logo

Genes within 1Mb (chr1:63626753:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 6.43e-03 -0.255 0.0928 0.207 B L1
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 5.42e-02 0.188 0.097 0.207 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 1.10e-01 0.156 0.0972 0.207 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0531 0.0679 0.207 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 3.16e-01 -0.108 0.108 0.207 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0503 0.111 0.207 B L1
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 1.84e-02 -0.191 0.0804 0.207 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 4.90e-02 0.176 0.0891 0.207 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 4.63e-01 0.0668 0.0909 0.207 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 4.35e-01 0.0574 0.0734 0.207 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0305 0.104 0.207 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -843376 sc-eQTL 5.49e-02 0.119 0.0617 0.207 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 6.30e-01 0.0451 0.0936 0.207 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 4.73e-02 -0.179 0.0895 0.207 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 9.27e-01 0.00914 0.0996 0.207 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0652 0.101 0.207 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 7.75e-01 0.0274 0.0958 0.207 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 1.99e-01 -0.138 0.107 0.207 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -843376 sc-eQTL 3.04e-02 0.117 0.0536 0.207 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 7.80e-03 0.282 0.105 0.207 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0955 0.0992 0.214 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 1.20e-01 0.159 0.102 0.214 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 2.64e-01 -0.117 0.105 0.214 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 1.45e-01 -0.12 0.0819 0.214 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 2.65e-02 -0.254 0.114 0.214 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 2.56e-01 -0.114 0.0998 0.214 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 8.48e-01 0.0186 0.0967 0.207 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 3.23e-01 0.0997 0.101 0.207 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 8.05e-02 0.17 0.0969 0.207 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 6.60e-01 0.0291 0.0659 0.207 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 5.41e-01 0.0637 0.104 0.207 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 4.76e-02 -0.165 0.083 0.208 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0119 0.0983 0.208 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 9.31e-01 0.00704 0.0809 0.208 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 6.25e-01 0.0425 0.0869 0.208 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 7.58e-01 0.0333 0.108 0.208 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 3.80e-01 0.103 0.117 0.208 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 1.78e-01 0.126 0.0933 0.207 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0564 0.094 0.207 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0441 0.096 0.207 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 9.22e-01 0.00813 0.0832 0.207 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 6.64e-01 0.032 0.0737 0.207 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 5.31e-01 0.0714 0.114 0.207 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 2.50e-02 -0.277 0.123 0.204 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 3.37e-01 -0.115 0.119 0.204 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0838 0.111 0.204 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 7.58e-01 0.036 0.117 0.204 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0468 0.114 0.204 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 6.65e-02 0.198 0.107 0.204 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 1.02e-02 -0.289 0.111 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 5.38e-03 0.317 0.113 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 7.97e-01 0.0283 0.11 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 7.81e-02 -0.163 0.0922 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 3.83e-01 0.0965 0.11 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0567 0.109 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 1.47e-01 -0.162 0.111 0.205 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 8.90e-01 0.0158 0.114 0.205 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000978 0.107 0.205 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 7.23e-01 0.036 0.101 0.205 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 1.66e-01 -0.161 0.116 0.205 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 7.99e-01 0.0294 0.115 0.205 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 2.48e-02 -0.254 0.113 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 5.38e-01 0.0705 0.114 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 8.18e-01 0.0253 0.11 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0963 0.0842 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 2.41e-01 -0.131 0.112 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0845 0.119 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 2.43e-01 -0.131 0.112 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0487 0.117 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 3.25e-01 0.11 0.112 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 1.49e-01 0.156 0.108 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 2.07e-01 -0.148 0.117 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 9.27e-01 0.0107 0.117 0.204 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 4.82e-01 0.0803 0.114 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 2.97e-01 0.126 0.12 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 6.52e-01 0.0476 0.106 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 1.39e-01 -0.162 0.109 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0398 0.117 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -843376 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0292 0.0424 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 8.93e-01 -0.015 0.111 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 6.25e-03 -0.248 0.0896 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 7.75e-02 0.174 0.0983 