logo

Genes within 1Mb (chr1:63662538:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0257 0.0999 0.16 B L1
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 9.60e-01 0.00526 0.104 0.16 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 3.53e-01 0.0962 0.103 0.16 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 1.64e-01 0.1 0.0717 0.16 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 5.84e-01 0.0628 0.114 0.16 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 5.25e-01 0.0746 0.117 0.16 B L1
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0826 0.0868 0.16 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0664 0.0959 0.16 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 8.08e-01 0.0236 0.0972 0.16 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 9.82e-01 0.00179 0.0785 0.16 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 7.43e-01 0.0366 0.111 0.16 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -807591 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0332 0.0665 0.16 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 9.84e-02 0.165 0.0994 0.16 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 5.38e-01 0.0586 0.095 0.16 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 6.28e-01 0.0508 0.105 0.16 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0796 0.106 0.16 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 1.50e-01 0.145 0.1 0.16 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 7.43e-01 -0.037 0.113 0.16 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -807591 sc-eQTL 1.18e-01 0.0892 0.0567 0.16 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 4.98e-01 0.0762 0.112 0.16 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 2.33e-01 -0.126 0.105 0.164 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0128 0.109 0.164 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 2.27e-01 -0.135 0.111 0.164 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0431 0.0874 0.164 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 5.60e-01 0.0714 0.122 0.164 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0141 0.106 0.164 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 3.06e-02 -0.224 0.103 0.16 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0714 0.109 0.16 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 1.14e-02 0.264 0.104 0.16 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 7.36e-01 0.024 0.0711 0.16 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 6.82e-01 0.0461 0.112 0.16 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 8.61e-02 -0.152 0.0883 0.161 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 7.86e-01 0.0284 0.104 0.161 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 9.56e-01 0.00478 0.0859 0.161 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 6.14e-01 0.0465 0.0921 0.161 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0246 0.115 0.161 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 2.48e-02 0.278 0.123 0.161 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0595 0.0992 0.16 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0748 0.0996 0.16 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 2.27e-01 0.123 0.101 0.16 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 7.77e-01 -0.025 0.0882 0.16 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0868 0.078 0.16 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 8.36e-01 0.025 0.121 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0785 0.132 0.161 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 3.37e-01 -0.122 0.126 0.161 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 2.41e-01 -0.138 0.117 0.161 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 3.60e-01 0.113 0.124 0.161 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0339 0.121 0.161 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 7.09e-01 0.0428 0.115 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0495 0.119 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 9.72e-01 -0.0043 0.121 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 5.38e-01 0.0714 0.116 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 6.91e-01 0.039 0.0979 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 4.53e-01 0.0877 0.117 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 8.79e-01 0.0176 0.116 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 8.42e-01 0.0235 0.118 0.162 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 4.63e-02 -0.238 0.119 0.162 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 4.18e-01 0.0911 0.112 0.162 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 3.23e-01 0.105 0.106 0.162 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 9.54e-01 0.00704 0.122 0.162 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 2.75e-01 0.132 0.121 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 4.59e-01 0.0882 0.119 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 3.17e-01 0.12 0.119 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 7.47e-01 0.037 0.114 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 3.44e-01 0.0834 0.088 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0424 0.117 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 7.17e-01 0.0453 0.125 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 7.39e-01 0.0393 0.118 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 4.85e-01 0.0857 0.122 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 9.75e-01 0.00376 0.118 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0202 0.113 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 5.09e-01 0.0813 0.123 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 5.32e-01 0.0767 0.122 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 6.29e-01 0.0581 0.12 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0875 0.127 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 7.14e-01 0.0407 0.111 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0304 0.115 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0281 0.123 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -807591 sc-eQTL 4.65e-01 0.0326 0.0446 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 7.82e-01 0.0324 0.117 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 1.39e-01 -0.145 0.0977 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0652 0.107 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 5.98e-01 0.0553 0.105 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 