Genes within 1Mb (chr1:63604673:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 1.78e-01 0.14 0.104 0.165 B L1
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0547 0.108 0.165 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 3.61e-01 0.0985 0.108 0.165 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0576 0.0748 0.165 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 7.45e-01 0.0387 0.119 0.165 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 9.97e-01 0.0004 0.122 0.165 B L1
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 5.16e-01 0.058 0.0891 0.165 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 2.27e-01 -0.119 0.0981 0.165 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0243 0.0997 0.165 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 8.57e-01 0.0145 0.0805 0.165 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 1.55e-01 -0.162 0.114 0.165 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -865456 sc-eQTL 1.25e-01 -0.104 0.0678 0.165 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 7.12e-01 0.0379 0.103 0.165 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 3.98e-01 0.0828 0.0978 0.165 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 2.18e-01 -0.133 0.108 0.165 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 1.15e-01 0.172 0.109 0.165 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 8.63e-01 0.018 0.104 0.165 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0391 0.116 0.165 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -865456 sc-eQTL 7.74e-04 -0.195 0.0572 0.165 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 2.52e-01 -0.133 0.115 0.165 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 1.67e-01 -0.151 0.108 0.153 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 4.93e-02 -0.22 0.111 0.153 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 7.06e-01 0.0435 0.115 0.153 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 7.73e-02 0.159 0.0895 0.153 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0543 0.126 0.153 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 1.84e-01 0.146 0.109 0.153 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 8.15e-02 -0.185 0.106 0.165 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00323 0.111 0.165 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00616 0.108 0.165 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 8.80e-01 -0.011 0.0727 0.165 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 7.32e-02 -0.205 0.114 0.165 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 1.15e-01 0.141 0.089 0.163 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0959 0.105 0.163 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0682 0.0864 0.163 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 9.60e-01 0.00471 0.0929 0.163 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 3.78e-01 -0.102 0.115 0.163 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 2.85e-01 -0.134 0.125 0.163 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 8.89e-01 0.0144 0.103 0.165 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0264 0.104 0.165 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 8.27e-01 0.0232 0.106 0.165 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0104 0.0918 0.165 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0402 0.0813 0.165 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 3.94e-01 -0.107 0.125 0.165 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 4.26e-01 0.112 0.14 0.166 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 5.80e-01 0.0743 0.134 0.166 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0228 0.125 0.166 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000358 0.131 0.166 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0325 0.128 0.166 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 3.48e-01 -0.114 0.121 0.166 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 9.48e-01 0.00791 0.121 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 1.84e-01 -0.163 0.122 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 2.57e-01 -0.133 0.117 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0726 0.099 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0356 0.118 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0158 0.117 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 1.33e-01 0.182 0.121 0.166 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 2.82e-01 0.133 0.123 0.166 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 2.65e-01 0.129 0.115 0.166 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0978 0.11 0.166 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0432 0.126 0.166 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 8.96e-01 0.0163 0.125 0.166 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 3.71e-01 0.109 0.122 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 5.72e-01 0.0694 0.123 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 3.95e-01 0.1 0.117 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 7.49e-01 0.029 0.0905 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 7.52e-01 0.0379 0.12 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 3.05e-01 0.131 0.128 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0569 0.119 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 7.96e-01 0.0321 0.124 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 3.69e-01 0.107 0.119 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0712 0.115 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 3.39e-01 0.119 0.125 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 1.54e-01 -0.177 0.124 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 3.11e-01 -0.122 0.12 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 3.15e-01 -0.127 0.127 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 6.30e-01 0.0535 0.111 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 1.38e-01 0.17 0.114 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 7.30e-01 0.0424 0.123 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -865456 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0518 0.0445 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 5.73e-01 0.0658 0.117 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0184 0.1 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0617 0.109 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 3.24e-01 -0.105 0.107 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0605 0.0945 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 2.90e-01 -0.122 0.115 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -865456 sc-eQTL 4.98e-02 -0.134 0.0678 