logo

Genes within 1Mb (chr1:63659159:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 6.53e-01 0.0391 0.0869 0.252 B L1
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 8.71e-01 0.0146 0.0901 0.252 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 9.52e-01 0.00546 0.0901 0.252 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 4.41e-01 0.0482 0.0625 0.252 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 8.25e-01 0.0221 0.0997 0.252 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 5.62e-01 0.0593 0.102 0.252 B L1
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0567 0.0756 0.252 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0224 0.0836 0.252 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0301 0.0846 0.252 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0336 0.0683 0.252 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 8.83e-01 0.0143 0.097 0.252 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -810970 sc-eQTL 1.60e-01 -0.0811 0.0576 0.252 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 5.87e-02 0.164 0.0863 0.252 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 3.23e-01 0.0811 0.0819 0.252 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 1.73e-01 0.123 0.0901 0.252 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000986 0.0917 0.252 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 2.71e-01 0.0958 0.0869 0.252 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00943 0.0974 0.252 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -810970 sc-eQTL 5.11e-01 0.0324 0.0493 0.252 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 1.28e-01 0.147 0.0966 0.252 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0784 0.0919 0.261 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 4.88e-01 -0.066 0.0949 0.261 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 1.03e-01 -0.158 0.0967 0.261 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0357 0.0761 0.261 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 3.19e-01 0.106 0.106 0.261 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 8.44e-01 0.0182 0.0927 0.261 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 1.31e-01 -0.135 0.089 0.252 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0259 0.0934 0.252 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 6.30e-04 0.305 0.0878 0.252 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 9.83e-01 0.0013 0.061 0.252 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00102 0.0965 0.252 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 9.46e-01 0.00519 0.0771 0.253 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 4.06e-01 0.0751 0.0903 0.253 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 3.15e-01 0.0748 0.0743 0.253 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 6.97e-01 0.0312 0.0799 0.253 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 9.41e-01 0.00732 0.0994 0.253 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 8.48e-02 0.186 0.107 0.253 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 5.15e-01 0.0559 0.0857 0.252 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0167 0.0862 0.252 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 1.39e-01 0.13 0.0876 0.252 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0567 0.0761 0.252 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 5.02e-02 -0.132 0.067 0.252 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0579 0.104 0.252 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 4.40e-01 0.088 0.114 0.245 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 1.21e-01 -0.169 0.108 0.245 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 1.16e-01 -0.159 0.101 0.245 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 2.58e-01 0.121 0.107 0.245 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0209 0.104 0.245 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 9.95e-01 0.000582 0.0989 0.245 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 2.57e-01 -0.118 0.104 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0544 0.105 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 1.38e-01 0.149 0.1 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0246 0.0853 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 8.13e-01 0.024 0.102 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 4.45e-01 0.0769 0.101 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 7.04e-01 0.0388 0.102 0.254 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 2.81e-01 -0.112 0.103 0.254 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 4.58e-01 0.0722 0.097 0.254 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0138 0.0924 0.254 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0325 0.106 0.254 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 6.35e-01 0.0499 0.105 0.254 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 9.85e-02 0.171 0.103 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 3.19e-01 0.104 0.104 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 8.62e-01 0.0174 0.0996 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 7.23e-01 0.0272 0.0767 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0205 0.102 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 3.76e-01 0.0961 0.108 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 4.33e-01 0.0807 0.103 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 1.12e-01 0.171 0.107 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 9.65e-01 0.0045 0.103 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 7.94e-01 -0.026 0.0994 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 3.80e-01 0.0947 0.108 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 3.35e-01 0.103 0.107 0.253 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00438 0.105 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 8.06e-02 -0.194 0.111 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 8.62e-01 0.017 0.0974 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 4.91e-01 0.0695 0.101 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 3.12e-01 -0.109 0.108 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -810970 sc-eQTL 4.24e-01 0.0313 0.0391 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 7.33e-01 0.035 0.102 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 6.48e-02 -0.157 0.0847 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0267 0.0927 