logo

Genes within 1Mb (chr1:63632394:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 1.91e-01 -0.119 0.0908 0.209 B L1
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 7.76e-02 0.166 0.0938 0.209 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 1.14e-01 0.149 0.0939 0.209 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 6.86e-01 0.0266 0.0657 0.209 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 4.77e-01 0.0745 0.104 0.209 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0173 0.107 0.209 B L1
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0645 0.0782 0.209 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 5.43e-01 0.0526 0.0864 0.209 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 7.95e-01 0.0227 0.0875 0.209 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0415 0.0706 0.209 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0455 0.1 0.209 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -837735 sc-eQTL 9.51e-01 0.00371 0.0598 0.209 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 9.89e-01 0.00129 0.09 0.209 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0654 0.086 0.209 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 6.55e-01 0.0425 0.0949 0.209 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 9.10e-01 0.0108 0.0962 0.209 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0573 0.0913 0.209 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 3.09e-01 -0.104 0.102 0.209 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -837735 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0436 0.0516 0.209 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0717 0.102 0.209 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 9.95e-01 0.00057 0.0966 0.207 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0713 0.0996 0.207 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 1.37e-01 -0.152 0.102 0.207 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 8.39e-04 -0.264 0.0777 0.207 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 7.88e-01 0.0302 0.112 0.207 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 1.90e-01 0.127 0.0969 0.207 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 1.10e-03 -0.305 0.0923 0.209 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0318 0.0987 0.209 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 2.35e-02 -0.215 0.0943 0.209 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 5.09e-01 0.0426 0.0645 0.209 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 2.16e-01 0.126 0.102 0.209 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0662 0.0794 0.21 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00103 0.0933 0.21 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 9.88e-01 0.00116 0.0768 0.21 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 3.76e-01 -0.073 0.0823 0.21 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 1.66e-01 0.142 0.102 0.21 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 1.27e-01 0.17 0.111 0.21 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0622 0.0915 0.209 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 2.08e-02 0.212 0.0909 0.209 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 6.38e-01 0.0443 0.0939 0.209 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0393 0.0813 0.209 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 1.06e-01 0.116 0.0717 0.209 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0299 0.111 0.209 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0573 0.122 0.202 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0259 0.117 0.202 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 4.63e-01 0.0797 0.108 0.202 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0837 0.114 0.202 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 7.17e-01 0.0405 0.111 0.202 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 4.44e-01 0.0808 0.105 0.202 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 8.67e-01 0.0181 0.108 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 6.72e-01 0.0464 0.11 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 9.94e-01 0.000765 0.105 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0805 0.0884 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 8.15e-03 0.277 0.104 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 4.09e-01 0.0864 0.104 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 1.90e-02 -0.25 0.106 0.211 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 8.15e-01 0.0255 0.109 0.211 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 8.69e-02 0.174 0.101 0.211 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 5.20e-01 0.0624 0.0969 0.211 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 5.07e-01 0.0737 0.111 0.211 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0396 0.11 0.211 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 3.63e-01 0.099 0.109 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 4.94e-02 0.214 0.108 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 1.48e-01 0.151 0.104 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00192 0.0807 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0721 0.107 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0804 0.114 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0361 0.106 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 3.57e-01 0.102 0.11 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 2.47e-01 -0.123 0.106 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 5.63e-01 0.0591 0.102 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 3.68e-01 0.0999 0.111 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 6.06e-01 -0.057 0.11 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 5.31e-01 0.0664 0.106 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00334 0.112 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00238 0.0979 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 2.48e-01 0.117 0.101 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 3.15e-02 -0.232 0.107 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -837735 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0307 0.0393 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 8.51e-01 0.0194 0.103 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0624 0.0874 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 2.93e-01 0.0999 0.0948 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 6.40e-01 0.0437 0.0934 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 1.15e-01 -0.13 0.0821 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0014 0.101 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -837735 sc-eQTL 7.36e-01 0.0202 0.0598 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0293 0.1 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 7.04e-01 0.0347 0.0911 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 