logo

Genes within 1Mb (chr1:63646579:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 4.75e-02 -0.164 0.0824 0.28 B L1
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 1.68e-01 -0.119 0.0858 0.28 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 8.42e-02 0.148 0.0855 0.28 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 3.08e-01 0.0611 0.0597 0.28 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 5.49e-01 0.0572 0.0952 0.28 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 6.64e-02 0.179 0.0968 0.28 B L1
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00172 0.0719 0.28 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0347 0.0794 0.28 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 8.35e-01 0.0167 0.0804 0.28 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 6.50e-01 0.0294 0.0649 0.28 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 5.36e-01 0.057 0.092 0.28 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -823550 sc-eQTL 4.63e-02 0.109 0.0545 0.28 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 5.48e-01 0.0498 0.0826 0.28 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 7.90e-01 0.021 0.0785 0.28 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 3.24e-01 0.0853 0.0863 0.28 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 3.33e-01 0.0848 0.0874 0.28 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 3.30e-01 -0.081 0.0831 0.28 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 2.24e-01 0.113 0.0928 0.28 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -823550 sc-eQTL 4.10e-02 0.0959 0.0466 0.28 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0123 0.0928 0.28 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 3.49e-01 -0.082 0.0874 0.282 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 5.73e-01 -0.051 0.0904 0.282 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 2.77e-02 0.203 0.0916 0.282 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 4.62e-01 0.0534 0.0724 0.282 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0398 0.101 0.282 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0895 0.088 0.282 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 1.57e-01 -0.122 0.0861 0.28 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 1.73e-01 0.123 0.0899 0.28 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 6.67e-01 0.0376 0.0872 0.28 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 3.24e-02 0.126 0.0584 0.28 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 1.23e-01 0.143 0.0927 0.28 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 1.07e-01 -0.117 0.0722 0.281 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 5.70e-02 -0.162 0.0845 0.281 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 5.56e-01 0.0413 0.0701 0.281 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0393 0.0753 0.281 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 3.31e-01 0.0911 0.0934 0.281 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0832 0.102 0.281 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0501 0.0826 0.28 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 6.56e-02 -0.153 0.0824 0.28 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 2.38e-01 -0.1 0.0845 0.28 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 1.06e-01 0.119 0.073 0.28 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0622 0.065 0.28 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0662 0.1 0.28 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 2.23e-03 -0.337 0.108 0.293 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0923 0.107 0.293 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 6.29e-01 0.0481 0.0994 0.293 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0378 0.105 0.293 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 2.92e-01 -0.108 0.102 0.293 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 9.07e-01 0.0113 0.0967 0.293 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 2.69e-01 -0.11 0.0996 0.279 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 8.09e-01 0.0245 0.101 0.279 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 2.67e-01 0.108 0.0966 0.279 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 1.12e-01 0.13 0.0815 0.279 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0357 0.0977 0.279 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 8.46e-01 0.0188 0.0968 0.279 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 9.11e-01 -0.011 0.0983 0.282 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 9.32e-02 -0.167 0.0993 0.282 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 6.42e-01 0.0436 0.0937 0.282 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 2.27e-02 0.202 0.088 0.282 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 6.50e-01 0.0463 0.102 0.282 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 5.87e-02 0.191 0.1 0.282 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 8.66e-03 -0.258 0.0973 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 6.50e-02 -0.183 0.0985 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00845 0.0951 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0182 0.0733 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 7.51e-01 0.0309 0.0972 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 5.04e-02 0.202 0.103 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0729 0.0971 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0728 0.101 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 1.97e-01 0.126 0.0971 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 8.64e-01 0.0161 0.0938 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 6.42e-01 0.0473 0.102 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 3.10e-01 0.103 0.101 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 9.02e-01 0.0122 0.0991 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 2.87e-01 0.111 0.104 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 6.78e-01 0.038 0.0916 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0281 0.0948 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 4.41e-03 0.286 0.0993 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -823550 sc-eQTL 1.75e-01 0.0499 0.0367 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 2.96e-01 -0.101 0.0961 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000553 0.0803 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 1.40e-01 -0.128 0.0868 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 9.86e-01 