logo

Genes within 1Mb (chr1:63629109:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 4.95e-03 -0.267 0.0939 0.201 B L1
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 4.94e-02 0.194 0.0982 0.201 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 1.08e-01 0.159 0.0985 0.201 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0544 0.0688 0.201 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0481 0.11 0.201 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0513 0.112 0.201 B L1
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 7.85e-02 -0.145 0.0819 0.201 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 4.71e-02 0.18 0.0902 0.201 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 6.45e-01 0.0425 0.0922 0.201 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 8.40e-01 0.0151 0.0745 0.201 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0232 0.106 0.201 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -841020 sc-eQTL 8.05e-02 0.11 0.0626 0.201 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 4.99e-01 0.0643 0.0948 0.201 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 6.59e-02 -0.168 0.091 0.201 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0228 0.101 0.201 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0138 0.102 0.201 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0363 0.0973 0.201 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 2.46e-01 -0.126 0.108 0.201 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -841020 sc-eQTL 4.08e-02 0.112 0.0545 0.201 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 2.11e-02 0.249 0.107 0.201 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 2.49e-01 -0.116 0.1 0.205 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 4.24e-01 0.083 0.104 0.205 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0925 0.106 0.205 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0697 0.0832 0.205 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 4.59e-02 -0.232 0.115 0.205 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 2.43e-01 -0.118 0.101 0.205 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0621 0.0978 0.201 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 5.89e-01 0.0552 0.102 0.201 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 1.02e-01 0.161 0.0981 0.201 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 2.20e-01 0.0818 0.0665 0.201 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 4.28e-01 0.0836 0.105 0.201 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 8.04e-02 -0.149 0.0845 0.202 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0416 0.0998 0.202 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 8.83e-01 0.0121 0.0822 0.202 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 9.95e-01 0.000519 0.0883 0.202 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 9.86e-01 0.00192 0.11 0.202 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 4.00e-01 0.1 0.119 0.202 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 3.14e-01 0.0956 0.0948 0.201 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 7.76e-01 0.0272 0.0954 0.201 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0183 0.0974 0.201 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 6.63e-01 0.0368 0.0843 0.201 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0118 0.0748 0.201 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 5.16e-01 0.0751 0.115 0.201 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 9.69e-03 -0.323 0.123 0.202 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 5.96e-01 -0.064 0.121 0.202 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 4.71e-01 -0.081 0.112 0.202 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 8.31e-01 0.0253 0.118 0.202 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00171 0.115 0.202 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 8.38e-02 0.188 0.108 0.202 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 4.85e-03 -0.318 0.112 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 6.95e-03 0.31 0.114 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00539 0.111 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 1.29e-01 -0.142 0.093 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 4.23e-01 0.0894 0.111 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0529 0.11 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 1.62e-01 -0.157 0.112 0.198 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00451 0.115 0.198 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0588 0.107 0.198 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 8.64e-01 0.0175 0.102 0.198 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0807 0.117 0.198 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 8.46e-01 0.0225 0.116 0.198 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 1.55e-02 -0.278 0.114 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 4.04e-01 0.0969 0.116 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 4.93e-01 0.0763 0.111 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 1.52e-01 -0.123 0.0853 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 9.86e-01 0.00206 0.114 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0386 0.121 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 1.94e-01 -0.148 0.113 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0441 0.119 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 3.68e-01 0.103 0.114 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 1.44e-01 0.16 0.109 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 1.57e-01 -0.168 0.118 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 7.62e-01 -0.036 0.118 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 7.13e-01 0.0419 0.114 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 1.19e-01 0.187 0.12 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 2.08e-01 0.132 0.105 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 3.07e-01 -0.111 0.109 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 8.53e-01 0.0215 0.116 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -841020 sc-eQTL 5.54e-01 -0.025 0.0423 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0259 0.111 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 5.75e-02 -0.175 0.0916 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 1.57e-01 0.142 0.0999 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 6.10e-01 