logo

Genes within 1Mb (chr1:63528963:C:CA):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 2.11e-01 0.133 0.106 0.16 B L1
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0206 0.11 0.16 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 5.69e-01 0.0628 0.11 0.16 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 4.57e-01 -0.057 0.0765 0.16 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 8.80e-01 0.0184 0.122 0.16 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 9.09e-01 0.0142 0.125 0.16 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 6.45e-01 0.042 0.0911 0.16 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 1.52e-01 -0.144 0.1 0.16 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0956 0.102 0.16 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0307 0.0822 0.16 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 7.90e-02 -0.204 0.116 0.16 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -941166 sc-eQTL 9.95e-02 -0.114 0.0692 0.16 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 8.59e-01 0.0187 0.105 0.16 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 5.95e-01 0.0533 0.1 0.16 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 3.56e-01 -0.102 0.11 0.16 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 1.22e-01 0.173 0.111 0.16 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 8.90e-01 0.0147 0.106 0.16 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0646 0.119 0.16 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -941166 sc-eQTL 5.58e-04 -0.205 0.0585 0.16 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 1.80e-01 -0.159 0.118 0.16 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 1.77e-01 -0.15 0.111 0.149 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 8.35e-02 -0.198 0.114 0.149 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 9.26e-01 0.011 0.118 0.149 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 1.13e-01 0.146 0.0916 0.149 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0191 0.129 0.149 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 2.12e-01 0.14 0.112 0.149 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 8.00e-02 -0.189 0.108 0.16 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 9.98e-01 0.000324 0.113 0.16 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0084 0.109 0.16 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00776 0.0739 0.16 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 5.03e-02 -0.228 0.116 0.16 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 1.08e-01 0.147 0.091 0.159 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0753 0.107 0.159 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0821 0.0882 0.159 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 7.29e-01 -0.033 0.0949 0.159 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 2.60e-01 -0.133 0.118 0.159 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0946 0.128 0.159 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 9.50e-01 0.00662 0.106 0.16 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0191 0.106 0.16 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 7.93e-01 0.0285 0.108 0.16 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 9.69e-01 0.0036 0.0939 0.16 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0354 0.0832 0.16 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 2.90e-01 -0.136 0.128 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 6.02e-01 0.0751 0.144 0.161 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 5.08e-01 0.0912 0.138 0.161 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0657 0.128 0.161 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0468 0.135 0.161 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 8.56e-01 -0.024 0.132 0.161 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 3.10e-01 -0.127 0.124 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 8.78e-01 -0.019 0.124 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 3.92e-01 -0.107 0.125 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 2.05e-01 -0.152 0.119 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0553 0.101 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0559 0.121 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00989 0.12 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 1.81e-01 0.166 0.124 0.162 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 2.79e-01 0.137 0.126 0.162 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 5.04e-01 0.0792 0.118 0.162 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0982 0.112 0.162 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0367 0.129 0.162 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 9.96e-01 0.000681 0.128 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 1.86e-01 0.165 0.125 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 5.92e-01 0.0674 0.125 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 3.95e-01 0.102 0.12 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 6.79e-01 0.0383 0.0926 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 8.09e-01 0.0298 0.123 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 2.90e-01 0.139 0.131 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0648 0.122 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 6.99e-01 0.0491 0.127 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 4.17e-01 0.0991 0.122 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0668 0.117 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 3.49e-01 0.119 0.127 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 2.24e-01 -0.154 0.126 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 1.81e-01 -0.164 0.122 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 2.10e-01 -0.162 0.129 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 5.47e-01 0.0683 0.113 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 1.11e-01 0.186 0.116 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 8.16e-01 0.0293 0.125 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -941166 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0528 0.0454 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 5.11e-01 0.0783 0.119 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0433 0.102 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0919 0.111 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 1.16e-01 -0.171 0.108 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0831 0.0963 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 1.81e-01 -0.158 0.117 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -941166 sc-eQTL 3.65e-02 -0.145 0.0691 