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0257 0.115 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 4.88e-01 0.0716 0.103 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0298 0.12 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 7.66e-01 0.0316 0.106 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0398 0.103 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 1.23e-01 -0.188 0.121 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -865456 sc-eQTL 1.19e-01 -0.15 0.0959 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 8.39e-02 0.203 0.117 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0659 0.121 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 9.46e-01 0.00823 0.122 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0732 0.119 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 1.47e-01 0.167 0.115 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0132 0.119 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -865456 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0475 0.0736 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 3.55e-01 0.114 0.123 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0924 0.11 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0774 0.117 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 2.89e-01 0.118 0.111 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 1.66e-01 -0.163 0.117 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 2.98e-02 -0.266 0.121 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -865456 sc-eQTL 1.49e-01 -0.075 0.0518 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 1.25e-01 -0.193 0.125 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 2.73e-01 0.123 0.112 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 2.77e-02 -0.254 0.115 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 3.19e-01 0.119 0.12 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 9.13e-01 0.0126 0.115 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0514 0.116 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -865456 sc-eQTL 2.69e-03 -0.24 0.079 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0275 0.11 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 6.96e-02 0.221 0.121 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 4.91e-01 0.0853 0.124 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 6.60e-01 0.0531 0.121 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 8.01e-01 0.0312 0.123 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 2.86e-01 -0.128 0.12 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -865456 sc-eQTL 8.80e-01 -0.00951 0.063 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 5.43e-01 0.0744 0.122 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 9.66e-01 0.00526 0.124 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0615 0.124 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 1.98e-01 0.155 0.12 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 5.21e-01 0.0743 0.116 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 6.95e-02 0.227 0.124 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -865456 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0133 0.0255 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0658 0.121 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00208 0.118 0.162 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 4.20e-01 0.0941 0.117 0.162 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 6.25e-01 0.0547 0.112 0.162 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00209 0.118 0.162 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 1.40e-01 -0.174 0.118 0.162 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0465 0.122 0.162 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 8.64e-01 0.0203 0.118 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 2.37e-01 -0.143 0.121 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0456 0.105 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 2.62e-01 0.132 0.117 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0429 0.122 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 2.28e-01 0.145 0.12 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 4.06e-01 0.0774 0.093 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 2.93e-01 -0.124 0.118 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0475 0.103 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 9.81e-01 0.00251 0.104 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 2.05e-01 -0.15 0.118 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0841 0.128 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0395 0.127 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 8.80e-01 -0.02 0.132 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 9.92e-01 0.000966 0.101 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 8.47e-01 0.0228 0.118 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 8.35e-01 0.0257 0.123 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0859 0.117 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 6.47e-01 0.0466 0.101 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 2.63e-01 0.128 0.114 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0179 0.106 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0234 0.109 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 3.16e-01 -0.113 0.112 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 9.18e-02 -0.202 0.119 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 9.33e-01 -0.012 0.143 0.185 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 4.96e-01 0.102 0.15 0.185 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 7.55e-01 -0.05 0.16 0.185 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0609 0.14 0.185 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 5.78e-01 0.0777 0.139 0.185 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 1.12e-01 0.243 0.151 0.185 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 1.97e-01 0.144 0.111 0.167 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 2.15e-01 -0.141 0.113 0.167 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 8.22e-01 0.0258 0.114 0.167 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 1.63e-01 0.139 0.0994 0.167 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 8.70e-01 0.0165 0.1 0.167 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 7.12e-01 -0.043 0.116 0.167 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 4.05e-01 0.1 0.12 0.165 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0618 0.129 0.165 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 4.44e-01 0.0905 0.118 0.165 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0712 