logo

Genes within 1Mb (chr1:63511501:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 2.34e-02 0.222 0.0972 0.175 B L1
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0859 0.102 0.175 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 7.46e-01 0.033 0.102 0.175 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 7.09e-01 0.0265 0.0709 0.175 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 8.29e-31 1.12 0.0822 0.175 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 1.32e-06 0.544 0.109 0.175 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 4.19e-01 0.0686 0.0848 0.175 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 8.36e-02 -0.162 0.093 0.175 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 5.18e-01 0.0614 0.0948 0.175 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 8.07e-01 0.0187 0.0766 0.175 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 1.04e-41 1.2 0.0704 0.175 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -958628 sc-eQTL 9.27e-01 0.00598 0.0649 0.175 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 6.57e-04 0.328 0.0949 0.175 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 2.34e-01 0.11 0.0918 0.175 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 5.96e-01 0.0539 0.101 0.175 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 3.27e-01 -0.101 0.103 0.175 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 1.10e-01 -0.156 0.0971 0.175 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 5.06e-26 1.02 0.0839 0.175 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -958628 sc-eQTL 7.99e-01 0.0141 0.0553 0.175 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 5.84e-06 0.482 0.104 0.175 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 6.42e-01 0.0486 0.104 0.182 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 3.13e-01 -0.109 0.107 0.182 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00737 0.11 0.182 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 4.94e-01 0.059 0.0862 0.182 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 1.20e-05 0.516 0.115 0.182 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 1.52e-02 0.253 0.103 0.182 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 3.80e-01 0.0884 0.101 0.175 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 2.40e-03 -0.316 0.103 0.175 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 2.32e-01 0.121 0.101 0.175 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0382 0.0686 0.175 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 2.37e-17 0.848 0.0915 0.175 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0414 0.0852 0.176 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0848 0.0997 0.176 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 4.25e-01 0.0657 0.0822 0.176 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 6.60e-01 0.0389 0.0883 0.176 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 9.01e-11 0.679 0.0993 0.176 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 6.01e-01 0.0624 0.119 0.176 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 3.82e-01 0.0849 0.0969 0.175 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0655 0.0975 0.175 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 7.30e-01 0.0344 0.0996 0.175 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 1.58e-02 -0.207 0.0851 0.175 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 1.53e-02 0.184 0.0754 0.175 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 5.04e-02 0.23 0.117 0.175 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 9.91e-01 0.00156 0.134 0.158 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 8.69e-01 0.0211 0.128 0.158 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0465 0.119 0.158 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 4.07e-01 -0.104 0.125 0.158 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 3.58e-04 0.43 0.118 0.158 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 5.82e-01 0.0638 0.116 0.158 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 8.85e-01 0.0169 0.117 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 7.41e-01 0.0391 0.118 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 5.16e-01 0.0735 0.113 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0533 0.0957 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 8.79e-09 0.632 0.105 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 5.80e-05 0.446 0.109 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 2.79e-01 0.123 0.114 0.177 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0681 0.116 0.177 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 9.30e-02 0.182 0.108 0.177 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 6.83e-01 0.0422 0.103 0.177 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 1.06e-04 0.451 0.114 0.177 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 7.98e-03 0.309 0.115 0.177 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 5.91e-02 0.218 0.115 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0775 0.116 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 1.94e-01 -0.145 0.111 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 6.93e-01 0.034 0.0859 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 1.76e-18 0.916 0.0949 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 3.65e-05 0.493 0.117 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 9.62e-03 0.296 0.113 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0955 0.12 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0224 0.116 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0351 0.111 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 5.88e-18 0.956 0.101 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0976 0.12 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 4.34e-01 0.0927 0.118 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 9.16e-02 0.21 0.124 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00975 0.109 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 2.93e-01 -0.119 0.113 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 1.96e-01 0.156 0.12 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -958628 sc-eQTL 5.20e-01 0.0283 0.0439 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 9.24e-01 0.011 0.115 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 6.87e-01 0.0383 0.0949 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 1.58e-02 -0.247 0.102 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 4.15e-01 0.0826 0.101 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 7.06e-01 0.0338 0.0895 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 6.05e-32 1.1 0.0788 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -958628 sc-eQTL 9.19e-01 0.0066 0.0648 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 1.09e-02 0.275 0.107 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 6.28e-02 0.182 0.0974 