logo

Genes within 1Mb (chr1:63554971:CT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 1.75e-02 0.233 0.0975 0.167 B L1
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0863 0.102 0.167 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0126 0.102 0.167 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 6.00e-01 0.0374 0.0711 0.167 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 1.83e-24 1.03 0.0884 0.167 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 7.35e-07 0.559 0.109 0.167 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 3.96e-01 0.0725 0.0853 0.167 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 1.40e-01 -0.139 0.0938 0.167 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 8.61e-01 0.0168 0.0955 0.167 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 7.26e-01 0.0271 0.0771 0.167 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 1.16e-31 1.1 0.079 0.167 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -915158 sc-eQTL 8.90e-01 -0.00902 0.0653 0.167 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 2.81e-04 0.352 0.0952 0.167 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 1.52e-01 0.133 0.0924 0.167 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 5.55e-01 0.0604 0.102 0.167 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0945 0.103 0.167 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0802 0.0983 0.167 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 4.00e-22 0.958 0.0882 0.167 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -915158 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0329 0.0557 0.167 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 1.88e-05 0.46 0.105 0.167 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 5.15e-01 0.0685 0.105 0.171 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 4.12e-01 -0.089 0.108 0.171 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0242 0.111 0.171 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 9.20e-01 0.00877 0.0871 0.171 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 2.21e-04 0.442 0.118 0.171 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 9.29e-03 0.274 0.104 0.171 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 4.11e-01 0.0831 0.101 0.167 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 3.01e-03 -0.31 0.103 0.167 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 1.64e-01 0.142 0.102 0.167 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0427 0.0689 0.167 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 1.08e-12 0.733 0.0966 0.167 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 1.82e-01 -0.114 0.0853 0.167 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0955 0.1 0.167 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 3.92e-01 0.0709 0.0826 0.167 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 1.56e-01 0.126 0.0884 0.167 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 1.34e-10 0.677 0.1 0.167 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 5.73e-01 0.0676 0.12 0.167 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 5.80e-01 0.0544 0.0982 0.167 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0236 0.0987 0.167 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 9.87e-01 0.00165 0.101 0.167 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 3.25e-02 -0.186 0.0863 0.167 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 1.40e-01 0.114 0.077 0.167 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 1.82e-01 0.159 0.119 0.167 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 8.29e-01 0.0284 0.131 0.153 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 9.49e-01 0.00809 0.126 0.153 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0625 0.117 0.153 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0567 0.123 0.153 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 3.47e-03 0.349 0.118 0.153 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 5.37e-01 0.0705 0.114 0.153 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 5.29e-01 0.0739 0.117 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 5.62e-01 0.0692 0.119 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 9.89e-01 0.00153 0.114 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0317 0.0964 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 3.63e-06 0.52 0.109 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 7.36e-04 0.38 0.111 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 2.53e-01 0.132 0.115 0.168 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 4.18e-01 -0.095 0.117 0.168 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 9.43e-02 0.184 0.109 0.168 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 9.24e-01 -0.01 0.105 0.168 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 5.15e-05 0.475 0.115 0.168 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 2.52e-02 0.265 0.117 0.168 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 1.21e-01 0.182 0.117 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0338 0.118 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 1.98e-01 -0.145 0.112 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 6.23e-01 0.0427 0.0869 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 7.47e-17 0.889 0.0978 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 2.07e-05 0.513 0.118 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 9.12e-03 0.301 0.114 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0673 0.121 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0498 0.116 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0481 0.112 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 2.11e-12 0.807 0.108 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 9.08e-01 -0.014 0.121 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 7.63e-01 0.0357 0.118 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 2.61e-01 0.14 0.125 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 2.87e-01 -0.116 0.109 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0869 0.113 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 1.29e-01 0.183 0.12 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -915158 sc-eQTL 8.23e-01 -0.00986 0.0439 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0183 0.115 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 4.86e-01 0.0666 0.0954 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 4.91e-02 -0.204 0.103 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00554 0.102 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 5.79e-01 0.05 0.0901 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 1.87e-22 0.965 0.0879 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -915158 sc-eQTL 