6.76e-01 0.0387 0.0926 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0202 0.113 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -807591 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0536 0.067 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 3.25e-01 0.111 0.112 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0819 0.101 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 3.71e-01 0.105 0.117 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 8.03e-01 0.0259 0.104 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 6.78e-01 0.0419 0.101 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 6.53e-01 0.0536 0.119 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -807591 sc-eQTL 4.87e-01 0.0655 0.0942 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 2.02e-01 0.147 0.115 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 2.25e-01 0.143 0.117 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 2.32e-01 -0.142 0.118 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 5.70e-02 -0.219 0.115 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 7.01e-02 -0.203 0.111 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0244 0.116 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -807591 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0414 0.0715 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 7.61e-01 0.0365 0.12 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0742 0.11 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0458 0.117 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 1.22e-01 -0.172 0.111 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0889 0.118 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0454 0.123 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -807591 sc-eQTL 3.22e-02 0.111 0.0516 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 2.74e-02 0.277 0.125 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 2.36e-01 0.13 0.109 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0276 0.113 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 6.36e-01 0.0556 0.117 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 2.79e-01 0.122 0.112 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 6.48e-01 -0.052 0.114 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -807591 sc-eQTL 1.84e-01 0.105 0.0787 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 1.69e-01 -0.148 0.107 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 4.00e-01 0.104 0.123 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 7.82e-01 0.0345 0.125 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0319 0.122 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0257 0.124 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0884 0.121 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -807591 sc-eQTL 8.92e-01 0.0086 0.0635 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 3.24e-01 -0.122 0.123 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 8.17e-01 0.0285 0.123 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 3.36e-03 0.358 0.121 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 9.72e-01 0.00421 0.119 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 1.80e-01 0.154 0.114 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 4.27e-01 0.0987 0.124 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -807591 sc-eQTL 1.42e-01 0.0371 0.0252 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 8.57e-01 0.0217 0.12 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 3.13e-01 -0.115 0.114 0.162 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00415 0.113 0.162 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 3.98e-01 0.0915 0.108 0.162 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 3.87e-02 -0.235 0.113 0.162 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 3.28e-01 -0.112 0.114 0.162 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00736 0.118 0.162 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 2.83e-01 -0.131 0.121 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0162 0.125 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 2.46e-01 0.125 0.108 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 6.39e-01 0.0567 0.121 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00723 0.126 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 4.21e-01 0.0999 0.124 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0952 0.0927 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 9.13e-01 0.0129 0.118 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 6.28e-01 0.0498 0.103 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 9.38e-01 0.00815 0.104 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0681 0.118 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 6.04e-02 0.24 0.127 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 1.89e-01 0.162 0.123 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 3.41e-01 -0.122 0.127 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 6.31e-01 -0.047 0.0976 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 7.26e-01 0.0398 0.113 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 3.88e-01 -0.103 0.119 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 8.96e-01 0.0148 0.114 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 1.74e-03 -0.321 0.101 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 6.71e-01 0.0498 0.117 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 1.01e-01 -0.177 0.108 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 7.80e-01 -0.031 0.111 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 7.43e-01 0.0377 0.115 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 7.13e-01 0.045 0.122 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 6.43e-01 0.0733 0.158 0.141 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0954 0.166 0.141 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 3.23e-01 0.175 0.177 0.141 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 4.19e-01 0.125 0.154 0.141 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 8.97e-01 -0.02 0.154 0.141 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 2.36e-01 -0.201 0.168 0.141 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 3.57e-01 -0.101 0.109 0.161 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 2.62e-01 0.125 0.111 0.161 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 6.19e-02 0.208 0.111 0.161 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 2.78e-01 