logo

Genes within 1Mb (chr1:63578108:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 1.73e-01 0.142 0.104 0.162 B L1
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0419 0.108 0.162 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 5.59e-01 0.0633 0.108 0.162 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0589 0.0752 0.162 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 7.73e-01 0.0346 0.12 0.162 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 8.68e-01 0.0205 0.123 0.162 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 6.23e-01 0.0442 0.0897 0.162 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 1.48e-01 -0.143 0.0986 0.162 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0737 0.1 0.162 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0135 0.081 0.162 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 1.04e-01 -0.187 0.114 0.162 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -892021 sc-eQTL 1.75e-01 -0.0929 0.0683 0.162 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 7.87e-01 0.0279 0.103 0.162 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 4.60e-01 0.0725 0.0981 0.162 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0987 0.108 0.162 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 1.10e-01 0.175 0.109 0.162 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 7.77e-01 0.0296 0.104 0.162 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0549 0.116 0.162 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -892021 sc-eQTL 9.28e-04 -0.193 0.0574 0.162 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 2.96e-01 -0.121 0.116 0.162 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 1.76e-01 -0.148 0.109 0.151 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 1.01e-01 -0.184 0.112 0.151 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 8.53e-01 0.0214 0.115 0.151 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 9.86e-02 0.149 0.0897 0.151 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0277 0.126 0.151 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 1.36e-01 0.164 0.109 0.151 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 6.85e-02 -0.193 0.105 0.162 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00445 0.111 0.162 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0111 0.107 0.162 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00714 0.0724 0.162 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 6.41e-02 -0.211 0.114 0.162 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 1.00e-01 0.147 0.0893 0.161 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0693 0.105 0.161 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 5.11e-01 -0.057 0.0867 0.161 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0153 0.0932 0.161 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 2.59e-01 -0.131 0.115 0.161 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 4.41e-01 -0.097 0.126 0.161 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 9.50e-01 0.00644 0.103 0.162 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0427 0.104 0.162 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 8.39e-01 0.0216 0.106 0.162 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00847 0.0919 0.162 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0381 0.0815 0.162 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 3.76e-01 -0.111 0.126 0.162 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 4.80e-01 0.0993 0.14 0.163 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 6.26e-01 0.0657 0.135 0.163 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0425 0.125 0.163 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00983 0.132 0.163 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 7.63e-01 -0.039 0.129 0.163 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 3.55e-01 -0.113 0.122 0.163 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00482 0.121 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 2.86e-01 -0.131 0.123 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 2.03e-01 -0.15 0.117 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 4.51e-01 -0.075 0.0993 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0422 0.118 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0122 0.117 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 1.05e-01 0.197 0.121 0.164 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 2.05e-01 0.157 0.123 0.164 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 4.05e-01 0.0967 0.116 0.164 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 3.17e-01 -0.11 0.11 0.164 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0365 0.126 0.164 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 9.58e-01 0.00655 0.125 0.164 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 2.82e-01 0.132 0.122 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 6.19e-01 0.0613 0.123 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 4.57e-01 0.0878 0.118 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 7.72e-01 0.0263 0.0908 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 7.57e-01 0.0373 0.121 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 2.76e-01 0.14 0.128 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0511 0.119 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 6.97e-01 0.0485 0.124 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 4.84e-01 0.0837 0.119 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0729 0.115 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 3.61e-01 0.114 0.125 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 2.05e-01 -0.157 0.124 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 3.11e-01 -0.122 0.12 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 3.15e-01 -0.127 0.127 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 6.30e-01 0.0535 0.111 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 1.38e-01 0.17 0.114 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 7.30e-01 0.0424 0.123 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -892021 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0518 0.0445 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 5.73e-01 0.0658 0.117 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0408 0.101 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0798 0.109 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 1.57e-01 -0.152 0.107 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 3.76e-01 -0.084 0.0947 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 2.10e-01 -0.145 0.116 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -892021 