logo

Genes within 1Mb (chr1:63671143:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0254 0.099 0.165 B L1
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0143 0.103 0.165 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 5.88e-01 0.0557 0.103 0.165 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 2.33e-01 0.0851 0.0711 0.165 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 5.41e-01 0.0694 0.113 0.165 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 6.70e-01 0.0496 0.116 0.165 B L1
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0701 0.086 0.165 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0706 0.095 0.165 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 9.17e-01 0.01 0.0963 0.165 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 9.08e-01 0.00898 0.0778 0.165 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 6.38e-01 0.052 0.11 0.165 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -798986 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0354 0.0658 0.165 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 8.38e-02 0.171 0.0984 0.165 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 4.78e-01 0.0669 0.0941 0.165 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 6.96e-01 0.0407 0.104 0.165 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0829 0.105 0.165 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 2.44e-01 0.117 0.0996 0.165 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 9.96e-01 0.000597 0.112 0.165 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -798986 sc-eQTL 1.34e-01 0.0846 0.0563 0.165 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 6.35e-01 0.0529 0.111 0.165 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 2.57e-01 -0.119 0.105 0.169 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 9.27e-01 -0.01 0.109 0.169 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 2.72e-01 -0.122 0.111 0.169 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0489 0.0871 0.169 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 5.92e-01 0.0655 0.122 0.169 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0142 0.106 0.169 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 1.94e-02 -0.241 0.102 0.165 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0648 0.108 0.165 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 1.38e-02 0.256 0.103 0.165 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 7.04e-01 0.0269 0.0707 0.165 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 6.10e-01 0.0571 0.112 0.165 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 1.08e-01 -0.141 0.0873 0.165 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 5.91e-01 0.0553 0.103 0.165 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 9.29e-01 0.00756 0.0848 0.165 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 5.75e-01 0.0511 0.091 0.165 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0379 0.113 0.165 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 2.04e-02 0.284 0.121 0.165 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0535 0.0986 0.165 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 2.69e-01 -0.11 0.0989 0.165 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 1.25e-01 0.155 0.101 0.165 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0149 0.0877 0.165 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0778 0.0776 0.165 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 6.39e-01 0.0562 0.12 0.165 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 3.71e-01 -0.118 0.131 0.163 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0735 0.126 0.163 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0836 0.117 0.163 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 2.26e-01 0.15 0.123 0.163 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0599 0.121 0.163 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 7.62e-01 0.0346 0.114 0.163 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0706 0.118 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0268 0.12 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 7.33e-01 0.0393 0.115 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 7.38e-01 0.0326 0.0974 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 3.25e-01 0.114 0.116 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 8.97e-01 0.0148 0.115 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 9.96e-01 0.00061 0.117 0.166 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 2.21e-02 -0.271 0.117 0.166 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 3.71e-01 0.0998 0.111 0.166 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 2.54e-01 0.121 0.106 0.166 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0313 0.121 0.166 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 5.04e-01 0.0804 0.12 0.166 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 4.31e-01 0.0929 0.118 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 4.34e-01 0.0927 0.118 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 8.32e-01 0.0241 0.113 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 3.51e-01 0.0815 0.0872 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0231 0.116 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 5.61e-01 0.0719 0.124 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 6.51e-01 0.0529 0.117 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 4.06e-01 0.101 0.122 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0273 0.117 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0535 0.113 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 5.94e-01 0.0652 0.122 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 7.42e-01 0.0401 0.122 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 4.68e-01 0.0869 0.12 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 4.05e-01 -0.105 0.126 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 9.23e-01 0.0107 0.111 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0849 0.114 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0586 0.122 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -798986 sc-eQTL 4.93e-01 0.0305 0.0444 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 6.37e-01 0.055 0.116 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 1.21e-01 -0.151 0.0968 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0918 0.106 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 7.77e-01 0.0294 0.104 