0.00152 0.0857 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 5.02e-01 0.0509 0.0757 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 6.85e-01 0.0376 0.0925 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -823550 sc-eQTL 5.70e-02 0.104 0.0544 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 5.70e-01 0.0522 0.0919 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 9.16e-01 0.00876 0.0832 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 2.65e-01 0.108 0.0963 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 4.76e-01 0.0611 0.0855 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 9.92e-01 0.000828 0.0833 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 7.68e-01 0.0291 0.0982 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -823550 sc-eQTL 7.21e-01 0.0278 0.0778 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0116 0.0951 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 4.48e-01 0.0751 0.0988 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 8.41e-01 0.02 0.0995 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 7.78e-01 0.0274 0.0969 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00479 0.0942 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0677 0.0971 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -823550 sc-eQTL 4.84e-01 0.0421 0.06 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0418 0.101 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 1.51e-02 -0.218 0.0889 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0248 0.0958 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 4.17e-01 0.0739 0.0908 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 7.45e-01 0.0315 0.0968 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 4.12e-01 0.0826 0.1 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -823550 sc-eQTL 4.56e-01 0.0318 0.0426 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0647 0.103 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 1.13e-01 0.145 0.0914 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 6.87e-02 0.173 0.0944 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 1.18e-01 0.153 0.0978 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0434 0.0944 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 7.87e-01 0.0259 0.0956 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -823550 sc-eQTL 6.42e-02 0.122 0.0658 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 7.12e-02 0.162 0.0895 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0569 0.101 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 7.46e-01 0.0332 0.102 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 2.01e-01 0.128 0.0995 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 2.86e-01 -0.109 0.102 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 1.20e-01 -0.154 0.0987 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -823550 sc-eQTL 1.55e-02 0.125 0.0514 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 1.93e-01 -0.132 0.101 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 9.09e-01 -0.012 0.105 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 2.87e-02 0.229 0.104 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0454 0.102 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 8.28e-01 0.0214 0.0982 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 7.58e-02 0.188 0.105 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -823550 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0172 0.0216 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 3.81e-01 0.0904 0.103 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0861 0.0969 0.279 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0392 0.096 0.279 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0654 0.0919 0.279 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 6.56e-01 0.0433 0.097 0.279 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 7.93e-01 0.0255 0.0972 0.279 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 1.16e-01 -0.157 0.0995 0.279 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 2.07e-03 -0.297 0.0951 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 9.03e-01 0.0122 0.0998 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 4.58e-02 0.172 0.0856 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 4.08e-01 0.08 0.0965 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 2.49e-01 -0.116 0.1 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0828 0.0991 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0556 0.0757 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 2.17e-01 -0.119 0.0958 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00675 0.0836 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0109 0.085 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 4.81e-01 0.0682 0.0966 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 2.58e-01 -0.118 0.104 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 4.99e-01 -0.07 0.103 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 1.74e-01 -0.146 0.107 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 6.45e-01 0.0378 0.0819 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 4.08e-01 0.0789 0.0952 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 1.95e-02 -0.232 0.0987 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 1.72e-01 -0.13 0.0949 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0246 0.0835 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 1.31e-01 -0.142 0.0938 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0474 0.0873 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0509 0.0893 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 5.24e-02 0.179 0.0918 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0298 0.0987 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 4.04e-01 0.0969 0.116 0.281 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 7.32e-02 0.217 0.12 0.281 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 3.09e-01 -0.133 0.13 0.281 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 2.86e-02 0.247 0.111 0.281 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 6.27e-01 0.0553 0.113 0.281 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 1.07e-01 -0.2 0.123 0.281 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0122 0.0938 0.28 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 2.53e-01 -0.109 0.0951 0.28 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 2.06e-01 0.121 0.0954 0.28 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 