logo

Genes within 1Mb (chr1:63641820:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 1.77e-01 0.137 0.101 0.16 B L1
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 7.46e-01 0.0341 0.105 0.16 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 1.60e-01 0.148 0.105 0.16 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 1.76e-01 -0.0987 0.0728 0.16 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0938 0.116 0.16 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0803 0.119 0.16 B L1
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 6.59e-01 0.0384 0.087 0.16 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 4.55e-01 0.0718 0.096 0.16 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00391 0.0973 0.16 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 4.80e-01 0.0555 0.0784 0.16 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 8.72e-01 0.018 0.111 0.16 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -828309 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0121 0.0665 0.16 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 8.52e-01 0.0187 0.1 0.16 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 1.70e-01 0.131 0.0949 0.16 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0179 0.105 0.16 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 4.47e-01 -0.081 0.106 0.16 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 4.61e-01 0.0746 0.101 0.16 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 2.56e-02 -0.251 0.112 0.16 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -828309 sc-eQTL 5.36e-01 0.0354 0.0571 0.16 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 9.71e-01 0.00412 0.113 0.16 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0133 0.105 0.167 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 6.32e-01 0.0518 0.108 0.167 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 1.40e-02 -0.271 0.109 0.167 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0787 0.0865 0.167 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 2.72e-01 -0.133 0.121 0.167 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00246 0.105 0.167 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0663 0.104 0.16 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 8.40e-02 -0.187 0.108 0.16 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0581 0.105 0.16 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 4.32e-01 0.0557 0.0707 0.16 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 1.67e-01 -0.154 0.111 0.16 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0689 0.0876 0.161 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 6.96e-01 0.0403 0.103 0.161 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0758 0.0846 0.161 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 7.23e-01 0.0322 0.091 0.161 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 1.45e-01 -0.164 0.113 0.161 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 4.41e-01 0.0947 0.123 0.161 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 8.39e-01 0.0202 0.0992 0.16 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 8.24e-01 0.0222 0.0997 0.16 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 2.97e-01 0.106 0.102 0.16 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 9.09e-01 0.0101 0.0881 0.16 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0484 0.0781 0.16 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 3.41e-01 0.115 0.12 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 1.63e-01 0.184 0.132 0.158 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0348 0.127 0.158 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0369 0.118 0.158 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 1.79e-01 0.167 0.124 0.158 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 9.50e-01 0.0076 0.121 0.158 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 1.65e-01 0.159 0.114 0.158 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 1.60e-01 0.169 0.12 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00116 0.122 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 4.17e-01 0.0948 0.117 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0701 0.0987 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00426 0.118 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0663 0.117 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 5.69e-01 0.0675 0.118 0.159 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 1.56e-01 -0.17 0.12 0.159 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 2.75e-01 0.123 0.112 0.159 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 5.76e-01 -0.06 0.107 0.159 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 2.47e-01 -0.142 0.122 0.159 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 9.62e-02 -0.202 0.121 0.159 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 2.06e-02 0.277 0.119 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 2.35e-01 0.143 0.12 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 3.28e-01 0.113 0.115 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 5.36e-01 -0.055 0.0889 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 3.88e-01 -0.102 0.118 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 8.76e-01 0.0196 0.126 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0502 0.117 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00216 0.122 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 7.55e-01 0.0368 0.118 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 3.04e-01 -0.117 0.113 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0371 0.123 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0186 0.122 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 1.15e-01 0.189 0.119 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 8.38e-01 0.0259 0.127 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 9.40e-01 0.00835 0.111 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00482 0.115 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 1.76e-01 -0.165 0.122 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -828309 sc-eQTL 8.75e-01 0.00699 0.0445 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 2.15e-01 0.144 0.116 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0161 0.0982 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 1.93e-01 0.139 0.106 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 7.98e-01 0.0269 0.105 