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 4.92e-01 0.0632 0.0917 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00839 0.112 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -798986 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0604 0.0663 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 2.88e-01 0.118 0.111 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0479 0.0998 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 3.15e-01 0.116 0.116 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 9.42e-01 0.0075 0.103 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00299 0.1 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 3.96e-01 0.1 0.118 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -798986 sc-eQTL 3.90e-01 0.0804 0.0933 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 1.87e-01 0.151 0.114 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 1.93e-01 0.152 0.116 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 2.86e-01 -0.125 0.117 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 1.16e-01 -0.18 0.114 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 7.39e-02 -0.198 0.11 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 7.61e-01 -0.035 0.115 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -798986 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0447 0.071 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 8.93e-01 0.016 0.119 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0309 0.109 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0332 0.116 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 2.18e-01 -0.135 0.109 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0787 0.117 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0315 0.122 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -798986 sc-eQTL 3.11e-02 0.111 0.051 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 5.50e-02 0.238 0.123 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 2.53e-01 0.124 0.108 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0613 0.112 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 7.44e-01 0.038 0.116 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 3.15e-01 0.112 0.111 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0372 0.113 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -798986 sc-eQTL 2.35e-01 0.0931 0.0781 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 1.49e-01 -0.154 0.106 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 4.56e-01 0.0913 0.122 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 8.43e-01 0.0245 0.124 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0808 0.121 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0879 0.124 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0277 0.12 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -798986 sc-eQTL 9.74e-01 0.00206 0.0631 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 3.55e-01 -0.113 0.122 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 9.67e-01 0.00502 0.121 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 1.69e-03 0.378 0.119 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00892 0.118 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 2.39e-01 0.134 0.113 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 3.59e-01 0.113 0.123 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -798986 sc-eQTL 1.38e-01 0.0371 0.0249 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0387 0.119 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 2.72e-01 -0.125 0.113 0.167 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0156 0.112 0.167 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 3.37e-01 0.103 0.107 0.167 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 8.65e-02 -0.194 0.113 0.167 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0751 0.114 0.167 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 8.97e-01 0.0152 0.117 0.167 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 3.09e-01 -0.123 0.12 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0371 0.124 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 4.37e-01 0.0833 0.107 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 6.42e-01 0.0557 0.12 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 8.48e-01 0.024 0.125 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 4.17e-01 0.0999 0.123 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0829 0.0916 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 7.62e-01 0.0353 0.116 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 5.20e-01 0.0652 0.101 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 8.90e-01 0.0142 0.103 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 3.28e-01 -0.115 0.117 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 8.69e-02 0.216 0.126 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 2.36e-01 0.145 0.122 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0989 0.127 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0313 0.0971 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 9.00e-01 0.0142 0.113 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 3.90e-01 -0.102 0.118 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 7.69e-01 0.0332 0.113 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 1.54e-03 -0.32 0.0997 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 4.19e-01 0.0933 0.115 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 1.24e-01 -0.164 0.106 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0221 0.109 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 7.45e-01 0.0369 0.113 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 5.10e-01 0.0796 0.121 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 7.79e-01 0.0438 0.156 0.141 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0346 0.163 0.141 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 3.55e-01 0.162 0.174 0.141 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 5.32e-01 0.0953 0.152 0.141 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 9.50e-01 0.00964 0.152 0.141 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 2.58e-01 -0.189 0.166 0.141 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 3.28e-01 -0.108 0.11 0.165 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 2.96e-01 0.117 0.112 0.165 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 3.61e-02 0.234 0.111 0.165 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 2.45e-01 0.114 0.098 