logo

Genes within 1Mb (chr1:63617155:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 4.79e-01 0.102 0.144 0.075 B L1
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 4.43e-01 -0.115 0.149 0.075 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 1.69e-01 0.206 0.149 0.075 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0159 0.104 0.075 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 2.56e-01 0.188 0.165 0.075 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 2.88e-01 0.18 0.169 0.075 B L1
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 9.31e-01 0.011 0.126 0.075 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 1.52e-01 -0.199 0.139 0.075 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 3.97e-02 -0.289 0.14 0.075 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 7.06e-01 0.043 0.114 0.075 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 9.68e-01 0.00653 0.162 0.075 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -852974 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0162 0.0965 0.075 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0362 0.145 0.075 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 6.00e-02 0.258 0.136 0.075 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 8.17e-03 -0.398 0.149 0.075 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 1.20e-02 0.383 0.151 0.075 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0442 0.146 0.075 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 9.54e-01 0.00935 0.163 0.075 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -852974 sc-eQTL 7.69e-02 -0.146 0.0819 0.075 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 4.92e-01 0.112 0.162 0.075 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 2.56e-01 -0.173 0.152 0.077 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 2.18e-01 -0.193 0.156 0.077 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 4.91e-01 0.111 0.161 0.077 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 9.51e-01 0.00771 0.126 0.077 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 3.51e-01 0.164 0.176 0.077 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 4.65e-01 0.112 0.153 0.077 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 6.80e-02 -0.273 0.149 0.075 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 1.61e-01 -0.219 0.156 0.075 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 1.14e-01 -0.239 0.151 0.075 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 6.12e-01 0.052 0.102 0.075 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 8.15e-01 0.0378 0.162 0.075 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 4.02e-01 0.105 0.125 0.075 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 1.21e-01 -0.228 0.146 0.075 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0359 0.121 0.075 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 8.61e-01 0.0228 0.13 0.075 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 7.53e-01 -0.051 0.162 0.075 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 1.91e-01 -0.23 0.175 0.075 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 1.74e-01 0.198 0.145 0.075 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 8.82e-01 0.0218 0.146 0.075 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 1.32e-01 0.224 0.148 0.075 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 9.39e-01 0.00986 0.129 0.075 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 7.09e-01 0.0428 0.114 0.075 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 3.80e-01 -0.155 0.176 0.075 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0493 0.2 0.074 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 1.07e-01 0.309 0.19 0.074 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 3.99e-01 -0.151 0.178 0.074 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 7.58e-01 0.0581 0.188 0.074 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0658 0.183 0.074 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 3.20e-01 -0.173 0.173 0.074 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 4.32e-01 0.137 0.174 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 2.88e-01 -0.188 0.177 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 7.27e-01 0.0592 0.169 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0311 0.143 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 1.52e-01 0.244 0.17 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 5.42e-01 0.103 0.169 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 5.97e-01 0.0912 0.172 0.075 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 1.18e-01 0.274 0.174 0.075 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 7.46e-01 0.0533 0.164 0.075 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 4.40e-02 -0.313 0.155 0.075 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 5.63e-01 -0.103 0.178 0.075 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 5.37e-01 -0.11 0.177 0.075 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 3.99e-01 0.146 0.173 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 4.43e-01 -0.133 0.174 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 3.71e-01 0.149 0.166 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0068 0.128 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 2.64e-01 0.19 0.17 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 6.58e-01 0.0804 0.181 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0146 0.17 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 4.79e-01 -0.125 0.177 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 2.88e-01 -0.181 0.17 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 5.15e-01 -0.107 0.164 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 6.62e-01 0.0777 0.178 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 6.29e-01 0.0856 0.177 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 5.77e-01 0.0957 0.171 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 7.23e-01 0.0644 0.181 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 2.15e-01 0.196 0.158 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 4.95e-01 0.112 0.164 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 5.49e-02 0.336 0.174 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -852974 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0632 0.0636 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 2.09e-01 0.209 0.166 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 3.56e-01 -0.13 0.141 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0721 0.153 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 9.61e-02 -0.25 0.15 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 4.02e-01 -0.111 0.133 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0728 0.163 