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0596 0.117 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 5.92e-01 0.0568 0.106 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0759 0.123 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 9.61e-01 0.00538 0.109 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0334 0.106 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 6.50e-02 -0.23 0.124 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -941166 sc-eQTL 1.12e-01 -0.157 0.0984 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 1.45e-01 0.176 0.12 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0789 0.125 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 8.82e-01 0.0187 0.125 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 3.27e-01 -0.12 0.122 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 3.15e-01 0.119 0.118 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0154 0.123 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -941166 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0517 0.0757 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 3.75e-01 0.113 0.127 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0905 0.112 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0384 0.119 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 3.83e-01 0.0987 0.113 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 2.09e-01 -0.151 0.12 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 1.38e-02 -0.306 0.123 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -941166 sc-eQTL 1.48e-01 -0.0766 0.0528 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 1.77e-01 -0.173 0.128 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 3.35e-01 0.11 0.114 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 2.18e-02 -0.271 0.117 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 3.25e-01 0.121 0.122 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0199 0.118 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0582 0.119 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -941166 sc-eQTL 1.91e-03 -0.254 0.0808 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 6.89e-01 -0.045 0.112 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 9.37e-02 0.21 0.125 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 6.30e-01 0.0613 0.127 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 7.35e-01 0.0419 0.124 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 6.30e-01 0.0612 0.127 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 3.58e-01 -0.113 0.123 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -941166 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0124 0.0647 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 6.50e-01 0.0571 0.125 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0177 0.127 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0394 0.127 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 2.15e-01 0.153 0.123 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 4.09e-01 0.098 0.119 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 9.44e-02 0.214 0.128 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -941166 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0155 0.0262 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0858 0.124 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0262 0.12 0.158 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 4.57e-01 0.0886 0.119 0.158 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 7.02e-01 0.0437 0.114 0.158 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 9.95e-01 0.000699 0.12 0.158 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 2.38e-01 -0.142 0.12 0.158 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 7.54e-01 -0.039 0.124 0.158 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 9.57e-01 0.00657 0.121 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 2.15e-01 -0.153 0.123 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 5.69e-01 -0.061 0.107 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 4.38e-01 0.0929 0.119 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0409 0.125 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 1.15e-01 0.194 0.122 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 3.19e-01 0.0951 0.0952 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 3.85e-01 -0.105 0.121 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0797 0.105 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0183 0.107 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 1.96e-01 -0.157 0.121 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0413 0.132 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0826 0.131 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 8.47e-01 0.0262 0.136 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0148 0.104 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 5.97e-01 0.0638 0.12 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 8.16e-01 0.0295 0.127 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0667 0.12 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 6.97e-01 0.0404 0.104 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 2.26e-01 0.142 0.117 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0267 0.109 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0722 0.111 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 2.22e-01 -0.14 0.115 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 1.14e-01 -0.193 0.122 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 8.45e-01 -0.029 0.148 0.178 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 3.78e-01 0.137 0.155 0.178 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0846 0.166 0.178 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 4.96e-01 -0.099 0.145 0.178 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 6.76e-01 0.0608 0.145 0.178 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 6.55e-02 0.292 0.157 0.178 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 2.14e-01 0.142 0.114 0.163 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 2.53e-01 -0.133 0.116 0.163 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 7.21e-01 0.0417 0.116 0.163 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 1.90e-01 0.133 0.102 0.163 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 8.88e-01 0.0144 0.102 0.163 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0752 0.119 0.163 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 4.12e-01 0.101 0.123 0.16 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0103 0.132 0.16 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 7.12e-01 0.0448 0.121 0.16 