logo

Genes within 1Mb (chr1:63628017:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 4.60e-03 -0.262 0.0914 0.212 B L1
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 6.12e-02 0.18 0.0957 0.212 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 8.48e-02 0.166 0.0958 0.212 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0463 0.067 0.212 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0904 0.107 0.212 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0485 0.109 0.212 B L1
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 1.22e-02 -0.202 0.0797 0.212 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 5.64e-02 0.17 0.0885 0.212 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 5.68e-01 0.0517 0.0903 0.212 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 6.29e-01 0.0353 0.073 0.212 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0159 0.104 0.212 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -842112 sc-eQTL 5.42e-02 0.119 0.0613 0.212 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 6.33e-01 0.0445 0.093 0.212 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 3.19e-02 -0.191 0.0885 0.212 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0128 0.0986 0.212 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0347 0.0999 0.212 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 7.83e-01 0.0262 0.0949 0.212 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 1.44e-01 -0.155 0.106 0.212 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -842112 sc-eQTL 6.30e-02 0.0996 0.0533 0.212 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 2.78e-02 0.232 0.105 0.212 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 3.05e-01 -0.101 0.0981 0.216 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 1.89e-01 0.133 0.101 0.216 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 2.32e-01 -0.124 0.104 0.216 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 2.02e-01 -0.104 0.0811 0.216 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 2.73e-02 -0.25 0.112 0.216 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 1.80e-01 -0.133 0.0987 0.216 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0251 0.0956 0.212 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 5.89e-01 0.054 0.0998 0.212 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 1.61e-01 0.135 0.0961 0.212 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 4.37e-01 0.0508 0.0652 0.212 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 5.29e-01 0.0649 0.103 0.212 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 3.76e-02 -0.172 0.0822 0.212 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0157 0.0974 0.212 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00348 0.0802 0.212 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 8.64e-01 0.0148 0.0862 0.212 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 9.54e-01 0.0062 0.107 0.212 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 2.63e-01 0.13 0.116 0.212 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 1.83e-01 0.123 0.092 0.212 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0342 0.0928 0.212 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0406 0.0947 0.212 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 7.46e-01 0.0266 0.082 0.212 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 8.96e-01 0.00949 0.0727 0.212 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 5.59e-01 0.0657 0.112 0.212 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 1.06e-02 -0.311 0.12 0.209 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 4.29e-01 -0.093 0.117 0.209 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 3.35e-01 -0.106 0.109 0.209 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 6.06e-01 0.0595 0.115 0.209 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0233 0.113 0.209 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 7.09e-02 0.192 0.106 0.209 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 5.77e-03 -0.305 0.109 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 4.11e-03 0.322 0.111 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 8.06e-01 0.0265 0.108 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 9.65e-02 -0.152 0.0908 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 6.64e-01 0.0474 0.109 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0484 0.108 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 1.33e-01 -0.165 0.109 0.209 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0101 0.112 0.209 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0313 0.105 0.209 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 9.46e-01 0.00681 0.0997 0.209 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 3.51e-01 -0.106 0.114 0.209 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00276 0.113 0.209 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 2.09e-02 -0.259 0.111 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 3.57e-01 0.104 0.113 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 6.46e-01 0.0499 0.108 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 1.80e-01 -0.112 0.0832 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0561 0.111 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0712 0.118 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 2.40e-01 -0.13 0.111 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0547 0.116 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 3.15e-01 0.112 0.111 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 1.00e-01 0.176 0.106 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 1.74e-01 -0.157 0.116 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00339 0.115 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 6.38e-01 0.053 0.113 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 1.90e-01 0.156 0.119 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 3.81e-01 0.0914 0.104 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 1.76e-01 -0.146 0.107 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 8.69e-01 0.0191 0.115 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -842112 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0307 0.0418 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 8.07e-01 0.0268 0.11 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 1.08e-02 -0.229 0.0891 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 1.05e-01 0.159 0.0976 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 