2.44e-01 0.123 0.106 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0844 0.0936 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 7.01e-01 0.0351 0.0913 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 1.28e-01 -0.164 0.107 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -837735 sc-eQTL 5.01e-01 0.0575 0.0852 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 5.11e-01 0.0685 0.104 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 8.13e-02 -0.187 0.107 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 2.91e-01 0.114 0.108 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 6.53e-01 0.0475 0.106 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 6.00e-02 0.192 0.102 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 6.11e-01 -0.054 0.106 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -837735 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0172 0.0654 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 1.15e-01 0.173 0.109 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0258 0.0974 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 5.11e-01 0.0681 0.103 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0666 0.0982 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 9.60e-01 0.00528 0.105 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 2.84e-01 -0.117 0.109 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -837735 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0254 0.0461 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 1.43e-01 -0.163 0.111 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 2.19e-02 -0.228 0.0987 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0345 0.103 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0534 0.107 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 2.80e-01 -0.111 0.102 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 2.68e-01 -0.115 0.104 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -837735 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0101 0.0721 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0769 0.0979 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 5.14e-01 0.0702 0.107 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 9.88e-01 0.00159 0.109 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 8.15e-01 0.0249 0.106 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 2.09e-01 -0.136 0.108 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 6.34e-01 0.0504 0.106 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -837735 sc-eQTL 9.88e-01 -0.000862 0.0555 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0157 0.108 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 1.89e-01 0.148 0.112 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 1.92e-01 0.147 0.112 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 9.40e-01 0.00824 0.109 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 1.49e-01 -0.152 0.105 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 8.91e-01 0.0156 0.114 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -837735 sc-eQTL 9.77e-01 0.000682 0.0232 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 5.32e-01 0.0691 0.11 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000701 0.104 0.208 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 2.94e-01 0.108 0.103 0.208 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 6.88e-03 0.265 0.097 0.208 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 2.48e-01 -0.12 0.104 0.208 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 9.45e-01 0.00716 0.104 0.208 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 7.62e-01 0.0326 0.107 0.208 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 9.15e-01 0.0111 0.104 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 8.11e-01 0.0255 0.106 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 4.67e-01 0.0672 0.0922 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0817 0.103 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 3.36e-01 0.103 0.107 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 6.10e-01 0.0541 0.106 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0297 0.0831 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0335 0.105 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 4.72e-01 0.066 0.0917 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 9.76e-01 0.00287 0.0932 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 3.09e-01 0.108 0.106 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 1.31e-02 0.282 0.113 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 7.44e-02 -0.195 0.109 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00958 0.114 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 2.09e-01 -0.109 0.0867 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0497 0.101 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 3.65e-01 0.0964 0.106 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 6.95e-01 0.0397 0.101 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0324 0.0903 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 8.65e-01 0.0174 0.102 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 8.69e-02 -0.162 0.0939 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0506 0.0967 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0958 0.1 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 7.93e-01 0.028 0.107 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 7.10e-02 -0.24 0.132 0.211 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0481 0.14 0.211 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 9.24e-01 0.0144 0.15 0.211 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 9.91e-01 0.00154 0.131 0.211 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 7.00e-02 0.235 0.129 0.211 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 6.33e-01 0.0686 0.143 0.211 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 6.05e-02 -0.183 0.0969 0.213 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 2.10e-01 0.125 0.0991 0.213 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 1.73e-01 -0.136 0.0994 0.213 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0674 0.0873 0.213 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0458 0.0876 0.213 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0867 0.102 0.213 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 1.49e-01 -0.149 0.103 0.209 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 3.65e-02 -0.23 0.109 0.209 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 1.88e-01 -0.133 0.101 0.209 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 7.80e-01 0.0289 0.104 0.209 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 4.52e-01 0.0816 0.108 0.209 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -837735 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0734 0.0817 0.209 