logo

Genes within 1Mb (chr1:63591674:GAGTT:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 1.67e-01 0.145 0.104 0.16 B L1
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0479 0.109 0.16 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 7.00e-01 0.0419 0.109 0.16 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0513 0.0754 0.16 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 6.40e-01 0.0562 0.12 0.16 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 7.80e-01 0.0343 0.123 0.16 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 6.88e-01 0.0361 0.0898 0.16 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 1.49e-01 -0.143 0.0987 0.16 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0707 0.1 0.16 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0192 0.0811 0.16 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 1.31e-01 -0.173 0.114 0.16 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -878455 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0934 0.0684 0.16 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 7.36e-01 0.0349 0.103 0.16 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 4.42e-01 0.0757 0.0984 0.16 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 3.14e-01 -0.109 0.108 0.16 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 1.18e-01 0.172 0.109 0.16 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 7.19e-01 0.0376 0.104 0.16 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0481 0.117 0.16 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -878455 sc-eQTL 7.70e-04 -0.196 0.0576 0.16 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 2.97e-01 -0.121 0.116 0.16 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 1.53e-01 -0.156 0.109 0.149 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 8.68e-02 -0.193 0.112 0.149 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 8.65e-01 0.0198 0.116 0.149 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 1.01e-01 0.148 0.0901 0.149 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0333 0.127 0.149 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 9.28e-02 0.185 0.11 0.149 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 6.60e-02 -0.195 0.105 0.16 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0231 0.111 0.16 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0185 0.107 0.16 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0092 0.0725 0.16 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 9.16e-02 -0.193 0.114 0.16 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 1.39e-01 0.133 0.0896 0.159 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 5.14e-01 -0.069 0.106 0.159 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0726 0.0869 0.159 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0153 0.0935 0.159 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 2.83e-01 -0.125 0.116 0.159 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 5.42e-01 -0.077 0.126 0.159 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 9.82e-01 0.00234 0.104 0.16 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0347 0.104 0.16 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 9.11e-01 0.012 0.106 0.16 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0239 0.092 0.16 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0328 0.0816 0.16 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0944 0.126 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 5.42e-01 0.086 0.141 0.161 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 5.83e-01 0.0743 0.135 0.161 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0613 0.126 0.161 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0193 0.132 0.161 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0324 0.129 0.161 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 3.01e-01 -0.126 0.122 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00901 0.121 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 2.58e-01 -0.14 0.123 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 1.70e-01 -0.162 0.117 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0685 0.0996 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0348 0.119 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00344 0.118 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 9.99e-02 0.201 0.121 0.162 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 1.78e-01 0.167 0.124 0.162 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 3.88e-01 0.101 0.116 0.162 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 3.38e-01 -0.106 0.11 0.162 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0277 0.127 0.162 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 9.47e-01 0.0084 0.126 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 2.77e-01 0.133 0.122 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 7.06e-01 0.0466 0.123 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 3.53e-01 0.11 0.118 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 4.83e-01 0.0639 0.0908 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 6.70e-01 0.0515 0.121 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 2.81e-01 0.139 0.128 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0431 0.119 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 7.14e-01 0.0457 0.125 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 5.98e-01 0.0633 0.12 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0895 0.115 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 3.04e-01 0.129 0.125 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 2.43e-01 -0.145 0.124 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 2.59e-01 -0.136 0.12 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 3.61e-01 -0.117 0.127 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 6.63e-01 0.0485 0.111 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 1.25e-01 0.177 0.115 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 7.08e-01 0.0463 0.123 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -878455 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0529 0.0446 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 5.57e-01 0.0688 0.117 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0638 0.101 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0782 0.109 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 2.28e-01 -0.129 0.107 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 2.87e-01 -0.101 0.0947 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 2.33e-01 -0.138 0.116 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -878455 sc-eQTL 7.19e-02 -0.123 0.0682 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0388 