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 3.78e-01 0.0858 0.0972 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 6.71e-01 0.0367 0.086 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00285 0.105 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -843376 sc-eQTL 5.98e-02 0.117 0.0618 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 1.58e-01 0.147 0.104 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 7.73e-01 0.0276 0.0952 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 7.89e-01 0.0297 0.111 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 1.65e-01 0.136 0.0976 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000216 0.0954 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0499 0.112 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -843376 sc-eQTL 4.86e-02 0.175 0.0883 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 5.00e-02 -0.213 0.108 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 1.79e-01 -0.15 0.111 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 4.39e-01 0.087 0.112 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00513 0.109 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 2.95e-01 0.111 0.106 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 6.06e-01 0.0567 0.11 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -843376 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0102 0.0679 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 8.04e-01 0.0282 0.114 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0897 0.102 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 1.52e-01 0.156 0.108 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 5.71e-01 0.0586 0.103 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0639 0.11 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0243 0.114 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -843376 sc-eQTL 3.34e-03 0.141 0.0475 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 2.57e-03 0.35 0.115 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 3.69e-02 -0.216 0.103 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0774 0.107 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 6.76e-01 0.0465 0.111 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 5.57e-01 0.0627 0.107 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 9.56e-01 0.00591 0.108 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -843376 sc-eQTL 2.88e-02 0.163 0.0741 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0144 0.102 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0279 0.115 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0255 0.116 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 1.16e-02 -0.284 0.111 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0548 0.116 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 2.52e-01 -0.129 0.112 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -843376 sc-eQTL 1.42e-01 0.0866 0.0588 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 8.33e-01 0.0243 0.115 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 3.07e-01 0.124 0.121 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 5.58e-01 0.0712 0.121 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 5.50e-01 0.0704 0.118 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0528 0.113 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 5.57e-02 -0.234 0.121 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -843376 sc-eQTL 4.46e-01 -0.019 0.0249 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 3.36e-01 0.114 0.119 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 4.17e-01 0.0883 0.109 0.21 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0241 0.108 0.21 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0222 0.103 0.21 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0575 0.109 0.21 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 9.37e-01 0.00867 0.109 0.21 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0136 0.112 0.21 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0742 0.11 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 3.37e-01 0.109 0.113 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 6.45e-01 0.0452 0.098 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0739 0.109 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0452 0.114 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 2.28e-01 0.136 0.112 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 2.09e-01 -0.11 0.0871 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 9.47e-01 0.00745 0.111 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0525 0.0964 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 4.05e-01 0.0817 0.0979 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0022 0.112 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 1.45e-01 0.176 0.12 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0652 0.121 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 6.22e-01 -0.062 0.126 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 1.32e-01 0.145 0.0956 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0066 0.112 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0334 0.117 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 7.76e-02 -0.197 0.111 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 2.68e-01 -0.105 0.0942 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0139 0.107 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 6.33e-01 0.0473 0.0989 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0296 0.101 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0121 0.105 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 8.00e-01 0.0284 0.112 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 5.03e-01 -0.084 0.125 0.211 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 8.17e-01 0.0306 0.132 0.211 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 1.49e-02 0.339 0.137 0.211 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 1.30e-01 -0.185 0.121 0.211 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 6.34e-01 0.0585 0.122 0.211 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0556 0.134 0.211 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 3.80e-01 0.0904 0.103 0.207 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 3.77e-01 0.0925 0.104 0.207 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0227 0.105 0.207 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 6.91e-01 0.0366 0.0919 0.207 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 