logo

Genes within 1Mb (chr1:63675102:GC:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 2.97e-01 -0.102 0.0978 0.179 B L1
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 4.20e-01 -0.082 0.101 0.179 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 6.84e-02 0.185 0.101 0.179 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 9.44e-01 0.00496 0.0706 0.179 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 6.32e-01 0.0538 0.112 0.179 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 3.56e-02 0.241 0.114 0.179 B L1
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00606 0.0848 0.179 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 4.66e-01 0.0683 0.0935 0.179 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00728 0.0948 0.179 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 1.26e-01 0.117 0.0761 0.179 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 5.32e-01 0.0679 0.109 0.179 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -795027 sc-eQTL 3.31e-01 0.063 0.0647 0.179 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 6.48e-01 0.0446 0.0975 0.179 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0285 0.0927 0.179 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00263 0.102 0.179 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 2.36e-01 0.123 0.103 0.179 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 1.51e-01 -0.141 0.0979 0.179 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 7.42e-01 0.0362 0.11 0.179 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -795027 sc-eQTL 7.79e-01 0.0157 0.0557 0.179 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 2.48e-01 -0.127 0.109 0.179 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 9.57e-01 0.00568 0.104 0.182 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 1.47e-01 -0.156 0.107 0.182 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 2.33e-01 0.131 0.11 0.182 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 2.19e-01 0.106 0.0859 0.182 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0184 0.12 0.182 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 3.92e-01 0.0898 0.105 0.182 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0816 0.101 0.179 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 1.86e-01 0.139 0.105 0.179 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 2.96e-02 -0.22 0.101 0.179 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 2.56e-01 0.0781 0.0686 0.179 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 6.33e-01 0.0519 0.109 0.179 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0743 0.0852 0.18 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 3.37e-02 -0.212 0.0991 0.18 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 9.51e-01 0.00504 0.0825 0.18 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0471 0.0885 0.18 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 3.92e-01 0.0943 0.11 0.18 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 2.88e-01 -0.127 0.119 0.18 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 2.63e-01 -0.109 0.0967 0.179 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 1.13e-01 -0.154 0.0969 0.179 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0479 0.0995 0.179 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 2.72e-02 0.189 0.0852 0.179 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 9.58e-01 0.00404 0.0764 0.179 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 3.85e-01 -0.102 0.118 0.179 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 1.95e-01 -0.167 0.128 0.184 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0133 0.123 0.184 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 4.52e-01 0.0865 0.115 0.184 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0727 0.121 0.184 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0168 0.118 0.184 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 9.70e-01 0.00419 0.112 0.184 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 9.47e-01 0.00778 0.117 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 5.84e-01 0.0648 0.118 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 1.67e-01 0.156 0.113 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 2.36e-01 0.113 0.0954 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 9.86e-01 0.00206 0.114 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 4.19e-01 0.0913 0.113 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 8.85e-01 0.0166 0.115 0.181 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 2.21e-01 -0.143 0.117 0.181 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0109 0.11 0.181 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 2.33e-01 0.124 0.104 0.181 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0206 0.119 0.181 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 5.66e-01 0.068 0.118 0.181 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 6.67e-03 -0.313 0.114 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 2.33e-01 -0.139 0.116 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 7.29e-01 0.0388 0.112 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0787 0.086 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 4.65e-01 0.0835 0.114 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 6.21e-03 0.331 0.12 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 9.83e-01 0.00245 0.113 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 3.69e-01 -0.106 0.118 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 4.39e-01 0.0879 0.113 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 8.45e-01 0.0214 0.109 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 8.39e-01 0.0241 0.118 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 9.44e-01 0.00833 0.118 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 7.86e-01 0.0326 0.12 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 1.67e-02 0.302 0.125 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 6.16e-01 0.0557 0.111 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 3.96e-01 0.0975 0.114 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 1.26e-01 0.187 0.122 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -795027 sc-eQTL 7.19e-01 0.0161 0.0446 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 1.13e-01 -0.184 0.116 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 8.98e-01 0.0123 0.0953 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0905 0.103 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 9.75e-01 0.00325 0.102 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 