0.0504 0.0986 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0098 0.0872 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 8.26e-01 0.0234 0.107 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -841020 sc-eQTL 6.34e-02 0.117 0.0626 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 1.34e-01 0.159 0.105 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 5.78e-01 0.054 0.0968 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 4.49e-01 0.0851 0.112 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 1.73e-01 0.136 0.0993 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0635 0.097 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 3.31e-01 -0.111 0.114 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -841020 sc-eQTL 1.65e-01 0.126 0.0903 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 8.21e-02 -0.192 0.11 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 9.20e-02 -0.19 0.113 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 2.03e-01 0.145 0.113 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0189 0.111 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 1.82e-01 0.144 0.107 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 7.61e-01 0.0338 0.111 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -841020 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00242 0.0688 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 3.73e-01 0.103 0.115 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 2.46e-01 -0.121 0.104 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 1.93e-01 0.144 0.11 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 4.71e-01 0.0758 0.105 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 3.67e-01 -0.101 0.112 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 4.63e-01 0.0853 0.116 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -841020 sc-eQTL 2.05e-02 0.114 0.0486 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 5.73e-03 0.326 0.117 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 5.12e-02 -0.205 0.104 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0829 0.109 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 4.20e-01 0.0909 0.113 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 7.96e-01 0.028 0.108 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 9.95e-01 0.000734 0.11 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -841020 sc-eQTL 4.43e-02 0.152 0.0752 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0255 0.103 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0523 0.116 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0372 0.117 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 1.48e-02 -0.277 0.113 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0498 0.117 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 1.53e-01 -0.162 0.113 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -841020 sc-eQTL 1.54e-01 0.085 0.0594 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0237 0.116 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 1.87e-01 0.157 0.119 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 8.35e-01 0.0249 0.119 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 5.08e-01 0.0767 0.116 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0677 0.111 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 9.24e-02 -0.202 0.12 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -841020 sc-eQTL 3.71e-01 -0.022 0.0245 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 4.01e-01 0.0983 0.117 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 4.59e-01 0.0812 0.109 0.203 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 6.52e-01 0.0489 0.108 0.203 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 6.32e-01 0.0498 0.104 0.203 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 9.52e-01 0.00659 0.11 0.203 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0163 0.11 0.203 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0311 0.113 0.203 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0268 0.11 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 4.27e-01 0.0893 0.112 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000723 0.0974 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0881 0.109 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0342 0.113 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 1.49e-01 0.161 0.111 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0917 0.0886 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00569 0.113 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0256 0.098 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 5.43e-01 0.0606 0.0995 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0233 0.113 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 2.07e-01 0.154 0.122 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 3.60e-01 -0.11 0.12 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0627 0.125 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 1.57e-01 0.135 0.095 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0093 0.111 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0256 0.117 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 2.04e-01 -0.141 0.111 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 2.33e-01 -0.114 0.095 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0231 0.108 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 8.97e-01 0.0129 0.0998 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0795 0.102 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0588 0.106 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 8.70e-01 0.0184 0.113 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 6.37e-01 -0.06 0.127 0.204 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0633 0.133 0.204 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 3.84e-02 0.293 0.14 0.204 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 3.81e-01 -0.109 0.124 0.204 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 7.47e-01 0.0402 0.124 0.204 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0435 0.136 0.204 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 6.99e-01 0.0401 0.104 0.2 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 1.68e-01 0.145 0.105 0.2 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 9.44e-01 0.00741 0.106 0.2 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 6.74e-01 0.039 0.0925 0.2 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 