logo

Genes within 1Mb (chr1:63752867:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 8.52e-01 -0.02 0.107 0.154 B L1
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 9.96e-01 0.000505 0.111 0.154 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 3.27e-01 0.0757 0.077 0.154 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 3.66e-01 -0.111 0.123 0.154 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 7.90e-01 0.0336 0.126 0.154 B L1
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 7.33e-01 0.0315 0.0923 0.154 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0687 0.102 0.154 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 1.33e-01 -0.125 0.0829 0.154 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 5.13e-02 -0.23 0.117 0.154 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -717262 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0713 0.0704 0.154 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 7.50e-01 0.0339 0.106 0.154 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000317 0.105 0.154 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 9.17e-01 -0.012 0.115 0.154 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0427 0.111 0.154 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 9.42e-02 -0.207 0.123 0.154 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -717262 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0667 0.0626 0.154 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0696 0.123 0.154 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 7.07e-01 0.0441 0.117 0.158 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 2.78e-01 -0.131 0.121 0.158 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0398 0.0971 0.158 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 5.12e-01 -0.089 0.136 0.158 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -992228 sc-eQTL 3.78e-01 0.101 0.114 0.158 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0898 0.118 0.158 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 1.89e-01 -0.151 0.115 0.154 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 4.00e-01 -0.101 0.12 0.154 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 6.54e-01 0.0352 0.0784 0.154 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 2.68e-01 -0.137 0.124 0.154 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 9.23e-01 0.00921 0.0949 0.155 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 3.99e-01 -0.094 0.111 0.155 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 7.31e-01 0.0339 0.0984 0.155 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 2.85e-01 -0.131 0.122 0.155 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 5.87e-02 0.25 0.132 0.155 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 3.25e-01 -0.108 0.109 0.154 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 1.82e-02 0.258 0.108 0.154 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0234 0.0971 0.154 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0805 0.0859 0.154 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -992228 sc-eQTL 1.25e-01 -0.186 0.121 0.154 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0151 0.133 0.154 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 2.73e-01 0.158 0.144 0.163 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 1.40e-01 0.204 0.138 0.163 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 8.87e-01 0.0193 0.136 0.163 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 1.70e-01 -0.182 0.132 0.163 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 2.13e-01 -0.156 0.125 0.163 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 4.44e-01 0.0984 0.128 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 9.77e-01 0.00381 0.131 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00139 0.106 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0925 0.126 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 2.17e-01 -0.154 0.124 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 4.16e-01 -0.103 0.126 0.153 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 7.25e-01 0.0453 0.128 0.153 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 9.66e-01 0.00493 0.114 0.153 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 8.98e-01 0.0169 0.131 0.153 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 1.24e-02 0.323 0.128 0.153 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 9.81e-01 0.00307 0.127 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0343 0.128 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 4.59e-01 0.0698 0.0941 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 3.94e-01 -0.107 0.125 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 5.05e-01 0.089 0.133 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0409 0.126 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 8.81e-01 0.0197 0.132 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 7.53e-01 0.0383 0.122 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 9.00e-01 0.0166 0.132 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 3.15e-01 0.132 0.131 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 4.26e-01 -0.107 0.135 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 2.81e-01 -0.154 0.142 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 2.30e-04 0.467 0.125 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 7.59e-02 -0.244 0.137 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -717262 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0519 0.05 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 5.89e-01 0.0709 0.131 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 5.23e-01 0.066 0.103 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 8.68e-02 -0.192 0.111 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 1.55e-01 -0.138 0.0971 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 1.07e-01 -0.192 0.118 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -717262 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0674 0.0705 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0734 0.118 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 3.49e-01 0.0997 0.106 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 7.72e-01 0.0358 0.124 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 5.12e-01 -0.07 0.107 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 2.00e-01 -0.161 0.125 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -717262 sc-eQTL 6.98e-01 0.0386 0.0996 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 1.73e-01 -0.166 0.121 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 3.45e-01 -0.12 0.126 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 6.39e-01 0.0598 0.127 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 9.52e-01 0.00733 0.121 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 3.29e-02 -0.265 0.123 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -717262 sc-eQTL 2.37e-01 -0.091 0.0767 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 2.05e-02 0.297 0.127 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 7.47e-01 0.0388 0.12 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 1.29e-01 0.194 0.127 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 9.15e-01 0.0137 0.129 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0607 0.134 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -717262 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0395 0.0568 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 4.25e-01 -0.11 0.137 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0388 0.118 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 4.14e-01 -0.1 0.122 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 4.10e-01 -0.1 0.121 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 6.73e-02 -0.225 0.122 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -717262 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0696 0.0852 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 5.25e-01 0.0737 0.116 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 8.11e-01 0.0318 0.132 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0636 0.134 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 9.11e-01 0.015 0.134 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 9.11e-01 0.0145 0.13 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -717262 sc-eQTL 3.32e-02 -0.145 0.0675 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 2.33e-01 0.158 0.132 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0228 0.137 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 3.11e-01 -0.14 0.137 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0789 