4.97e-02 0.176 0.0891 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 5.03e-01 0.0736 0.11 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -795027 sc-eQTL 2.71e-01 0.0717 0.0649 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 7.54e-01 0.0343 0.109 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 8.55e-01 -0.018 0.0984 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 1.81e-01 0.153 0.114 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 7.99e-01 0.0259 0.101 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0495 0.0986 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 5.65e-01 0.0669 0.116 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -795027 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0335 0.0921 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0288 0.112 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 9.84e-01 0.00226 0.116 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 1.77e-01 0.157 0.116 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 6.13e-01 0.0574 0.113 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 2.27e-01 0.133 0.11 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 3.11e-01 -0.115 0.113 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -795027 sc-eQTL 4.20e-01 0.0566 0.0702 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0281 0.118 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 6.87e-02 -0.189 0.103 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 9.66e-01 0.00477 0.111 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 9.47e-02 0.175 0.104 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 8.55e-01 0.0204 0.112 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 9.92e-01 -0.0012 0.116 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -795027 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0555 0.0491 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 9.89e-02 -0.196 0.118 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 8.57e-01 0.0192 0.107 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 1.44e-01 0.162 0.11 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 7.00e-02 0.207 0.113 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0643 0.11 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 3.08e-01 -0.113 0.111 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -795027 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00534 0.0771 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 1.62e-01 0.146 0.104 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0952 0.118 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 2.46e-01 -0.138 0.119 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 7.50e-02 0.207 0.116 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 2.55e-01 -0.135 0.119 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0796 0.116 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -795027 sc-eQTL 2.87e-01 0.0647 0.0606 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 1.68e-01 -0.163 0.117 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0325 0.122 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 1.79e-01 0.164 0.122 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 2.88e-01 -0.126 0.118 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 8.79e-01 0.0174 0.114 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 9.01e-02 0.208 0.122 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -795027 sc-eQTL 2.64e-01 -0.028 0.025 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 3.25e-01 0.118 0.119 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0897 0.116 0.177 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 9.24e-01 0.0109 0.115 0.177 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0517 0.11 0.177 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 1.02e-01 0.19 0.115 0.177 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 7.49e-01 0.0373 0.116 0.177 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 8.95e-02 -0.203 0.119 0.177 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 1.51e-02 -0.277 0.113 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 5.40e-01 -0.072 0.117 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 9.85e-01 0.00191 0.102 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 8.91e-01 0.0156 0.114 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0877 0.118 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0389 0.117 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0185 0.0898 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 1.47e-01 -0.165 0.113 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0251 0.0991 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 8.69e-01 0.0167 0.101 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 6.66e-01 0.0495 0.114 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 3.82e-01 -0.108 0.123 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 4.18e-02 -0.246 0.12 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 2.89e-01 -0.134 0.126 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00312 0.0964 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 7.44e-01 0.0366 0.112 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 2.73e-02 -0.258 0.116 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 1.19e-01 -0.175 0.111 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 3.28e-01 0.0965 0.0984 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 2.92e-01 -0.117 0.111 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 2.61e-01 0.116 0.103 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0307 0.106 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 1.19e-01 0.17 0.109 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0174 0.117 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00473 0.139 0.181 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 5.32e-03 0.401 0.141 0.181 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 5.49e-02 -0.298 0.154 0.181 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 9.75e-01 0.00432 0.136 0.181 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 9.64e-01 0.00617 0.136 0.181 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 8.20e-01 -0.034 0.149 0.181 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 9.20e-01 -0.011 0.109 0.18 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 9.00e-02 -0.188 0.11 0.18 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 4.58e-01 0.0828 0.111 0.18 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0753 0.0975 0.18 