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00695 0.104 0.209 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 1.67e-01 0.145 0.104 0.205 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 7.40e-01 0.0353 0.106 0.205 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 1.06e-01 -0.168 0.104 0.205 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 3.32e-02 -0.192 0.0895 0.205 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 3.80e-01 0.101 0.115 0.205 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 3.15e-01 0.0928 0.092 0.205 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 8.15e-04 -0.324 0.0955 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0663 0.0981 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 1.96e-01 -0.134 0.103 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0643 0.0727 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0303 0.103 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 5.87e-01 -0.059 0.109 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0522 0.11 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 3.94e-02 -0.21 0.101 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 4.02e-02 0.181 0.0875 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 1.63e-01 0.139 0.0993 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0992 0.112 0.227 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 1.12e-01 0.191 0.119 0.227 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 3.89e-03 -0.336 0.115 0.227 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0113 0.113 0.227 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 4.19e-01 0.0968 0.119 0.227 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0165 0.118 0.227 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 6.88e-03 -0.299 0.109 0.209 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0217 0.104 0.209 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 8.83e-01 0.0156 0.106 0.209 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 8.37e-02 -0.175 0.1 0.209 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 8.20e-01 0.0254 0.111 0.209 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 1.57e-01 -0.138 0.0974 0.206 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 1.61e-01 0.15 0.107 0.206 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 8.49e-02 -0.182 0.105 0.206 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 8.00e-01 0.025 0.0989 0.206 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0739 0.103 0.206 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0852 0.117 0.215 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 1.21e-01 -0.176 0.113 0.215 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 6.34e-02 -0.215 0.115 0.215 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 8.01e-03 -0.274 0.102 0.215 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 7.74e-01 0.0338 0.117 0.215 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00528 0.104 0.215 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0903 0.101 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 4.76e-01 0.08 0.112 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 2.15e-01 0.12 0.097 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0683 0.0785 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 1.15e-02 0.26 0.102 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 3.70e-01 0.0965 0.108 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 8.31e-01 0.0227 0.106 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 4.24e-02 0.221 0.108 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 5.96e-01 0.0542 0.102 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0131 0.078 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 8.24e-01 0.0246 0.11 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0775 0.111 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 7.80e-03 -0.265 0.0987 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0761 0.0971 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 4.72e-02 -0.194 0.097 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 4.91e-01 0.0467 0.0676 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 2.22e-01 0.122 0.0998 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 2.09e-03 -0.295 0.0947 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 5.07e-01 0.0729 0.11 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0504 0.109 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00675 0.0928 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0158 0.108 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 38983 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0598 0.081 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 264819 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0112 0.0974 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 944008 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0165 0.0872 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 848262 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0555 0.087 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 sc-eQTL 4.14e-01 0.0844 0.103 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 109022 sc-eQTL 1.55e-01 0.162 0.113 0.211 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 38983 eQTL 0.00176 -0.064 0.0204 0.0 0.0 0.241
ENSG00000125703 ATG4C 848262 eQTL 0.0412 -0.0393 0.0192 0.0 0.0 0.241
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 eQTL 5.89e-05 -0.135 0.0333 0.0 0.0 0.241

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 PGM1 38983 1.57e-05 1.84e-05 3.07e-06 1.15e-05 3.18e-06 8.35e-06 2.26e-05 3.34e-06 1.66e-05 8.56e-06 2.08e-05 8.35e-06 2.86e-05 7.53e-06 5.1e-06 1.03e-05 9.14e-06 1.52e-05 4.54e-06 4.38e-06 8.57e-06 1.67e-05 1.72e-05 5.76e-06 2.74e-05 5.33e-06 7.99e-06 8.11e-06 1.75e-05 1.57e-05 1.14e-05 1.33e-06 1.56e-06 5.15e-06 8.09e-06 4.22e-06 2.04e-06 2.61e-06 3.25e-06 2.42e-06 1.5e-06 2.12e-05 2.6e-06 2.62e-07 1.93e-06 2.79e-06 2.95e-06 1.36e-06 1.08e-06
ENSG00000142856 ITGB3BP 38673 1.59e-05 1.86e-05 3.05e-06 1.15e-05 3.15e-06 8.4e-06 2.26e-05 3.34e-06 1.67e-05 8.58e-06 2.09e-05 8.35e-06 2.87e-05 7.58e-06 5.1e-06 1.03e-05 9.13e-06 1.52e-05 4.61e-06 4.41e-06 8.59e-06 1.67e-05 1.73e-05 5.74e-06 2.75e-05 5.37e-06 8.01e-06 8.11e-06 1.77e-05 1.57e-05 1.15e-05 1.34e-06 1.61e-06 5.21e-06 8.09e-06 4.27e-06 2.04e-06 2.64e-06 3.25e-06 2.44e-06 1.48e-06 2.12e-05 2.6e-06 2.69e-07 1.93e-06 2.84e-06 2.95e-06 1.38e-06 1.06e-06
ENSG00000203965 \N 109022 6.97e-06 8.81e-06 1.13e-06 4.79e-06 1.76e-06 3.52e-06 9.22e-06 1.45e-06 5.48e-06 4.2e-06 8.9e-06 4.41e-06 1.07e-05 3.86e-06 1.37e-06 5.68e-06 3.77e-06 3.97e-06 1.99e-06 2.41e-06 3.73e-06 7.5e-06 5.56e-06 2.82e-06 9.99e-06 2.34e-06 3.93e-06 3.2e-06 6.74e-06 7.11e-06 3.71e-06 8.78e-07 7.99e-07 2.77e-06 3.5e-06 2.12e-06 1.33e-06 9.68e-07 1.3e-06 1e-06 8.36e-07 8.42e-06 1.23e-06 1.52e-07 6.81e-07 1.32e-06 9.43e-07 6.92e-07 5.6e-07