logo

Genes within 1Mb (chr1:63618528:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 2.83e-01 0.0989 0.0919 0.182 B L1
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00923 0.0955 0.182 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 7.30e-01 -0.033 0.0955 0.182 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00265 0.0664 0.182 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 4.75e-02 -0.209 0.105 0.182 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 2.48e-01 -0.125 0.108 0.182 B L1
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 1.93e-02 0.186 0.079 0.182 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00597 0.0884 0.182 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 2.10e-02 -0.206 0.0884 0.182 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 8.06e-01 0.0178 0.0722 0.182 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 1.61e-02 -0.245 0.101 0.182 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -851601 sc-eQTL 9.90e-01 -0.000737 0.0612 0.182 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 8.44e-01 0.0181 0.0921 0.182 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 1.64e-01 0.123 0.0881 0.182 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0355 0.0975 0.182 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0332 0.0988 0.182 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0395 0.0939 0.182 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 5.13e-02 -0.204 0.104 0.182 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -851601 sc-eQTL 6.26e-01 0.0259 0.0531 0.182 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 1.84e-01 -0.139 0.104 0.182 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0174 0.0983 0.178 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 2.97e-01 -0.106 0.101 0.178 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 3.52e-01 0.0967 0.104 0.178 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 7.98e-01 0.0208 0.0813 0.178 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0613 0.114 0.178 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0695 0.0989 0.178 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 1.22e-01 0.147 0.0945 0.182 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 1.86e-01 0.131 0.0988 0.182 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0212 0.0959 0.182 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0252 0.0648 0.182 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0678 0.102 0.182 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 5.31e-02 0.159 0.0816 0.18 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 3.27e-01 0.0947 0.0963 0.18 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0405 0.0795 0.18 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 4.90e-01 0.0591 0.0853 0.18 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0695 0.106 0.18 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0707 0.115 0.18 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 6.38e-01 0.0429 0.0911 0.182 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 6.04e-01 0.0475 0.0916 0.182 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0345 0.0935 0.182 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 8.01e-01 0.0204 0.081 0.182 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 5.88e-01 -0.039 0.0718 0.182 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 2.45e-01 -0.129 0.11 0.182 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 4.67e-02 0.248 0.124 0.179 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 4.25e-01 -0.096 0.12 0.179 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 5.36e-01 0.0694 0.112 0.179 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 3.27e-01 -0.115 0.117 0.179 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0936 0.115 0.179 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0973 0.109 0.179 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 8.40e-01 0.0222 0.11 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 5.08e-02 -0.218 0.111 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0105 0.107 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 2.59e-01 0.102 0.0901 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 2.59e-01 -0.121 0.107 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0584 0.107 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 9.62e-01 0.00519 0.108 0.181 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0652 0.11 0.181 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0615 0.103 0.181 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0313 0.0977 0.181 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0231 0.112 0.181 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 8.58e-01 0.0198 0.111 0.181 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 5.83e-01 0.0602 0.109 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 5.44e-01 0.0667 0.11 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 7.46e-01 0.0342 0.105 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 3.32e-01 0.0786 0.0809 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 2.31e-01 -0.129 0.107 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0294 0.115 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 1.01e-01 0.176 0.107 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 3.44e-01 0.106 0.112 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 7.48e-01 0.0347 0.108 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 5.12e-01 -0.068 0.104 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 8.09e-02 -0.196 0.112 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0224 0.112 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 3.25e-01 -0.106 0.108 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0398 0.114 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 4.32e-01 0.0783 0.0995 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 4.06e-01 0.0857 0.103 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 1.32e-01 -0.166 0.11 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -851601 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0113 0.0401 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 3.23e-01 -0.104 0.105 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 5.57e-02 0.172 0.0895 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0437 0.0981 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 7.66e-02 -0.17 0.0957 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 5.99e-01 0.0449 0.0852 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 8.75e-02 -0.178 0.103 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -851601 sc-eQTL 8.98e-01 0.00791 0.0617 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 7.70e-01 0.0303 0.103 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 7.32e-02 0.165 0.0917 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00445 0.107 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 1.45e-01 -0.138 0.0946 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 4.56e-01 -0.069 0.0924 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 3.38e-02 -0.231 0.108 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -851601 sc-eQTL 4.85e-01 0.0604 0.0864 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0858 0.105 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 9.80e-01 0.00277 0.112 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 8.64e-01 0.0193 0.112 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 1.91e-01 -0.143 0.109 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0812 0.106 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 2.89e-01 -0.116 0.109 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -851601 sc-eQTL 7.46e-01 -0.022 0.0678 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 3.00e-01 0.118 0.113 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 8.23e-01 0.0227 0.101 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0744 0.107 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0281 0.102 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 2.32e-01 -0.13 0.108 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0452 0.113 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -851601 sc-eQTL 1.56e-01 -0.0678 0.0477 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 1.57e-02 -0.278 0.114 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 5.87e-03 0.279 0.1 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 3.22e-01 0.105 0.106 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 1.42e-01 0.16 0.109 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 8.51e-01 0.0198 0.105 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 8.56e-03 -0.278 0.105 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -851601 sc-eQTL 8.69e-01 0.0122 0.0737 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 7.46e-01 0.0325 0.1 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 6.62e-01 0.0502 0.115 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0637 0.116 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0865 0.113 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 8.76e-01 0.0181 0.116 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0307 0.113 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -851601 sc-eQTL 4.76e-01 0.0423 0.0591 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 9.09e-01 0.0131 0.115 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 2.01e-01 -0.145 0.113 