0.128 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 3.71e-01 0.124 0.139 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -717262 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0185 0.0283 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 2.97e-01 -0.14 0.134 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 4.82e-01 0.0892 0.127 0.149 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 3.83e-01 0.109 0.125 0.149 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0731 0.127 0.149 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 1.74e-01 -0.172 0.126 0.149 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -992228 sc-eQTL 3.63e-01 -0.111 0.122 0.149 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 5.86e-01 0.0712 0.131 0.149 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 8.92e-01 -0.017 0.125 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 2.27e-01 -0.154 0.127 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 1.86e-01 -0.164 0.123 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 1.36e-01 -0.192 0.128 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0556 0.127 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 4.99e-01 0.067 0.0989 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0889 0.125 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 7.79e-01 0.0312 0.111 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 6.14e-01 0.0637 0.126 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 4.11e-01 0.112 0.136 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 8.09e-01 0.0331 0.137 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 6.74e-01 0.0599 0.142 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 2.22e-01 -0.154 0.126 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0112 0.133 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 2.48e-03 0.379 0.124 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0245 0.108 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 2.48e-01 -0.141 0.122 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 2.23e-01 0.141 0.115 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0376 0.12 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 2.62e-01 0.143 0.127 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 1.92e-01 -0.202 0.154 0.178 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 2.86e-01 -0.174 0.162 0.178 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0536 0.152 0.178 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0554 0.152 0.178 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0292 0.167 0.178 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0612 0.117 0.154 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 5.36e-02 0.23 0.118 0.154 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 1.76e-01 0.142 0.104 0.154 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0337 0.105 0.154 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -992228 sc-eQTL 7.53e-02 -0.194 0.109 0.154 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 3.93e-01 0.104 0.122 0.154 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 2.36e-01 0.145 0.122 0.154 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 5.68e-01 0.0749 0.131 0.154 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 3.13e-02 -0.263 0.122 0.154 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 8.36e-01 0.0266 0.129 0.154 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -717262 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0833 0.097 0.154 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0182 0.123 0.154 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 4.74e-01 0.0927 0.129 0.149 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0512 0.131 0.149 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 4.41e-01 0.0862 0.112 0.149 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 4.14e-01 0.116 0.141 0.149 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -992228 sc-eQTL 7.84e-01 0.0333 0.121 0.149 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0182 0.114 0.149 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0921 0.117 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0317 0.118 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 7.98e-01 0.0224 0.0873 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0556 0.124 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0664 0.13 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0846 0.132 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 3.55e-01 0.0977 0.105 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 8.36e-02 -0.206 0.118 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0468 0.147 0.136 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0444 0.157 0.136 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0612 0.147 0.136 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0555 0.156 0.136 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -992228 sc-eQTL 7.63e-01 0.0417 0.138 0.136 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 9.03e-01 0.0188 0.153 0.136 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0865 0.131 0.158 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 1.52e-01 -0.174 0.121 0.158 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0426 0.119 0.158 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 9.05e-01 0.0157 0.131 0.158 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 2.63e-01 0.134 0.12 0.158 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 4.07e-01 -0.109 0.132 0.158 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 6.07e-01 0.0624 0.121 0.158 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 9.45e-01 0.00882 0.127 0.158 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 2.53e-01 -0.166 0.145 0.161 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 4.23e-01 -0.114 0.141 0.161 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0766 0.13 0.161 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 3.65e-01 -0.132 0.145 0.161 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -992228 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0642 0.132 0.161 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0524 0.129 0.161 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 7.91e-01 0.0316 0.119 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 3.52e-01 0.123 0.131 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 8.53e-01 0.0172 0.0924 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 6.33e-01 -0.058 0.121 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 8.43e-01 0.0251 0.126 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 8.28e-01 -0.027 0.124 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0319 0.128 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 2.75e-01 0.0994 0.0908 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0867 0.129 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 2.55e-01 0.147 0.129 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 2.74e-01 -0.131 0.12 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0426 0.116 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 7.80e-01 0.0227 0.0811 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 1.99e-01 -0.154 0.12 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 5.45e-01 0.0696 0.115 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 1.65e-01 -0.181 0.13 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0268 0.11 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 5.39e-01 0.0786 0.128 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 159456 sc-eQTL 6.62e-01 0.0423 0.0967 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 385292 sc-eQTL 4.34e-01 -0.091 0.116 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 968735 sc-eQTL 7.01e-01 0.04 0.104 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 159146 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0519 0.123 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 sc-eQTL 5.11e-02 0.264 0.135 0.155 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 eQTL 3.32e-02 0.0671 0.0315 0.00127 0.0 0.161

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000203965 EFCAB7 229495 1.38e-06 1.36e-06 2.54e-07 1.28e-06 4.48e-07 6.47e-07 1.52e-06 3.77e-07 1.69e-06 6.9e-07 2.1e-06 1.12e-06 2.6e-06 3.34e-07 4.05e-07 1.01e-06 1.12e-06 1.1e-06 5.86e-07 4.71e-07 6.58e-07 2e-06 1.21e-06 6.89e-07 2.44e-06 8.55e-07 9.97e-07 8.31e-07 1.71e-06 1.26e-06 8.13e-07 2.56e-07 3.47e-07 5.91e-07 6.04e-07 6.24e-07 7.34e-07 3.65e-07 4.69e-07 2.04e-07 3.53e-07 1.8e-06 3.49e-07 9e-08 3.75e-07 2.3e-07 3.64e-07 1.96e-07 2.89e-07