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0972 0.124 0.16 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 2.46e-01 -0.15 0.129 0.16 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -941166 sc-eQTL 4.36e-01 0.0764 0.0978 0.16 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 4.84e-02 0.244 0.123 0.16 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0527 0.126 0.141 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00178 0.128 0.141 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 5.05e-01 0.0837 0.125 0.141 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 1.14e-02 0.274 0.107 0.141 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 4.64e-02 0.274 0.137 0.141 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000373 0.111 0.141 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 1.64e-02 -0.271 0.112 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 9.64e-01 0.00509 0.114 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 3.90e-01 0.103 0.12 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 8.84e-01 0.0123 0.0843 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0832 0.119 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 3.16e-01 -0.125 0.125 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0803 0.127 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 2.10e-01 -0.147 0.117 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0364 0.102 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0346 0.115 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0701 0.137 0.152 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 4.23e-01 -0.117 0.145 0.152 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0584 0.143 0.152 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 3.11e-01 -0.138 0.136 0.152 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 2.16e-01 -0.179 0.144 0.152 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 8.86e-01 0.0205 0.143 0.152 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 1.64e-03 -0.389 0.122 0.158 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 5.84e-01 0.0638 0.116 0.158 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 2.84e-01 -0.127 0.119 0.158 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 5.69e-01 0.0648 0.113 0.158 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00964 0.125 0.158 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 9.35e-01 0.00937 0.116 0.158 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 4.68e-01 0.0922 0.127 0.158 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 4.63e-01 0.0918 0.125 0.158 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0145 0.117 0.158 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 2.45e-02 -0.273 0.121 0.158 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0731 0.143 0.138 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 1.61e-01 -0.194 0.138 0.138 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 5.79e-01 0.079 0.142 0.138 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 1.27e-01 -0.194 0.126 0.138 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 1.87e-01 -0.189 0.142 0.138 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 8.94e-01 0.0169 0.127 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 1.67e-01 0.163 0.117 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 7.87e-01 0.0352 0.13 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0558 0.113 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0893 0.0911 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 5.11e-01 -0.079 0.12 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 8.31e-01 0.0268 0.125 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 3.48e-01 0.114 0.122 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 8.02e-01 0.0315 0.125 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 3.27e-01 0.115 0.117 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 9.86e-01 -0.0016 0.0894 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 4.22e-01 0.102 0.126 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 8.48e-01 0.0243 0.127 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 7.51e-02 -0.205 0.115 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0433 0.112 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 9.09e-01 0.013 0.113 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0218 0.0779 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0922 0.115 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 2.07e-02 -0.252 0.108 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 2.42e-01 0.145 0.124 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0836 0.123 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 1.16e-01 0.164 0.104 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 6.12e-02 -0.227 0.121 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -64448 sc-eQTL 1.98e-01 0.12 0.0927 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 161388 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0354 0.112 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 840577 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0497 0.1 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 744831 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0518 0.0999 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 sc-eQTL 2.83e-01 -0.127 0.118 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 sc-eQTL 2.03e-01 -0.167 0.13 0.159 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116652 DLEU2L -18119 eQTL 0.00949 0.0949 0.0365 0.00164 0.0 0.143
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 eQTL 0.000176 0.155 0.0411 0.0021 0.0 0.143
ENSG00000203965 EFCAB7 5591 eQTL 6.88e-04 0.115 0.0337 0.0 0.0 0.143

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 \N -64448 3.04e-05 3.37e-05 8.86e-06 1.26e-05 3.78e-06 5.69e-06 2.58e-05 3.42e-06 1.73e-05 6.93e-06 2.29e-05 8.63e-06 3.13e-05 8.95e-06 5.59e-06 1.49e-05 1.43e-05 1.87e-05 7.5e-06 6.34e-06 1.4e-05 2.36e-05 1.81e-05 9.41e-06 3.02e-05 7.34e-06 8.04e-06 1.13e-05 1.86e-05 1.49e-05 1.23e-05 1.41e-06 2.07e-06 4.84e-06 7.35e-06 5.47e-06 3.68e-06 2.85e-06 2.81e-06 9.71e-07 1.72e-06 2.19e-05 5.69e-06 1.24e-06 1.93e-06 3.81e-06 3.97e-06 1.27e-06 4.67e-07
ENSG00000142856 ITGB3BP -64758 3.04e-05 3.34e-05 8.86e-06 1.24e-05 3.8e-06 5.65e-06 2.56e-05 3.39e-06 1.73e-05 6.86e-06 2.28e-05 8.6e-06 3.11e-05 8.95e-06 5.6e-06 1.48e-05 1.43e-05 1.84e-05 7.5e-06 6.18e-06 1.4e-05 2.33e-05 1.81e-05 9.31e-06 3.01e-05 7.34e-06 8.02e-06 1.12e-05 1.86e-05 1.48e-05 1.24e-05 1.45e-06 2.04e-06 4.84e-06 7.28e-06 5.47e-06 3.7e-06 2.83e-06 2.8e-06 1.01e-06 1.7e-06 2.17e-05 5.69e-06 1.27e-06 1.91e-06 3.81e-06 3.96e-06 1.28e-06 4.81e-07