logo

Genes within 1Mb (chr1:63654942:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 6.08e-01 0.0449 0.0873 0.218 B L1
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0269 0.0904 0.218 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 4.79e-01 0.064 0.0903 0.218 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 9.34e-01 0.00523 0.0629 0.218 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 9.35e-01 0.00811 0.1 0.218 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00876 0.103 0.218 B L1
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0125 0.0757 0.218 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 8.36e-01 0.0174 0.0836 0.218 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0596 0.0845 0.218 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 6.18e-01 0.0341 0.0683 0.218 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 3.80e-01 0.0851 0.0968 0.218 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -815187 sc-eQTL 7.13e-01 0.0213 0.0578 0.218 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 1.66e-01 0.12 0.0867 0.218 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 5.26e-01 0.0525 0.0825 0.218 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 5.80e-01 0.0505 0.091 0.218 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0581 0.0921 0.218 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 3.71e-01 0.0784 0.0875 0.218 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0944 0.0978 0.218 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -815187 sc-eQTL 7.06e-02 0.0894 0.0492 0.218 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 4.21e-01 0.0786 0.0975 0.218 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0938 0.0915 0.225 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 4.11e-01 0.0778 0.0945 0.225 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 2.05e-01 -0.123 0.0966 0.225 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0813 0.0757 0.225 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0621 0.106 0.225 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0314 0.0923 0.225 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 1.12e-01 -0.143 0.0899 0.218 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 1.85e-01 -0.125 0.094 0.218 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 2.49e-01 0.105 0.091 0.218 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 4.58e-01 0.0458 0.0616 0.218 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0272 0.0975 0.218 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 1.58e-01 -0.108 0.0765 0.219 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 7.81e-01 0.0251 0.0901 0.219 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 7.57e-01 -0.023 0.0742 0.219 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 8.01e-01 0.0201 0.0797 0.219 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0918 0.0988 0.219 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 8.99e-02 0.182 0.107 0.219 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00754 0.0863 0.218 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0166 0.0867 0.218 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 4.88e-01 0.0615 0.0884 0.218 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 9.81e-01 0.00185 0.0767 0.218 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0428 0.0679 0.218 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 2.07e-01 0.132 0.104 0.218 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 9.42e-01 0.00828 0.114 0.222 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 2.99e-01 -0.114 0.109 0.222 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00865 0.102 0.222 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 1.46e-01 0.155 0.106 0.222 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0282 0.104 0.222 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 5.58e-01 0.0579 0.0988 0.222 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 5.67e-01 0.0596 0.104 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0533 0.106 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 5.51e-01 0.0602 0.101 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 7.89e-01 0.0229 0.0855 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00356 0.102 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0635 0.101 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 8.73e-01 0.0165 0.103 0.218 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 5.58e-02 -0.2 0.104 0.218 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 2.33e-01 0.117 0.0978 0.218 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 6.09e-01 0.0477 0.0932 0.218 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0659 0.107 0.218 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 7.92e-01 -0.028 0.106 0.218 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 1.58e-01 0.146 0.103 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 5.15e-01 0.0677 0.104 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 7.89e-01 0.0267 0.0996 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 7.55e-01 0.0239 0.0767 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0154 0.102 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 5.65e-01 0.0626 0.108 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00472 0.102 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 6.17e-01 0.0533 0.106 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 9.02e-01 0.0126 0.102 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 4.11e-01 -0.081 0.0984 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 8.84e-01 0.0156 0.107 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 5.22e-01 0.0682 0.106 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 3.51e-01 0.097 0.104 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0501 0.11 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 5.79e-01 0.0534 0.0961 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0652 0.0994 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0534 0.106 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -815187 sc-eQTL 4.91e-01 0.0266 0.0386 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 3.77e-01 0.0893 0.101 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0685 0.0858 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 6.12e-01 0.0474 0.0933 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0606 0.0917 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 