logo

Genes within 1Mb (chr1:63661333:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0594 0.0978 0.169 B L1
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0097 0.101 0.169 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 6.04e-01 0.0526 0.101 0.169 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 1.57e-01 0.0997 0.0702 0.169 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 7.56e-01 0.0349 0.112 0.169 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 5.99e-01 0.0605 0.115 0.169 B L1
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0511 0.0848 0.169 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0786 0.0935 0.169 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 8.44e-01 0.0187 0.0948 0.169 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 7.76e-01 0.0218 0.0766 0.169 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 6.79e-01 0.045 0.109 0.169 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -808796 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0388 0.0648 0.169 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 1.67e-01 0.135 0.0971 0.169 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 4.74e-01 0.0666 0.0928 0.169 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 6.52e-01 0.0463 0.102 0.169 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0782 0.104 0.169 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 2.31e-01 0.118 0.0983 0.169 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0705 0.11 0.169 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -808796 sc-eQTL 1.27e-01 0.0849 0.0555 0.169 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 7.60e-01 0.0336 0.11 0.169 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 2.49e-01 -0.119 0.103 0.171 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 8.73e-01 0.017 0.106 0.171 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 1.73e-01 -0.148 0.109 0.171 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0564 0.0853 0.171 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 5.60e-01 0.0697 0.119 0.171 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00776 0.104 0.171 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 4.72e-02 -0.201 0.101 0.169 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0701 0.106 0.169 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 3.44e-02 0.216 0.102 0.169 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 9.00e-01 0.00874 0.0693 0.169 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 5.81e-01 0.0606 0.109 0.169 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 5.89e-02 -0.163 0.0859 0.17 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 7.92e-01 0.0268 0.102 0.17 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0017 0.0837 0.17 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 7.79e-01 0.0252 0.0898 0.17 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0442 0.112 0.17 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 3.65e-02 0.253 0.12 0.17 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0894 0.0966 0.169 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0906 0.097 0.169 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 3.34e-01 0.0959 0.099 0.169 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00627 0.0859 0.169 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 2.09e-01 -0.0956 0.0759 0.169 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 7.84e-01 0.0322 0.118 0.169 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0493 0.128 0.168 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 3.77e-01 -0.109 0.123 0.168 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 2.45e-01 -0.133 0.114 0.168 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 3.70e-01 0.108 0.12 0.168 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0242 0.118 0.168 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 6.12e-01 0.0566 0.111 0.168 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0434 0.116 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00992 0.118 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00497 0.113 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 6.30e-01 0.0459 0.0953 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 6.58e-01 0.0504 0.114 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 9.04e-01 0.0136 0.113 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 8.12e-01 0.0274 0.115 0.17 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 3.36e-02 -0.248 0.116 0.17 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 4.00e-01 0.0925 0.11 0.17 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 3.04e-01 0.107 0.104 0.17 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 9.61e-01 0.0059 0.119 0.17 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 4.38e-01 0.092 0.118 0.17 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 5.16e-01 0.0756 0.116 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 5.43e-01 0.0711 0.117 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 6.93e-01 0.0443 0.112 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 3.92e-01 0.0739 0.0861 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0408 0.114 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 6.64e-01 0.0531 0.122 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00411 0.115 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 4.08e-01 0.0991 0.12 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0252 0.115 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00658 0.111 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 4.89e-01 0.0833 0.12 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 5.28e-01 0.0756 0.12 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 7.25e-01 0.0412 0.117 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 4.48e-01 -0.094 0.124 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 7.38e-01 0.0362 0.108 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0563 0.112 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 9.45e-01 0.00833 0.12 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -808796 sc-eQTL 6.11e-01 0.0221 0.0435 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 8.32e-01 0.0241 0.114 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 2.36e-01 -0.114 0.0958 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 6.53e-01 -0.047 0.104 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 9.42e-01 0.00742 0.103 