6.91e-01 0.0334 0.0838 0.28 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0477 0.084 0.28 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0207 0.0977 0.28 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 7.48e-01 0.031 0.0964 0.28 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 8.40e-01 0.0208 0.103 0.28 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 3.36e-01 0.091 0.0945 0.28 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 3.66e-02 0.201 0.0957 0.28 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 3.03e-01 0.104 0.101 0.28 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -823550 sc-eQTL 3.04e-01 0.0785 0.0763 0.28 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 1.72e-01 0.132 0.0964 0.28 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 1.14e-01 -0.147 0.0928 0.28 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 2.70e-01 -0.104 0.0945 0.28 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 6.38e-01 0.0439 0.093 0.28 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 7.67e-01 0.0239 0.0808 0.28 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0845 0.102 0.28 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 6.91e-01 0.0328 0.0822 0.28 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0406 0.0899 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 6.69e-01 0.0385 0.09 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0262 0.0949 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 6.58e-04 0.225 0.0649 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0151 0.0946 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 2.81e-01 -0.108 0.1 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 3.39e-02 0.215 0.101 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 3.39e-01 0.09 0.094 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 8.30e-01 0.0175 0.0815 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 3.82e-02 0.19 0.0911 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0518 0.117 0.267 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0954 0.125 0.267 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0023 0.123 0.267 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0405 0.117 0.267 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 2.07e-01 -0.157 0.124 0.267 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 8.78e-01 0.0188 0.122 0.267 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 1.04e-02 -0.262 0.101 0.278 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0454 0.0958 0.278 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0579 0.0978 0.278 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 7.16e-02 -0.168 0.0927 0.278 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 5.01e-01 0.0693 0.103 0.278 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 8.25e-01 0.0207 0.0936 0.274 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 6.38e-01 0.0484 0.103 0.274 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 4.38e-01 0.0785 0.101 0.274 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 9.08e-01 -0.011 0.0945 0.274 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 3.99e-01 0.0833 0.0987 0.274 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0311 0.11 0.294 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 5.51e-01 0.0641 0.107 0.294 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 3.08e-02 0.236 0.108 0.294 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 5.17e-01 0.0639 0.0983 0.294 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 3.63e-01 0.101 0.11 0.294 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0996 0.0975 0.294 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 4.19e-02 -0.189 0.0923 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0991 0.103 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 3.04e-01 0.0919 0.0892 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 8.40e-02 0.125 0.0718 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0184 0.095 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 1.67e-01 0.137 0.0985 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 1.96e-02 -0.223 0.0947 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 6.07e-02 -0.185 0.098 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 4.19e-01 0.0746 0.0921 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0183 0.0704 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 4.24e-01 0.0795 0.0994 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 7.23e-02 0.179 0.0993 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0782 0.0918 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 1.15e-01 0.14 0.0885 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 8.40e-01 0.0182 0.0897 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 1.43e-02 0.151 0.0611 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 5.18e-01 0.0593 0.0916 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 1.12e-02 -0.223 0.0872 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0562 0.1 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 7.25e-01 0.0351 0.0995 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 1.69e-01 -0.117 0.0844 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 1.87e-01 0.13 0.0981 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 53168 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0503 0.0737 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 279004 sc-eQTL 6.90e-02 -0.161 0.0879 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 958193 sc-eQTL 6.51e-01 -0.036 0.0793 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 862447 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0515 0.0792 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 52858 sc-eQTL 2.12e-01 0.117 0.0936 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 123207 sc-eQTL 6.23e-01 -0.051 0.104 0.28 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000185483 ROR1 -127438 pQTL 0.0375 0.0289 0.0139 0.0 0.0 0.315

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000203965 \N 123207 4.33e-06 4.34e-06 9.13e-07 2.42e-06 1.33e-06 1.19e-06 2.94e-06 1.01e-06 3.56e-06 2.01e-06 4.14e-06 3.21e-06 6.75e-06 1.62e-06 1.02e-06 2.82e-06 1.74e-06 2.88e-06 1.36e-06 9.69e-07 2.49e-06 4.14e-06 3.51e-06 1.55e-06 4.84e-06 1.48e-06 2.62e-06 1.57e-06 4.2e-06 4e-06 2.04e-06 5.93e-07 7.92e-07 1.8e-06 2.04e-06 9.71e-07 9.99e-07 4.76e-07 1.23e-06 3.8e-07 5.44e-07 4.93e-06 4.34e-07 1.56e-07 6.36e-07 3.57e-07 7.91e-07 5.05e-07 4.83e-07