5.04e-01 0.0646 0.0964 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 9.12e-01 0.00944 0.0853 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 8.72e-01 0.0168 0.104 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -842112 sc-eQTL 5.88e-02 0.116 0.0613 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 1.56e-01 0.147 0.103 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00138 0.0945 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 7.82e-01 0.0305 0.11 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 1.81e-01 0.13 0.0969 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00538 0.0947 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0547 0.112 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -842112 sc-eQTL 3.86e-02 0.182 0.0876 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 3.79e-02 -0.223 0.107 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 1.01e-01 -0.181 0.11 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 3.97e-01 0.0941 0.111 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0243 0.108 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 2.41e-01 0.123 0.105 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 6.89e-01 0.0435 0.109 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -842112 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0147 0.0672 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 6.95e-01 0.0442 0.113 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 2.85e-01 -0.108 0.101 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 1.84e-01 0.142 0.107 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 5.37e-01 0.063 0.102 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0502 0.108 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 8.43e-01 0.0224 0.113 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -842112 sc-eQTL 4.51e-03 0.135 0.0469 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 4.03e-03 0.329 0.113 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 2.31e-02 -0.232 0.101 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 3.91e-01 -0.091 0.106 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 4.26e-01 0.0873 0.11 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 6.94e-01 0.0415 0.105 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0311 0.107 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -842112 sc-eQTL 4.73e-02 0.146 0.0733 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0629 0.1 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0425 0.113 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0221 0.114 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 8.23e-03 -0.292 0.109 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00716 0.114 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 1.72e-01 -0.151 0.11 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -842112 sc-eQTL 1.86e-01 0.0769 0.0579 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00838 0.113 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 2.64e-01 0.132 0.118 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 6.75e-01 0.05 0.119 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 3.18e-01 0.115 0.115 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0303 0.111 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 3.40e-02 -0.253 0.119 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -842112 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0215 0.0244 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 3.37e-01 0.112 0.116 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 2.54e-01 0.122 0.107 0.214 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 9.89e-01 0.00148 0.106 0.214 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 8.62e-01 0.0177 0.102 0.214 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0133 0.107 0.214 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 9.33e-01 0.00903 0.108 0.214 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0239 0.111 0.214 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0182 0.109 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 3.56e-01 0.103 0.111 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 8.58e-01 0.0173 0.0968 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0727 0.108 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0275 0.113 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 1.74e-01 0.151 0.111 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 1.40e-01 -0.128 0.0862 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 9.65e-01 0.00487 0.11 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0266 0.0956 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 5.26e-01 0.0616 0.097 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0262 0.11 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 1.19e-01 0.186 0.119 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 3.73e-01 -0.106 0.119 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0498 0.124 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 1.64e-01 0.132 0.0943 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00177 0.11 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 7.82e-01 -0.032 0.116 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 1.52e-01 -0.158 0.11 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 2.72e-01 -0.103 0.0932 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 9.89e-01 0.00146 0.106 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 8.73e-01 0.0157 0.0978 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0379 0.1 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0533 0.104 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 6.76e-01 0.0461 0.11 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 6.00e-01 -0.065 0.124 0.215 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0331 0.13 0.215 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 2.57e-02 0.307 0.136 0.215 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 2.82e-01 -0.13 0.121 0.215 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 8.42e-01 0.0242 0.121 0.215 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0281 0.133 0.215 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 5.97e-01 0.0535 0.101 0.211 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 4.32e-01 0.0809 0.103 0.211 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 8.55e-01 -0.019 0.103 0.211 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 9.13e-01 0.00995 0.0905 0.211 