1.33e-01 0.139 0.0923 0.2 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 6.92e-01 0.0428 0.108 0.2 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0373 0.11 0.201 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0385 0.118 0.201 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0619 0.108 0.201 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 2.32e-01 0.132 0.11 0.201 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 1.24e-01 -0.178 0.115 0.201 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -841020 sc-eQTL 1.71e-01 -0.12 0.0872 0.201 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 2.51e-01 0.127 0.111 0.201 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 8.29e-02 -0.19 0.109 0.21 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 6.07e-01 0.0574 0.111 0.21 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0183 0.109 0.21 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0521 0.0948 0.21 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 6.38e-02 -0.222 0.119 0.21 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 5.91e-01 -0.052 0.0965 0.21 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0971 0.102 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00971 0.102 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 1.04e-01 0.175 0.107 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 2.46e-01 0.0879 0.0756 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 2.14e-01 0.133 0.107 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 8.10e-01 0.0273 0.113 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 2.26e-01 0.139 0.114 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 6.71e-01 0.0453 0.106 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0428 0.0921 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0072 0.104 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0296 0.131 0.194 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0259 0.14 0.194 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 5.66e-01 0.0788 0.137 0.194 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 7.95e-02 0.229 0.129 0.194 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 7.60e-01 0.0426 0.139 0.194 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 1.40e-01 -0.201 0.136 0.194 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 3.56e-01 -0.105 0.113 0.2 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0348 0.106 0.2 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 2.30e-01 0.13 0.108 0.2 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 6.92e-01 0.0408 0.103 0.2 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0902 0.113 0.2 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 1.89e-01 -0.135 0.103 0.197 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 2.85e-02 0.247 0.112 0.197 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0323 0.111 0.197 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 5.01e-01 0.0702 0.104 0.197 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 5.14e-01 0.0712 0.109 0.197 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 7.25e-01 0.0437 0.124 0.215 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 7.85e-01 0.033 0.121 0.215 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 7.03e-01 0.0471 0.123 0.215 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 2.88e-01 0.117 0.11 0.215 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0669 0.124 0.215 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00555 0.11 0.215 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 1.36e-02 -0.256 0.103 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 3.65e-02 0.24 0.114 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 8.08e-01 0.0244 0.1 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 1.24e-01 -0.124 0.0805 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 6.97e-01 0.0415 0.106 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 6.90e-01 0.0443 0.111 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 8.00e-03 -0.296 0.11 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 3.95e-01 0.0983 0.115 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 2.18e-01 0.133 0.108 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0371 0.0823 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0916 0.116 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0775 0.117 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0529 0.104 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 4.03e-01 0.0843 0.101 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 1.67e-01 0.14 0.101 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 3.28e-01 0.0687 0.07 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 2.06e-01 0.131 0.103 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 1.43e-01 -0.145 0.0984 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 4.05e-01 0.0935 0.112 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 1.58e-01 0.157 0.111 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 4.70e-01 0.0684 0.0946 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 9.65e-01 0.00484 0.11 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 35698 sc-eQTL 7.61e-02 -0.153 0.0859 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 261534 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0454 0.104 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 940723 sc-eQTL 7.33e-01 0.0318 0.0931 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 844977 sc-eQTL 7.48e-01 0.0299 0.0929 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 sc-eQTL 8.48e-01 0.0212 0.11 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 105737 sc-eQTL 8.39e-01 0.0248 0.122 0.203 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 35698 eQTL 0.000322 -0.087 0.0241 0.0 0.0 0.172
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 eQTL 3.81e-08 -0.217 0.0392 0.0 0.0 0.172

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000142856 ITGB3BP 35388 1.1e-05 1.26e-05 1.31e-06 8.67e-06 2.5e-06 5.29e-06 1.17e-05 2.19e-06 1.14e-05 5.61e-06 1.38e-05 6.49e-06 2.39e-05 4.54e-06 3.46e-06 6.68e-06 5.55e-06 7.38e-06 2.68e-06 3.12e-06 5.07e-06 1.04e-05 1.02e-05 3.38e-06 2.31e-05 3.98e-06 5.79e-06 5.04e-06 1.1e-05 9.23e-06 7.65e-06 1.08e-06 1.14e-06 4.09e-06 6.76e-06 2.7e-06 1.81e-06 2.02e-06 2.7e-06 2.07e-06 1.55e-06 1.51e-05 1.46e-06 2.09e-07 7.64e-07 1.75e-06 1.74e-06 7.83e-07 6.22e-07