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000857 0.0979 0.18 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 5.50e-01 0.0681 0.114 0.18 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 9.73e-01 0.0038 0.111 0.179 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 4.23e-01 0.0955 0.119 0.179 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 1.39e-01 0.161 0.109 0.179 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 4.57e-03 0.314 0.11 0.179 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 1.57e-01 0.165 0.116 0.179 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -795027 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00461 0.0883 0.179 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 9.19e-02 0.188 0.111 0.179 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 8.60e-01 0.0196 0.111 0.18 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0422 0.113 0.18 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 4.12e-01 0.0907 0.11 0.18 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 5.22e-01 0.0615 0.0958 0.18 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 7.16e-01 0.0444 0.122 0.18 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 4.98e-01 0.0663 0.0976 0.18 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0129 0.105 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 7.38e-02 0.187 0.104 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 3.40e-02 -0.233 0.109 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 1.59e-01 0.109 0.0773 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0587 0.11 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 3.68e-01 -0.105 0.117 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 1.41e-01 0.174 0.118 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 4.90e-01 -0.076 0.11 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 9.92e-01 0.000958 0.0952 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 4.42e-02 0.215 0.106 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0824 0.137 0.173 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 3.38e-01 -0.14 0.146 0.173 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 9.61e-01 0.00711 0.144 0.173 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0869 0.137 0.173 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 4.28e-01 -0.116 0.146 0.173 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0617 0.143 0.173 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 7.73e-02 -0.207 0.116 0.182 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 1.16e-01 -0.172 0.109 0.182 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 1.26e-01 -0.171 0.111 0.182 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0529 0.107 0.182 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0899 0.117 0.182 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 4.34e-01 0.0836 0.106 0.179 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 9.81e-01 0.00275 0.117 0.179 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0868 0.115 0.179 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 9.29e-01 0.00964 0.108 0.179 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0773 0.113 0.179 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 2.97e-01 -0.137 0.131 0.189 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0582 0.128 0.189 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 2.04e-01 0.165 0.13 0.189 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 7.59e-01 -0.036 0.117 0.189 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 4.40e-01 0.102 0.131 0.189 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 8.58e-01 0.0208 0.116 0.189 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 3.33e-01 -0.105 0.109 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0622 0.12 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 2.64e-01 0.117 0.104 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 3.04e-01 0.0866 0.0842 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00962 0.111 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 3.07e-01 0.118 0.115 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 6.41e-02 -0.209 0.112 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 1.05e-01 -0.188 0.116 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 3.37e-01 0.104 0.108 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0628 0.0828 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 3.88e-01 0.101 0.117 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 5.51e-02 0.225 0.117 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0543 0.107 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 4.02e-02 0.212 0.103 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 3.08e-02 -0.225 0.104 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 2.53e-01 0.0827 0.0721 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 5.17e-01 0.0694 0.107 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 1.33e-01 -0.154 0.102 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 1.06e-01 -0.188 0.116 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 3.09e-01 -0.118 0.115 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0225 0.0986 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 4.90e-01 -0.079 0.114 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 81691 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0249 0.0866 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 307527 sc-eQTL 3.53e-02 -0.218 0.103 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 986716 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0226 0.0932 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 890970 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0382 0.093 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 81381 sc-eQTL 3.55e-01 0.102 0.11 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 151730 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0989 0.122 0.179 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000185483 ROR1 -98915 pQTL 0.0475 0.031 0.0156 0.0 0.0 0.209

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000203965 \N 151730 1.02e-05 2.19e-05 2.64e-06 1.15e-05 3.06e-06 5.69e-06 2.34e-05 2.18e-06 1.84e-05 8.86e-06 2.45e-05 1.29e-05 3.24e-05 1.05e-05 7.03e-06 1.03e-05 8.79e-06 1.31e-05 4.19e-06 2.84e-06 7.34e-06 1.44e-05 1.49e-05 4.68e-06 2.78e-05 5.34e-06 7.58e-06 6.14e-06 1.6e-05 1.4e-05 1.14e-05 9.9e-07 1.21e-06 4e-06 5.98e-06 3.78e-06 1.77e-06 1.95e-06 2.25e-06 1.74e-06 7.54e-07 1.97e-05 2.56e-06 2.1e-07 1.85e-06 2.61e-06 2.53e-06 9.83e-07 5.02e-07