logo

Genes within 1Mb (chr1:63741663:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 7.32e-01 0.0536 0.157 0.06 B L1
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0502 0.162 0.06 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 1.67e-02 0.269 0.111 0.06 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0229 0.18 0.06 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0209 0.184 0.06 B L1
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 3.36e-01 -0.13 0.134 0.06 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 9.66e-02 0.247 0.148 0.06 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0867 0.121 0.06 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 8.23e-01 0.0385 0.173 0.06 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -728466 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0494 0.103 0.06 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0394 0.155 0.06 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0258 0.149 0.06 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 1.16e-01 0.258 0.163 0.06 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00336 0.158 0.06 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 5.41e-01 -0.108 0.177 0.06 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -728466 sc-eQTL 1.58e-01 0.126 0.089 0.06 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 1.60e-01 0.247 0.175 0.06 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 2.21e-02 -0.382 0.165 0.059 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 5.51e-01 0.103 0.173 0.059 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 2.98e-01 0.144 0.138 0.059 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 1.36e-01 0.289 0.193 0.059 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0993 0.169 0.059 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 5.34e-01 0.101 0.162 0.06 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 4.88e-01 0.117 0.169 0.06 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0979 0.11 0.06 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 5.64e-01 -0.101 0.174 0.06 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 1.09e-01 -0.221 0.137 0.06 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 5.87e-02 0.305 0.16 0.06 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 8.29e-01 -0.031 0.143 0.06 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 5.68e-01 -0.101 0.178 0.06 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 2.20e-02 0.439 0.19 0.06 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 2.27e-01 -0.189 0.156 0.06 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0187 0.157 0.06 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 5.30e-01 0.0874 0.139 0.06 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 5.10e-01 0.0813 0.123 0.06 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 7.38e-01 0.0636 0.19 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 3.47e-01 -0.209 0.222 0.056 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 5.26e-01 -0.135 0.213 0.056 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 4.93e-01 0.143 0.209 0.056 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0318 0.204 0.056 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 4.40e-01 0.149 0.193 0.056 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 2.95e-01 0.197 0.188 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 6.11e-01 0.0975 0.192 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 9.04e-01 0.0188 0.155 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 3.58e-02 0.386 0.183 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 6.40e-01 0.0856 0.183 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 6.54e-01 0.0845 0.188 0.06 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 1.38e-01 -0.283 0.19 0.06 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 5.00e-01 0.115 0.17 0.06 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0532 0.195 0.06 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 1.05e-01 -0.314 0.193 0.06 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 1.75e-01 0.254 0.187 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 9.57e-01 -0.0103 0.188 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 1.09e-01 0.222 0.138 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 5.26e-01 -0.117 0.184 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0342 0.196 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 3.01e-01 -0.189 0.182 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 6.67e-01 -0.082 0.19 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 2.77e-01 0.192 0.176 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0611 0.191 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 2.79e-01 0.206 0.19 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 2.17e-01 -0.229 0.185 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 5.55e-01 0.116 0.196 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 9.63e-01 0.00815 0.178 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0128 0.19 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -728466 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0615 0.0689 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 6.78e-01 0.0751 0.181 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 4.13e-01 -0.124 0.151 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 1.34e-01 0.246 0.163 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0564 0.143 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 7.63e-01 0.0527 0.174 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -728466 sc-eQTL 9.22e-01 0.0101 0.103 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0245 0.173 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 5.15e-01 -0.102 0.156 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 2.86e-01 0.194 0.181 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0329 0.157 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 8.13e-01 0.0438 0.185 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -728466 sc-eQTL 7.39e-02 -0.261 0.145 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 6.24e-01 0.0878 0.179 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 1.35e-01 0.275 0.183 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 6.00e-01 0.0973 0.185 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 9.23e-01 -0.017 0.175 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 4.34e-01 0.142 0.181 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -728466 sc-eQTL 9.80e-01 -0.0028 0.112 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0277 0.187 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 1.89e-01 -0.224 0.17 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 7.22e-01 0.0646 0.182 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 7.15e-01 0.067 0.183 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 8.61e-01 0.0335 0.191 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -728466 sc-eQTL 1.48e-01 0.117 0.0805 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 7.71e-01 0.0569 0.195 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 4.03e-01 0.143 0.171 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 1.77e-02 0.419 0.175 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0273 0.176 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 4.10e-01 -0.147 0.178 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -728466 sc-eQTL 2.33e-01 0.148 0.123 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 2.88e-01 0.179 0.168 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 5.75e-01 0.108 0.192 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 1.44e-01 0.284 0.193 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 4.24e-01 -0.155 0.194 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 3.55e-01 -0.174 0.188 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -728466 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0511 0.0989 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 3.80e-01 -0.168 0.192 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 1.05e-01 0.311 0.191 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 4.68e-02 0.382 0.191 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 