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 7.98e-01 0.0232 0.0907 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00662 0.111 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -808796 sc-eQTL 3.53e-01 -0.061 0.0655 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 4.79e-01 0.078 0.11 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 6.70e-01 -0.042 0.0983 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 5.07e-01 0.0758 0.114 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 8.34e-01 0.0212 0.101 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 3.99e-01 0.0831 0.0984 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 6.53e-01 0.0523 0.116 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -808796 sc-eQTL 5.12e-01 0.0604 0.092 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 1.59e-01 0.158 0.112 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 2.85e-01 0.123 0.115 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 1.59e-01 -0.162 0.115 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 1.20e-01 -0.175 0.112 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 9.33e-02 -0.183 0.109 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 9.90e-01 0.00143 0.113 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -808796 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0208 0.0697 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 9.31e-01 0.0101 0.117 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0343 0.107 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0245 0.114 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 1.07e-01 -0.174 0.107 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 3.13e-01 -0.116 0.115 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0624 0.119 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -808796 sc-eQTL 4.27e-02 0.102 0.0502 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 4.49e-02 0.245 0.121 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 3.17e-01 0.107 0.107 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0515 0.111 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 7.49e-01 0.0367 0.114 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 3.50e-01 0.103 0.11 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0651 0.111 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -808796 sc-eQTL 1.85e-01 0.102 0.0768 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 1.97e-01 -0.135 0.104 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 5.35e-01 0.0747 0.12 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 9.11e-01 0.0136 0.122 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0353 0.119 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 8.82e-01 -0.018 0.122 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0913 0.118 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -808796 sc-eQTL 9.99e-01 -7.19e-05 0.062 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 2.63e-01 -0.135 0.12 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00732 0.119 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 8.44e-03 0.312 0.117 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0432 0.116 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 2.03e-01 0.142 0.111 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 1.99e-01 0.154 0.12 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -808796 sc-eQTL 2.48e-03 0.0735 0.024 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00691 0.117 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 2.33e-01 -0.133 0.111 0.171 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0259 0.11 0.171 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 6.50e-01 0.0479 0.105 0.171 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 5.63e-02 -0.212 0.11 0.171 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0993 0.111 0.171 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 8.18e-01 0.0264 0.115 0.171 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 2.33e-01 -0.14 0.117 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 9.41e-01 0.00901 0.121 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 3.65e-01 0.0948 0.104 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 5.64e-01 0.0674 0.117 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 7.20e-01 0.0437 0.122 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 3.99e-01 0.101 0.12 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 1.74e-01 -0.123 0.0901 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 9.23e-01 0.0111 0.115 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 7.81e-01 0.0278 0.0999 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00566 0.102 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 3.54e-01 -0.107 0.115 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 9.76e-02 0.206 0.124 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 1.61e-01 0.168 0.12 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 3.87e-01 -0.108 0.124 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0586 0.0952 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 7.93e-01 0.0291 0.111 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0847 0.116 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 6.17e-01 0.0555 0.111 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 2.96e-03 -0.296 0.0984 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 6.27e-01 0.0552 0.114 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 9.69e-02 -0.174 0.105 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0538 0.108 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 8.56e-01 0.0202 0.111 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 7.15e-01 0.0433 0.119 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 7.82e-01 0.0438 0.158 0.148 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0912 0.166 0.148 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 3.67e-01 0.16 0.177 0.148 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 4.23e-01 0.124 0.154 0.148 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 9.71e-01 -0.0056 0.154 0.148 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 1.28e-01 -0.257 0.168 0.148 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 2.10e-01 -0.133 0.106 0.17 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 4.42e-01 0.0832 0.108 0.17 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 5.48e-02 0.208 0.108 0.17 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 1.75e-01 0.129 