logo

Genes within 1Mb (chr1:63643100:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 1.75e-01 0.137 0.101 0.162 B L1
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 9.12e-01 0.0116 0.105 0.162 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 1.79e-01 0.141 0.105 0.162 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 1.76e-01 -0.0986 0.0727 0.162 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 3.62e-01 -0.106 0.116 0.162 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 3.81e-01 -0.104 0.119 0.162 B L1
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 6.49e-01 0.0396 0.0868 0.162 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 4.03e-01 0.0803 0.0957 0.162 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00458 0.0971 0.162 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 5.24e-01 0.05 0.0783 0.162 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 9.45e-01 0.00774 0.111 0.162 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -827029 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0192 0.0664 0.162 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 7.94e-01 0.0262 0.0999 0.162 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 1.83e-01 0.126 0.0947 0.162 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0212 0.105 0.162 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 4.57e-01 -0.079 0.106 0.162 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 5.86e-01 0.055 0.101 0.162 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 2.14e-02 -0.258 0.111 0.162 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -827029 sc-eQTL 4.48e-01 0.0434 0.057 0.162 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 9.94e-01 0.000806 0.112 0.162 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0241 0.105 0.169 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 6.27e-01 0.0525 0.108 0.169 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 1.74e-02 -0.262 0.109 0.169 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0827 0.0864 0.169 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 2.84e-01 -0.13 0.121 0.169 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 9.96e-01 0.000543 0.105 0.169 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0639 0.103 0.162 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 1.16e-01 -0.169 0.107 0.162 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0571 0.104 0.162 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 5.33e-01 0.0441 0.0705 0.162 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 1.08e-01 -0.179 0.111 0.162 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0673 0.0875 0.163 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 7.90e-01 0.0274 0.103 0.163 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0735 0.0845 0.163 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 6.69e-01 0.0389 0.0909 0.163 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 1.16e-01 -0.177 0.112 0.163 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 4.18e-01 0.0993 0.122 0.163 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 9.83e-01 0.00206 0.0991 0.162 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 8.87e-01 0.0142 0.0996 0.162 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 2.88e-01 0.108 0.101 0.162 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 8.69e-01 0.0145 0.088 0.162 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 5.22e-01 -0.05 0.078 0.162 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 2.84e-01 0.129 0.12 0.162 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 1.70e-01 0.181 0.132 0.161 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0188 0.127 0.161 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 8.79e-01 -0.018 0.118 0.161 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 1.54e-01 0.177 0.123 0.161 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00612 0.121 0.161 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 2.00e-01 0.147 0.114 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 1.63e-01 0.168 0.12 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0165 0.122 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 3.82e-01 0.102 0.116 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0692 0.0986 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 9.95e-01 0.00081 0.118 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0918 0.116 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 6.40e-01 0.0554 0.118 0.162 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 9.56e-02 -0.2 0.119 0.162 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 2.85e-01 0.12 0.112 0.162 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0555 0.107 0.162 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 1.92e-01 -0.16 0.122 0.162 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 7.30e-02 -0.218 0.121 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 1.85e-02 0.281 0.118 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 2.63e-01 0.135 0.12 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 2.98e-01 0.12 0.115 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0572 0.0887 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 3.37e-01 -0.113 0.118 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 8.86e-01 0.018 0.126 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0417 0.117 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0132 0.122 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 9.68e-01 0.00477 0.117 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 3.08e-01 -0.115 0.113 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0394 0.123 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0251 0.122 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 9.66e-02 0.198 0.119 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00323 0.126 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 9.37e-01 0.00872 0.111 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0304 0.114 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 1.11e-01 -0.195 0.122 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -827029 sc-eQTL 9.19e-01 0.00454 0.0445 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 2.03e-01 0.148 0.116 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0257 0.0981 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 1.62e-01 0.149 0.106 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 