7.83e-01 0.0223 0.0811 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 3.59e-01 0.0909 0.0989 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -815187 sc-eQTL 8.24e-01 0.013 0.0587 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 4.42e-01 0.0757 0.0983 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 7.17e-01 0.0315 0.0868 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 5.38e-01 0.0621 0.101 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 7.81e-01 0.0248 0.0894 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 5.70e-01 0.0495 0.087 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 3.62e-01 0.0935 0.102 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -815187 sc-eQTL 9.55e-01 0.00455 0.0813 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 1.36e-01 0.148 0.0988 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 2.84e-01 0.11 0.102 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 3.20e-01 -0.102 0.103 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 3.74e-02 -0.208 0.0993 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 1.81e-01 -0.13 0.097 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00525 0.101 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -815187 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0672 0.062 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0506 0.104 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 2.65e-01 -0.106 0.0944 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 7.82e-01 0.0279 0.101 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 3.27e-02 -0.203 0.0945 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0984 0.101 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 9.51e-01 0.00656 0.106 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -815187 sc-eQTL 6.77e-02 0.0816 0.0444 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 3.35e-03 0.315 0.106 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 9.23e-02 0.159 0.0941 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0746 0.0979 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 5.51e-01 0.0605 0.101 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 2.50e-01 0.112 0.097 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0932 0.0984 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -815187 sc-eQTL 4.77e-02 0.135 0.0677 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 1.39e-01 -0.137 0.0924 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00486 0.107 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 9.10e-01 0.0123 0.108 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0383 0.106 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0602 0.108 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 3.27e-01 -0.103 0.105 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -815187 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0424 0.0551 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 3.04e-01 -0.11 0.107 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 3.48e-01 0.0996 0.106 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 9.54e-03 0.274 0.105 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 8.17e-01 -0.024 0.103 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 1.32e-01 0.149 0.0987 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 9.24e-01 0.0102 0.107 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -815187 sc-eQTL 1.71e-02 0.0519 0.0216 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0254 0.104 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0671 0.0994 0.221 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 8.13e-01 0.0234 0.0985 0.221 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 2.80e-01 0.102 0.0941 0.221 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 3.11e-01 -0.101 0.0992 0.221 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 1.07e-01 -0.16 0.099 0.221 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 2.39e-01 0.121 0.102 0.221 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00423 0.103 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0519 0.106 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 3.67e-01 0.0829 0.0917 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 4.12e-01 0.0843 0.102 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 5.02e-01 0.0718 0.107 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 5.92e-01 0.0566 0.105 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 1.30e-01 -0.121 0.0797 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 3.37e-01 0.0977 0.101 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0337 0.0885 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0155 0.0899 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 9.71e-02 -0.169 0.102 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 1.20e-01 0.171 0.11 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 1.27e-01 0.164 0.107 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 1.52e-01 -0.16 0.111 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0446 0.0854 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 9.84e-01 0.00197 0.0994 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0638 0.104 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 8.76e-01 0.0156 0.0993 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 3.87e-02 -0.182 0.0874 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 7.36e-01 0.0337 0.0998 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 1.04e-01 -0.15 0.0919 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0659 0.0945 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00486 0.098 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00334 0.104 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 1.97e-01 0.169 0.13 0.189 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 7.17e-01 0.0501 0.138 0.189 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 1.02e-01 0.24 0.146 0.189 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0498 0.128 0.189 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0953 0.128 0.189 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0521 0.141 0.189 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 7.68e-01 0.0283 0.0957 0.22 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 2.09e-01 0.122 0.097 0.22 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 2.06e-01 0.123 0.0973 0.22 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 