.37e-01 0.0459 0.222 0.064 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 1.56e-01 -0.313 0.22 0.064 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 1.16e-01 0.349 0.22 0.064 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -607797 sc-eQTL 1.19e-01 0.304 0.194 0.064 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 3.22e-01 -0.215 0.217 0.064 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 7.40e-01 0.0513 0.154 0.08 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 7.85e-01 0.0391 0.143 0.08 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0949 0.154 0.08 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0888 0.126 0.08 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 8.98e-01 0.0184 0.144 0.079 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0621 0.158 0.079 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 7.83e-01 0.0418 0.152 0.079 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 4.07e-01 0.0888 0.107 0.079 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 5.56e-01 -0.102 0.173 0.079 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 2.85e-01 -0.18 0.168 0.079 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0746 0.173 0.079 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 3.34e-01 0.135 0.139 0.079 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -607797 sc-eQTL 1.25e-01 -0.241 0.156 0.079 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 3.71e-01 -0.137 0.153 0.079 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 6.97e-01 0.0559 0.144 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 7.60e-01 0.0486 0.159 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 8.68e-01 0.0244 0.146 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 9.48e-01 0.00759 0.116 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 9.59e-01 0.00779 0.153 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 3.25e-01 -0.147 0.149 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 4.04e-01 -0.129 0.154 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 2.43e-01 0.181 0.155 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 4.50e-01 -0.085 0.112 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 4.55e-01 0.117 0.156 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 8.56e-01 0.026 0.144 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 7.04e-01 0.0529 0.139 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 5.40e-01 0.0878 0.143 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 3.35e-01 -0.114 0.118 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 7.28e-01 0.0472 0.135 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 6.63e-01 -0.067 0.154 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 4.52e-01 -0.113 0.151 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 8.25e-01 0.0199 0.0898 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 543887 sc-eQTL 1.78e-01 0.159 0.117 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 769723 sc-eQTL 9.67e-01 0.00585 0.141 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 543577 sc-eQTL 8.21e-01 0.0339 0.15 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -930456 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0287 0.0711 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 613926 sc-eQTL 1.79e-02 0.39 0.163 0.078 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000226891 LINC01359 -865191 eQTL 0.0343 0.113 0.0534 0.0 0.0 0.0795

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina