logo

Genes within 1Mb (chr1:63659697:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0257 0.0999 0.16 B L1
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 9.60e-01 0.00526 0.104 0.16 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 3.53e-01 0.0962 0.103 0.16 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 1.64e-01 0.1 0.0717 0.16 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 5.84e-01 0.0628 0.114 0.16 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 5.25e-01 0.0746 0.117 0.16 B L1
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0826 0.0868 0.16 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0664 0.0959 0.16 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 8.08e-01 0.0236 0.0972 0.16 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 9.82e-01 0.00179 0.0785 0.16 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 7.43e-01 0.0366 0.111 0.16 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -810432 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0332 0.0665 0.16 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 9.84e-02 0.165 0.0994 0.16 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 5.38e-01 0.0586 0.095 0.16 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 6.28e-01 0.0508 0.105 0.16 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0796 0.106 0.16 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 1.50e-01 0.145 0.1 0.16 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 7.43e-01 -0.037 0.113 0.16 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -810432 sc-eQTL 1.18e-01 0.0892 0.0567 0.16 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 4.98e-01 0.0762 0.112 0.16 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 2.33e-01 -0.126 0.105 0.164 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0128 0.109 0.164 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 2.27e-01 -0.135 0.111 0.164 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0431 0.0874 0.164 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 5.60e-01 0.0714 0.122 0.164 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0141 0.106 0.164 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 3.06e-02 -0.224 0.103 0.16 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0714 0.109 0.16 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 1.14e-02 0.264 0.104 0.16 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 7.36e-01 0.024 0.0711 0.16 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 6.82e-01 0.0461 0.112 0.16 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 8.61e-02 -0.152 0.0883 0.161 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 7.86e-01 0.0284 0.104 0.161 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 9.56e-01 0.00478 0.0859 0.161 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 6.14e-01 0.0465 0.0921 0.161 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0246 0.115 0.161 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 2.48e-02 0.278 0.123 0.161 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0595 0.0992 0.16 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0748 0.0996 0.16 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 2.27e-01 0.123 0.101 0.16 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 7.77e-01 -0.025 0.0882 0.16 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0868 0.078 0.16 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 8.36e-01 0.025 0.121 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0785 0.132 0.161 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 3.37e-01 -0.122 0.126 0.161 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 2.41e-01 -0.138 0.117 0.161 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 3.60e-01 0.113 0.124 0.161 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0339 0.121 0.161 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 7.09e-01 0.0428 0.115 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0495 0.119 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 9.72e-01 -0.0043 0.121 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 5.38e-01 0.0714 0.116 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 6.91e-01 0.039 0.0979 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 4.53e-01 0.0877 0.117 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 8.79e-01 0.0176 0.116 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 8.42e-01 0.0235 0.118 0.162 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 4.63e-02 -0.238 0.119 0.162 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 4.18e-01 0.0911 0.112 0.162 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 3.23e-01 0.105 0.106 0.162 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 9.54e-01 0.00704 0.122 0.162 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 2.75e-01 0.132 0.121 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 4.59e-01 0.0882 0.119 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 3.17e-01 0.12 0.119 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 7.47e-01 0.037 0.114 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 3.44e-01 0.0834 0.088 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0424 0.117 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 7.17e-01 0.0453 0.125 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 7.39e-01 0.0393 0.118 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 4.85e-01 0.0857 0.122 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 9.75e-01 0.00376 0.118 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0202 0.113 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 5.09e-01 0.0813 0.123 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 5.32e-01 0.0767 0.122 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 6.29e-01 0.0581 0.12 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0875 0.127 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 7.14e-01 0.0407 0.111 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0304 0.115 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0281 0.123 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -810432 sc-eQTL 4.65e-01 0.0326 0.0446 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 7.82e-01 0.0324 0.117 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 1.39e-01 -0.145 0.0977 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0652 0.107 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 5.98e-01 0.0553 0.105 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 