logo

Genes within 1Mb (chr1:64090995:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 4.52e-01 0.0979 0.13 0.109 B L1
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 6.23e-01 0.0662 0.135 0.109 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 5.00e-01 0.101 0.149 0.109 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 1.86e-01 -0.121 0.0914 0.109 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 3.28e-01 0.149 0.152 0.109 B L1
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 2.18e-01 -0.139 0.113 0.109 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00205 0.125 0.109 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0111 0.145 0.109 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -379134 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0413 0.0863 0.109 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 8.47e-01 0.0175 0.0905 0.109 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 7.82e-01 -0.036 0.13 0.109 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 3.62e-01 -0.113 0.124 0.109 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 2.48e-01 0.158 0.136 0.109 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 3.73e-01 0.131 0.147 0.109 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -379134 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0111 0.0745 0.109 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 2.92e-01 0.124 0.117 0.109 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0241 0.147 0.109 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 5.57e-01 0.0788 0.134 0.113 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 4.26e-01 0.11 0.138 0.113 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 7.48e-01 -0.05 0.155 0.113 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 4.08e-01 0.0847 0.102 0.113 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -654100 sc-eQTL 1.19e-01 0.204 0.13 0.113 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 6.15e-01 -0.068 0.135 0.113 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 1.40e-01 0.194 0.131 0.109 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00931 0.137 0.109 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0424 0.142 0.109 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0267 0.0955 0.109 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 1.70e-01 0.158 0.114 0.109 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 2.20e-01 -0.165 0.134 0.109 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0808 0.148 0.109 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 9.70e-01 0.00264 0.069 0.109 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 3.38e-01 0.154 0.161 0.109 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 8.15e-02 0.229 0.131 0.109 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 3.18e-02 0.284 0.131 0.109 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 5.97e-01 -0.055 0.104 0.109 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 4.05e-01 0.0839 0.101 0.109 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -654100 sc-eQTL 1.49e-01 0.211 0.146 0.109 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 9.69e-02 -0.266 0.159 0.109 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 5.41e-01 0.108 0.177 0.102 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 3.90e-01 -0.146 0.169 0.102 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0848 0.162 0.102 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 7.90e-01 0.0433 0.162 0.102 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 5.03e-01 0.103 0.153 0.102 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 6.41e-01 0.0743 0.159 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0407 0.162 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 8.52e-02 0.268 0.155 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 3.06e-01 -0.138 0.134 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 3.07e-01 0.158 0.154 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0567 0.155 0.108 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 6.30e-01 0.0759 0.157 0.108 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 6.71e-01 0.0683 0.161 0.108 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 6.80e-02 -0.243 0.132 0.108 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 2.96e-01 0.167 0.159 0.108 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 3.07e-01 0.161 0.157 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 6.15e-02 0.295 0.157 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0072 0.155 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 1.51e-01 -0.172 0.119 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 6.29e-01 0.0799 0.165 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00743 0.155 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 1.53e-01 -0.23 0.161 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 4.53e-01 0.122 0.162 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 2.36e-01 -0.149 0.125 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 3.57e-01 -0.149 0.161 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 2.73e-01 -0.17 0.155 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 3.62e-01 0.149 0.164 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 5.52e-01 0.0943 0.158 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -379134 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0212 0.0576 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 1.14e-01 0.224 0.141 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0127 0.151 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0848 0.127 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0158 0.138 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0198 0.147 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -379134 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0282 0.0868 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0378 0.0886 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0261 0.146 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0495 0.13 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 9.50e-01 0.0095 0.151 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 5.90e-01 -0.083 0.154 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -379134 sc-eQTL 8.31e-01 0.026 0.122 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 1.96e-01 0.129 0.0994 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 8.11e-01 0.0357 0.149 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 2.86e-01 -0.165 0.154 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 1.74e-01 0.211 0.155 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 2.30e-01 0.183 0.152 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -379134 sc-eQTL 2.72e-01 0.103 0.0938 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 9.37e-01 0.0105 0.134 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 9.36e-01 0.0127 0.158 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 4.52e-01 0.104 0.138 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 2.64e-03 0.438 0.144 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 3.10e-01 -0.157 0.154 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -379134 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0734 0.0652 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 2.55e-01 0.139 0.122 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 9.25e-01 -0.015 0.158 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 3.99e-02 -0.291 0.141 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 7.24e-02 -0.264 0.146 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 2.47e-01 0.171 0.147 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -379134 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0214 0.103 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 9.76e-01 0.00364 0.123 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 3.91e-01 -0.12 0.139 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 4.55e-01 -0.118 0.157 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 9.14e-02 0.269 0.158 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 4.08e-01 0.128 0.154 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -379134 sc-eQTL 1.22e-01 0.125 0.0807 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 7.41e-01 0.0433 0.131 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 9.03e-01 0.0193 0.158 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 3.85e-01 0.139 0.16 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0209 0.161 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 4.99e-01 -0.109 0.162 