8.84e-01 0.0152 0.105 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 6.47e-01 0.0425 0.0925 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 7.28e-01 0.0394 0.113 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -827029 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0296 0.067 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 9.03e-01 0.0137 0.112 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 5.17e-01 0.0653 0.101 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 7.34e-01 0.0398 0.117 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0213 0.104 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 6.03e-01 0.0526 0.101 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 8.21e-01 0.027 0.119 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -827029 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0315 0.0943 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 6.00e-01 0.0605 0.115 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 2.80e-01 0.128 0.118 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0378 0.119 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 1.49e-01 -0.167 0.115 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0937 0.112 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0231 0.116 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -827029 sc-eQTL 2.53e-01 -0.082 0.0716 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 6.18e-01 -0.06 0.12 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 4.95e-01 0.0742 0.109 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 6.05e-01 0.0598 0.115 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 1.50e-01 -0.158 0.109 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 3.33e-01 -0.113 0.116 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 2.08e-01 -0.153 0.121 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -827029 sc-eQTL 1.25e-01 0.0788 0.0512 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 4.20e-02 0.252 0.123 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 3.41e-01 0.106 0.111 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 2.39e-01 -0.135 0.115 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0148 0.119 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 3.27e-01 0.112 0.114 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 1.16e-01 -0.181 0.115 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -827029 sc-eQTL 5.43e-01 0.0488 0.08 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 7.87e-02 -0.191 0.108 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00728 0.12 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 8.41e-01 0.0244 0.121 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0394 0.118 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0643 0.121 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0776 0.118 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -827029 sc-eQTL 8.70e-02 -0.106 0.0614 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0883 0.12 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 1.68e-01 0.172 0.125 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 1.82e-01 0.168 0.125 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0192 0.122 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 1.12e-01 0.186 0.116 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0974 0.127 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -827029 sc-eQTL 9.76e-03 0.0662 0.0254 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 7.76e-01 -0.035 0.123 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0474 0.114 0.165 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 5.74e-01 0.0635 0.113 0.165 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 5.35e-01 0.0671 0.108 0.165 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 6.23e-01 -0.056 0.114 0.165 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 7.05e-03 -0.305 0.112 0.165 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 5.89e-02 0.221 0.116 0.165 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 2.69e-01 0.129 0.117 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 7.90e-01 -0.032 0.12 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 3.23e-01 -0.103 0.104 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 7.14e-01 0.0427 0.116 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 8.72e-01 0.0195 0.121 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 5.81e-01 0.0659 0.119 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 1.70e-01 -0.125 0.0908 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 6.13e-01 0.0586 0.116 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00746 0.101 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 7.89e-01 0.0274 0.102 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 2.22e-02 -0.265 0.115 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 4.66e-01 0.0917 0.126 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 1.63e-01 0.175 0.125 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 3.39e-01 -0.125 0.13 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 2.80e-01 -0.108 0.0994 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0276 0.116 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 8.10e-01 0.0293 0.122 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 8.68e-01 0.0193 0.116 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0991 0.0999 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 4.69e-01 0.082 0.113 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0905 0.105 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0458 0.107 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0851 0.111 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 7.56e-01 0.0368 0.118 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0434 0.145 0.133 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 3.76e-01 0.135 0.152 0.133 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 8.53e-02 0.28 0.161 0.133 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 3.33e-01 -0.138 0.142 0.133 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 2.49e-01 -0.164 0.141 0.133 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 9.88e-01 0.00242 0.156 0.133 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 4.54e-01 0.0819 0.109 0.165 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 6.65e-01 0.0481 0.111 0.165 