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0596 0.114 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 2.88e-02 -0.241 0.109 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 6.68e-01 0.0457 0.106 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0825 0.115 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -851601 sc-eQTL 8.56e-01 -0.00427 0.0235 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0587 0.112 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0517 0.108 0.184 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0263 0.107 0.184 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 7.03e-01 -0.039 0.102 0.184 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 3.99e-01 0.0909 0.108 0.184 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0313 0.108 0.184 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 9.80e-01 0.00279 0.111 0.184 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 9.88e-02 0.176 0.106 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 3.07e-01 -0.112 0.109 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0131 0.0948 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0214 0.106 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 4.77e-01 0.0783 0.11 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0857 0.109 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 1.83e-01 0.112 0.0841 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00194 0.107 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 8.74e-02 -0.159 0.0926 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 2.44e-01 -0.11 0.0944 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0441 0.108 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0625 0.116 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 7.43e-01 0.0373 0.113 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 3.89e-01 0.101 0.117 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 4.91e-01 0.062 0.0899 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 9.65e-01 0.00466 0.105 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 3.16e-01 -0.11 0.11 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0589 0.105 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 4.15e-01 0.0756 0.0926 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 4.87e-01 0.0729 0.105 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 2.92e-01 0.102 0.0968 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 4.19e-02 0.201 0.0983 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0791 0.103 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 8.39e-01 0.0223 0.11 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 4.68e-01 0.101 0.139 0.17 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 4.33e-01 0.115 0.146 0.17 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 3.95e-01 -0.133 0.156 0.17 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0365 0.136 0.17 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 1.52e-01 -0.194 0.135 0.17 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 3.28e-01 0.146 0.149 0.17 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0497 0.101 0.178 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0655 0.103 0.178 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0268 0.103 0.178 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 6.66e-01 -0.039 0.0902 0.178 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 6.16e-01 0.0454 0.0905 0.178 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0448 0.105 0.178 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 7.45e-01 0.0349 0.107 0.182 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 8.01e-01 0.029 0.115 0.182 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 1.60e-01 -0.148 0.105 0.182 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 2.98e-01 0.112 0.107 0.182 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 9.35e-01 0.00919 0.113 0.182 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -851601 sc-eQTL 9.51e-02 -0.142 0.0846 0.182 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00525 0.108 0.182 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 2.89e-01 -0.114 0.107 0.176 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 6.80e-01 -0.045 0.109 0.176 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 1.39e-01 0.158 0.106 0.176 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 2.32e-01 0.111 0.0927 0.176 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 6.68e-01 0.0507 0.118 0.176 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 2.97e-01 0.0988 0.0945 0.176 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 5.32e-01 0.0623 0.0996 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0152 0.0998 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0663 0.105 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0034 0.074 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0865 0.105 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 3.94e-01 0.095 0.111 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 4.21e-03 0.321 0.111 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 3.31e-01 0.102 0.105 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 9.42e-01 0.00659 0.0907 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 1.55e-01 0.145 0.102 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 2.44e-01 0.141 0.121 0.179 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 3.56e-01 0.119 0.129 0.179 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 3.44e-01 0.12 0.126 0.179 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 8.37e-01 0.025 0.121 0.179 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 4.87e-01 0.0897 0.129 0.179 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0676 0.127 0.179 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0638 0.113 0.176 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 2.52e-01 -0.12 0.105 0.176 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 4.78e-01 0.0764 0.107 0.176 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 8.88e-01 0.0145 0.103 0.176 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 1.33e-01 -0.169 0.112 0.176 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 3.64e-02 0.212 0.1 0.181 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 1.24e-01 -0.171 0.111 0.181 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 8.77e-01 -0.017 0.11 0.181 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0777 0.102 0.181 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0323 0.107 0.181 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 6.08e-01 0.0655 0.127 0.158 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 9.65e-01 0.00548 0.124 0.158 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0701 0.127 0.158 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0575 0.114 0.158 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 3.44e-01 -0.121 0.127 0.158 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 8.14e-01 0.0266 0.113 0.158 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 5.09e-01 0.0671 0.101 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 5.74e-02 -0.213 0.111 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0254 0.0975 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 9.46e-01 0.00533 0.0788 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 2.85e-01 -0.111 0.103 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0637 0.108 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 1.02e-01 0.176 0.107 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 2.97e-01 0.116 0.111 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 4.71e-01 0.0747 0.104 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0109 0.0791 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 8.07e-02 -0.195 0.111 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0532 0.112 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 1.88e-01 0.135 0.102 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 2.49e-01 0.114 0.0987 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 8.18e-01 -0.023 0.0997 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0211 0.0689 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 9.13e-01 0.0112 0.102 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 2.72e-01 0.107 0.0972 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0862 0.111 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 9.13e-01 0.0119 0.11 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 9.71e-01 0.0034 0.0934 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 3.04e-01 -0.111 0.108 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 25117 sc-eQTL 7.49e-02 0.149 0.0831 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 250953 sc-eQTL 5.20e-01 0.0647 0.1 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 930142 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0531 0.09 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 834396 sc-eQTL 4.68e-01 0.0653 0.0898 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 24807 sc-eQTL 2.70e-01 -0.118 0.106 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 sc-eQTL 9.10e-01 0.0133 0.118 0.181 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 25117 eQTL 9.74e-08 0.115 0.0215 0.0 0.0 0.192
ENSG00000185483 ROR1 -155489 pQTL 0.0207 0.0384 0.0166 0.0 0.0 0.188
ENSG00000203965 EFCAB7 95156 eQTL 4.28e-02 -0.0593 0.0292 0.0 0.0 0.192

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina