logo

Genes within 1Mb (chr1:63673960:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 2.82e-01 -0.105 0.0976 0.182 B L1
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0588 0.101 0.182 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 7.36e-02 0.181 0.101 0.182 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 9.29e-01 0.00629 0.0705 0.182 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 6.83e-01 0.0459 0.112 0.182 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 4.28e-02 0.232 0.114 0.182 B L1
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00385 0.0844 0.182 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 5.48e-01 0.056 0.093 0.182 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 9.96e-01 0.00048 0.0943 0.182 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 1.13e-01 0.12 0.0757 0.182 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 6.40e-01 0.0507 0.108 0.182 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -796169 sc-eQTL 2.72e-01 0.0708 0.0643 0.182 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 7.54e-01 0.0304 0.097 0.182 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0375 0.0924 0.182 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00194 0.102 0.182 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 2.37e-01 0.122 0.103 0.182 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 1.32e-01 -0.148 0.0976 0.182 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 8.10e-01 0.0264 0.11 0.182 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -796169 sc-eQTL 6.26e-01 0.0271 0.0555 0.182 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 1.75e-01 -0.148 0.109 0.182 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 9.78e-01 0.00284 0.104 0.185 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 1.72e-01 -0.146 0.107 0.185 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 2.13e-01 0.137 0.109 0.185 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 2.05e-01 0.109 0.0856 0.185 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0264 0.12 0.185 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 3.28e-01 0.102 0.104 0.185 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0839 0.1 0.182 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 1.73e-01 0.143 0.104 0.182 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 3.69e-02 -0.211 0.1 0.182 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 3.33e-01 0.0665 0.0685 0.182 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 6.59e-01 0.0479 0.108 0.182 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0703 0.0851 0.182 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 3.01e-02 -0.216 0.0989 0.182 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0114 0.0823 0.182 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0502 0.0884 0.182 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 4.60e-01 0.0812 0.11 0.182 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 2.23e-01 -0.145 0.119 0.182 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 2.67e-01 -0.107 0.0964 0.182 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 1.25e-01 -0.149 0.0966 0.182 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0457 0.0992 0.182 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 2.86e-02 0.187 0.0849 0.182 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0117 0.0762 0.182 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0826 0.117 0.182 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 1.51e-01 -0.184 0.128 0.186 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 8.91e-01 0.017 0.123 0.186 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 5.23e-01 0.0734 0.115 0.186 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0951 0.121 0.186 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 9.41e-01 0.00874 0.118 0.186 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00487 0.112 0.186 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00501 0.116 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 6.04e-01 0.0613 0.118 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 1.76e-01 0.152 0.112 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 2.54e-01 0.109 0.0951 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 9.42e-01 0.00821 0.114 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 4.16e-01 0.0916 0.112 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 8.33e-01 0.0242 0.115 0.183 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 2.83e-01 -0.125 0.116 0.183 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 9.44e-01 0.00767 0.109 0.183 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 1.94e-01 0.135 0.104 0.183 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0192 0.119 0.183 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 6.34e-01 0.0563 0.118 0.183 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 1.23e-02 -0.288 0.114 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 2.34e-01 -0.138 0.116 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 8.17e-01 0.0258 0.111 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0864 0.0857 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 5.60e-01 0.0665 0.114 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 8.80e-03 0.316 0.12 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00494 0.113 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0754 0.118 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 5.13e-01 0.0741 0.113 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 7.83e-01 0.03 0.109 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 9.26e-01 0.011 0.118 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 9.25e-01 0.0111 0.118 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 6.67e-01 0.0515 0.119 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 2.28e-02 0.286 0.125 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 4.41e-01 0.085 0.11 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 3.36e-01 0.11 0.114 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 6.10e-02 0.228 0.121 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -796169 sc-eQTL 7.57e-01 0.0138 0.0444 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 8.01e-02 -0.203 0.115 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 9.01e-01 0.0118 0.0948 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0907 0.103 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 9.03e-01 0.0123 0.101 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 4.81e-02 0.176 0.0887 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 6.26e-01 0.0534 0.109 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -796169 sc-eQTL 2.22e-01 0.079 0.0645 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 8.83e-01 0.0159 0.109 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00971 0.0981 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 2.04e-01 0.145 0.114 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 8.91e-01 0.0138 0.101 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0436 0.0983 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 6.71e-01 0.0494 0.116 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -796169 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0447 0.0918 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0235 0.112 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 9.21e-01 0.0114 0.115 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 2.61e-01 0.13 0.116 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 6.79e-01 0.0468 0.113 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 2.81e-01 0.118 0.109 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 3.64e-01 -0.103 0.113 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -796169 sc-eQTL 4.58e-01 0.0521 0.07 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0169 0.117 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 5.31e-02 -0.2 0.103 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0119 0.11 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 9.29e-02 0.175 0.104 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 9.44e-01 0.00785 0.111 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0125 0.116 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -796169 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0561 0.0489 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 9.91e-02 -0.195 0.118 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 9.04e-01 0.0128 0.107 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 1.37e-01 0.164 0.11 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 9.30e-02 0.191 0.113 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0669 0.109 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 2.71e-01 -0.122 0.11 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -796169 sc-eQTL 8.73e-01 0.0123 0.0768 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 2.23e-01 0.127 0.104 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 3.74e-01 -0.105 0.117 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 3.21e-01 -0.118 0.119 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 5.79e-02 0.219 0.115 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 2.15e-01 -0.147 0.118 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 3.82e-01 -0.101 0.115 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -796169 sc-eQTL 2.97e-01 0.0632 0.0604 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 1.96e-01 -0.152 0.117 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0542 0.121 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 1.48e-01 0.176 0.121 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 4.07e-01 -0.098 0.118 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 7.82e-01 0.0314 0.114 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 9.06e-02 0.207 0.122 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -796169 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0291 0.025 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 3.80e-01 0.105 0.119 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0834 0.116 0.18 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00512 0.115 0.18 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0522 0.11 0.18 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 8.97e-02 0.196 0.115 0.18 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 8.89e-01 0.0162 0.116 0.18 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 1.23e-01 -0.184 0.119 0.18 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 1.55e-02 -0.275 0.113 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0754 0.117 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00401 0.101 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 6.75e-01 0.0476 0.113 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0835 0.118 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0452 0.116 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 7.80e-01 -0.025 0.0895 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 1.01e-01 -0.186 0.113 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0469 0.0988 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00584 0.1 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 6.59e-01 0.0504 0.114 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 3.09e-01 -0.126 0.123 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 7.82e-02 -0.212 0.12 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0963 0.125 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 9.09e-01 -0.011 0.0959 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 7.92e-01 0.0294 0.111 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 1.41e-02 -0.286 0.115 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 1.11e-01 -0.177 0.111 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 3.25e-01 0.0966 0.098 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 3.56e-01 -0.102 0.111 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 2.72e-01 0.113 0.103 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0395 0.105 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 1.58e-01 0.154 0.108 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0227 0.116 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00473 0.139 0.181 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 5.32e-03 0.401 0.141 0.181 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 5.49e-02 -0.298 0.154 0.181 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 9.75e-01 0.00432 0.136 0.181 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 9.64e-01 0.00617 0.136 0.181 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 8.20e-01 -0.034 0.149 0.181 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 8.26e-01 0.0238 0.109 0.183 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 5.81e-02 -0.209 0.11 0.183 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 4.31e-01 0.0873 0.111 0.183 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0848 0.0969 