9.47e-01 0.00433 0.0653 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 1.65e-02 0.261 0.108 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 2.29e-01 0.119 0.0985 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 4.92e-01 0.0789 0.115 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 4.38e-01 0.079 0.102 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 4.59e-02 0.197 0.0981 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 1.53e-17 0.916 0.0982 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -915158 sc-eQTL 2.42e-01 -0.108 0.0922 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 3.55e-04 0.398 0.11 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0106 0.116 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 2.25e-01 -0.141 0.116 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0216 0.113 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 7.53e-02 -0.196 0.109 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 2.08e-05 0.475 0.109 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -915158 sc-eQTL 2.94e-01 0.0737 0.0701 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 6.92e-01 0.0468 0.118 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 5.62e-01 0.062 0.107 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0798 0.113 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0597 0.108 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 8.90e-01 0.0159 0.115 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 5.75e-07 0.58 0.112 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -915158 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0567 0.0504 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 1.81e-01 0.163 0.122 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 5.40e-01 0.0658 0.107 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 2.74e-01 0.122 0.111 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 3.42e-01 -0.109 0.115 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 8.34e-01 0.0231 0.11 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 4.64e-16 0.842 0.0955 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -915158 sc-eQTL 6.06e-01 -0.04 0.0774 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 5.53e-04 0.359 0.102 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 5.30e-01 -0.073 0.116 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 2.35e-01 0.14 0.117 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 7.98e-01 0.0294 0.115 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 6.04e-01 0.061 0.117 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 3.28e-06 0.517 0.108 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -915158 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00463 0.0599 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 2.36e-01 0.138 0.116 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 1.22e-01 0.182 0.117 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 8.41e-01 0.0237 0.118 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0753 0.114 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 1.92e-02 -0.256 0.109 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 6.55e-03 0.322 0.117 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -915158 sc-eQTL 9.41e-01 0.00179 0.0243 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 2.56e-01 0.131 0.115 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 7.52e-01 0.036 0.114 0.169 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 7.50e-01 0.0359 0.112 0.169 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0651 0.108 0.169 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 8.62e-02 -0.194 0.113 0.169 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 1.38e-05 0.484 0.109 0.169 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 3.95e-01 0.0996 0.117 0.169 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0334 0.114 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0952 0.117 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00559 0.101 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 7.04e-01 0.0431 0.113 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 2.70e-03 0.35 0.115 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 5.87e-01 0.0631 0.116 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 1.04e-01 -0.144 0.0884 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 9.52e-01 0.00684 0.113 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 1.66e-01 0.136 0.0978 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 1.16e-02 0.25 0.0983 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 4.64e-05 0.454 0.109 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0265 0.123 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 3.77e-02 0.253 0.121 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 2.62e-01 -0.142 0.126 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0531 0.0969 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 4.15e-01 -0.092 0.113 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 9.01e-03 0.307 0.116 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0491 0.113 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 1.37e-01 -0.146 0.0979 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 3.61e-01 -0.102 0.111 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00691 0.103 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0294 0.105 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 6.22e-07 0.529 0.103 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 8.61e-01 0.0204 0.116 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 4.68e-02 0.301 0.15 0.156 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 1.30e-01 -0.242 0.159 0.156 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0118 0.171 0.156 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0229 0.149 0.156 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 6.92e-03 0.397 0.144 0.156 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 1.15e-01 0.257 0.162 0.156 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 5.75e-01 0.0594 0.106 0.165 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0075 0.108 0.165 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 2.54e-02 0.241 0.107 0.165 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 2.82e-01 0.102 0.0944 0.165 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 4.19e-06 -0.427 0.0903 0.165 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 3.40e-01 -0.105 0.11 0.165 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 4.56e-01 0.0834 0.112 0.167 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 4.82e-01 -0.084 0.119 0.167 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0375 0.11 