0.106 0.0976 0.161 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0246 0.0982 0.161 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 8.31e-01 0.0244 0.114 0.161 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 9.84e-01 0.00235 0.115 0.16 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 9.62e-02 -0.204 0.122 0.16 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 1.41e-01 -0.165 0.112 0.16 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 3.16e-01 -0.115 0.115 0.16 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 5.41e-01 0.0736 0.12 0.16 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -807591 sc-eQTL 1.03e-01 0.148 0.0904 0.16 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 3.07e-01 0.118 0.115 0.16 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 1.56e-02 -0.277 0.113 0.168 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 2.76e-01 -0.127 0.116 0.168 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 1.72e-02 -0.271 0.113 0.168 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0469 0.0995 0.168 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0295 0.126 0.168 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0145 0.101 0.168 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 1.43e-02 -0.265 0.107 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 2.87e-01 -0.116 0.109 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 9.31e-02 0.192 0.114 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 6.02e-01 0.0421 0.0806 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 9.76e-01 0.00339 0.114 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 3.98e-01 -0.102 0.12 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 3.96e-01 -0.104 0.122 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 4.66e-01 0.0826 0.113 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 6.11e-01 -0.05 0.0981 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 7.30e-01 0.0383 0.111 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 1.71e-01 0.182 0.132 0.167 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0182 0.142 0.167 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0309 0.139 0.167 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 6.01e-01 0.0697 0.133 0.167 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0808 0.141 0.167 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 4.20e-01 0.112 0.139 0.167 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 5.71e-02 -0.233 0.122 0.158 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 8.78e-01 0.0176 0.115 0.158 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 3.17e-03 0.342 0.115 0.158 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 7.12e-01 0.0413 0.112 0.158 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 9.68e-01 0.00487 0.123 0.158 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 8.32e-01 0.0239 0.113 0.154 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 4.18e-01 0.1 0.124 0.154 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 5.67e-01 0.0699 0.122 0.154 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 3.15e-01 0.115 0.114 0.154 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 1.30e-01 0.18 0.118 0.154 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 7.75e-01 0.0377 0.131 0.181 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 5.93e-01 0.0686 0.128 0.181 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 3.12e-01 -0.132 0.13 0.181 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 2.18e-01 0.144 0.117 0.181 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 1.04e-01 0.213 0.131 0.181 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 8.89e-01 0.0164 0.117 0.181 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0889 0.112 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 3.49e-01 -0.116 0.124 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 6.20e-01 0.0534 0.108 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 1.59e-01 0.122 0.0865 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 6.17e-01 0.0572 0.114 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 4.41e-01 0.0917 0.119 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 7.21e-01 0.0415 0.116 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 4.09e-01 0.0987 0.119 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 8.55e-01 0.0204 0.112 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 8.14e-01 0.0201 0.0852 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 9.28e-01 0.0108 0.121 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 5.24e-01 0.0772 0.121 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 4.30e-02 -0.224 0.11 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 2.50e-01 -0.123 0.107 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 3.76e-02 0.224 0.107 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0204 0.0747 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 9.64e-01 0.00503 0.111 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0556 0.106 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 3.70e-01 0.108 0.12 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 1.66e-02 0.284 0.118 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 1.72e-01 0.139 0.101 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 3.54e-01 0.109 0.118 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 69127 sc-eQTL 1.54e-01 -0.13 0.0905 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 294963 sc-eQTL 7.20e-01 0.0392 0.109 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 974152 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0356 0.0978 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 878406 sc-eQTL 5.98e-01 0.0516 0.0976 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0489 0.116 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 139166 sc-eQTL 7.47e-02 0.227 0.127 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 eQTL 0.00297 -0.112 0.0376 0.0 0.0 0.184

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000142856 ITGB3BP 68817 1.43e-05 2.73e-05 7.73e-06 7.15e-06 2.44e-06 3.82e-06 1.19e-05 1.51e-06 1.01e-05 5.08e-06 1.2e-05 5.63e-06 1.6e-05 4.76e-06 5.23e-06 9e-06 1.48e-05 1.18e-05 3.31e-06 2.68e-06 6.48e-06 1.16e-05 9.43e-06 3.36e-06 2.1e-05 4.5e-06 6.02e-06 4.58e-06 1.18e-05 7.94e-06 6.58e-06 9.76e-07 1.12e-06 3.29e-06 3.56e-06 2.69e-06 2.15e-06 1.85e-06 1.6e-06 8.89e-07 4.51e-07 1.69e-05 2.63e-06 2.64e-07 6.97e-07 1.53e-06 1.82e-06 6.84e-07 5.83e-07