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -852974 sc-eQTL 9.04e-01 0.0116 0.0963 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00805 0.161 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 9.94e-01 0.00112 0.147 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 1.15e-01 -0.268 0.169 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 3.18e-01 -0.151 0.15 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 2.41e-01 0.172 0.146 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 5.22e-01 0.111 0.173 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -852974 sc-eQTL 2.84e-02 -0.299 0.136 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 9.87e-01 0.00269 0.168 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00897 0.175 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 8.03e-01 -0.044 0.176 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 3.88e-01 -0.148 0.171 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 2.28e-01 0.201 0.166 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0451 0.172 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -852974 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0557 0.106 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 7.94e-01 0.0466 0.178 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 8.81e-01 0.0233 0.155 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 1.31e-02 -0.406 0.162 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 1.14e-03 0.503 0.152 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 8.50e-01 0.0314 0.166 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 7.71e-02 -0.305 0.172 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -852974 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0527 0.0732 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 4.06e-01 -0.147 0.177 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 2.64e-02 0.35 0.157 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 6.96e-02 -0.297 0.163 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 4.96e-01 0.115 0.169 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 5.09e-01 -0.107 0.163 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 7.99e-01 0.042 0.165 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -852974 sc-eQTL 3.12e-01 -0.115 0.114 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 1.75e-01 0.211 0.155 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0704 0.178 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 9.24e-01 0.0172 0.18 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 6.60e-01 0.0774 0.176 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 5.47e-01 -0.108 0.18 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 3.39e-01 -0.167 0.174 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -852974 sc-eQTL 7.20e-01 -0.033 0.0917 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0812 0.178 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 2.72e-01 0.196 0.178 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 8.42e-01 0.0358 0.179 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 3.12e-02 0.373 0.172 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 6.53e-01 0.0751 0.167 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 1.30e-01 0.274 0.18 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -852974 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0389 0.0367 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 4.11e-01 0.144 0.175 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 2.24e-01 0.205 0.168 0.071 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 1.44e-02 0.406 0.165 0.071 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 2.71e-01 0.176 0.16 0.071 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 5.39e-01 0.104 0.169 0.071 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 3.12e-01 -0.171 0.169 0.071 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 4.88e-01 -0.121 0.174 0.071 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 9.54e-01 0.00935 0.162 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 4.93e-01 -0.114 0.166 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0836 0.144 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 7.44e-01 0.0526 0.161 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0163 0.168 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0569 0.165 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 8.47e-01 0.0251 0.13 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 1.70e-01 -0.227 0.165 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 2.66e-01 0.16 0.144 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 5.24e-01 0.0932 0.146 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 2.21e-01 -0.203 0.166 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 1.37e-01 -0.267 0.179 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 5.64e-01 0.106 0.184 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00581 0.191 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0444 0.146 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 5.58e-01 0.0994 0.17 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 5.29e-01 -0.112 0.178 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0941 0.17 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 7.76e-01 0.0407 0.143 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0637 0.162 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0893 0.15 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 2.49e-01 -0.177 0.153 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 6.36e-01 0.0752 0.159 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 5.35e-01 -0.105 0.169 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 5.73e-01 -0.115 0.203 0.078 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 4.70e-01 0.154 0.213 0.078 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 4.62e-01 0.168 0.227 0.078 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 1.50e-01 0.285 0.197 0.078 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 9.91e-01 0.00214 0.199 0.078 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 5.92e-02 0.409 0.214 0.078 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 6.85e-01 0.0642 0.158 0.076 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 4.32e-01 -0.126 0.161 0.076 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00498 0.161 0.076 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 5.82e-01 0.0778 0.141 0.076 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 7.59e-01 0.0436 0.142 0.076 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 2.63e-01 -0.184 0.164 0.076 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 6.66e-02 0.305 0.166 0.075 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0304 0.178 0.075 