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -379134 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0379 0.0329 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 2.32e-01 -0.186 0.155 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 2.70e-01 0.173 0.157 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 2.67e-01 0.166 0.149 0.108 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 1.93e-01 0.193 0.148 0.108 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0518 0.15 0.108 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 4.24e-01 0.108 0.135 0.108 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -654100 sc-eQTL 7.43e-01 0.0474 0.144 0.108 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 2.33e-02 -0.349 0.153 0.108 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 6.68e-02 0.28 0.152 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 7.49e-01 0.0502 0.157 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 6.85e-02 -0.287 0.157 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 1.91e-01 0.13 0.0993 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 4.42e-01 -0.12 0.156 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 1.21e-01 0.186 0.119 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 4.58e-01 -0.113 0.152 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 7.29e-01 0.0531 0.153 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 9.03e-01 0.00985 0.0809 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 3.15e-01 0.166 0.165 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 4.98e-01 -0.109 0.161 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 3.27e-01 -0.164 0.167 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 4.25e-01 0.125 0.156 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 6.01e-01 0.0547 0.104 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0526 0.149 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0986 0.131 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0363 0.148 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 6.44e-02 -0.268 0.144 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0552 0.0863 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 2.81e-01 0.167 0.154 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 3.91e-01 -0.159 0.185 0.115 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 5.40e-01 -0.12 0.194 0.115 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 6.73e-01 0.0764 0.181 0.115 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 1.16e-01 -0.214 0.135 0.115 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0742 0.199 0.115 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 9.67e-01 0.0058 0.14 0.109 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 2.41e-01 0.167 0.142 0.109 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 1.25e-01 -0.192 0.125 0.109 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0537 0.0989 0.109 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -654100 sc-eQTL 1.47e-01 -0.189 0.13 0.109 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 6.52e-01 0.0658 0.146 0.109 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0565 0.148 0.109 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 2.31e-02 -0.358 0.156 0.109 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 7.62e-01 0.0472 0.155 0.109 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -379134 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0477 0.117 0.109 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 9.72e-01 0.00444 0.125 0.109 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 9.85e-01 0.00283 0.149 0.109 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 7.06e-02 0.259 0.143 0.117 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0464 0.146 0.117 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 9.55e-01 0.00884 0.158 0.117 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 5.25e-01 0.0782 0.123 0.117 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -654100 sc-eQTL 9.68e-02 0.224 0.134 0.117 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 3.76e-01 -0.112 0.126 0.117 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 5.90e-02 0.256 0.135 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0473 0.136 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0405 0.143 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0903 0.122 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 5.88e-01 0.082 0.151 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0791 0.153 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0169 0.139 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 6.32e-01 0.0607 0.126 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00944 0.174 0.1 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 7.54e-01 0.0583 0.185 0.1 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 2.42e-01 0.216 0.184 0.1 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 7.62e-01 0.0562 0.185 0.1 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -654100 sc-eQTL 1.51e-02 0.393 0.16 0.1 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 2.27e-01 -0.219 0.181 0.1 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 5.10e-01 0.0994 0.151 0.113 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000356 0.14 0.113 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 4.74e-01 0.108 0.151 0.113 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 8.76e-01 0.0192 0.123 0.113 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 4.35e-01 0.108 0.138 0.115 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 7.18e-01 0.0549 0.152 0.115 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 3.15e-01 -0.147 0.146 0.115 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0692 0.103 0.115 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 4.03e-01 -0.145 0.173 0.107 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 5.74e-01 0.0949 0.168 0.107 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 5.05e-01 -0.116 0.173 0.107 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 1.01e-01 0.228 0.138 0.107 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -654100 sc-eQTL 1.49e-01 0.227 0.156 0.107 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 4.54e-01 -0.115 0.153 0.107 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 6.93e-01 0.0578 0.146 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00521 0.161 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 3.89e-01 0.128 0.149 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 1.57e-01 -0.166 0.117 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 1.92e-01 0.202 0.154 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 4.58e-01 0.114 0.153 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 3.16e-01 0.158 0.157 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 9.23e-01 0.0154 0.159 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 1.56e-01 -0.163 0.115 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0268 0.16 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 1.04e-01 0.226 0.138 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0473 0.135 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 7.13e-01 -0.051 0.139 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0508 0.115 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 2.31e-01 0.161 0.134 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 8.11e-01 0.0365 0.152 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0813 0.149 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0237 0.0889 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 497584 sc-eQTL 4.94e-01 0.08 0.117 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 723420 sc-eQTL 1.90e-01 -0.184 0.14 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 sc-eQTL 9.73e-01 0.00509 0.149 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -976759 sc-eQTL 8.41e-01 0.0142 0.0707 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 567623 sc-eQTL 1.49e-01 0.237 0.164 0.108 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000142856 ITGB3BP 497274 eQTL 0.00547 0.155 0.0558 0.0 0.0 0.0731

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000088035 \N 723420 3.1e-07 1.56e-07 6.42e-08 2.2e-07 9.94e-08 8.37e-08 2.24e-07 5.89e-08 1.86e-07 9.72e-08 1.76e-07 1.31e-07 2.38e-07 8.07e-08 5.69e-08 9.48e-08 4.25e-08 1.91e-07 7.29e-08 5.48e-08 1.18e-07 1.76e-07 1.68e-07 3.42e-08 2.17e-07 1.56e-07 1.23e-07 1.12e-07 1.39e-07 1.1e-07 1.22e-07 3.55e-08 3.29e-08 9.5e-08 3.51e-08 3.11e-08 3.91e-08 8.37e-08 6.39e-08 5.45e-08 6e-08 1.59e-07 5.27e-08 1.28e-08 3.07e-08 1.55e-08 8.98e-08 1.91e-09 4.91e-08