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 6.21e-01 0.0458 0.0927 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 6.38e-01 0.0534 0.113 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -828309 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0215 0.0671 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 9.69e-01 0.00436 0.112 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 6.01e-01 0.0529 0.101 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 7.49e-01 0.0375 0.117 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0113 0.104 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 4.58e-01 0.0751 0.101 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 9.15e-01 0.0128 0.119 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -828309 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0224 0.0945 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 6.31e-01 0.0555 0.115 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 3.41e-01 0.113 0.118 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0389 0.119 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 1.24e-01 -0.178 0.115 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 3.59e-01 -0.103 0.112 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00846 0.116 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -828309 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0786 0.0717 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0387 0.12 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 5.23e-01 0.0696 0.109 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 7.43e-01 0.0379 0.116 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 1.45e-01 -0.16 0.109 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 3.70e-01 -0.105 0.117 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 1.67e-01 -0.168 0.121 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -828309 sc-eQTL 1.20e-01 0.0801 0.0512 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 4.67e-02 0.247 0.123 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 3.22e-01 0.11 0.111 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 2.84e-01 -0.123 0.115 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0148 0.119 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 2.75e-01 0.125 0.114 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 1.67e-01 -0.16 0.115 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -828309 sc-eQTL 6.28e-01 0.0388 0.0801 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 7.85e-02 -0.191 0.108 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00265 0.12 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 8.14e-01 0.0286 0.121 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0386 0.119 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0369 0.121 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0834 0.118 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -828309 sc-eQTL 9.41e-02 -0.103 0.0614 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0849 0.12 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 9.85e-02 0.207 0.125 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 1.96e-01 0.163 0.125 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0194 0.122 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 1.18e-01 0.183 0.117 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 3.55e-01 -0.118 0.127 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -828309 sc-eQTL 8.99e-03 0.0671 0.0254 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 8.02e-01 -0.031 0.123 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0288 0.114 0.162 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 5.53e-01 0.067 0.113 0.162 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 5.21e-01 0.0695 0.108 0.162 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0518 0.114 0.162 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 7.88e-03 -0.301 0.112 0.162 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 6.90e-02 0.213 0.117 0.162 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 3.02e-01 0.121 0.117 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0128 0.12 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0862 0.104 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 7.87e-01 0.0314 0.116 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 9.12e-01 0.0134 0.121 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 5.94e-01 0.0638 0.119 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 1.56e-01 -0.129 0.0908 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 5.06e-01 0.077 0.116 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0129 0.101 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 7.82e-01 0.0283 0.102 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 3.18e-02 -0.249 0.115 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 5.14e-01 0.0822 0.126 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 1.10e-01 0.201 0.125 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 3.08e-01 -0.133 0.13 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0997 0.0996 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00889 0.116 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 6.62e-01 0.0533 0.122 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 7.63e-01 0.035 0.116 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0969 0.1 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 5.15e-01 0.0739 0.113 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 3.34e-01 -0.102 0.105 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0599 0.107 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0784 0.111 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 7.66e-01 0.0354 0.119 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0434 0.145 0.133 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 3.76e-01 0.135 0.152 0.133 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 8.53e-02 0.28 0.161 0.133 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 3.33e-01 -0.138 0.142 0.133 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 2.49e-01 -0.164 0.141 0.133 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 9.88e-01 0.00242 0.156 0.133 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 4.71e-01 0.0789 0.109 0.163 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 6.11e-01 0.0566 0.111 0.163 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 