0.121 0.165 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 2.83e-01 -0.136 0.126 0.165 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -865456 sc-eQTL 4.26e-01 0.0761 0.0954 0.165 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 6.40e-02 0.223 0.12 0.165 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 7.69e-01 -0.036 0.122 0.146 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 9.88e-01 0.00189 0.124 0.146 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 3.89e-01 0.105 0.122 0.146 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 8.22e-03 0.277 0.104 0.146 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 6.83e-02 0.244 0.133 0.146 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 7.13e-01 0.0397 0.108 0.146 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 1.35e-02 -0.274 0.11 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 9.06e-01 0.0132 0.112 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 3.55e-01 0.109 0.117 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 9.01e-01 0.0103 0.0827 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0739 0.117 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 3.57e-01 -0.113 0.123 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0715 0.124 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 2.24e-01 -0.141 0.115 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0374 0.1 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0391 0.113 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0641 0.133 0.155 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 3.30e-01 -0.138 0.141 0.155 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0518 0.139 0.155 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 2.40e-01 -0.156 0.132 0.155 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 2.47e-01 -0.163 0.141 0.155 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00747 0.139 0.155 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 1.81e-03 -0.378 0.119 0.162 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 8.23e-01 0.0255 0.114 0.162 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 2.66e-01 -0.13 0.116 0.162 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 5.67e-01 0.0637 0.111 0.162 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 9.03e-01 0.015 0.122 0.162 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 9.81e-01 0.00265 0.113 0.163 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 7.45e-01 0.0405 0.125 0.163 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 5.72e-01 0.0693 0.122 0.163 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0339 0.114 0.163 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 5.60e-02 -0.228 0.119 0.163 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0731 0.143 0.138 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 1.61e-01 -0.194 0.138 0.138 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 5.79e-01 0.079 0.142 0.138 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 1.27e-01 -0.194 0.126 0.138 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 1.87e-01 -0.189 0.142 0.138 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 8.94e-01 0.0169 0.127 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 8.22e-02 0.199 0.114 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00365 0.127 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0128 0.11 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0927 0.0889 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0721 0.117 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 7.73e-01 0.0352 0.122 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 5.39e-01 0.0733 0.119 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 9.02e-01 0.0152 0.123 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 2.89e-01 0.121 0.114 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0146 0.0874 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 3.66e-01 0.112 0.123 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 9.63e-01 0.00569 0.124 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 7.68e-02 -0.2 0.113 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 7.92e-01 -0.029 0.11 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 8.71e-01 0.018 0.111 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0244 0.0765 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0859 0.113 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 1.89e-02 -0.251 0.106 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 4.71e-01 0.0882 0.122 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0902 0.121 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 1.33e-01 0.155 0.103 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 1.53e-01 -0.171 0.119 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 11262 sc-eQTL 1.98e-01 0.117 0.0905 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 237098 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0628 0.109 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 916287 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0327 0.0978 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 820541 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0235 0.0976 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 sc-eQTL 3.60e-01 -0.106 0.115 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 sc-eQTL 1.31e-01 -0.193 0.127 0.164 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116652 DLEU2L 57591 eQTL 0.00821 0.096 0.0363 0.00176 0.0 0.145
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 eQTL 0.000161 0.155 0.0408 0.00264 0.0 0.145
ENSG00000203965 EFCAB7 81301 eQTL 5.51e-04 0.116 0.0335 0.0 0.0 0.145


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 \N 11262 3.12e-05 3.04e-05 5.66e-06 1.5e-05 5.29e-06 1.36e-05 3.93e-05 3.96e-06 2.85e-05 1.42e-05 3.59e-05 1.58e-05 4.49e-05 1.26e-05 6.5e-06 1.67e-05 1.51e-05 2.26e-05 7.46e-06 6.05e-06 1.34e-05 2.96e-05 2.86e-05 8.13e-06 4.15e-05 7.34e-06 1.3e-05 1.15e-05 2.89e-05 2.32e-05 1.81e-05 1.63e-06 2.41e-06 6.79e-06 1.12e-05 5.45e-06 2.93e-06 3.16e-06 4.46e-06 3.17e-06 1.77e-06 3.54e-05 2.99e-06 3.84e-07 2.13e-06 3.65e-06 3.97e-06 1.45e-06 1.52e-06
ENSG00000142856 ITGB3BP 10952 3.17e-05 3.07e-05 5.7e-06 1.51e-05 5.33e-06 1.37e-05 3.97e-05 4.07e-06 2.88e-05 1.45e-05 3.61e-05 1.61e-05 4.49e-05 1.28e-05 6.59e-06 1.72e-05 1.52e-05 2.29e-05 7.47e-06 6.18e-06 1.35e-05 2.99e-05 2.89e-05 8.24e-06 4.2e-05 7.42e-06 1.31e-05 1.16e-05 2.94e-05 2.35e-05 1.83e-05 1.64e-06 2.37e-06 6.84e-06 1.12e-05 5.47e-06 2.98e-06 3.14e-06 4.48e-06 3.19e-06 1.76e-06 3.56e-05 3.07e-06 3.99e-07 2.19e-06 3.66e-06 3.97e-06 1.48e-06 1.52e-06