6.76e-01 0.0387 0.0926 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0202 0.113 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -810432 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0536 0.067 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 3.25e-01 0.111 0.112 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0819 0.101 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 3.71e-01 0.105 0.117 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 8.03e-01 0.0259 0.104 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 6.78e-01 0.0419 0.101 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 6.53e-01 0.0536 0.119 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -810432 sc-eQTL 4.87e-01 0.0655 0.0942 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 2.02e-01 0.147 0.115 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 2.25e-01 0.143 0.117 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 2.32e-01 -0.142 0.118 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 5.70e-02 -0.219 0.115 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 7.01e-02 -0.203 0.111 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0244 0.116 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -810432 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0414 0.0715 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 7.61e-01 0.0365 0.12 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0742 0.11 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0458 0.117 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 1.22e-01 -0.172 0.111 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0889 0.118 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0454 0.123 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -810432 sc-eQTL 3.22e-02 0.111 0.0516 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 2.74e-02 0.277 0.125 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 2.36e-01 0.13 0.109 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0276 0.113 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 6.36e-01 0.0556 0.117 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 2.79e-01 0.122 0.112 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 6.48e-01 -0.052 0.114 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -810432 sc-eQTL 1.84e-01 0.105 0.0787 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 1.69e-01 -0.148 0.107 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 4.00e-01 0.104 0.123 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 7.82e-01 0.0345 0.125 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0319 0.122 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0257 0.124 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0884 0.121 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -810432 sc-eQTL 8.92e-01 0.0086 0.0635 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 3.24e-01 -0.122 0.123 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 8.17e-01 0.0285 0.123 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 3.36e-03 0.358 0.121 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 9.72e-01 0.00421 0.119 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 1.80e-01 0.154 0.114 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 4.27e-01 0.0987 0.124 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -810432 sc-eQTL 1.42e-01 0.0371 0.0252 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 8.57e-01 0.0217 0.12 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 3.13e-01 -0.115 0.114 0.162 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00415 0.113 0.162 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 3.98e-01 0.0915 0.108 0.162 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 3.87e-02 -0.235 0.113 0.162 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 3.28e-01 -0.112 0.114 0.162 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00736 0.118 0.162 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 2.83e-01 -0.131 0.121 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0162 0.125 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 2.46e-01 0.125 0.108 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 6.39e-01 0.0567 0.121 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00723 0.126 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 4.21e-01 0.0999 0.124 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0952 0.0927 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 9.13e-01 0.0129 0.118 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 6.28e-01 0.0498 0.103 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 9.38e-01 0.00815 0.104 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0681 0.118 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 6.04e-02 0.24 0.127 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 1.89e-01 0.162 0.123 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 3.41e-01 -0.122 0.127 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 6.31e-01 -0.047 0.0976 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 7.26e-01 0.0398 0.113 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 3.88e-01 -0.103 0.119 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 8.96e-01 0.0148 0.114 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 1.74e-03 -0.321 0.101 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 6.71e-01 0.0498 0.117 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 1.01e-01 -0.177 0.108 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 7.80e-01 -0.031 0.111 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 7.43e-01 0.0377 0.115 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 7.13e-01 0.045 0.122 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 6.43e-01 0.0733 0.158 0.141 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0954 0.166 0.141 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 3.23e-01 0.175 0.177 0.141 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 4.19e-01 0.125 0.154 0.141 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 8.97e-01 -0.02 0.154 0.141 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 2.36e-01 -0.201 0.168 0.141 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 3.57e-01 -0.101 0.109 0.161 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 2.62e-01 0.125 0.111 0.161 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 6.19e-02 0.208 0.111 0.161 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 2.78e-01 