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 3.42e-02 0.192 0.0898 0.211 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 8.03e-01 0.0264 0.105 0.211 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0496 0.108 0.212 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0444 0.115 0.212 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0376 0.106 0.212 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 3.21e-01 0.107 0.108 0.212 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 1.17e-01 -0.177 0.112 0.212 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -842112 sc-eQTL 2.17e-01 -0.105 0.0851 0.212 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 2.15e-01 0.134 0.108 0.212 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 6.78e-02 -0.196 0.107 0.222 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 1.90e-01 0.143 0.109 0.222 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0698 0.107 0.222 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0901 0.0928 0.222 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 3.41e-02 -0.249 0.116 0.222 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0624 0.0946 0.222 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0603 0.0997 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0345 0.0998 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 1.62e-01 0.147 0.105 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 5.97e-01 0.0392 0.074 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 2.53e-01 0.12 0.105 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 5.70e-01 0.0628 0.11 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 2.25e-01 0.136 0.112 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 7.82e-01 0.0288 0.104 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0228 0.0899 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0417 0.101 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0168 0.128 0.209 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0523 0.136 0.209 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 4.70e-01 0.0968 0.133 0.209 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 1.13e-01 0.202 0.127 0.209 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0151 0.136 0.209 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 1.58e-01 -0.188 0.133 0.209 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0517 0.111 0.211 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00874 0.104 0.211 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 4.23e-01 0.0848 0.106 0.211 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 8.45e-01 0.0197 0.101 0.211 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 3.37e-01 -0.107 0.111 0.211 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 5.53e-02 -0.196 0.101 0.206 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 2.31e-02 0.254 0.111 0.206 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0333 0.111 0.206 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 6.97e-01 0.0403 0.103 0.206 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 4.73e-01 0.0777 0.108 0.206 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 5.95e-01 0.0653 0.123 0.226 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 7.21e-01 0.0428 0.12 0.226 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 6.83e-01 0.0499 0.122 0.226 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 3.64e-01 0.0996 0.109 0.226 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 5.75e-01 -0.069 0.123 0.226 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0267 0.109 0.226 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 1.09e-02 -0.258 0.1 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 3.30e-02 0.239 0.112 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 6.41e-01 0.0457 0.0978 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 1.01e-01 -0.13 0.0786 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00913 0.104 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 8.03e-01 0.027 0.108 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 1.18e-02 -0.274 0.108 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 4.20e-01 0.0909 0.112 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 2.88e-01 0.112 0.105 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0191 0.0802 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 2.89e-01 -0.12 0.113 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0776 0.114 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00294 0.102 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 4.55e-01 0.0736 0.0983 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 2.51e-01 0.114 0.0988 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 5.07e-01 0.0455 0.0685 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 3.36e-01 0.0976 0.101 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 1.06e-01 -0.156 0.0962 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 2.72e-01 0.121 0.11 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 1.69e-01 0.15 0.108 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 6.23e-01 0.0456 0.0927 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 9.98e-01 0.000216 0.108 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 34606 sc-eQTL 3.64e-02 -0.176 0.0836 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 260442 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0193 0.101 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 939631 sc-eQTL 9.26e-01 0.00841 0.0909 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 843885 sc-eQTL 6.46e-01 0.0417 0.0907 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 sc-eQTL 8.10e-01 0.0259 0.107 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 104645 sc-eQTL 6.45e-01 0.0548 0.119 0.213 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 34606 eQTL 0.000121 -0.087 0.0225 0.0 0.0 0.187
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 eQTL 3.04e-10 -0.232 0.0365 0.0 0.0 0.187

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000142856 ITGB3BP 34296 2.06e-05 2.61e-05 2.57e-06 1.03e-05 3.06e-06 7.78e-06 3.06e-05 3.08e-06 1.77e-05 7.94e-06 2.29e-05 8.63e-06 3.51e-05 8.09e-06 5.16e-06 9.16e-06 1.04e-05 1.41e-05 4.61e-06 4.17e-06 7.99e-06 1.76e-05 2e-05 4.96e-06 2.84e-05 5.29e-06 7.69e-06 7.29e-06 1.91e-05 1.57e-05 1.28e-05 1.07e-06 1.4e-06 3.69e-06 6.68e-06 3.22e-06 1.76e-06 2.26e-06 2.35e-06 1.57e-06 9.75e-07 2.57e-05 2.52e-06 1.7e-07 1.07e-06 2.35e-06 1.94e-06 7e-07 4.66e-07