logo

Genes within 1Mb (chr1:63534220:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 8.66e-08 -0.478 0.0861 0.239 B L1
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 5.62e-01 0.0555 0.0954 0.239 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 6.42e-01 0.0444 0.0954 0.239 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 2.34e-01 0.079 0.0662 0.239 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 7.13e-04 -0.353 0.103 0.239 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 9.55e-01 0.00615 0.108 0.239 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 9.92e-03 -0.205 0.0786 0.239 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 6.61e-02 0.162 0.0875 0.239 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 6.24e-01 0.0438 0.0892 0.239 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0159 0.0721 0.239 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 4.86e-02 -0.201 0.101 0.239 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -935909 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0323 0.061 0.239 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 9.59e-01 0.0047 0.0918 0.239 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 8.70e-02 -0.149 0.0869 0.239 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 8.69e-01 0.016 0.0964 0.239 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0227 0.0977 0.239 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 5.91e-01 0.05 0.0927 0.239 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 1.75e-01 -0.141 0.103 0.239 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -935909 sc-eQTL 2.28e-01 0.0633 0.0523 0.239 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 1.28e-01 0.157 0.103 0.239 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0566 0.0962 0.245 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 3.68e-01 0.0895 0.0992 0.245 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 8.22e-01 -0.023 0.102 0.245 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0776 0.0795 0.245 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 3.81e-03 -0.319 0.109 0.245 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 5.21e-02 -0.188 0.096 0.245 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0133 0.0946 0.239 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 3.54e-02 0.207 0.0977 0.239 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 3.95e-01 0.0812 0.0954 0.239 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00761 0.0645 0.239 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0938 0.102 0.239 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 1.86e-01 -0.108 0.0811 0.24 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0306 0.0954 0.24 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0961 0.0783 0.24 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00513 0.0844 0.24 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 6.27e-01 -0.051 0.105 0.24 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 1.49e-01 0.164 0.113 0.24 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 6.38e-01 0.0432 0.0916 0.239 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 2.39e-01 0.108 0.0918 0.239 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 4.70e-01 -0.068 0.0939 0.239 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 5.48e-01 -0.049 0.0813 0.239 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 2.74e-01 0.0789 0.072 0.239 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 7.30e-01 0.0385 0.111 0.239 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 5.57e-02 -0.231 0.12 0.253 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 2.69e-02 -0.256 0.115 0.253 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0571 0.108 0.253 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 9.99e-01 0.000154 0.114 0.253 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0513 0.111 0.253 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 6.07e-02 0.197 0.104 0.253 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 1.39e-01 -0.162 0.109 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 1.06e-01 0.18 0.111 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 9.30e-01 0.00931 0.107 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 1.99e-01 -0.116 0.0898 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 1.30e-01 -0.162 0.107 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 5.24e-01 0.0679 0.106 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 2.45e-02 -0.24 0.106 0.237 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 3.19e-01 -0.109 0.109 0.237 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0413 0.102 0.237 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 2.63e-01 0.109 0.0968 0.237 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 1.15e-01 -0.175 0.11 0.237 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 8.95e-01 0.0145 0.11 0.237 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 1.18e-05 -0.474 0.105 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 8.01e-01 0.0279 0.111 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 7.13e-01 0.039 0.106 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 4.06e-01 -0.068 0.0817 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 6.52e-03 -0.293 0.107 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 1.60e-01 -0.162 0.115 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 