0.106 0.0976 0.161 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0246 0.0982 0.161 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 8.31e-01 0.0244 0.114 0.161 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 9.84e-01 0.00235 0.115 0.16 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 9.62e-02 -0.204 0.122 0.16 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 1.41e-01 -0.165 0.112 0.16 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 3.16e-01 -0.115 0.115 0.16 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 5.41e-01 0.0736 0.12 0.16 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -810432 sc-eQTL 1.03e-01 0.148 0.0904 0.16 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 3.07e-01 0.118 0.115 0.16 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 1.56e-02 -0.277 0.113 0.168 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 2.76e-01 -0.127 0.116 0.168 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 1.72e-02 -0.271 0.113 0.168 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0469 0.0995 0.168 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0295 0.126 0.168 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0145 0.101 0.168 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 1.43e-02 -0.265 0.107 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 2.87e-01 -0.116 0.109 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 9.31e-02 0.192 0.114 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 6.02e-01 0.0421 0.0806 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 9.76e-01 0.00339 0.114 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 3.98e-01 -0.102 0.12 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 3.96e-01 -0.104 0.122 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 4.66e-01 0.0826 0.113 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 6.11e-01 -0.05 0.0981 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 7.30e-01 0.0383 0.111 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 1.71e-01 0.182 0.132 0.167 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0182 0.142 0.167 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0309 0.139 0.167 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 6.01e-01 0.0697 0.133 0.167 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0808 0.141 0.167 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 4.20e-01 0.112 0.139 0.167 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 5.71e-02 -0.233 0.122 0.158 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 8.78e-01 0.0176 0.115 0.158 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 3.17e-03 0.342 0.115 0.158 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 7.12e-01 0.0413 0.112 0.158 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 9.68e-01 0.00487 0.123 0.158 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 8.32e-01 0.0239 0.113 0.154 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 4.18e-01 0.1 0.124 0.154 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 5.67e-01 0.0699 0.122 0.154 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 3.15e-01 0.115 0.114 0.154 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 1.30e-01 0.18 0.118 0.154 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 7.75e-01 0.0377 0.131 0.181 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 5.93e-01 0.0686 0.128 0.181 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 3.12e-01 -0.132 0.13 0.181 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 2.18e-01 0.144 0.117 0.181 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 1.04e-01 0.213 0.131 0.181 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 8.89e-01 0.0164 0.117 0.181 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0889 0.112 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 3.49e-01 -0.116 0.124 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 6.20e-01 0.0534 0.108 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 1.59e-01 0.122 0.0865 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 6.17e-01 0.0572 0.114 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 4.41e-01 0.0917 0.119 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 7.21e-01 0.0415 0.116 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 4.09e-01 0.0987 0.119 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 8.55e-01 0.0204 0.112 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 8.14e-01 0.0201 0.0852 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 9.28e-01 0.0108 0.121 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 5.24e-01 0.0772 0.121 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 4.30e-02 -0.224 0.11 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 2.50e-01 -0.123 0.107 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 3.76e-02 0.224 0.107 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0204 0.0747 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 9.64e-01 0.00503 0.111 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0556 0.106 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 3.70e-01 0.108 0.12 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 1.66e-02 0.284 0.118 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 1.72e-01 0.139 0.101 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 3.54e-01 0.109 0.118 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 66286 sc-eQTL 1.54e-01 -0.13 0.0905 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 292122 sc-eQTL 7.20e-01 0.0392 0.109 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 971311 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0356 0.0978 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 875565 sc-eQTL 5.98e-01 0.0516 0.0976 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0489 0.116 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 136325 sc-eQTL 7.47e-02 0.227 0.127 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 eQTL 0.00458 -0.107 0.0375 0.0 0.0 0.184

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000142856 ITGB3BP 65976 1.53e-05 3.22e-05 3.07e-06 1.6e-05 3.7e-06 9.27e-06 3.46e-05 4.59e-06 4e-05 1.52e-05 4.8e-05 2.11e-05 4.7e-05 1.75e-05 5.71e-06 1.92e-05 1.07e-05 1.97e-05 4.64e-06 5.62e-06 1.09e-05 2.66e-05 2.22e-05 6.86e-06 3.7e-05 5.96e-06 1.13e-05 1.52e-05 2.39e-05 1.67e-05 1.98e-05 1.6e-06 2.23e-06 5.98e-06 1.11e-05 4.81e-06 2.82e-06 2.74e-06 4.62e-06 3.36e-06 1.64e-06 2.95e-05 2.7e-06 3.18e-07 1.92e-06 3.07e-06 2.9e-06 1.61e-06 1.28e-06