0.165 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0736 0.0985 0.165 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 5.54e-01 0.0679 0.115 0.165 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0114 0.114 0.165 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 1.72e-01 -0.166 0.121 0.165 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 2.53e-01 -0.128 0.111 0.165 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 4.01e-01 -0.096 0.114 0.165 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 8.06e-01 0.0294 0.12 0.165 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -798986 sc-eQTL 1.77e-01 0.122 0.0899 0.165 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 2.83e-01 0.123 0.114 0.165 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 1.65e-02 -0.273 0.113 0.173 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 2.81e-01 -0.125 0.116 0.173 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 4.91e-02 -0.223 0.113 0.173 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0569 0.0989 0.173 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0664 0.125 0.173 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00601 0.101 0.173 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 9.54e-03 -0.279 0.106 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 3.18e-01 -0.108 0.108 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 8.66e-02 0.195 0.113 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 5.64e-01 0.0463 0.0802 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 9.21e-01 0.0113 0.114 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 3.72e-01 -0.107 0.12 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 2.45e-01 -0.142 0.121 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 5.99e-01 0.0595 0.113 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 5.07e-01 -0.065 0.0977 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 7.22e-01 0.0392 0.11 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 3.24e-01 0.131 0.132 0.17 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0384 0.141 0.17 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0381 0.138 0.17 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 9.02e-01 0.0164 0.132 0.17 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0766 0.14 0.17 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 5.34e-01 0.086 0.138 0.17 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 5.47e-02 -0.235 0.122 0.162 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 5.54e-01 0.0677 0.114 0.162 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 2.09e-03 0.355 0.114 0.162 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 8.25e-01 0.0246 0.111 0.162 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 7.78e-01 0.0346 0.123 0.162 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 8.64e-01 0.0192 0.112 0.158 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 3.39e-01 0.118 0.123 0.158 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 6.26e-01 0.0593 0.121 0.158 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 2.35e-01 0.135 0.113 0.158 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 1.17e-01 0.186 0.118 0.158 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 6.69e-01 0.056 0.131 0.186 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 6.58e-01 0.0563 0.127 0.186 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 2.61e-01 -0.146 0.129 0.186 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 2.29e-01 0.14 0.116 0.186 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 1.24e-01 0.201 0.13 0.186 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 9.92e-01 0.00118 0.116 0.186 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 3.41e-01 -0.106 0.111 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 2.23e-01 -0.15 0.122 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 6.91e-01 0.0424 0.107 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 1.32e-01 0.13 0.0857 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 6.36e-01 0.0537 0.113 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 7.06e-01 0.0447 0.118 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 6.80e-01 0.0477 0.115 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 4.63e-01 0.0872 0.119 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0129 0.111 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 9.88e-01 0.00126 0.0846 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 8.72e-01 0.0192 0.12 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 5.19e-01 0.0777 0.12 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 3.37e-02 -0.234 0.109 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 1.94e-01 -0.139 0.106 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 5.09e-02 0.209 0.107 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0228 0.0744 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 9.39e-01 0.00849 0.11 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0534 0.106 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 1.96e-01 0.155 0.12 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 1.38e-02 0.291 0.117 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 1.65e-01 0.141 0.101 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 2.56e-01 0.134 0.117 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 77732 sc-eQTL 1.95e-01 -0.116 0.0894 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 303568 sc-eQTL 4.95e-01 0.0737 0.108 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 982757 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0147 0.0966 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 887011 sc-eQTL 5.61e-01 0.0561 0.0963 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0674 0.114 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 147771 sc-eQTL 6.49e-02 0.232 0.125 0.166 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 eQTL 0.00421 -0.108 0.0376 0.0 0.0 0.183

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000142856 ITGB3BP 77422 8.08e-06 9.23e-06 1.35e-06 4.79e-06 2.45e-06 3.82e-06 9.8e-06 2.15e-06 8.41e-06 4.99e-06 1.1e-05 5.06e-06 1.34e-05 3.88e-06 2.49e-06 6.54e-06 3.75e-06 6.85e-06 2.66e-06 2.79e-06 4.98e-06 8.39e-06 7.17e-06 3.25e-06 1.28e-05 3.89e-06 4.74e-06 3.75e-06 9.27e-06 7.95e-06 4.75e-06 1.11e-06 1.12e-06 3.39e-06 4.14e-06 2.62e-06 1.85e-06 1.95e-06 2.16e-06 9.86e-07 1.11e-06 1.14e-05 1.25e-06 2.5e-07 7.9e-07 1.73e-06 1.4e-06 6.92e-07 4.9e-07