0.167 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 2.06e-01 -0.142 0.112 0.167 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 4.38e-03 0.331 0.115 0.167 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -915158 sc-eQTL 6.85e-03 0.238 0.0871 0.167 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 7.45e-01 0.0365 0.112 0.167 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 3.31e-01 0.109 0.112 0.171 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0628 0.114 0.171 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0709 0.112 0.171 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0222 0.0972 0.171 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 3.80e-02 0.254 0.122 0.171 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 3.14e-01 0.0996 0.0987 0.171 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 8.50e-01 0.0199 0.105 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 2.31e-01 -0.126 0.105 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 4.40e-01 0.0857 0.111 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 9.99e-01 8.38e-05 0.078 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 5.56e-09 0.619 0.102 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 3.67e-01 0.106 0.117 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 5.05e-02 -0.231 0.118 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 4.66e-01 0.0803 0.11 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 2.43e-01 -0.111 0.095 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 3.81e-04 0.377 0.104 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 5.55e-01 0.0762 0.129 0.164 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 2.54e-01 0.157 0.137 0.164 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0736 0.135 0.164 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 5.96e-01 0.0683 0.129 0.164 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 1.42e-01 0.201 0.136 0.164 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 6.03e-01 0.0701 0.135 0.164 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 4.90e-01 0.0816 0.118 0.167 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 2.12e-01 -0.137 0.11 0.167 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 5.91e-01 0.0604 0.112 0.167 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 3.15e-01 -0.108 0.107 0.167 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 4.82e-05 0.471 0.113 0.167 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 3.55e-01 0.0981 0.106 0.165 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 2.07e-01 -0.147 0.116 0.165 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 2.24e-01 0.139 0.114 0.165 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 6.87e-01 0.0432 0.107 0.165 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 2.26e-02 0.254 0.111 0.165 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 4.79e-01 0.087 0.123 0.178 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 6.40e-01 -0.056 0.12 0.178 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0218 0.122 0.178 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00232 0.11 0.178 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 1.70e-02 0.292 0.121 0.178 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 3.35e-02 0.23 0.107 0.178 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 2.21e-01 0.135 0.11 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0277 0.122 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 7.87e-01 0.0285 0.106 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00318 0.0854 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 5.58e-11 0.701 0.101 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 2.02e-04 0.428 0.113 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 5.80e-03 0.313 0.112 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0894 0.118 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0891 0.11 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 6.69e-01 0.0359 0.0839 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 6.64e-22 1.03 0.0952 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 3.70e-04 0.419 0.116 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 6.86e-01 0.0436 0.108 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 3.81e-02 -0.216 0.103 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 2.17e-01 0.13 0.105 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0464 0.0726 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 5.03e-10 0.64 0.0981 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 1.94e-01 0.133 0.102 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 1.26e-02 -0.289 0.115 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 3.78e-01 0.102 0.115 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0555 0.0983 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 1.14e-04 0.434 0.11 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -38440 sc-eQTL 2.38e-01 -0.103 0.0867 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 187396 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0655 0.104 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 866585 sc-eQTL 5.32e-01 0.0586 0.0935 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 770839 sc-eQTL 1.91e-01 0.122 0.0931 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 sc-eQTL 3.18e-09 0.63 0.102 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 31599 sc-eQTL 7.60e-01 0.0374 0.122 0.166 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000088035 ALG6 187396 eQTL 6.73e-13 -0.12 0.0165 0.0226 0.0528 0.188
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 eQTL 1.52e-28 0.403 0.0351 0.0 0.0 0.188
ENSG00000230798 FOXD3-AS1 230530 eQTL 0.00758 -0.0889 0.0332 0.00109 0.001 0.188

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000088035 ALG6 187396 3.68e-06 2.4e-06 3.51e-07 1.25e-06 2.71e-07 7.11e-07 1.32e-06 1.59e-07 1.43e-06 6.05e-07 1.85e-06 1.27e-06 2.73e-06 8.3e-07 4.19e-07 9.37e-07 7.91e-07 7e-07 7.98e-07 3.99e-07 6.39e-07 1.91e-06 1.64e-06 4.59e-07 1.66e-06 4.33e-07 5.76e-07 5.29e-07 1.43e-06 8.59e-07 5.3e-07 8.25e-08 2.13e-07 1.18e-06 6.01e-07 3.71e-07 7.29e-07 3.65e-07 4.82e-07 1.17e-07 7.16e-08 2.02e-06 4.01e-07 1.65e-07 9.95e-08 2.97e-07 2.22e-07 1.22e-08 8.21e-08
ENSG00000142856 ITGB3BP -38750 0.000106 5.13e-05 6.57e-06 1.17e-05 3.33e-06 1.6e-05 3.03e-05 2.41e-06 2.72e-05 8.58e-06 2.88e-05 1.08e-05 4.95e-05 1.15e-05 5.81e-06 1.77e-05 1.2e-05 1.4e-05 5.87e-06 3.39e-06 8.57e-06 2.92e-05 2.59e-05 5.19e-06 2.57e-05 5.33e-06 8e-06 7.33e-06 2.16e-05 9.18e-06 1.05e-05 1.07e-06 2.24e-06 4.13e-06 6.13e-06 2.82e-06 1.78e-06 2.14e-06 2.7e-06 1.92e-06 1e-06 6.58e-05 4.86e-06 4.33e-07 1.91e-06 3.27e-06 3.25e-06 7.33e-07 1.36e-06