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 4.25e-01 0.091 0.114 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 6.79e-01 0.0418 0.101 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 6.88e-02 0.178 0.0976 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 3.63e-20 0.969 0.0948 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -958628 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0904 0.0917 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 4.92e-03 0.313 0.11 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0593 0.115 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 3.56e-01 -0.107 0.115 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0355 0.113 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 1.02e-01 -0.178 0.109 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 9.06e-06 0.49 0.108 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -958628 sc-eQTL 6.56e-01 0.0312 0.0698 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 3.63e-01 0.107 0.117 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 7.14e-01 0.0388 0.106 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0647 0.113 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 9.42e-01 0.00781 0.107 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0396 0.114 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 2.62e-09 0.676 0.109 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -958628 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0579 0.05 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 1.05e-01 0.196 0.12 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00535 0.107 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 7.14e-01 0.0405 0.11 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 2.03e-01 -0.145 0.114 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0282 0.109 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 1.47e-17 0.87 0.0932 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -958628 sc-eQTL 8.92e-01 0.0105 0.0768 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 1.61e-03 0.326 0.102 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 7.95e-01 0.0303 0.116 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 2.18e-01 0.145 0.117 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0491 0.115 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 8.64e-01 0.0201 0.117 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 1.57e-07 0.578 0.106 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -958628 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0106 0.0599 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 6.07e-01 0.0599 0.116 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 3.76e-01 0.103 0.116 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 4.60e-01 0.0864 0.117 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00754 0.113 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 1.04e-02 -0.277 0.107 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 3.33e-02 0.25 0.116 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -958628 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00174 0.024 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 8.94e-02 0.194 0.113 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 8.41e-01 0.0227 0.113 0.177 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 9.84e-01 0.00223 0.112 0.177 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0183 0.107 0.177 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 8.41e-02 -0.195 0.112 0.177 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 4.62e-07 0.554 0.106 0.177 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 1.37e-01 0.173 0.116 0.177 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0222 0.112 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 3.09e-01 -0.117 0.115 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 5.25e-01 0.0635 0.0998 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 5.08e-01 -0.074 0.111 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 3.12e-03 0.34 0.114 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 3.89e-01 0.0987 0.114 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0525 0.0888 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 9.31e-01 0.00983 0.113 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 2.95e-01 0.103 0.0978 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 6.44e-02 0.184 0.0988 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 3.05e-05 0.463 0.109 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0487 0.122 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 6.88e-02 0.219 0.12 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 3.67e-01 -0.113 0.125 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 9.17e-01 0.0101 0.0959 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0672 0.111 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 3.33e-03 0.341 0.115 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0247 0.112 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 2.94e-01 -0.103 0.0975 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 3.30e-01 -0.108 0.11 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0156 0.102 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 5.16e-01 -0.068 0.105 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 7.26e-08 0.565 0.101 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 9.22e-01 0.0113 0.115 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 8.70e-02 0.261 0.151 0.159 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 2.82e-01 -0.173 0.16 0.159 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0317 0.172 0.159 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 4.12e-01 0.123 0.149 0.159 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 2.36e-03 0.446 0.143 0.159 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 1.36e-01 0.244 0.162 0.159 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 4.75e-01 0.0753 0.105 0.174 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 5.37e-01 0.0664 0.107 0.174 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 7.51e-02 0.191 0.107 0.174 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 6.32e-01 0.0452 0.0942 0.174 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 1.02e-06 -0.45 0.0892 0.174 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 2.79e-01 -0.119 0.11 0.174 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 8.13e-01 0.0263 0.111 0.175 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 2.63e-01 -0.133 0.118 0.175 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0814 0.109 0.175 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 2.74e-01 -0.122 0.111 0.175 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 1.16e-02 0.292 0.115 0.175 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -958628 sc-eQTL 3.05e-02 0.19 0.0871 0.175 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0237 