logo

Genes within 1Mb (chr1:63648218:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 9.69e-02 0.146 0.0875 0.248 B L1
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 6.08e-01 0.0468 0.0912 0.248 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 9.38e-01 0.00711 0.0912 0.248 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 1.32e-01 -0.0953 0.0631 0.248 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 3.11e-01 -0.102 0.101 0.248 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0223 0.103 0.248 B L1
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 8.69e-01 0.0127 0.0766 0.248 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 1.50e-01 0.121 0.0842 0.248 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 6.57e-01 -0.038 0.0856 0.248 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00626 0.0691 0.248 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 9.38e-01 0.0076 0.0981 0.248 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -821911 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0589 0.0584 0.248 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 4.63e-01 0.0647 0.088 0.248 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 2.08e-01 0.104 0.0826 0.248 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 4.75e-01 0.0652 0.0912 0.248 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 9.53e-01 0.00542 0.0925 0.248 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 9.62e-01 0.00414 0.0879 0.248 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 9.10e-02 -0.166 0.0977 0.248 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -821911 sc-eQTL 7.26e-01 0.0175 0.0497 0.248 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 3.01e-01 0.101 0.0978 0.248 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0169 0.0925 0.259 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 6.89e-01 0.0382 0.0954 0.259 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 1.59e-02 -0.235 0.0964 0.259 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0384 0.0765 0.259 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0785 0.107 0.259 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 4.87e-01 0.0647 0.093 0.259 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 5.85e-01 -0.049 0.0895 0.248 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0968 0.0932 0.248 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 4.51e-01 0.0682 0.0903 0.248 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 8.70e-01 0.01 0.0611 0.248 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 1.90e-01 -0.127 0.0962 0.248 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 8.13e-01 0.0181 0.0764 0.249 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 2.57e-01 0.101 0.0893 0.249 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 5.98e-01 0.039 0.0737 0.249 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0099 0.0792 0.249 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0859 0.0983 0.249 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 4.48e-01 0.0812 0.107 0.249 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 2.43e-01 0.101 0.0863 0.248 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 6.45e-01 0.0401 0.0869 0.248 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 3.12e-01 0.0898 0.0886 0.248 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0521 0.0768 0.248 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0875 0.0679 0.248 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 5.15e-01 0.0685 0.105 0.248 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 2.34e-02 0.263 0.115 0.237 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 3.02e-01 -0.115 0.111 0.237 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0606 0.104 0.237 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 7.43e-02 0.195 0.108 0.237 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 9.11e-01 0.012 0.107 0.237 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 5.07e-01 0.0671 0.101 0.237 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 9.33e-01 0.0087 0.104 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0627 0.106 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 1.88e-01 0.133 0.1 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 2.36e-01 -0.101 0.0851 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 4.38e-01 -0.079 0.102 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 8.20e-01 0.0229 0.101 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 5.06e-01 0.0682 0.102 0.248 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0532 0.104 0.248 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 5.40e-01 0.0599 0.0976 0.248 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 1.28e-01 -0.141 0.0924 0.248 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 8.44e-02 -0.183 0.106 0.248 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 6.36e-02 -0.195 0.105 0.248 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 5.01e-03 0.291 0.103 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 3.14e-01 0.106 0.105 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 3.23e-01 0.0994 0.1 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0863 0.0772 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0475 0.103 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 2.26e-01 0.133 0.109 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 9.55e-01 0.00583 0.103 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 3.70e-01 0.0962 0.107 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00748 0.103 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0847 0.0992 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0246 0.108 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 7.29e-01 0.0372 0.107 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 3.39e-01 0.101 0.105 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 2.05e-01 -0.141 0.111 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 8.77e-01 -0.015 0.0972 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 6.73e-01 0.0425 0.101 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 7.17e-02 -0.193 0.107 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -821911 sc-eQTL 7.21e-01 0.014 0.0391 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 3.94e-01 0.0871 0.102 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 2.36e-01 -0.102 0.0858 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 9.24e-02 0.157 0.0928 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 9.68e-01 0.00373 0.0919 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 9.90e-01 0.00102 0.0812 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 5.22e-01 0.0636 0.0991 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -821911 