0.0946 0.17 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0417 0.0952 0.17 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 8.35e-01 0.023 0.111 0.17 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0234 0.111 0.169 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 1.13e-01 -0.188 0.118 0.169 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 1.42e-01 -0.16 0.108 0.169 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 2.63e-01 -0.124 0.111 0.169 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 7.35e-01 0.0395 0.116 0.169 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -808796 sc-eQTL 8.73e-02 0.15 0.0874 0.169 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 4.05e-01 0.0929 0.111 0.169 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 1.92e-02 -0.261 0.11 0.176 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 3.55e-01 -0.105 0.113 0.176 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 1.43e-02 -0.271 0.11 0.176 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0485 0.0968 0.176 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0294 0.123 0.176 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00047 0.0986 0.176 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 1.72e-02 -0.251 0.104 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 2.39e-01 -0.125 0.106 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 1.64e-01 0.155 0.111 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 5.93e-01 0.042 0.0785 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 7.49e-01 0.0356 0.111 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 3.65e-01 -0.106 0.117 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 4.39e-01 -0.092 0.119 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 6.15e-01 0.0555 0.11 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0608 0.0953 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 6.75e-01 0.0451 0.108 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 2.06e-01 0.163 0.129 0.176 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0365 0.138 0.176 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0504 0.135 0.176 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 9.37e-01 0.0102 0.129 0.176 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 4.23e-01 -0.11 0.137 0.176 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 3.84e-01 0.118 0.135 0.176 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 1.13e-01 -0.189 0.119 0.167 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 7.32e-01 0.0381 0.111 0.167 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 3.49e-03 0.328 0.111 0.167 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 9.35e-01 0.0088 0.108 0.167 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0613 0.119 0.167 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 5.77e-01 0.0611 0.109 0.163 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 3.77e-01 0.106 0.12 0.163 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 4.14e-01 0.0967 0.118 0.163 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 4.09e-01 0.0913 0.11 0.163 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 9.04e-02 0.195 0.115 0.163 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 9.21e-01 0.0127 0.127 0.186 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 6.02e-01 0.0648 0.124 0.186 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 2.56e-01 -0.144 0.126 0.186 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 2.81e-01 0.123 0.113 0.186 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 1.29e-01 0.193 0.127 0.186 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 9.42e-01 0.00823 0.113 0.186 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0538 0.109 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 3.19e-01 -0.121 0.121 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 9.41e-01 0.00772 0.105 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 1.14e-01 0.134 0.0843 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 7.66e-01 0.0332 0.111 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 4.97e-01 0.079 0.116 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 9.62e-01 0.0055 0.114 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 5.04e-01 0.0785 0.117 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 9.21e-01 0.0108 0.11 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 9.12e-01 0.00922 0.0836 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 9.84e-01 0.00242 0.118 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 5.15e-01 0.0775 0.119 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 5.09e-02 -0.21 0.107 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 2.37e-01 -0.124 0.104 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 1.05e-01 0.171 0.105 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0212 0.0728 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 8.01e-01 0.0271 0.108 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00663 0.103 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 2.90e-01 0.124 0.117 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 1.98e-02 0.269 0.115 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 3.23e-01 0.0977 0.0987 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 4.94e-01 0.0786 0.115 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 67922 sc-eQTL 1.24e-01 -0.136 0.0882 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 293758 sc-eQTL 7.17e-01 0.0387 0.107 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 972947 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0413 0.0954 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 877201 sc-eQTL 7.78e-01 0.0269 0.0953 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0859 0.113 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 137961 sc-eQTL 8.75e-02 0.213 0.124 0.17 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 eQTL 0.00953 -0.0963 0.0371 0.0 0.0 0.19

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000142856 ITGB3BP 67612 7.03e-06 9.44e-06 1.04e-06 4.47e-06 2.1e-06 3.26e-06 9.62e-06 1.69e-06 7.7e-06 4.26e-06 1.07e-05 4.98e-06 1.27e-05 3.83e-06 1.76e-06 5.7e-06 3.8e-06 4.84e-06 2.56e-06 2.51e-06 4.18e-06 7.85e-06 6.91e-06 2.82e-06 1.22e-05 2.68e-06 4.39e-06 3.24e-06 7.59e-06 7.98e-06 4.53e-06 6.75e-07 9.66e-07 2.86e-06 3.56e-06 2.21e-06 1.55e-06 1.49e-06 1.61e-06 1.02e-06 1.02e-06 1.11e-05 1.09e-06 1.76e-07 7.18e-07 1.31e-06 8.85e-07 7.14e-07 6e-07