3.34e-01 0.0827 0.0853 0.22 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 2.19e-01 0.105 0.0855 0.22 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0483 0.0996 0.22 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0361 0.0991 0.218 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0835 0.106 0.218 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 1.66e-01 -0.135 0.0968 0.218 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0537 0.0993 0.218 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 6.31e-01 -0.05 0.104 0.218 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -815187 sc-eQTL 1.67e-01 0.108 0.0782 0.218 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 8.28e-01 0.0216 0.0995 0.218 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 1.68e-02 -0.236 0.0977 0.232 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0137 0.101 0.232 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 7.89e-02 -0.173 0.0979 0.232 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0751 0.0856 0.232 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0571 0.109 0.232 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0408 0.0873 0.232 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 1.20e-01 -0.146 0.0936 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 1.94e-01 -0.122 0.0938 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 3.67e-01 0.0896 0.0992 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 3.84e-01 0.0608 0.0697 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0669 0.0989 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 2.19e-01 -0.129 0.105 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 2.17e-01 -0.131 0.106 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 8.07e-01 0.0241 0.0986 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0482 0.0853 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 4.49e-01 0.0729 0.0962 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 1.72e-01 0.154 0.112 0.23 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 6.47e-01 0.0551 0.12 0.23 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 6.66e-01 -0.051 0.118 0.23 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 8.91e-01 0.0155 0.113 0.23 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00194 0.12 0.23 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0797 0.117 0.23 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0981 0.107 0.216 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 8.12e-01 0.0238 0.0999 0.216 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 1.42e-01 0.15 0.101 0.216 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 6.86e-01 0.0394 0.0973 0.216 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0369 0.107 0.216 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0345 0.0978 0.21 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 9.99e-01 -7.94e-05 0.107 0.21 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0676 0.106 0.21 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 5.37e-01 0.061 0.0987 0.21 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 2.38e-01 0.122 0.103 0.21 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 9.00e-01 0.0141 0.113 0.229 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 2.08e-01 0.138 0.109 0.229 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 3.51e-01 -0.104 0.112 0.229 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 7.75e-01 0.0287 0.1 0.229 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 5.52e-01 0.0671 0.113 0.229 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 8.49e-01 0.019 0.0998 0.229 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 7.31e-01 0.0336 0.0975 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 1.89e-01 -0.141 0.107 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 2.99e-01 0.0972 0.0933 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 2.00e-01 0.0969 0.0754 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0162 0.0994 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0787 0.103 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 5.49e-01 0.0604 0.101 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 7.05e-01 0.0394 0.104 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 9.72e-01 0.00343 0.0969 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0538 0.0739 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0155 0.105 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 5.38e-01 0.0648 0.105 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 9.00e-02 -0.163 0.0956 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 1.24e-01 -0.143 0.0927 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 2.78e-01 0.102 0.0936 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 9.70e-01 0.00243 0.0649 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0242 0.096 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 8.72e-01 0.0149 0.0929 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 7.21e-01 0.0378 0.106 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 6.49e-01 0.0475 0.104 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 1.58e-01 0.126 0.0886 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 5.04e-01 0.0691 0.103 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 61531 sc-eQTL 1.88e-01 -0.103 0.078 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 287367 sc-eQTL 6.68e-01 0.0404 0.094 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 966556 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0881 0.0841 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 870810 sc-eQTL 8.51e-01 0.0158 0.0841 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 sc-eQTL 1.77e-01 -0.134 0.0993 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 131570 sc-eQTL 1.84e-01 0.146 0.11 0.22 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000142856 ITGB3BP 61221 eQTL 0.0319 -0.0719 0.0335 0.0 0.0 0.246

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000088035 \N 287367 1.34e-06 2.13e-06 2.42e-07 1.23e-06 3.91e-07 6.43e-07 1.46e-06 4.06e-07 1.67e-06 6.19e-07 2.05e-06 9.31e-07 2.63e-06 3.9e-07 4.87e-07 1.03e-06 1.07e-06 1.06e-06 5.99e-07 4.42e-07 8.07e-07 1.92e-06 1.11e-06 5.41e-07 2.33e-06 7.59e-07 1.06e-06 8.48e-07 1.59e-06 1.3e-06 8.13e-07 3.05e-07 2.8e-07 6.27e-07 5.3e-07 4.8e-07 7.3e-07 2.95e-07 4.99e-07 3.34e-07 2.8e-07 2.05e-06 3.59e-07 1.74e-07 1.9e-07 2.3e-07 2.39e-07 5.98e-08 2.03e-07