logo

Genes within 1Mb (chr1:63659080:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0257 0.0999 0.16 B L1
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 9.60e-01 0.00526 0.104 0.16 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 3.53e-01 0.0962 0.103 0.16 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 1.64e-01 0.1 0.0717 0.16 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 5.84e-01 0.0628 0.114 0.16 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 5.25e-01 0.0746 0.117 0.16 B L1
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0826 0.0868 0.16 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0664 0.0959 0.16 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 8.08e-01 0.0236 0.0972 0.16 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 9.82e-01 0.00179 0.0785 0.16 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 7.43e-01 0.0366 0.111 0.16 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -811049 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0332 0.0665 0.16 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 9.84e-02 0.165 0.0994 0.16 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 5.38e-01 0.0586 0.095 0.16 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 6.28e-01 0.0508 0.105 0.16 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0796 0.106 0.16 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 1.50e-01 0.145 0.1 0.16 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 7.43e-01 -0.037 0.113 0.16 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -811049 sc-eQTL 1.18e-01 0.0892 0.0567 0.16 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 4.98e-01 0.0762 0.112 0.16 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 2.33e-01 -0.126 0.105 0.164 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0128 0.109 0.164 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 2.27e-01 -0.135 0.111 0.164 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0431 0.0874 0.164 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 5.60e-01 0.0714 0.122 0.164 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0141 0.106 0.164 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 3.06e-02 -0.224 0.103 0.16 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0714 0.109 0.16 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 1.14e-02 0.264 0.104 0.16 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 7.36e-01 0.024 0.0711 0.16 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 6.82e-01 0.0461 0.112 0.16 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 8.61e-02 -0.152 0.0883 0.161 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 7.86e-01 0.0284 0.104 0.161 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 9.56e-01 0.00478 0.0859 0.161 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 6.14e-01 0.0465 0.0921 0.161 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0246 0.115 0.161 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 2.48e-02 0.278 0.123 0.161 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0595 0.0992 0.16 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0748 0.0996 0.16 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 2.27e-01 0.123 0.101 0.16 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 7.77e-01 -0.025 0.0882 0.16 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0868 0.078 0.16 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 8.36e-01 0.025 0.121 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0785 0.132 0.161 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 3.37e-01 -0.122 0.126 0.161 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 2.41e-01 -0.138 0.117 0.161 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 3.60e-01 0.113 0.124 0.161 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0339 0.121 0.161 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 7.09e-01 0.0428 0.115 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0495 0.119 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 9.72e-01 -0.0043 0.121 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 5.38e-01 0.0714 0.116 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 6.91e-01 0.039 0.0979 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 4.53e-01 0.0877 0.117 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 8.79e-01 0.0176 0.116 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 8.42e-01 0.0235 0.118 0.162 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 4.63e-02 -0.238 0.119 0.162 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 4.18e-01 0.0911 0.112 0.162 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 3.23e-01 0.105 0.106 0.162 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 9.54e-01 0.00704 0.122 0.162 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 2.75e-01 0.132 0.121 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 4.59e-01 0.0882 0.119 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 3.17e-01 0.12 0.119 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 7.47e-01 0.037 0.114 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 3.44e-01 0.0834 0.088 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0424 0.117 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 7.17e-01 0.0453 0.125 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 7.39e-01 0.0393 0.118 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 4.85e-01 0.0857 0.122 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 9.75e-01 0.00376 0.118 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0202 0.113 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 5.09e-01 0.0813 0.123 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 5.32e-01 0.0767 0.122 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 6.29e-01 0.0581 0.12 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0875 0.127 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 7.14e-01 0.0407 0.111 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0304 0.115 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0281 0.123 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -811049 sc-eQTL 4.65e-01 0.0326 0.0446 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 7.82e-01 0.0324 0.117 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 1.39e-01 -0.145 0.0977 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0652 0.107 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 5.98e-01 0.0553 0.105 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 