sc-eQTL 7.14e-02 -0.123 0.0682 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0538 0.115 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 5.57e-01 0.061 0.104 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0725 0.12 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 9.69e-01 0.00417 0.107 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0221 0.104 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 7.28e-02 -0.219 0.122 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -892021 sc-eQTL 1.18e-01 -0.152 0.0966 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 1.02e-01 0.194 0.118 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0748 0.122 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 9.98e-01 0.000318 0.122 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0884 0.119 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 1.75e-01 0.157 0.115 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0016 0.12 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -892021 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0516 0.0738 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 3.52e-01 0.115 0.124 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 3.41e-01 -0.105 0.11 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0531 0.117 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 2.92e-01 0.117 0.111 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 1.98e-01 -0.152 0.118 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 2.40e-02 -0.275 0.121 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -892021 sc-eQTL 1.52e-01 -0.0745 0.0517 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 1.37e-01 -0.186 0.125 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 2.39e-01 0.132 0.112 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 2.92e-02 -0.252 0.115 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 3.56e-01 0.111 0.12 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 9.69e-01 0.00455 0.115 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0507 0.117 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -892021 sc-eQTL 2.74e-03 -0.24 0.0791 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0217 0.11 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 6.96e-02 0.221 0.121 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 4.91e-01 0.0853 0.124 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 6.60e-01 0.0531 0.121 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 8.01e-01 0.0312 0.123 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 2.86e-01 -0.128 0.12 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -892021 sc-eQTL 8.80e-01 -0.00951 0.063 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 5.43e-01 0.0744 0.122 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 9.72e-01 0.00429 0.124 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 7.54e-01 -0.039 0.124 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 1.64e-01 0.167 0.12 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 5.23e-01 0.0741 0.116 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 8.18e-02 0.218 0.124 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -892021 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0149 0.0255 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0434 0.122 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0282 0.118 0.16 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 5.51e-01 0.0697 0.117 0.16 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 6.91e-01 0.0445 0.112 0.16 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0276 0.118 0.16 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 1.92e-01 -0.154 0.118 0.16 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0219 0.122 0.16 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 9.51e-01 0.00728 0.119 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 2.64e-01 -0.136 0.121 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0266 0.105 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 3.19e-01 0.117 0.117 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0566 0.122 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 1.70e-01 0.166 0.12 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 3.02e-01 0.0964 0.0932 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 3.77e-01 -0.105 0.118 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0378 0.103 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0177 0.105 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 1.79e-01 -0.16 0.119 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0517 0.129 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0503 0.128 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 8.71e-01 0.0216 0.132 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 9.79e-01 0.00265 0.101 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 7.23e-01 0.0417 0.118 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 8.10e-01 0.0298 0.124 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0662 0.118 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 7.70e-01 0.0297 0.102 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 2.23e-01 0.14 0.114 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0187 0.106 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0391 0.109 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 2.16e-01 -0.139 0.112 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 1.40e-01 -0.177 0.119 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0273 0.143 0.181 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 4.81e-01 0.106 0.15 0.181 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0696 0.161 0.181 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0592 0.14 0.181 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 6.69e-01 0.0599 0.14 0.181 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 7.67e-02 0.271 0.151 0.181 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 2.00e-01 0.143 0.111 0.165 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 2.07e-01 -0.143 0.113 0.165 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 8.60e-01 0.0201 0.114 0.165 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 1.75e-01 0.135 0.0992 0.165 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 8.66e-01 0.0169 0.1 0.165 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0525 0.116 0.165 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 4.08e-01 0.1 0.121 0.162 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0439 0.129 0.162 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 5.18e-01 0.0768 0.119 0.162 