logo

Genes within 1Mb (chr1:63628393:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 1.38e-03 -0.304 0.0937 0.199 B L1
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 1.03e-01 0.162 0.0989 0.199 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 1.30e-01 0.15 0.0989 0.199 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0613 0.069 0.199 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 3.45e-01 -0.104 0.11 0.199 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0739 0.113 0.199 B L1
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 6.27e-03 -0.226 0.0819 0.199 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 7.30e-02 0.164 0.0913 0.199 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 5.59e-01 0.0545 0.093 0.199 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 7.20e-01 0.027 0.0752 0.199 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0603 0.107 0.199 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -841736 sc-eQTL 6.28e-02 0.118 0.0632 0.199 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 3.85e-01 0.0833 0.0956 0.199 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 8.33e-03 -0.242 0.0907 0.199 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 9.54e-01 0.00583 0.102 0.199 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 9.54e-01 0.00593 0.103 0.199 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0157 0.0978 0.199 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 1.82e-01 -0.146 0.109 0.199 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -841736 sc-eQTL 2.18e-02 0.126 0.0547 0.199 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 2.20e-02 0.249 0.108 0.199 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 2.22e-01 -0.124 0.101 0.203 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 2.42e-01 0.122 0.104 0.203 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 6.02e-01 -0.056 0.107 0.203 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0931 0.0837 0.203 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 6.63e-02 -0.215 0.116 0.203 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 1.50e-01 -0.147 0.102 0.203 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0486 0.0988 0.199 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 4.57e-01 0.0768 0.103 0.199 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 1.11e-01 0.159 0.0991 0.199 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 3.71e-01 0.0603 0.0673 0.199 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 6.77e-01 0.0445 0.106 0.199 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 8.81e-02 -0.146 0.0854 0.2 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0449 0.101 0.2 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0148 0.083 0.2 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 7.94e-01 0.0234 0.0892 0.2 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0105 0.111 0.2 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 2.80e-01 0.13 0.12 0.2 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 1.30e-01 0.144 0.0948 0.199 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00386 0.0958 0.199 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0371 0.0978 0.199 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 9.33e-01 0.0071 0.0847 0.199 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 8.80e-01 0.0113 0.0751 0.199 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 6.85e-01 0.047 0.116 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 1.13e-02 -0.315 0.123 0.202 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 3.70e-01 -0.108 0.12 0.202 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0786 0.112 0.202 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 8.41e-01 0.0236 0.118 0.202 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0391 0.115 0.202 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 1.26e-01 0.166 0.108 0.202 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 1.05e-02 -0.291 0.113 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 3.05e-03 0.341 0.114 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 7.32e-01 0.038 0.111 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 6.08e-02 -0.176 0.0932 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 6.99e-01 0.0433 0.112 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0612 0.111 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 6.78e-02 -0.206 0.112 0.196 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0403 0.115 0.196 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0375 0.108 0.196 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0503 0.103 0.196 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0787 0.117 0.196 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00811 0.117 0.196 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 5.23e-03 -0.322 0.114 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 7.30e-01 0.0404 0.117 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 8.60e-01 0.0198 0.112 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 2.39e-01 -0.101 0.0858 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0579 0.114 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 3.67e-01 -0.11 0.122 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 2.08e-01 -0.143 0.114 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0264 0.119 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 4.41e-01 0.0881 0.114 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 1.49e-01 0.158 0.109 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 1.40e-01 -0.176 0.119 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 9.29e-01 0.0106 0.119 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 7.52e-01 0.0361 0.114 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 2.95e-01 0.127 0.121 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 2.67e-01 0.117 0.105 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 3.09e-01 -0.111 0.109 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0114 0.117 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -841736 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0288 0.0424 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000935 0.111 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 1.07e-02 -0.236 0.0918 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 2.10e-01 0.127 0.101 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 5.37e-01 0.0614 0.0994 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00778 0.088 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0161 0.107 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -841736 