6.76e-01 0.0387 0.0926 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0202 0.113 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -811049 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0536 0.067 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 3.25e-01 0.111 0.112 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0819 0.101 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 3.71e-01 0.105 0.117 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 8.03e-01 0.0259 0.104 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 6.78e-01 0.0419 0.101 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 6.53e-01 0.0536 0.119 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -811049 sc-eQTL 4.87e-01 0.0655 0.0942 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 2.02e-01 0.147 0.115 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 2.25e-01 0.143 0.117 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 2.32e-01 -0.142 0.118 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 5.70e-02 -0.219 0.115 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 7.01e-02 -0.203 0.111 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0244 0.116 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -811049 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0414 0.0715 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 7.61e-01 0.0365 0.12 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0742 0.11 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0458 0.117 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 1.22e-01 -0.172 0.111 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0889 0.118 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0454 0.123 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -811049 sc-eQTL 3.22e-02 0.111 0.0516 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 2.74e-02 0.277 0.125 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 2.36e-01 0.13 0.109 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0276 0.113 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 6.36e-01 0.0556 0.117 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 2.79e-01 0.122 0.112 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 6.48e-01 -0.052 0.114 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -811049 sc-eQTL 1.84e-01 0.105 0.0787 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 1.69e-01 -0.148 0.107 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 4.00e-01 0.104 0.123 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 7.82e-01 0.0345 0.125 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0319 0.122 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0257 0.124 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0884 0.121 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -811049 sc-eQTL 8.92e-01 0.0086 0.0635 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 3.24e-01 -0.122 0.123 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 8.17e-01 0.0285 0.123 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 3.36e-03 0.358 0.121 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 9.72e-01 0.00421 0.119 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 1.80e-01 0.154 0.114 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 4.27e-01 0.0987 0.124 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -811049 sc-eQTL 1.42e-01 0.0371 0.0252 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 8.57e-01 0.0217 0.12 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 3.13e-01 -0.115 0.114 0.162 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00415 0.113 0.162 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 3.98e-01 0.0915 0.108 0.162 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 3.87e-02 -0.235 0.113 0.162 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 3.28e-01 -0.112 0.114 0.162 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00736 0.118 0.162 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 2.83e-01 -0.131 0.121 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0162 0.125 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 2.46e-01 0.125 0.108 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 6.39e-01 0.0567 0.121 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00723 0.126 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 4.21e-01 0.0999 0.124 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0952 0.0927 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 9.13e-01 0.0129 0.118 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 6.28e-01 0.0498 0.103 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 9.38e-01 0.00815 0.104 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0681 0.118 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 6.04e-02 0.24 0.127 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 1.89e-01 0.162 0.123 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 3.41e-01 -0.122 0.127 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 6.31e-01 -0.047 0.0976 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 7.26e-01 0.0398 0.113 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 3.88e-01 -0.103 0.119 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 8.96e-01 0.0148 0.114 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 1.74e-03 -0.321 0.101 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 6.71e-01 0.0498 0.117 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 1.01e-01 -0.177 0.108 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 7.80e-01 -0.031 0.111 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 7.43e-01 0.0377 0.115 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 7.13e-01 0.045 0.122 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 6.43e-01 0.0733 0.158 0.141 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0954 0.166 0.141 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 3.23e-01 0.175 0.177 0.141 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 4.19e-01 0.125 0.154 0.141 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 8.97e-01 -0.02 0.154 0.141 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 2.36e-01 -0.201 0.168 0.141 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 3.57e-01 -0.101 0.109 0.161 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 2.62e-01 0.125 0.111 0.161 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 6.19e-02 0.208 0.111 0.161 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 2.78e-01 0.106 