8.87e-01 0.0158 0.112 0.163 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0376 0.0976 0.163 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 2.16e-01 0.121 0.0976 0.163 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0516 0.114 0.163 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0282 0.115 0.16 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0652 0.123 0.16 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 3.36e-01 -0.108 0.112 0.16 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 3.61e-01 -0.105 0.115 0.16 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 7.68e-01 0.0356 0.12 0.16 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -828309 sc-eQTL 5.61e-01 0.0529 0.0909 0.16 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 9.03e-01 -0.014 0.115 0.16 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 3.68e-01 -0.101 0.112 0.173 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 5.73e-01 0.0644 0.114 0.173 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 1.56e-01 -0.159 0.111 0.173 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0765 0.0971 0.173 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 2.93e-01 -0.13 0.123 0.173 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0989 0.0988 0.173 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 2.76e-01 -0.118 0.108 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 1.85e-01 -0.144 0.108 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0865 0.114 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0187 0.0804 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 2.34e-01 -0.136 0.114 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0825 0.12 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 3.32e-01 -0.118 0.121 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0296 0.112 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 5.41e-01 0.0595 0.0972 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 5.68e-01 0.0628 0.11 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 2.64e-01 0.143 0.127 0.176 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 9.53e-01 0.00798 0.136 0.176 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 9.05e-01 -0.016 0.134 0.176 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 8.43e-01 0.0253 0.128 0.176 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 9.24e-01 0.0129 0.136 0.176 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 2.24e-01 -0.162 0.133 0.176 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 4.01e-01 0.102 0.121 0.167 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0504 0.112 0.167 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 4.17e-01 0.0932 0.115 0.167 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 4.50e-01 0.0829 0.11 0.167 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 1.46e-01 -0.175 0.12 0.167 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 2.86e-01 -0.118 0.111 0.158 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0415 0.122 0.158 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 1.42e-01 -0.176 0.119 0.158 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 8.98e-01 0.0144 0.112 0.158 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 7.92e-01 -0.031 0.117 0.158 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0225 0.128 0.167 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 7.48e-01 0.0402 0.125 0.167 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 2.20e-02 -0.29 0.126 0.167 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0209 0.115 0.167 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 5.19e-01 0.0831 0.128 0.167 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 4.29e-01 0.09 0.114 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 1.18e-01 0.175 0.111 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0862 0.124 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 2.50e-01 0.124 0.107 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 7.95e-01 0.0226 0.0869 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 8.41e-01 -0.023 0.114 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 3.00e-01 -0.123 0.119 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 2.80e-01 0.126 0.116 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 4.73e-01 0.0862 0.12 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 3.69e-01 0.101 0.112 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 1.37e-01 -0.127 0.0852 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 3.80e-01 -0.106 0.121 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00681 0.122 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 2.95e-01 -0.116 0.111 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 1.19e-01 -0.167 0.107 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0576 0.108 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 8.04e-01 0.0186 0.0748 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0557 0.111 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 4.09e-01 0.0865 0.104 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0704 0.119 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0652 0.118 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 1.93e-01 0.13 0.0998 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 2.78e-01 -0.126 0.116 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 48409 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0885 0.0889 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 274245 sc-eQTL 7.55e-01 0.0335 0.107 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 953434 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0699 0.0957 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 857688 sc-eQTL 6.53e-01 0.0431 0.0956 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 48099 sc-eQTL 7.50e-02 -0.201 0.113 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 118448 sc-eQTL 6.15e-01 0.0631 0.125 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000088035 \N 274245 1.33e-06 9.79e-07 3.3e-07 1.2e-06 2.71e-07 6.02e-07 1.52e-06 3.43e-07 1.28e-06 4.48e-07 1.52e-06 7e-07 2e-06 3e-07 5.35e-07 8.28e-07 7.93e-07 5.88e-07 7.76e-07 6.4e-07 6.51e-07 1.42e-06 8.84e-07 6.02e-07 2.24e-06 3.17e-07 9.13e-07 7.27e-07 1.25e-06 1.34e-06 6.04e-07 1.86e-07 2.29e-07 6.74e-07 5.93e-07 4.52e-07 7.3e-07 2.97e-07 4.12e-07 2.64e-07 2.91e-07 1.49e-06 1.93e-07 1.38e-07 1.85e-07 2.11e-07 2.29e-07 5.28e-08 1.11e-07