sc-eQTL 6.74e-02 0.116 0.0632 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 1.11e-01 0.17 0.106 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0326 0.0975 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 7.51e-01 0.036 0.113 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 1.26e-01 0.153 0.0998 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 9.24e-01 0.0093 0.0977 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0927 0.115 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -841736 sc-eQTL 1.12e-01 0.145 0.0907 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 8.64e-02 -0.191 0.111 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 1.10e-01 -0.181 0.113 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 3.03e-01 0.118 0.114 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0831 0.111 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 4.83e-01 0.076 0.108 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 7.43e-01 0.0366 0.112 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -841736 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0458 0.069 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 5.11e-01 0.0761 0.116 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 1.53e-01 -0.149 0.104 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 1.53e-01 0.159 0.111 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 5.10e-01 0.0695 0.105 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0714 0.112 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 7.74e-01 0.0336 0.117 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -841736 sc-eQTL 1.06e-02 0.126 0.0488 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 7.66e-03 0.317 0.118 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 2.36e-02 -0.238 0.104 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0797 0.109 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 2.16e-01 0.14 0.113 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 9.06e-01 0.0128 0.108 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0273 0.11 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -841736 sc-eQTL 1.84e-02 0.179 0.0751 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 6.64e-01 -0.045 0.103 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0766 0.117 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 8.53e-01 -0.022 0.118 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 6.25e-03 -0.313 0.113 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0715 0.118 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 2.48e-01 -0.132 0.114 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -841736 sc-eQTL 1.55e-01 0.0856 0.0599 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00824 0.117 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 4.38e-01 0.0931 0.12 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 9.90e-01 0.00153 0.12 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 2.54e-01 0.133 0.116 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0551 0.112 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 3.46e-02 -0.255 0.12 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -841736 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0207 0.0247 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 6.55e-01 0.0527 0.118 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 1.32e-01 0.166 0.11 0.201 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 7.73e-01 0.0315 0.109 0.201 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 4.66e-01 0.0763 0.105 0.201 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 9.41e-01 0.00815 0.11 0.201 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 9.80e-01 0.00272 0.111 0.201 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0584 0.114 0.201 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 8.59e-01 0.0195 0.11 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 2.00e-01 0.145 0.112 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 7.12e-01 0.0362 0.0978 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0735 0.109 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0351 0.114 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 3.05e-01 0.115 0.112 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 1.96e-01 -0.116 0.0891 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0233 0.114 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0569 0.0987 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 4.71e-01 0.0724 0.1 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0314 0.114 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 1.04e-01 0.2 0.123 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0771 0.121 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0845 0.126 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 1.24e-01 0.148 0.0957 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 8.76e-01 0.0175 0.112 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0281 0.118 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 2.30e-01 -0.134 0.112 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 2.61e-01 -0.108 0.096 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0218 0.109 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00436 0.101 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0578 0.103 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0533 0.107 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 8.63e-01 0.0197 0.114 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0509 0.128 0.207 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0427 0.135 0.207 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 2.35e-02 0.323 0.141 0.207 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 2.49e-01 -0.145 0.125 0.207 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 9.50e-01 0.00783 0.125 0.207 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0484 0.138 0.207 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 9.34e-01 0.00858 0.104 0.198 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 4.80e-01 0.0748 0.106 0.198 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0186 0.106 0.198 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00879 0.093 0.198 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 2.99e-02 0.202 0.0922 0.198 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0117 0.108 0.198 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0436 0.111 0.199 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 9.04e-01 0.0144 0.119 0.199 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0476 0.109 0.199 