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0784 0.0585 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 2.44e-01 0.115 0.0982 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 3.68e-01 0.0786 0.0872 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 7.31e-01 0.0349 0.101 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0119 0.0899 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0393 0.0875 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 8.68e-01 0.0172 0.103 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -821911 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00352 0.0818 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0422 0.0998 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 3.57e-01 0.0943 0.102 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0304 0.103 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 9.27e-02 -0.168 0.0996 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0637 0.0973 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0829 0.1 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -821911 sc-eQTL 1.87e-01 -0.082 0.0619 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 7.72e-01 0.0303 0.104 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 3.56e-01 0.0887 0.0958 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 6.69e-01 0.0437 0.102 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0472 0.0968 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 3.29e-01 -0.101 0.103 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 1.18e-01 -0.167 0.107 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -821911 sc-eQTL 5.21e-01 0.0292 0.0454 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 4.75e-02 0.217 0.109 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 6.95e-01 0.0381 0.097 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0161 0.1 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 8.64e-01 0.0178 0.104 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 7.79e-01 0.0279 0.0996 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0568 0.101 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -821911 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00731 0.0699 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0931 0.0949 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 5.21e-01 0.0675 0.105 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00602 0.106 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0804 0.104 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 5.56e-01 0.0625 0.106 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 9.62e-01 0.00491 0.103 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -821911 sc-eQTL 4.70e-02 -0.107 0.0536 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 9.46e-01 0.00713 0.105 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 2.85e-01 0.117 0.109 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 8.08e-01 0.0267 0.11 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 7.89e-01 0.0285 0.106 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 7.38e-01 0.0343 0.102 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 1.44e-01 -0.162 0.11 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -821911 sc-eQTL 2.19e-02 0.0514 0.0223 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0482 0.107 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 5.97e-01 0.0525 0.0993 0.251 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 4.73e-01 0.0707 0.0983 0.251 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 1.94e-01 0.122 0.0939 0.251 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 2.91e-01 -0.105 0.0991 0.251 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 4.79e-02 -0.196 0.0986 0.251 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 4.72e-02 0.203 0.102 0.251 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 2.12e-01 0.127 0.101 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0267 0.104 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 4.72e-01 0.065 0.0901 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 6.94e-01 0.0397 0.101 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 4.73e-01 0.0754 0.105 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 5.89e-01 0.056 0.104 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0481 0.0794 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 2.48e-01 0.116 0.101 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 9.26e-01 0.00817 0.0878 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 5.30e-01 -0.056 0.0891 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 2.54e-01 -0.116 0.101 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 2.79e-01 0.119 0.109 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 9.60e-02 0.179 0.107 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0253 0.112 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 1.22e-01 -0.132 0.0851 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 4.60e-01 0.0737 0.0995 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 5.31e-01 0.0656 0.104 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 8.54e-01 0.0184 0.0996 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 6.63e-01 -0.038 0.0871 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 2.96e-01 0.103 0.0982 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 4.02e-01 0.0764 0.0911 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0493 0.0933 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 2.30e-01 -0.116 0.0963 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 8.58e-01 0.0185 0.103 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0783 0.119 0.207 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 2.63e-01 0.14 0.125 0.207 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 7.82e-01 0.0372 0.134 0.207 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0376 0.117 0.207 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0821 0.116 0.207 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 9.76e-01 -0.0039 0.128 0.207 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 2.35e-01 0.117 0.0979 0.248 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 4.98e-01 0.0678 0.0998 0.248 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 7.80e-01 0.028 0.1 0.248 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 5.90e-01 0.0473 0.0877 0.248 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 5.99e-01 0.0463 0.088 0.248 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 2.25e-01 -0.124 0.102 0.248 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 7.56e-01 0.0312 0.1 0.248 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 3.32e-01 0.104 0.107 0.248 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 8.80e-02 -0.167 0.0975 0.248 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0381 