0.111 0.175 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 3.44e-01 0.105 0.111 0.183 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 5.12e-01 -0.074 0.113 0.183 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0493 0.111 0.183 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 9.07e-01 0.0112 0.0961 0.183 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 1.00e-03 0.395 0.118 0.183 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 3.76e-01 0.0867 0.0977 0.183 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0375 0.105 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 9.72e-02 -0.173 0.104 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 5.29e-01 0.0695 0.11 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0368 0.0776 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 1.15e-12 0.738 0.0975 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 1.10e-01 0.187 0.116 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 8.03e-02 -0.207 0.118 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 8.11e-01 0.0263 0.11 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0647 0.095 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 6.83e-05 0.42 0.103 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 5.17e-01 0.0841 0.129 0.17 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 6.46e-01 0.0636 0.138 0.17 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0517 0.135 0.17 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0329 0.129 0.17 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 2.54e-02 0.305 0.135 0.17 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 7.38e-01 0.0454 0.135 0.17 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 3.82e-01 0.103 0.118 0.176 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 3.40e-01 -0.105 0.109 0.176 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 5.53e-01 0.0665 0.112 0.176 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0787 0.107 0.176 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 7.62e-06 0.515 0.112 0.176 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 2.71e-01 0.116 0.105 0.174 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0993 0.115 0.174 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 3.92e-01 0.0975 0.114 0.174 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 4.74e-01 0.0761 0.106 0.174 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 8.11e-03 0.292 0.109 0.174 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 4.08e-01 0.101 0.121 0.192 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 3.10e-01 -0.12 0.118 0.192 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 9.70e-01 0.0046 0.121 0.192 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 7.09e-01 0.0405 0.108 0.192 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 1.62e-02 0.29 0.119 0.192 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 1.67e-02 0.255 0.106 0.192 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 5.29e-01 0.0688 0.109 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0301 0.121 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 3.43e-01 0.0995 0.105 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00928 0.0847 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 1.08e-13 0.777 0.0977 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 6.40e-06 0.512 0.111 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 3.73e-03 0.325 0.111 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 3.89e-01 -0.1 0.116 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 5.88e-01 -0.059 0.109 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 7.87e-01 0.0224 0.083 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 2.82e-27 1.11 0.0889 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 2.50e-03 0.353 0.115 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 6.63e-01 0.0469 0.107 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 2.02e-02 -0.24 0.103 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 3.41e-01 0.0998 0.105 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0574 0.0723 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 1.10e-13 0.747 0.094 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 1.19e-01 0.16 0.102 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 5.35e-02 -0.224 0.115 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 4.58e-01 0.0856 0.115 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0165 0.0983 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 4.82e-06 0.51 0.109 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -81910 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0366 0.0866 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 143926 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0573 0.104 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 823115 sc-eQTL 7.37e-01 0.0313 0.0931 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 727369 sc-eQTL 5.17e-01 0.0603 0.0929 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 sc-eQTL 1.19e-09 0.642 0.101 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -11871 sc-eQTL 7.59e-01 0.0373 0.122 0.175 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000088035 ALG6 143926 eQTL 1.36e-10 -0.106 0.0163 0.0 0.0 0.198
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 eQTL 1.11e-30 0.41 0.0343 0.0571 0.00303 0.198
ENSG00000230798 FOXD3-AS1 187060 eQTL 0.000726 -0.11 0.0326 0.00743 0.00684 0.198

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000088035 ALG6 143926 3.61e-06 4.13e-06 5.55e-07 2.02e-06 7.91e-07 8.89e-07 2.37e-06 9.96e-07 2.42e-06 1.46e-06 3.95e-06 1.91e-06 6.07e-06 1.24e-06 9.36e-07 2.11e-06 1.54e-06 2.17e-06 1.49e-06 1.24e-06 1.56e-06 3.58e-06 3.37e-06 1.68e-06 4.64e-06 1.19e-06 1.77e-06 1.44e-06 3.79e-06 3.21e-06 2e-06 3.23e-07 6.23e-07 1.45e-06 1.87e-06 8.95e-07 9.25e-07 4.48e-07 1.17e-06 3.46e-07 1.96e-07 4.17e-06 5.79e-07 1.85e-07 3.68e-07 3.52e-07 8.95e-07 2.07e-07 2.56e-07
ENSG00000142856 ITGB3BP -82220 5.07e-06 7.1e-06 6.33e-07 3.48e-06 1.54e-06 1.85e-06 8.23e-06 1.26e-06 4.56e-06 3.29e-06 8.18e-06 2.83e-06 1.01e-05 2.19e-06 9.51e-07 3.99e-06 2.16e-06 3.99e-06 1.58e-06 1.63e-06 2.55e-06 6.71e-06 4.8e-06 1.96e-06 8.92e-06 2.14e-06 2.91e-06 1.97e-06 6.07e-06 6.65e-06 3.35e-06 4.19e-07 6.95e-07 2.3e-06 1.93e-06 1.3e-06 1.01e-06 5.42e-07 8.38e-07 6.39e-07 6.6e-07 7.99e-06 5.96e-07 1.61e-07 8.03e-07 9.92e-07 1.15e-06 6.82e-07 6.19e-07
ENSG00000230798 FOXD3-AS1 187060 2.13e-06 2.57e-06 2.31e-07 1.7e-06 4.94e-07 8.27e-07 1.83e-06 6.05e-07 1.68e-06 8.16e-07 2.48e-06 1.3e-06 3.27e-06 1.24e-06 5.7e-07 1.17e-06 9.22e-07 1.73e-06 7.31e-07 1.15e-06 8.29e-07 2.77e-06 2.04e-06 9.4e-07 3.4e-06 1.12e-06 1.23e-06 1.64e-06 1.91e-06 1.84e-06 1.67e-06 2.31e-07 4.61e-07 1.1e-06 1.01e-06 7.08e-07 8.3e-07 4.57e-07 6.01e-07 3.47e-07 2.88e-07 3.03e-06 4.1e-07 1.99e-07 3.38e-07 2.98e-07 4.3e-07 2.22e-07 2.13e-07