1.72e-03 -0.334 0.105 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 5.51e-01 -0.067 0.112 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 8.28e-01 0.0235 0.108 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 2.14e-02 0.238 0.103 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 1.88e-02 -0.263 0.111 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 7.68e-01 0.0331 0.112 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 4.84e-01 0.0761 0.109 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 9.52e-01 0.00695 0.115 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0941 0.1 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0839 0.104 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0754 0.111 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -935909 sc-eQTL 4.68e-01 0.0293 0.0403 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0558 0.106 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 1.12e-01 -0.142 0.0888 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 3.94e-02 0.199 0.096 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 4.17e-01 0.0773 0.0952 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00301 0.0843 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 1.13e-01 -0.163 0.102 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -935909 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00817 0.061 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 5.60e-01 0.0597 0.102 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 4.05e-02 -0.189 0.0919 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0226 0.108 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 2.49e-01 0.11 0.0952 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 9.45e-01 0.00643 0.093 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 1.36e-01 -0.163 0.109 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -935909 sc-eQTL 5.91e-01 0.0467 0.0868 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0791 0.106 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 1.48e-02 -0.263 0.107 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 6.27e-01 0.0532 0.109 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 6.06e-01 0.0549 0.106 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0738 0.103 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 5.68e-01 -0.061 0.107 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -935909 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0367 0.066 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 7.67e-01 0.0328 0.111 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 7.38e-01 0.0334 0.0996 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 1.07e-01 0.171 0.105 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 7.52e-01 0.0318 0.1 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0928 0.107 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0844 0.111 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -935909 sc-eQTL 8.31e-04 0.156 0.0459 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 1.24e-01 0.175 0.113 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 6.96e-03 -0.268 0.0983 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 5.43e-01 0.063 0.103 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 6.72e-01 0.0453 0.107 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 5.51e-01 0.0613 0.103 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0687 0.104 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -935909 sc-eQTL 6.17e-02 0.134 0.0715 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0467 0.098 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 1.37e-01 -0.165 0.11 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 1.38e-01 -0.167 0.112 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 8.25e-01 0.0243 0.11 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 8.28e-01 0.0245 0.112 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 2.38e-02 -0.245 0.108 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -935909 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00697 0.0573 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 5.55e-01 0.0658 0.111 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 5.34e-01 0.0692 0.111 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0794 0.112 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00854 0.108 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0435 0.104 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 2.10e-01 -0.141 0.112 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -935909 sc-eQTL 7.25e-01 0.00808 0.023 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 1.76e-01 0.148 0.109 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 3.37e-01 0.102 0.106 0.24 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 6.78e-01 0.0439 0.106 0.24 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 9.95e-01 0.000683 0.101 0.24 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0411 0.107 0.24 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0222 0.107 0.24 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0755 0.11 0.24 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0434 0.105 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00723 0.108 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0884 0.0931 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0307 0.104 