0.1 0.248 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0588 0.105 0.248 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -821911 sc-eQTL 5.33e-01 0.0495 0.0792 0.248 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 2.88e-01 -0.107 0.1 0.248 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0558 0.1 0.263 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 5.18e-01 0.0658 0.102 0.263 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 2.91e-01 -0.105 0.0995 0.263 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0307 0.0866 0.263 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0172 0.11 0.263 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 5.37e-02 -0.17 0.0874 0.263 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 2.49e-01 -0.108 0.0932 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0378 0.0935 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 1.42e-01 0.145 0.0981 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 9.50e-01 0.00432 0.0694 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 1.93e-01 -0.128 0.0979 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0313 0.104 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0617 0.105 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0349 0.0978 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0478 0.0847 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 6.81e-01 0.0394 0.0955 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 5.78e-02 0.207 0.108 0.273 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 8.88e-01 0.0165 0.117 0.273 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0534 0.115 0.273 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 5.26e-01 0.0695 0.109 0.273 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0364 0.116 0.273 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 1.45e-01 -0.167 0.114 0.273 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 6.15e-01 0.0526 0.104 0.253 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0576 0.0973 0.253 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 6.95e-01 0.039 0.0994 0.253 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 7.27e-01 0.0331 0.0949 0.253 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 2.73e-01 -0.115 0.104 0.253 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 1.57e-01 -0.135 0.0948 0.247 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0657 0.105 0.247 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 2.54e-01 -0.117 0.103 0.247 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 6.84e-01 0.0391 0.0962 0.247 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 8.53e-01 0.0186 0.101 0.247 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 7.94e-01 0.0305 0.117 0.254 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 8.72e-01 0.0184 0.114 0.254 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 4.62e-02 -0.23 0.115 0.254 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0422 0.104 0.254 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0864 0.117 0.254 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 7.68e-02 0.182 0.102 0.254 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 4.83e-01 0.0684 0.0972 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0723 0.108 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 2.72e-01 0.103 0.0932 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0779 0.0753 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 3.12e-01 -0.1 0.099 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 2.61e-01 -0.116 0.103 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 9.82e-02 0.168 0.101 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 2.58e-01 0.118 0.104 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 6.86e-01 0.0395 0.0976 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 1.41e-01 -0.11 0.0741 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 3.19e-01 -0.105 0.105 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 1.89e-01 0.139 0.105 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0673 0.096 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0552 0.093 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 3.68e-01 0.0844 0.0936 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 6.55e-01 -0.029 0.0648 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0733 0.0957 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 8.65e-01 0.0155 0.0909 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0902 0.103 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 8.55e-01 0.0187 0.102 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 1.51e-01 0.125 0.0867 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0645 0.101 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 54807 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00996 0.0775 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 280643 sc-eQTL 3.21e-01 0.0924 0.0929 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 959832 sc-eQTL 7.67e-01 0.0247 0.0834 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 864086 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00333 0.0832 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 54497 sc-eQTL 2.22e-01 -0.12 0.0983 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 124846 sc-eQTL 5.44e-01 0.0662 0.109 0.25 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000088035 \N 280643 2.28e-06 2.75e-06 2.84e-07 1.58e-06 3.73e-07 8.03e-07 1.33e-06 4.39e-07 1.67e-06 7.41e-07 2.21e-06 1.14e-06 3.39e-06 9.7e-07 4.61e-07 9.51e-07 1.13e-06 1.16e-06 5.54e-07 8.94e-07 7.61e-07 2.07e-06 1.61e-06 5.61e-07 2.63e-06 8.55e-07 1e-06 1.15e-06 1.73e-06 1.37e-06 1.72e-06 2.45e-07 3.19e-07 5.83e-07 8.71e-07 4.75e-07 6.89e-07 3.48e-07 5.99e-07 2.09e-07 2.67e-07 3.27e-06 3.9e-07 4.11e-08 1.69e-07 3.09e-07 2.35e-07 3.7e-08 8.53e-08
ENSG00000142856 \N 54497 1.18e-05 1.52e-05 1.37e-06 6.74e-06 2.22e-06 4.42e-06 1.28e-05 2.16e-06 1.06e-05 5.11e-06 1.59e-05 5.23e-06 2.31e-05 3.99e-06 2.96e-06 6.64e-06 5.03e-06 7.38e-06 2.58e-06 2.74e-06 5.06e-06 1.04e-05 8.93e-06 2.78e-06 1.67e-05 3.81e-06 4.75e-06 4.08e-06 1.1e-05 7.97e-06 8.17e-06 5.87e-07 1.1e-06 2.77e-06 4.34e-06 2.11e-06 1.55e-06 1.57e-06 1.84e-06 1e-06 4.72e-07 1.8e-05 1.38e-06 1.46e-07 7.66e-07 1.61e-06 1.08e-06 7.24e-07 5.73e-07
ENSG00000203965 \N 124846 6.57e-06 9.25e-06 8.36e-07 3.85e-06 1.32e-06 1.59e-06 8.56e-06 1.17e-06 4.7e-06 2.81e-06 8.8e-06 3.27e-06 1.13e-05 2.5e-06 9.73e-07 3.85e-06 2.75e-06 3.93e-06 1.43e-06 1.19e-06 3.02e-06 6.43e-06 4.72e-06 1.6e-06 9.02e-06 2.01e-06 2.24e-06 1.65e-06 5.03e-06 4.58e-06 4.06e-06 5.93e-07 5.47e-07 1.71e-06 2.06e-06 9.58e-07 9.16e-07 4.24e-07 8.58e-07 4.23e-07 1.67e-07 9.18e-06 6.3e-07 1.96e-07 3.27e-07 1.32e-06 9e-07 2.38e-07 1.74e-07