0.183 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 9.69e-01 0.00379 0.0973 0.183 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 4.26e-01 0.09 0.113 0.183 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 9.99e-01 9.9e-05 0.111 0.182 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 4.81e-01 0.0837 0.118 0.182 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 1.19e-01 0.17 0.108 0.182 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 4.93e-03 0.31 0.109 0.182 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 1.59e-01 0.164 0.116 0.182 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -796169 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00471 0.088 0.182 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 9.22e-02 0.187 0.111 0.182 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 8.92e-01 0.015 0.111 0.183 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0328 0.112 0.183 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 3.92e-01 0.0943 0.11 0.183 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 4.72e-01 0.0688 0.0956 0.183 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 6.30e-01 0.0585 0.121 0.183 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 4.16e-01 0.0793 0.0973 0.183 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00849 0.104 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 8.07e-02 0.182 0.104 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 4.56e-02 -0.219 0.109 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 1.95e-01 0.1 0.0771 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0587 0.11 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 3.47e-01 -0.11 0.117 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 1.30e-01 0.179 0.118 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0801 0.11 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00904 0.095 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 4.38e-02 0.215 0.106 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0914 0.137 0.176 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 4.25e-01 -0.116 0.145 0.176 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 9.28e-01 0.013 0.143 0.176 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0972 0.136 0.176 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 4.19e-01 -0.117 0.145 0.176 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0487 0.143 0.176 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 5.23e-02 -0.226 0.116 0.184 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 1.30e-01 -0.165 0.108 0.184 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 1.44e-01 -0.163 0.111 0.184 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 4.87e-01 -0.074 0.106 0.184 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0933 0.117 0.184 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 4.60e-01 0.0787 0.106 0.181 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 8.44e-01 0.0231 0.117 0.181 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0784 0.115 0.181 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 9.39e-01 0.00827 0.107 0.181 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0993 0.112 0.181 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 2.94e-01 -0.137 0.13 0.192 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0514 0.127 0.192 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 1.75e-01 0.176 0.129 0.192 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0344 0.117 0.192 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 5.27e-01 0.0829 0.131 0.192 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 7.99e-01 0.0296 0.116 0.192 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 2.95e-01 -0.113 0.108 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0504 0.12 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 2.43e-01 0.121 0.104 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 3.19e-01 0.0838 0.0839 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00415 0.111 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 3.48e-01 0.108 0.115 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 7.54e-02 -0.2 0.112 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 1.63e-01 -0.162 0.116 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 4.21e-01 0.0873 0.108 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0621 0.0826 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 4.93e-01 0.0801 0.117 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 6.63e-02 0.215 0.117 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0533 0.107 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 4.15e-02 0.21 0.103 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 3.66e-02 -0.217 0.103 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 3.14e-01 0.0726 0.0719 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 5.26e-01 0.0677 0.107 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 9.38e-02 -0.172 0.102 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 1.45e-01 -0.17 0.116 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 3.59e-01 -0.106 0.115 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0396 0.0983 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0993 0.114 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 80549 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0223 0.0864 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 306385 sc-eQTL 3.74e-02 -0.215 0.103 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 985574 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0384 0.093 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 889828 sc-eQTL 5.26e-01 -0.059 0.0927 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 80239 sc-eQTL 4.20e-01 0.0888 0.11 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 150588 sc-eQTL 3.40e-01 -0.116 0.121 0.181 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000185483 ROR1 -100057 pQTL 0.0444 0.0315 0.0156 0.0 0.0 0.208

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000203965 \N 150588 2.48e-06 2.59e-06 3.33e-07 1.86e-06 4.63e-07 8.22e-07 1.83e-06 6.01e-07 1.8e-06 9.51e-07 2.12e-06 1.26e-06 3.49e-06 1.38e-06 8.73e-07 1.51e-06 9.79e-07 1.99e-06 8.58e-07 1.13e-06 1.11e-06 2.9e-06 2.13e-06 1.03e-06 3.45e-06 1.3e-06 1.21e-06 1.64e-06 1.98e-06 1.85e-06 1.53e-06 3.02e-07 5.43e-07 1.21e-06 9.55e-07 9.21e-07 8.28e-07 4.46e-07 1.12e-06 3.52e-07 2.11e-07 3.37e-06 5.2e-07 2.07e-07 3.41e-07 3.33e-07 7.75e-07 2.22e-07 2.29e-07