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0864 0.164 0.075 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 9.16e-01 0.0177 0.167 0.075 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 6.31e-01 0.0841 0.175 0.075 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -852974 sc-eQTL 1.80e-01 0.177 0.132 0.075 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 2.50e-01 -0.193 0.167 0.075 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 1.10e-01 -0.279 0.174 0.073 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 4.32e-01 -0.14 0.177 0.073 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 5.84e-01 0.0955 0.174 0.073 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0868 0.151 0.073 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 1.20e-01 0.297 0.19 0.073 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 9.29e-01 0.0138 0.154 0.073 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 2.15e-01 -0.191 0.154 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0593 0.154 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 5.43e-01 -0.099 0.163 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0595 0.114 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 7.25e-01 0.0572 0.162 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 3.02e-02 -0.373 0.171 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 1.67e-01 -0.242 0.174 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 3.35e-02 -0.344 0.161 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 1.71e-01 0.192 0.14 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 3.19e-01 0.158 0.158 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 5.90e-01 0.0978 0.181 0.076 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 2.08e-01 -0.243 0.192 0.076 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0942 0.19 0.076 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0262 0.181 0.076 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0958 0.192 0.076 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 4.85e-01 -0.132 0.189 0.076 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 2.06e-01 -0.221 0.174 0.076 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 2.36e-01 0.193 0.162 0.076 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0773 0.166 0.076 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 5.65e-01 0.0912 0.158 0.076 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 5.46e-01 -0.106 0.174 0.076 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 8.16e-01 -0.035 0.151 0.079 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0834 0.165 0.079 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 5.75e-01 0.0915 0.163 0.079 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0537 0.152 0.079 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 3.82e-01 -0.139 0.159 0.079 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 8.25e-01 0.0446 0.201 0.068 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 4.69e-01 -0.142 0.195 0.068 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 3.09e-01 0.203 0.199 0.068 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 8.75e-01 0.0283 0.179 0.068 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 1.23e-01 0.31 0.2 0.068 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 5.10e-01 0.117 0.178 0.068 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 3.59e-01 0.148 0.161 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 6.21e-01 0.0885 0.179 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 7.63e-01 0.0468 0.155 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 2.31e-01 -0.15 0.125 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 3.62e-01 0.15 0.165 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 9.82e-01 0.00377 0.172 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 5.19e-01 0.11 0.17 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 2.25e-01 -0.212 0.174 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 9.10e-01 0.0184 0.163 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0501 0.125 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 1.72e-01 0.241 0.176 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 6.12e-01 0.09 0.177 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 5.57e-02 -0.303 0.157 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 2.03e-01 -0.196 0.153 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 7.89e-02 -0.271 0.154 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 7.02e-01 0.041 0.107 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 3.23e-01 0.157 0.158 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 1.54e-01 -0.214 0.15 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 8.70e-01 0.028 0.171 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 9.89e-01 0.00242 0.169 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 5.88e-01 0.0781 0.144 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 2.26e-01 -0.203 0.167 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 23744 sc-eQTL 6.11e-01 0.0648 0.127 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 249580 sc-eQTL 1.98e-01 -0.197 0.152 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 928769 sc-eQTL 7.07e-01 0.0515 0.137 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 833023 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0112 0.137 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 sc-eQTL 6.04e-01 -0.084 0.162 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 93783 sc-eQTL 1.18e-01 -0.279 0.178 0.075 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 23744 eQTL 0.0121 -0.0821 0.0326 0.0109 0.0 0.078
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 eQTL 0.0179 0.127 0.0536 0.0 0.0 0.078
ENSG00000185483 ROR1 -156862 pQTL 0.0301 -0.0524 0.0241 0.0 0.0 0.0816

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000142856 ITGB3BP 23434 2.69e-05 2.8e-05 4.31e-06 1.24e-05 3.92e-06 1.07e-05 3.16e-05 3.75e-06 2.34e-05 9.96e-06 3.05e-05 1.29e-05 3.85e-05 1.15e-05 5.6e-06 1.26e-05 1.36e-05 1.96e-05 6.31e-06 4.81e-06 9.78e-06 2.31e-05 2.5e-05 6.12e-06 3.7e-05 5.99e-06 8.52e-06 8.54e-06 2.39e-05 1.99e-05 1.54e-05 1.41e-06 1.61e-06 5.08e-06 9.85e-06 4.48e-06 2.24e-06 2.73e-06 3.34e-06 2.07e-06 1.48e-06 3.51e-05 2.86e-06 3.24e-07 1.93e-06 2.69e-06 3.39e-06 1.3e-06 9.57e-07
ENSG00000230798 \N 292714 1.32e-06 1.33e-06 8.35e-07 6.97e-07 1.38e-07 4.77e-07 1.1e-06 2.64e-07 1.14e-06 3.11e-07 1.41e-06 5.35e-07 2e-06 2.92e-07 4.41e-07 6e-07 9.36e-07 5.55e-07 5.72e-07 4.12e-07 2.97e-07 8.58e-07 8.27e-07 2.92e-07 2.25e-06 2.99e-07 5.82e-07 5.31e-07 9.4e-07 1.23e-06 5.79e-07 7.03e-08 9.36e-08 6.95e-07 5.9e-07 2.42e-07 7.15e-07 1.53e-07 7.41e-08 7.28e-08 1.16e-07 1.49e-06 6.94e-08 1.6e-07 9.79e-08 1.02e-07 1.49e-07 3.84e-08 4.68e-08