0.0976 0.161 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0246 0.0982 0.161 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 8.31e-01 0.0244 0.114 0.161 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 9.84e-01 0.00235 0.115 0.16 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 9.62e-02 -0.204 0.122 0.16 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 1.41e-01 -0.165 0.112 0.16 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 3.16e-01 -0.115 0.115 0.16 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 5.41e-01 0.0736 0.12 0.16 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -811049 sc-eQTL 1.03e-01 0.148 0.0904 0.16 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 3.07e-01 0.118 0.115 0.16 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 1.56e-02 -0.277 0.113 0.168 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 2.76e-01 -0.127 0.116 0.168 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 1.72e-02 -0.271 0.113 0.168 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0469 0.0995 0.168 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0295 0.126 0.168 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0145 0.101 0.168 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 1.43e-02 -0.265 0.107 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 2.87e-01 -0.116 0.109 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 9.31e-02 0.192 0.114 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 6.02e-01 0.0421 0.0806 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 9.76e-01 0.00339 0.114 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 3.98e-01 -0.102 0.12 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 3.96e-01 -0.104 0.122 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 4.66e-01 0.0826 0.113 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 6.11e-01 -0.05 0.0981 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 7.30e-01 0.0383 0.111 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 1.71e-01 0.182 0.132 0.167 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0182 0.142 0.167 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0309 0.139 0.167 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 6.01e-01 0.0697 0.133 0.167 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0808 0.141 0.167 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 4.20e-01 0.112 0.139 0.167 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 5.71e-02 -0.233 0.122 0.158 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 8.78e-01 0.0176 0.115 0.158 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 3.17e-03 0.342 0.115 0.158 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 7.12e-01 0.0413 0.112 0.158 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 9.68e-01 0.00487 0.123 0.158 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 8.32e-01 0.0239 0.113 0.154 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 4.18e-01 0.1 0.124 0.154 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 5.67e-01 0.0699 0.122 0.154 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 3.15e-01 0.115 0.114 0.154 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 1.30e-01 0.18 0.118 0.154 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 7.75e-01 0.0377 0.131 0.181 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 5.93e-01 0.0686 0.128 0.181 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 3.12e-01 -0.132 0.13 0.181 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 2.18e-01 0.144 0.117 0.181 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 1.04e-01 0.213 0.131 0.181 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 8.89e-01 0.0164 0.117 0.181 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0889 0.112 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 3.49e-01 -0.116 0.124 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 6.20e-01 0.0534 0.108 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 1.59e-01 0.122 0.0865 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 6.17e-01 0.0572 0.114 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 4.41e-01 0.0917 0.119 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 7.21e-01 0.0415 0.116 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 4.09e-01 0.0987 0.119 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 8.55e-01 0.0204 0.112 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 8.14e-01 0.0201 0.0852 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 9.28e-01 0.0108 0.121 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 5.24e-01 0.0772 0.121 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 4.30e-02 -0.224 0.11 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 2.50e-01 -0.123 0.107 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 3.76e-02 0.224 0.107 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0204 0.0747 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 9.64e-01 0.00503 0.111 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0556 0.106 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 3.70e-01 0.108 0.12 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 1.66e-02 0.284 0.118 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 1.72e-01 0.139 0.101 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 3.54e-01 0.109 0.118 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 65669 sc-eQTL 1.54e-01 -0.13 0.0905 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 291505 sc-eQTL 7.20e-01 0.0392 0.109 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 970694 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0356 0.0978 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 874948 sc-eQTL 5.98e-01 0.0516 0.0976 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0489 0.116 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 135708 sc-eQTL 7.47e-02 0.227 0.127 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 eQTL 0.00455 -0.107 0.0375 0.0 0.0 0.184

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000142856 ITGB3BP 65359 3.17e-05 3.07e-05 2.98e-06 1.32e-05 2.97e-06 8.76e-06 2.67e-05 2.9e-06 2.15e-05 9.85e-06 2.38e-05 9.52e-06 3.51e-05 9.38e-06 5.36e-06 1.14e-05 1.02e-05 1.79e-05 4.64e-06 4.27e-06 8.57e-06 2.19e-05 1.8e-05 5.19e-06 3.11e-05 5.44e-06 8.36e-06 8.88e-06 1.91e-05 1.57e-05 1.31e-05 1.41e-06 1.67e-06 4.49e-06 7.8e-06 3.8e-06 1.91e-06 2.61e-06 3.24e-06 2.38e-06 9.48e-07 2.75e-05 2.55e-06 2.03e-07 1.36e-06 2.77e-06 2.95e-06 8.11e-07 6.33e-07