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0972 0.121 0.162 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 3.12e-01 -0.128 0.127 0.162 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -892021 sc-eQTL 4.46e-01 0.0732 0.0957 0.162 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 6.21e-02 0.226 0.12 0.162 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0399 0.123 0.144 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 9.36e-01 0.0101 0.125 0.144 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 4.55e-01 0.0915 0.122 0.144 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 1.00e-02 0.271 0.104 0.144 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 5.86e-02 0.254 0.133 0.144 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 7.10e-01 0.0403 0.108 0.144 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 1.51e-02 -0.269 0.11 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 9.81e-01 0.00267 0.111 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 4.01e-01 0.0986 0.117 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 7.71e-01 0.0241 0.0826 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0759 0.117 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 3.21e-01 -0.122 0.122 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 5.41e-01 -0.076 0.124 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 2.04e-01 -0.146 0.115 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0438 0.0997 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0362 0.113 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0641 0.133 0.155 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 3.30e-01 -0.138 0.141 0.155 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0518 0.139 0.155 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 2.40e-01 -0.156 0.132 0.155 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 2.47e-01 -0.163 0.141 0.155 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00747 0.139 0.155 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 2.25e-03 -0.37 0.12 0.16 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 6.70e-01 0.0486 0.114 0.16 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 2.42e-01 -0.136 0.116 0.16 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 5.38e-01 0.0684 0.111 0.16 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0132 0.122 0.16 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0109 0.113 0.161 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 5.82e-01 0.0686 0.124 0.161 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 3.83e-01 0.107 0.122 0.161 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0327 0.114 0.161 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 4.53e-02 -0.239 0.118 0.161 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0731 0.143 0.138 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 1.61e-01 -0.194 0.138 0.138 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 5.79e-01 0.079 0.142 0.138 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 1.27e-01 -0.194 0.126 0.138 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 1.87e-01 -0.189 0.142 0.138 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 8.94e-01 0.0169 0.127 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 1.02e-01 0.188 0.115 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 8.48e-01 0.0245 0.128 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0416 0.111 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0983 0.0893 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0746 0.118 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 8.02e-01 0.0308 0.123 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 4.26e-01 0.0951 0.119 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 8.63e-01 0.0212 0.123 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 3.93e-01 0.0982 0.115 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0132 0.0877 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 3.60e-01 0.114 0.124 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 8.41e-01 0.025 0.125 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 6.94e-02 -0.205 0.112 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0411 0.11 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 9.20e-01 0.0111 0.11 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0208 0.0763 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0886 0.113 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 1.95e-02 -0.25 0.106 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 3.10e-01 0.124 0.122 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 4.82e-01 -0.085 0.121 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 1.36e-01 0.153 0.102 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 8.75e-02 -0.204 0.119 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -15303 sc-eQTL 1.78e-01 0.123 0.0909 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 210533 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0331 0.11 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 889722 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0266 0.0981 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 793976 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0407 0.098 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 sc-eQTL 2.86e-01 -0.124 0.116 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 sc-eQTL 1.98e-01 -0.165 0.128 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116652 DLEU2L 31026 eQTL 0.012 0.0913 0.0363 0.00146 0.0 0.143
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 eQTL 0.000212 0.152 0.0408 0.0018 0.0 0.143
ENSG00000203965 EFCAB7 54736 eQTL 7.75e-04 0.113 0.0335 0.0 0.0 0.143

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 \N -15303 4.1e-05 2.95e-05 6e-06 1.45e-05 5.23e-06 1.46e-05 4.1e-05 3.9e-06 2.72e-05 1.39e-05 3.39e-05 1.46e-05 4.49e-05 1.28e-05 6.69e-06 1.7e-05 1.48e-05 2.35e-05 7.41e-06 6.05e-06 1.4e-05 3.13e-05 2.83e-05 8.4e-06 3.77e-05 7.28e-06 1.25e-05 1.13e-05 3.01e-05 2.37e-05 1.73e-05 1.58e-06 2.59e-06 6.84e-06 1.01e-05 4.81e-06 2.78e-06 3.12e-06 4.29e-06 3.24e-06 1.7e-06 3.51e-05 3.68e-06 2.71e-07 2.3e-06 3.29e-06 4.13e-06 1.49e-06 1.46e-06
ENSG00000142856 ITGB3BP -15613 4.04e-05 2.91e-05 6e-06 1.44e-05 5.23e-06 1.46e-05 4.07e-05 3.9e-06 2.7e-05 1.38e-05 3.38e-05 1.46e-05 4.49e-05 1.27e-05 6.69e-06 1.7e-05 1.47e-05 2.35e-05 7.41e-06 6.02e-06 1.4e-05 3.13e-05 2.83e-05 8.24e-06 3.73e-05 7.28e-06 1.25e-05 1.13e-05 3.01e-05 2.37e-05 1.73e-05 1.58e-06 2.56e-06 6.84e-06 1.01e-05 4.81e-06 2.78e-06 3.11e-06 4.29e-06 3.24e-06 1.7e-06 3.49e-05 3.68e-06 2.64e-07 2.3e-06 3.29e-06 4.09e-06 1.47e-06 1.46e-06