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 1.09e-01 -0.174 0.108 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0212 0.107 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0524 0.0846 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 9.61e-01 -0.0053 0.107 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0798 0.0934 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 2.60e-01 0.107 0.0947 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 3.45e-01 -0.102 0.108 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 1.58e-01 0.165 0.116 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0814 0.115 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0181 0.12 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 4.48e-01 0.0696 0.0915 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0162 0.107 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0359 0.112 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0287 0.107 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0167 0.0927 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00759 0.105 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0128 0.0971 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 2.75e-01 -0.108 0.099 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 9.74e-01 -0.0034 0.103 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 1.42e-01 0.161 0.109 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0513 0.135 0.241 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 4.69e-01 0.103 0.142 0.241 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 3.17e-02 0.324 0.149 0.241 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0604 0.133 0.241 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 2.84e-01 -0.142 0.132 0.241 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 1.74e-01 -0.197 0.144 0.241 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0381 0.101 0.239 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 2.96e-01 0.107 0.102 0.239 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0941 0.103 0.239 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0845 0.0898 0.239 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 1.20e-02 0.225 0.0889 0.239 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 3.55e-01 0.097 0.105 0.239 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0661 0.105 0.239 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0612 0.113 0.239 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0643 0.103 0.239 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 9.42e-02 0.177 0.105 0.239 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 4.37e-02 -0.223 0.11 0.239 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -935909 sc-eQTL 9.59e-01 0.00433 0.0837 0.239 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 2.36e-01 -0.126 0.106 0.239 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0904 0.105 0.254 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 1.01e-01 0.174 0.106 0.254 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0677 0.104 0.254 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 1.71e-01 -0.124 0.0901 0.254 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 8.51e-04 -0.378 0.111 0.254 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00299 0.0922 0.254 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 3.41e-01 0.0941 0.0985 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 2.88e-01 0.105 0.0986 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 3.10e-01 0.106 0.104 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 9.73e-01 0.0025 0.0733 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0672 0.104 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0987 0.109 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 1.83e-02 0.261 0.11 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 6.80e-01 0.0426 0.103 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0675 0.0891 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 7.58e-02 -0.178 0.0999 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0832 0.118 0.239 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 9.88e-01 0.00185 0.126 0.239 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 9.82e-02 -0.204 0.123 0.239 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 7.63e-01 0.0357 0.118 0.239 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 3.16e-01 0.126 0.125 0.239 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 3.24e-01 -0.122 0.123 0.239 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0834 0.111 0.244 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0664 0.103 0.244 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 9.23e-01 0.0103 0.106 0.244 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0699 0.101 0.244 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0624 0.111 0.244 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 2.91e-01 -0.105 0.0988 0.242 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 4.29e-02 0.22 0.108 0.242 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00718 0.107 0.242 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 2.44e-01 0.116 0.0997 0.242 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 1.94e-01 0.136 0.104 0.242 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 8.79e-01 0.0176 0.116 0.249 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 5.06e-01 0.0749 0.112 0.249 