1.77e-01 0.242 0.179 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0528 0.194 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -728466 sc-eQTL 3.01e-02 0.0855 0.0392 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 3.24e-01 0.186 0.188 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 1.87e-01 -0.241 0.182 0.061 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 7.26e-01 0.0634 0.181 0.061 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 3.05e-01 -0.187 0.182 0.061 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 5.35e-01 -0.114 0.183 0.061 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 3.30e-01 0.183 0.188 0.061 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 2.33e-01 0.213 0.178 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 2.23e-01 0.223 0.182 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 1.99e-01 0.227 0.176 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0322 0.184 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 1.87e-03 0.559 0.177 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 2.42e-01 -0.168 0.143 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 6.06e-01 0.0941 0.182 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0757 0.161 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0163 0.183 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 3.96e-01 0.168 0.198 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 4.86e-01 -0.134 0.192 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 3.64e-01 -0.181 0.199 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 2.40e-01 -0.208 0.177 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 1.03e-01 -0.303 0.185 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 5.23e-01 -0.113 0.177 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 2.10e-02 -0.361 0.155 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 1.77e-03 0.55 0.174 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 5.67e-01 0.0966 0.168 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 1.04e-01 -0.283 0.173 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 9.74e-02 0.308 0.185 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 3.16e-01 0.221 0.22 0.063 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 1.65e-01 0.321 0.23 0.063 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 7.47e-01 0.0698 0.216 0.063 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 2.53e-01 -0.246 0.214 0.063 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 2.16e-01 0.293 0.235 0.063 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 9.40e-01 0.0129 0.171 0.061 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0204 0.174 0.061 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 2.75e-01 0.166 0.152 0.061 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 1.44e-01 0.224 0.152 0.061 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0242 0.178 0.061 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00815 0.178 0.06 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 4.82e-01 -0.133 0.19 0.06 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 3.30e-01 0.174 0.178 0.06 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 1.98e-01 -0.24 0.186 0.06 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -728466 sc-eQTL 8.36e-01 0.0292 0.141 0.06 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0586 0.178 0.06 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 3.75e-01 -0.165 0.186 0.056 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 6.86e-01 0.0763 0.189 0.056 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 3.41e-01 0.153 0.16 0.056 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 4.97e-01 0.138 0.203 0.056 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 7.64e-01 0.0493 0.164 0.056 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 7.64e-01 0.0508 0.169 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 1.20e-01 0.263 0.168 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0283 0.125 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 3.97e-01 -0.15 0.177 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 7.93e-01 0.0494 0.188 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 9.36e-01 0.0153 0.191 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 1.12e-01 -0.243 0.152 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 2.41e-01 0.202 0.172 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0905 0.19 0.07 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 7.66e-01 0.0605 0.203 0.07 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 1.24e-01 0.291 0.188 0.07 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 3.87e-01 0.174 0.201 0.07 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 1.85e-01 0.263 0.197 0.07 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0449 0.197 0.06 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 4.76e-01 0.131 0.183 0.06 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 3.92e-01 0.153 0.178 0.06 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00708 0.197 0.06 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 1.76e-01 -0.232 0.171 0.059 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 8.11e-01 0.045 0.188 0.059 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 4.81e-01 0.122 0.173 0.059 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 4.92e-01 -0.124 0.181 0.059 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 4.06e-01 -0.174 0.209 0.059 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 2.93e-01 0.214 0.203 0.059 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0568 0.187 0.059 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 6.90e-01 0.0838 0.21 0.059 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 3.86e-01 -0.161 0.185 0.059 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 3.36e-01 0.171 0.177 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 4.59e-01 -0.145 0.196 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 5.15e-01 0.0897 0.137 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 1.77e-01 0.244 0.18 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 8.78e-01 -0.029 0.188 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 8.93e-01 0.0244 0.181 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0174 0.187 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 1.45e-01 0.194 0.132 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 5.81e-01 -0.104 0.188 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 7.77e-01 0.0537 0.189 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 7.31e-01 0.0596 0.173 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 4.29e-01 0.133 0.167 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 1.20e-01 -0.181 0.116 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00826 0.173 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 2.14e-01 -0.209 0.167 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 8.76e-01 0.0298 0.191 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 4.99e-02 0.315 0.16 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 4.02e-01 -0.157 0.187 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 148252 sc-eQTL 5.36e-02 -0.269 0.139 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 374088 sc-eQTL 5.01e-02 0.328 0.166 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 957531 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0605 0.15 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 147942 sc-eQTL 4.95e-01 -0.122 0.178 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 218291 sc-eQTL 2.76e-01 0.214 0.196 0.06 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000125703 ATG4C 957531 eQTL 0.00366 -0.119 0.0408 0.0 0.0 0.0417

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000230798 \N 417222 8.15e-07 5.67e-07 1.24e-07 3.77e-07 1.07e-07 2.09e-07 5.28e-07 1.45e-07 4.43e-07 2.39e-07 6.28e-07 3.73e-07 7.53e-07 1.34e-07 2.44e-07 2.36e-07 3.13e-07 3.74e-07 2.17e-07 1.76e-07 2.3e-07 3.92e-07 3.45e-07 1.76e-07 7.42e-07 2.55e-07 3.04e-07 2.69e-07 3.86e-07 5.67e-07 2.73e-07 5.88e-08 5.86e-08 1.54e-07 3.31e-07 1.48e-07 1.05e-07 1.07e-07 6.58e-08 2.2e-08 1.23e-07 5.29e-07 4.3e-08 1.54e-08 1.69e-07 1.46e-08 1.18e-07 3.01e-08 6.26e-08