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 1.67e-01 0.153 0.111 0.199 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 4.02e-02 -0.238 0.115 0.199 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -841736 sc-eQTL 2.28e-01 -0.106 0.0876 0.199 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 3.96e-01 0.0945 0.111 0.199 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 1.02e-01 -0.181 0.11 0.207 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 3.15e-01 0.113 0.112 0.207 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 8.00e-01 -0.028 0.11 0.207 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0797 0.0954 0.207 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 7.51e-02 -0.215 0.12 0.207 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0656 0.0973 0.207 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0851 0.103 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0365 0.103 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 9.01e-02 0.184 0.108 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 6.23e-01 0.0375 0.0763 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 3.49e-01 0.101 0.108 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 6.04e-01 0.0591 0.114 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 1.34e-01 0.173 0.115 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 7.59e-01 0.0329 0.107 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0244 0.0927 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0621 0.104 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 8.90e-01 0.0181 0.131 0.191 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0293 0.139 0.191 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 6.75e-01 0.0574 0.137 0.191 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 2.86e-01 0.139 0.13 0.191 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0373 0.139 0.191 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 1.62e-01 -0.191 0.136 0.191 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0578 0.114 0.198 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 8.44e-01 -0.021 0.107 0.198 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 5.84e-01 0.0596 0.109 0.198 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 7.82e-01 0.0288 0.104 0.198 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 3.08e-01 -0.117 0.114 0.198 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 7.65e-02 -0.184 0.103 0.195 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 2.76e-02 0.25 0.113 0.195 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00956 0.112 0.195 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 4.29e-01 0.0831 0.105 0.195 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 5.16e-01 0.0714 0.11 0.195 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 8.37e-01 0.0255 0.124 0.212 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 3.43e-01 0.114 0.12 0.212 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 4.05e-01 0.103 0.123 0.212 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 2.55e-01 0.126 0.11 0.212 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 3.86e-01 -0.108 0.124 0.212 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0477 0.11 0.212 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 6.30e-03 -0.284 0.103 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 4.73e-02 0.229 0.115 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 4.78e-01 0.0713 0.1 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 2.02e-02 -0.188 0.0802 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00566 0.107 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 9.24e-01 0.0106 0.111 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 3.57e-03 -0.326 0.11 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 6.20e-01 0.0576 0.116 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 4.37e-01 0.0843 0.108 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00822 0.0827 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 2.29e-01 -0.141 0.117 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0962 0.117 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0336 0.105 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 3.46e-01 0.0956 0.101 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 1.53e-01 0.146 0.102 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 5.38e-01 0.0435 0.0706 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 4.75e-01 0.0747 0.104 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 7.15e-02 -0.179 0.0988 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 3.07e-01 0.115 0.113 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 2.34e-01 0.133 0.111 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 4.09e-01 0.0787 0.0952 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 9.01e-01 0.0138 0.111 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 34982 sc-eQTL 7.46e-02 -0.155 0.0867 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 260818 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0551 0.105 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 940007 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0186 0.094 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 844261 sc-eQTL 5.70e-01 0.0534 0.0937 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 sc-eQTL 8.93e-01 0.015 0.111 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 105021 sc-eQTL 5.65e-01 0.0708 0.123 0.2 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 34982 eQTL 2.51e-05 -0.0995 0.0235 0.0 0.0 0.176
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 eQTL 2.02e-10 -0.245 0.0381 0.0 0.0 0.176

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 PGM1 34982 1.67e-05 2.41e-05 4.04e-06 1.31e-05 4.08e-06 9.07e-06 3.12e-05 4.01e-06 2.08e-05 1.17e-05 2.99e-05 1.26e-05 3.69e-05 9.56e-06 5.8e-06 1.25e-05 1.12e-05 1.81e-05 5.89e-06 5.36e-06 1.07e-05 2.31e-05 2.49e-05 7.45e-06 3.29e-05 5.99e-06 1.02e-05 9.69e-06 2.5e-05 1.77e-05 1.34e-05 1.67e-06 2.23e-06 6.33e-06 9.4e-06 4.54e-06 2.76e-06 2.83e-06 3.6e-06 2.69e-06 1.67e-06 2.75e-05 2.67e-06 3.43e-07 2.04e-06 3.29e-06 3.88e-06 1.49e-06 1.37e-06
ENSG00000142856 ITGB3BP 34672 1.69e-05 2.41e-05 4.1e-06 1.31e-05 4.14e-06 9.14e-06 3.16e-05 4.07e-06 2.12e-05 1.19e-05 3.02e-05 1.29e-05 3.69e-05 9.68e-06 5.84e-06 1.26e-05 1.13e-05 1.83e-05 5.97e-06 5.4e-06 1.08e-05 2.33e-05 2.5e-05 7.45e-06 3.32e-05 6.05e-06 1.04e-05 9.74e-06 2.52e-05 1.78e-05 1.36e-05 1.65e-06 2.22e-06 6.43e-06 9.41e-06 4.56e-06 2.76e-06 2.85e-06 3.62e-06 2.71e-06 1.67e-06 2.78e-05 2.63e-06 3.43e-07 2.07e-06 3.27e-06 3.88e-06 1.49e-06 1.38e-06