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 8.38e-01 0.0186 0.0911 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 8.95e-01 0.0107 0.0805 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00296 0.0984 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -810970 sc-eQTL 6.41e-02 -0.108 0.0578 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 7.36e-02 0.174 0.097 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0322 0.0868 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 4.95e-01 0.0689 0.101 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 9.25e-01 0.00837 0.0893 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00132 0.0869 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 8.15e-01 0.024 0.102 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -810970 sc-eQTL 5.49e-01 0.0487 0.0811 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 5.89e-01 0.0536 0.0991 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 1.42e-01 0.15 0.102 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 2.53e-01 -0.117 0.102 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 5.77e-02 -0.19 0.0993 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 4.62e-02 -0.193 0.0964 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0578 0.1 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -810970 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0659 0.0619 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 5.34e-01 0.0647 0.104 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 9.96e-01 0.000434 0.0958 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0334 0.102 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0744 0.0965 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0595 0.103 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0822 0.107 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -810970 sc-eQTL 2.76e-01 0.0494 0.0452 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 4.67e-02 0.217 0.109 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 5.08e-01 0.063 0.095 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 5.42e-01 0.06 0.0983 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 6.13e-01 0.0516 0.102 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 6.00e-01 0.0512 0.0976 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 7.14e-01 0.0362 0.0989 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -810970 sc-eQTL 1.00e+00 3.07e-05 0.0686 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0753 0.0931 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 1.05e-01 0.17 0.105 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 7.72e-01 0.0309 0.107 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0647 0.104 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 3.70e-01 0.0955 0.106 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 8.80e-01 0.0156 0.103 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -810970 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0242 0.0543 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00118 0.105 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 5.76e-01 0.0597 0.106 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 1.10e-01 0.17 0.106 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 3.52e-01 0.0964 0.103 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 7.39e-01 0.0333 0.0997 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00361 0.108 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -810970 sc-eQTL 2.74e-01 0.024 0.0219 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 9.27e-01 0.00963 0.105 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 7.94e-01 0.0259 0.099 0.255 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 7.32e-01 0.0336 0.098 0.255 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 9.31e-02 0.157 0.0933 0.255 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 2.04e-02 -0.229 0.0978 0.255 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0776 0.0991 0.255 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 8.73e-01 0.0164 0.102 0.255 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0242 0.103 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 8.16e-01 0.0245 0.105 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 2.87e-02 0.199 0.0903 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 4.65e-01 0.0746 0.102 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 6.17e-01 0.0531 0.106 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 4.59e-01 0.0777 0.105 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 9.96e-01 0.000357 0.0805 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 6.59e-01 0.0451 0.102 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 5.46e-01 0.0537 0.0888 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0162 0.0903 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 9.53e-01 0.00606 0.103 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 1.55e-01 0.158 0.11 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 5.58e-02 0.205 0.106 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0259 0.111 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 2.39e-01 -0.1 0.0849 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 2.09e-01 0.124 0.0987 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0375 0.104 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 7.28e-01 0.0345 0.099 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 9.87e-02 -0.147 0.0884 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 7.75e-01 0.0288 0.101 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0154 0.0931 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0332 0.0952 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0542 0.0986 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 8.50e-01 0.0199 0.105 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 9.50e-01 0.00796 0.128 0.222 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0907 0.134 0.222 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0609 0.143 0.222 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 2.38e-01 0.148 0.124 0.222 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0465 0.125 0.222 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 3.86e-01 -0.119 0.137 0.222 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0407 0.0965 0.25 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 3.50e-01 0.0918 0.098 0.25 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 2.22e-01 0.12 0.0982 0.25 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 5.62e-02 0.164 0.0855 0.25 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 1.70e-01 -0.119 0.0862 0.25 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 2.31e-01 -0.121 0.1 0.25 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 4.38e-01 0.0765 0.0985 0.252 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0534 0.105 0.252 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 2.76e-02 -0.212 0.0957 0.252 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0855 0.0987 0.252 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0122 0.103 0.252 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -810970 sc-eQTL 7.73e-02 0.138 0.0776 0.252 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0122 0.099 0.252 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 1.13e-01 -0.16 0.101 0.266 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 1.72e-01 -0.14 0.102 0.266 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 4.14e-02 -0.205 0.0998 0.266 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0241 0.0876 0.266 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 5.82e-01 0.0612 0.111 0.266 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 1.41e-01 -0.131 0.0887 0.266 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 4.31e-02 -0.187 0.0919 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0289 0.0929 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 1.46e-03 0.308 0.0957 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 5.48e-01 0.0414 0.0689 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0467 0.0976 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0312 0.104 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 7.61e-01 -0.032 0.105 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 2.85e-01 0.104 0.097 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0912 0.084 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 6.75e-01 0.0399 0.095 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 4.09e-02 0.228 0.11 0.273 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 9.29e-01 0.0107 0.119 0.273 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00432 0.117 0.273 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 2.26e-01 0.135 0.111 0.273 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 2.74e-01 -0.13 0.118 0.273 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 9.36e-01 0.00942 0.117 0.273 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 1.28e-01 -0.159 0.104 0.251 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0081 0.0974 0.251 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 5.78e-02 0.188 0.0986 0.251 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 7.91e-01 0.0252 0.0949 0.251 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 6.45e-01 0.0482 0.105 0.251 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0598 0.0958 0.251 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0155 0.105 0.251 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 6.34e-01 0.0494 0.104 0.251 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 3.15e-01 0.0973 0.0967 0.251 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 1.48e-01 0.146 0.101 0.251 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 5.47e-01 0.0693 0.115 0.274 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 8.57e-01 0.0202 0.112 0.274 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 2.42e-01 -0.134 0.114 0.274 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 5.75e-01 0.0575 0.102 0.274 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 7.48e-01 0.037 0.115 0.274 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 4.14e-01 0.0832 0.102 0.274 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0988 0.0977 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0963 0.108 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 3.40e-01 0.0896 0.0938 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00888 0.076 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 9.90e-01 0.00123 0.0999 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 6.29e-01 0.0503 0.104 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 2.00e-01 0.13 0.101 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 1.85e-01 0.138 0.104 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0151 0.0974 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 9.77e-01 0.00212 0.0743 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00958 0.105 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 1.30e-01 0.16 0.105 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 1.82e-01 -0.127 0.0945 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0269 0.0919 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 1.38e-03 0.293 0.0904 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0435 0.0639 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0365 0.0947 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0726 0.0908 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 8.30e-01 0.0221 0.103 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 2.21e-02 0.233 0.101 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 1.12e-01 0.138 0.0866 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 3.21e-01 0.1 0.101 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 65748 sc-eQTL 9.88e-01 0.00115 0.0786 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 291584 sc-eQTL 4.91e-01 0.065 0.0942 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 970773 sc-eQTL 7.34e-01 0.0288 0.0845 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 875027 sc-eQTL 7.20e-01 0.0302 0.0843 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00803 0.1 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 135787 sc-eQTL 1.69e-01 0.152 0.11 0.254 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 eQTL 0.0429 -0.066 0.0325 0.0 0.0 0.264

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000142856 ITGB3BP 65438 1.41e-05 1.96e-05 2.57e-06 9.48e-06 2.7e-06 6.99e-06 1.84e-05 3.51e-06 1.64e-05 7.59e-06 2.09e-05 8.6e-06 2.99e-05 7.61e-06 5.09e-06 9.57e-06 8.8e-06 1.22e-05 4.28e-06 4.04e-06 7.66e-06 1.52e-05 1.4e-05 4.52e-06 2.73e-05 5.22e-06 7.54e-06 6.65e-06 1.44e-05 1.25e-05 1.21e-05 9.55e-07 1.33e-06 4.02e-06 7.74e-06 3.37e-06 1.89e-06 2.4e-06 2.7e-06 1.6e-06 1.05e-06 2.57e-05 2.64e-06 2.01e-07 9.22e-07 2.44e-06 2.71e-06 7.41e-07 4.81e-07