0.115 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 4.43e-01 0.0799 0.104 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0844 0.121 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0138 0.107 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0132 0.104 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 8.79e-02 -0.209 0.122 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -878455 sc-eQTL 1.00e-01 -0.16 0.0968 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 1.38e-01 0.176 0.118 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0731 0.122 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00221 0.123 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0866 0.119 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 1.62e-01 0.162 0.115 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 9.77e-01 0.00345 0.12 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -878455 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0492 0.074 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 3.49e-01 0.116 0.124 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 3.52e-01 -0.102 0.11 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0492 0.117 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 3.36e-01 0.107 0.111 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 2.34e-01 -0.141 0.118 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 3.31e-02 -0.261 0.122 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -878455 sc-eQTL 1.64e-01 -0.0724 0.0519 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 1.50e-01 -0.181 0.125 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 1.95e-01 0.145 0.112 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 2.42e-02 -0.261 0.115 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 4.23e-01 0.0964 0.12 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00307 0.115 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0472 0.117 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -878455 sc-eQTL 2.45e-03 -0.243 0.0793 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0185 0.11 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 5.96e-02 0.23 0.121 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 6.51e-01 0.0561 0.124 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 5.48e-01 0.0727 0.121 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 6.48e-01 0.0566 0.124 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 2.56e-01 -0.137 0.12 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -878455 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00484 0.0632 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 6.33e-01 0.0587 0.123 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 9.30e-01 -0.011 0.124 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0286 0.125 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 1.13e-01 0.191 0.12 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 5.40e-01 0.0712 0.116 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 1.00e-01 0.207 0.125 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -878455 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0145 0.0256 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0516 0.122 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 8.59e-01 -0.021 0.118 0.158 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 5.69e-01 0.0666 0.117 0.158 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 7.46e-01 0.0363 0.112 0.158 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0422 0.118 0.158 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 1.73e-01 -0.161 0.118 0.158 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 9.09e-01 -0.014 0.122 0.158 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 9.95e-01 0.000745 0.119 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 2.24e-01 -0.148 0.121 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0208 0.106 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 2.96e-01 0.123 0.118 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0193 0.123 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 1.28e-01 0.184 0.121 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 3.46e-01 0.0883 0.0935 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 3.57e-01 -0.109 0.119 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 6.36e-01 -0.049 0.103 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0279 0.105 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 1.40e-01 -0.176 0.119 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0411 0.129 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0549 0.128 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 9.46e-01 0.00897 0.133 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 8.86e-01 0.0145 0.102 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 6.76e-01 0.0494 0.118 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 7.82e-01 0.0344 0.124 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0466 0.118 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 8.66e-01 0.0172 0.102 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 1.91e-01 0.15 0.115 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0417 0.107 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0333 0.109 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 2.45e-01 -0.131 0.113 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 1.48e-01 -0.174 0.12 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0273 0.143 0.181 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 4.81e-01 0.106 0.15 0.181 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0696 0.161 0.181 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0592 0.14 0.181 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 6.69e-01 0.0599 0.14 0.181 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 7.67e-02 0.271 0.151 0.181 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 2.22e-01 0.137 0.112 0.163 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 1.86e-01 -0.151 0.113 0.163 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 7.61e-01 0.0348 0.114 0.163 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 1.38e-01 0.148 0.0995 0.163 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 8.06e-01 0.0246 0.1 0.163 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 6.31e-01 -0.056 0.117 0.163 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 3.47e-01 0.114 0.121 0.16 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0469 0.129 0.16 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 5.68e-01 0.0679 0.119 0.16 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 3.45e-01 -0.115 0.121 0.16 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 3.53e-01 -0.118 0.127 0.16 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -878455 sc-eQTL 5.51e-01 0.0573 0.0959 0.16 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 6.93e-02 0.22 0.121 0.16 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0341 0.124 0.141 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00883 0.125 0.141 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 4.58e-01 0.0914 0.123 0.141 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 1.20e-02 0.267 0.105 0.141 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 5.90e-02 0.255 0.134 0.141 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 6.19e-01 0.0541 0.109 0.141 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 2.29e-02 -0.252 0.11 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0175 0.112 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 4.63e-01 0.0865 0.118 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 8.28e-01 0.018 0.0828 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0635 0.117 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 2.70e-01 -0.136 0.123 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0754 0.124 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 1.89e-01 -0.152 0.115 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0434 0.1 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0192 0.113 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 5.44e-01 -0.081 0.133 0.152 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 3.95e-01 -0.121 0.142 0.152 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0684 0.139 0.152 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 1.57e-01 -0.188 0.132 0.152 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 3.00e-01 -0.147 0.141 0.152 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 9.64e-01 0.00627 0.139 0.152 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 3.79e-03 -0.352 0.12 0.158 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 6.49e-01 0.0521 0.114 0.158 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 2.78e-01 -0.127 0.116 0.158 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 4.51e-01 0.0841 0.111 0.158 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00461 0.123 0.158 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0419 0.114 0.158 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 7.41e-01 0.0413 0.125 0.158 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 3.14e-01 0.124 0.123 0.158 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 8.62e-01 -0.02 0.115 0.158 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 4.87e-02 -0.236 0.119 0.158 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 3.79e-01 -0.126 0.143 0.136 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 2.55e-01 -0.159 0.139 0.136 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 5.88e-01 0.0771 0.142 0.136 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 1.52e-01 -0.183 0.127 0.136 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 1.51e-01 -0.206 0.142 0.136 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 7.55e-01 0.0397 0.127 0.136 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 1.08e-01 0.185 0.115 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 8.44e-01 0.0252 0.128 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0546 0.111 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 3.00e-01 -0.093 0.0894 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0599 0.118 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 7.71e-01 0.0358 0.123 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 3.99e-01 0.101 0.119 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 9.48e-01 0.008 0.123 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 4.04e-01 0.096 0.115 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 9.92e-01 0.000914 0.0877 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 2.82e-01 0.133 0.124 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 7.94e-01 0.0325 0.125 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 7.18e-02 -0.204 0.113 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0588 0.11 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000816 0.111 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0258 0.0765 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 5.31e-01 -0.071 0.113 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 1.14e-02 -0.271 0.106 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 3.88e-01 0.106 0.122 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0695 0.121 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 9.43e-02 0.173 0.103 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 1.03e-01 -0.195 0.119 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -1737 sc-eQTL 2.31e-01 0.109 0.0912 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 224099 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0304 0.11 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 903288 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0459 0.0984 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 807542 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0415 0.0982 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 sc-eQTL 2.68e-01 -0.129 0.116 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 sc-eQTL 2.35e-01 -0.153 0.128 0.159 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116652 DLEU2L 44592 eQTL 0.0123 0.0909 0.0362 0.00144 0.0 0.143
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 eQTL 0.000223 0.151 0.0408 0.00175 0.0 0.143
ENSG00000203965 EFCAB7 68302 eQTL 7.76e-04 0.113 0.0335 0.0 0.0 0.143

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 \N -1737 0.000191 0.000172 2.23e-05 4.57e-05 1.72e-05 5.36e-05 0.00014 1.51e-05 0.000103 4.73e-05 0.000138 5.95e-05 0.000177 4.84e-05 2.12e-05 8.31e-05 5.72e-05 7.78e-05 2.54e-05 1.74e-05 5.01e-05 0.000139 0.000115 3.15e-05 0.000167 3.27e-05 5.45e-05 4.02e-05 0.000114 5.07e-05 7.42e-05 3.79e-06 5.75e-06 1.47e-05 2.78e-05 1.28e-05 6.03e-06 5.95e-06 9.95e-06 5.87e-06 3.45e-06 0.000171 1.55e-05 4.49e-07 7.6e-06 1.11e-05 1.45e-05 3.82e-06 3.26e-06
ENSG00000142856 ITGB3BP -2047 0.000189 0.000167 2.13e-05 4.32e-05 1.57e-05 5.16e-05 0.000134 1.43e-05 9.85e-05 4.57e-05 0.000131 5.65e-05 0.000172 4.7e-05 2.1e-05 7.89e-05 5.64e-05 7.57e-05 2.43e-05 1.64e-05 4.86e-05 0.000131 0.000111 3.01e-05 0.000162 3.1e-05 5.12e-05 3.92e-05 0.000112 4.92e-05 6.99e-05 3.62e-06 5.71e-06 1.41e-05 2.66e-05 1.19e-05 6.05e-06 5.8e-06 9.93e-06 5.62e-06 3.21e-06 0.000162 1.5e-05 4.31e-07 7.13e-06 1.08e-05 1.4e-05 3.86e-06 3.26e-06