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 7.61e-01 0.0339 0.111 0.165 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00234 0.0976 0.165 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 1.87e-01 0.129 0.0975 0.165 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 7.85e-01 -0.031 0.114 0.165 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 6.50e-01 -0.052 0.114 0.162 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0553 0.122 0.162 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0837 0.112 0.162 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0955 0.115 0.162 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 9.08e-01 0.0139 0.12 0.162 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -827029 sc-eQTL 6.75e-01 0.0381 0.0908 0.162 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0107 0.115 0.162 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 3.31e-01 -0.109 0.112 0.176 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 5.31e-01 0.0714 0.114 0.176 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 1.77e-01 -0.151 0.111 0.176 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 4.16e-01 -0.079 0.0968 0.176 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 3.51e-01 -0.115 0.123 0.176 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0859 0.0986 0.176 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 2.68e-01 -0.12 0.108 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 2.38e-01 -0.128 0.108 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0786 0.114 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0275 0.0803 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 1.67e-01 -0.157 0.113 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0754 0.119 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 3.12e-01 -0.122 0.121 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0435 0.112 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 5.68e-01 0.0554 0.097 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 6.38e-01 0.0516 0.109 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 4.75e-01 0.0913 0.127 0.179 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 9.73e-01 0.00464 0.136 0.179 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0307 0.133 0.179 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00984 0.127 0.179 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00581 0.135 0.179 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 1.75e-01 -0.18 0.132 0.179 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 3.66e-01 0.109 0.12 0.169 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0306 0.112 0.169 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 3.71e-01 0.103 0.114 0.169 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 5.62e-01 0.0635 0.109 0.169 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 1.20e-01 -0.187 0.12 0.169 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 3.01e-01 -0.114 0.11 0.161 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0139 0.121 0.161 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 1.18e-01 -0.187 0.119 0.161 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00363 0.112 0.161 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0412 0.117 0.161 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0387 0.128 0.169 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 8.67e-01 0.021 0.125 0.169 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 2.95e-02 -0.276 0.126 0.169 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0251 0.115 0.169 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 6.45e-01 0.0594 0.129 0.169 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 4.85e-01 0.0795 0.114 0.169 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 1.38e-01 0.166 0.111 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 3.63e-01 -0.113 0.124 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 2.34e-01 0.128 0.107 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 7.76e-01 0.0247 0.0868 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0289 0.114 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 2.01e-01 -0.152 0.118 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 2.55e-01 0.133 0.116 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 5.47e-01 0.0722 0.12 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 4.43e-01 0.086 0.112 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 1.33e-01 -0.128 0.085 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 3.29e-01 -0.118 0.121 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0147 0.121 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 3.13e-01 -0.112 0.11 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 1.33e-01 -0.161 0.107 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0571 0.108 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 8.89e-01 0.0105 0.0746 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0787 0.11 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 3.63e-01 0.095 0.104 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0423 0.119 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0595 0.117 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 2.99e-01 0.104 0.0998 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 2.24e-01 -0.141 0.116 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 49689 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0861 0.0888 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 275525 sc-eQTL 8.22e-01 0.0241 0.107 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 954714 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0595 0.0957 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 858968 sc-eQTL 6.18e-01 0.0477 0.0955 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 49379 sc-eQTL 5.56e-02 -0.216 0.112 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 119728 sc-eQTL 5.93e-01 0.0669 0.125 0.164 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000088035 \N 275525 1.29e-06 2.61e-06 2.43e-07 1.26e-06 3.81e-07 6.91e-07 1.59e-06 3.34e-07 1.48e-06 3.76e-07 1.74e-06 1.37e-06 2.54e-06 5.23e-07 3.96e-07 8.35e-07 9.41e-07 7.72e-07 5.84e-07 6.56e-07 6.13e-07 1.92e-06 9.97e-07 4.22e-07 2.43e-06 4.27e-07 9.72e-07 6.93e-07 1.38e-06 1.34e-06 8.17e-07 3.75e-08 1.08e-07 8.95e-07 8.71e-07 4.44e-07 7.3e-07 3.36e-07 5.13e-07 3.45e-07 2.89e-07 1.62e-06 6.51e-07 1.06e-07 1.81e-07 1.23e-07 2.08e-07 2.64e-07 1.14e-07