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 1.86e-01 0.152 0.114 0.249 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 1.98e-01 0.133 0.103 0.249 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 3.10e-01 -0.117 0.115 0.249 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 3.27e-02 -0.218 0.101 0.249 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 3.36e-03 -0.297 0.1 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 4.72e-01 0.0813 0.113 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 7.37e-01 0.0329 0.0979 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0579 0.0791 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 1.65e-02 -0.248 0.103 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 1.75e-01 0.147 0.108 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 8.59e-08 -0.555 0.1 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 7.75e-01 0.0316 0.11 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 9.35e-01 0.00841 0.103 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 2.99e-01 0.0815 0.0783 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 3.28e-04 -0.393 0.108 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 2.30e-01 -0.134 0.111 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 7.66e-01 0.0301 0.101 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 2.52e-02 0.218 0.0968 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 3.15e-01 0.0991 0.0984 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0266 0.0682 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 1.44e-01 -0.147 0.1 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 1.72e-01 -0.131 0.0956 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 3.42e-01 0.104 0.109 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 4.41e-01 0.0831 0.108 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 5.89e-01 0.0498 0.0919 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 2.81e-01 0.115 0.106 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -59191 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0828 0.0827 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 166645 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0196 0.0995 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 845834 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0768 0.089 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 750088 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0155 0.089 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 sc-eQTL 7.26e-01 -0.037 0.105 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 10848 sc-eQTL 1.87e-01 0.154 0.116 0.241 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 -59191 eQTL 3.72e-18 -0.177 0.02 0.00815 0.00833 0.223
ENSG00000088035 ALG6 166645 eQTL 0.0327 0.0329 0.0154 0.0 0.0 0.223
ENSG00000116641 DOCK7 845852 eQTL 0.00273 0.077 0.0256 0.00322 0.0 0.223
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 eQTL 4.1599999999999994e-42 -0.442 0.0309 0.0024 0.0031 0.223
ENSG00000185483 ROR1 -239797 pQTL 0.0426 -0.0321 0.0158 0.0 0.0 0.225

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 PGM1 -59191 2.04e-05 1.76e-05 3.99e-06 1.01e-05 3.82e-06 6.82e-06 2.25e-05 2.92e-06 1.73e-05 9.43e-06 1.94e-05 8.32e-06 2.86e-05 8.66e-06 5.07e-06 1.13e-05 8.15e-06 1.29e-05 5.69e-06 4.08e-06 8.88e-06 1.98e-05 1.73e-05 4.9e-06 3.2e-05 5.13e-06 8.52e-06 6.41e-06 1.67e-05 1.31e-05 1.08e-05 1.4e-06 1.46e-06 4.49e-06 8.6e-06 3.74e-06 1.7e-06 2.39e-06 2.22e-06 1.88e-06 1.29e-06 2.49e-05 2.64e-06 3.57e-07 2.74e-06 2.96e-06 2.56e-06 1.52e-06 1.33e-06
ENSG00000088035 ALG6 166645 8.64e-06 9.31e-06 1.26e-06 4.75e-06 2.46e-06 1.55e-06 9.07e-06 1.04e-06 5.33e-06 4.13e-06 8.88e-06 2.99e-06 1.14e-05 4e-06 1.79e-06 5.46e-06 1.84e-06 3.99e-06 2.67e-06 2.41e-06 4.52e-06 8.17e-06 5.93e-06 2.32e-06 1.15e-05 2.19e-06 3.73e-06 2.1e-06 5.98e-06 4.58e-06 4.06e-06 1e-06 6.11e-07 2.78e-06 3.53e-06 2.04e-06 1.35e-06 9.68e-07 1.2e-06 5.64e-07 8.54e-07 9.58e-06 1.63e-06 3.62e-07 1.55e-06 2.56e-06 1.14e-06 7.13e-07 4.43e-07
ENSG00000125703 \N 750088 1.3e-06 9.37e-07 2.81e-07 3.2e-07 1.14e-07 3.2e-07 9.74e-07 8.17e-08 1.14e-06 3.12e-07 1.09e-06 5.6e-07 1.91e-06 2.68e-07 3.96e-07 4.84e-07 1.17e-07 5.54e-07 5.26e-07 1.78e-07 3.6e-07 1.05e-06 6.93e-07 1.71e-07 1.94e-06 2.53e-07 4.91e-07 3.95e-07 8.81e-07 5.28e-07 5.23e-07 7.12e-08 6.08e-08 2.84e-07 3.66e-07 2.04e-07 1.12e-07 1.02e-07 7.72e-08 7.39e-08 5.43e-08 7.45e-07 2.32e-07 1.33e-07 5.84e-08 1.46e-07 9.68e-08 3.05e-08 1.06e-07
ENSG00000142856 ITGB3BP -59501 2.04e-05 1.73e-05 3.99e-06 9.98e-06 3.82e-06 6.82e-06 2.25e-05 2.92e-06 1.73e-05 9.47e-06 1.94e-05 8.28e-06 2.82e-05 8.62e-06 5.07e-06 1.13e-05 8.2e-06 1.29e-05 5.69e-06 4.11e-06 8.78e-06 1.98e-05 1.73e-05 4.9e-06 3.2e-05 5.05e-06 8.4e-06 6.41e-06 1.66e-05 1.31e-05 1.07e-05 1.4e-06 1.43e-06 4.4e-06 8.6e-06 3.74e-06 1.7e-06 2.39e-06 2.25e-06 1.88e-06 1.29e-06 2.46e-05 2.64e-06 3.57e-07 2.74e-06 2.96e-06 2.56e-06 1.5e-06 1.33e-06
ENSG00000203965 \N 10848 5.67e-05 3.92e-05 8.22e-06 1.99e-05 8.29e-06 1.83e-05 5.61e-05 6.5e-06 4.13e-05 2.1e-05 4.97e-05 2.22e-05 6.26e-05 1.82e-05 9.07e-06 2.79e-05 2.36e-05 3.58e-05 1.07e-05 8.89e-06 2.5e-05 5.11e-05 3.86e-05 1.18e-05 6.25e-05 1.23e-05 2.14e-05 1.84e-05 4.25e-05 2.85e-05 2.79e-05 2.32e-06 4.39e-06 8.89e-06 1.56e-05 8.08e-06 4.02e-06 4.16e-06 6.44e-06 4.01e-06 1.88e-06 4.97e-05 4.93e-06 5.19e-07 3.09e-06 5.22e-06 5.63e-06 2.4e-06 1.71e-06