3.09e-02 0.198 0.0912 0.207 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 8.09e-01 0.026 0.107 0.207 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0228 0.109 0.207 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0376 0.116 0.207 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0616 0.107 0.207 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 3.95e-01 0.0929 0.109 0.207 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 7.25e-02 -0.205 0.113 0.207 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -843376 sc-eQTL 2.38e-01 -0.102 0.0861 0.207 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 3.34e-01 0.106 0.109 0.207 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 8.31e-02 -0.188 0.108 0.222 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 1.67e-01 0.153 0.11 0.222 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0588 0.108 0.222 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0991 0.0939 0.222 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 3.24e-02 -0.254 0.118 0.222 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 4.85e-01 -0.067 0.0958 0.222 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0355 0.101 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0273 0.101 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 1.70e-01 0.146 0.106 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 7.08e-01 0.0281 0.0748 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 2.40e-01 0.124 0.106 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 3.63e-01 0.102 0.111 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 7.14e-02 0.203 0.112 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 3.91e-01 0.0899 0.105 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0572 0.0907 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0749 0.102 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 9.21e-01 -0.013 0.131 0.203 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0623 0.14 0.203 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 5.07e-01 0.0914 0.137 0.203 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 1.47e-01 0.19 0.13 0.203 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 9.35e-01 0.0113 0.139 0.203 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 1.95e-01 -0.178 0.136 0.203 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0489 0.113 0.209 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0188 0.105 0.209 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 2.85e-01 0.115 0.107 0.209 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 8.30e-01 0.022 0.102 0.209 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0955 0.113 0.209 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 1.42e-01 -0.152 0.103 0.204 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 8.81e-03 0.296 0.112 0.204 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0225 0.112 0.204 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 7.34e-01 0.0357 0.105 0.204 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 3.74e-01 0.0975 0.109 0.204 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 5.39e-01 0.0763 0.124 0.226 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 6.54e-01 0.0543 0.121 0.226 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 8.95e-01 0.0163 0.123 0.226 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 2.68e-01 0.123 0.11 0.226 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 4.04e-01 -0.104 0.124 0.226 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 9.60e-01 0.00559 0.11 0.226 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 1.81e-02 -0.243 0.102 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 3.15e-02 0.245 0.113 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 5.53e-01 0.059 0.0993 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 1.38e-01 -0.119 0.0799 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0168 0.106 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 6.68e-01 0.0472 0.11 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 1.06e-02 -0.281 0.109 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 5.28e-01 0.0718 0.114 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 3.86e-01 0.0922 0.106 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0152 0.0811 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 1.45e-01 -0.167 0.114 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0885 0.115 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 7.15e-01 0.0376 0.103 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 2.32e-01 0.119 0.0992 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 1.46e-01 0.146 0.0997 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 8.02e-01 0.0174 0.0693 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 4.25e-01 0.0817 0.102 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 2.14e-01 -0.122 0.0977 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 1.89e-01 0.146 0.111 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 1.07e-01 0.177 0.11 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 5.81e-01 0.052 0.0939 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 8.07e-01 0.0267 0.109 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 33342 sc-eQTL 8.13e-02 -0.148 0.0846 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 259178 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0243 0.102 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 938367 sc-eQTL 9.89e-01 0.00128 0.0916 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 842621 sc-eQTL 5.02e-01 0.0614 0.0914 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 sc-eQTL 5.93e-01 0.0579 0.108 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 103381 sc-eQTL 7.83e-01 0.0331 0.12 0.209 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 33342 eQTL 0.00068 -0.0752 0.0221 0.0 0.0 0.189
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 eQTL 1.13e-09 -0.22 0.0357 0.0 0.0 0.189

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000142856 ITGB3BP 33032 2.1e-05 2.45e-05 3.83e-06 1.24e-05 3.06e-06 9.68e-06 2.83e-05 3.02e-06 1.87e-05 8.91e-06 2.41e-05 9.08e-06 3.69e-05 9.38e-06 5.26e-06 1.09e-05 1.07e-05 1.66e-05 5.99e-06 4.41e-06 8.37e-06 2.04e-05 2.02e-05 5.33e-06 3.21e-05 5.41e-06 8.05e-06 7.92e-06 2.39e-05 2.03e-05 1.28e-05 1.18e-06 1.61e-06 4.84e-06 8.5e-06 4.02e-06 1.81e-06 2.48e-06 3.22e-06 2.37e-06 1.08e-06 2.78e-05 2.67e-06 2.5e-07 1.55e-06 2.63e-06 2.9e-06 8.47e-07 8.01e-07