logo

Genes within 1Mb (chr1:63440522:C:CT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 1.47e-01 0.147 0.101 0.175 B L1
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0384 0.105 0.175 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 6.27e-01 0.0513 0.105 0.175 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0478 0.0731 0.175 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 7.66e-01 0.0347 0.116 0.175 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 6.27e-01 0.0581 0.119 0.175 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 6.42e-01 0.0405 0.0869 0.175 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 1.12e-01 -0.152 0.0954 0.175 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0669 0.097 0.175 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0189 0.0784 0.175 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 6.26e-02 -0.207 0.11 0.175 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 5.20e-01 0.0643 0.0998 0.175 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 5.19e-01 0.0616 0.0954 0.175 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0778 0.105 0.175 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 5.98e-02 0.2 0.106 0.175 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 5.14e-01 0.0662 0.101 0.175 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0547 0.113 0.175 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 2.42e-01 -0.132 0.113 0.175 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 1.14e-01 -0.169 0.107 0.162 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 1.29e-01 -0.168 0.11 0.162 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 9.93e-01 0.00105 0.114 0.162 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 1.82e-01 0.119 0.0885 0.162 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0744 0.124 0.162 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 1.06e-01 0.175 0.107 0.162 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 1.15e-01 -0.162 0.102 0.175 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 9.61e-01 0.00532 0.108 0.175 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 7.92e-01 0.0274 0.104 0.175 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0277 0.0702 0.175 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 3.32e-02 -0.235 0.11 0.175 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 2.18e-01 0.107 0.0868 0.174 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0896 0.102 0.174 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0684 0.084 0.174 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00226 0.0904 0.174 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 2.59e-01 -0.127 0.112 0.174 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0538 0.122 0.174 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0121 0.1 0.175 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 8.89e-01 -0.014 0.1 0.175 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 8.44e-01 0.0202 0.103 0.175 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 9.66e-01 0.00377 0.0888 0.175 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0534 0.0787 0.175 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 3.96e-01 -0.103 0.121 0.175 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 4.01e-01 0.115 0.136 0.179 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 7.93e-01 0.0344 0.131 0.179 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0721 0.122 0.179 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00717 0.128 0.179 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0518 0.125 0.179 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 3.26e-01 -0.116 0.118 0.179 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 9.99e-01 0.000164 0.117 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0928 0.119 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 2.17e-01 -0.141 0.113 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0562 0.0963 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 7.94e-01 -0.03 0.115 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0316 0.114 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 8.36e-02 0.203 0.117 0.177 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 2.75e-01 0.131 0.119 0.177 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 3.08e-01 0.114 0.112 0.177 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 1.56e-01 -0.151 0.106 0.177 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 9.50e-01 0.00761 0.122 0.177 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 6.98e-01 0.047 0.121 0.177 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 3.45e-01 0.112 0.119 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 6.29e-01 0.0577 0.119 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 3.26e-01 0.112 0.114 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 5.97e-01 0.0466 0.088 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 5.13e-01 0.0764 0.117 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 1.54e-01 0.177 0.124 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0282 0.116 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 7.65e-01 0.0362 0.121 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 8.22e-01 0.0262 0.116 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 5.92e-01 -0.06 0.112 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 7.74e-01 0.0349 0.121 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 1.64e-01 -0.168 0.12 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 2.46e-01 -0.135 0.116 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 3.93e-01 -0.105 0.123 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 7.94e-01 0.0282 0.108 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 1.12e-01 0.177 0.111 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 6.55e-01 0.0533 0.119 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 8.52e-01 0.0212 0.113 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0257 0.0973 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0984 0.106 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 1.44e-01 -0.152 0.103 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0782 0.0917 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 8.79e-02 -0.191 0.112 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0354 0.111 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 6.69e-01 0.0429 0.1 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 4.98e-01 -0.079 0.116 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 6.72e-01 0.0437 0.103 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00668 0.1 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 7.96e-02 -0.207 0.118 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 6.67e-02 0.21 0.114 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0616 0.118 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 8.31e-01 0.0253 0.118 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0789 0.115 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 2.65e-01 0.125 0.112 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00974 0.116 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 3.46e-01 0.113 0.12 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0862 0.107 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000406 0.114 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 4.47e-01 0.0819 0.108 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 3.36e-01 -0.11 0.114 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 6.15e-02 -0.222 0.118 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 1.56e-01 -0.173 0.122 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 2.25e-01 0.132 0.108 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 1.04e-01 -0.183 0.112 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 2.81e-01 0.125 0.116 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 8.43e-01 0.0222 0.112 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0452 0.113 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 9.41e-01 0.00793 0.107 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 1.32e-01 0.177 0.117 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 5.33e-01 0.0744 0.119 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 3.50e-01 0.109 0.116 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 6.04e-01 0.0619 0.119 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 3.74e-01 -0.103 0.116 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 4.06e-01 0.0981 0.118 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 7.01e-01 0.0463 0.12 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0707 0.121 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 1.70e-01 0.161 0.117 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 7.17e-01 0.0409 0.113 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 4.65e-02 0.242 0.121 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0538 0.118 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0393 0.114 0.173 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 6.60e-01 0.0499 0.113 0.173 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 9.13e-01 0.0118 0.108 0.173 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0432 0.114 0.173 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 1.37e-01 -0.17 0.114 0.173 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0499 0.118 0.173 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 6.68e-01 0.0494 0.115 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 2.37e-01 -0.14 0.118 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0915 0.102 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 4.07e-01 0.0948 0.114 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0791 0.119 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 1.40e-01 0.173 0.117 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 4.98e-01 0.0615 0.0906 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0697 0.115 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 9.83e-01 0.00214 0.1 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 9.55e-01 0.00571 0.102 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 2.26e-01 -0.14 0.115 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 8.17e-01 -0.029 0.125 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 4.39e-01 -0.095 0.123 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 8.57e-01 -0.023 0.127 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0101 0.0973 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 7.05e-01 0.0429 0.113 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 9.84e-01 0.00232 0.119 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0675 0.113 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00684 0.0984 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 4.01e-01 0.0934 0.111 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 8.16e-01 -0.024 0.103 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0331 0.105 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 2.71e-01 -0.12 0.109 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 2.08e-01 -0.146 0.116 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 9.59e-01 0.00709 0.137 0.196 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 8.57e-01 0.0259 0.144 0.196 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0389 0.154 0.196 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 3.43e-01 -0.127 0.134 0.196 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 7.66e-01 0.0399 0.134 0.196 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 6.73e-02 0.268 0.145 0.196 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 3.16e-01 0.108 0.107 0.178 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 2.74e-01 -0.12 0.109 0.178 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 7.72e-01 0.0319 0.11 0.178 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 6.09e-02 0.18 0.0952 0.178 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 9.34e-01 0.00803 0.0963 0.178 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0131 0.112 0.178 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 2.52e-01 0.133 0.116 0.175 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0409 0.125 0.175 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 3.88e-01 0.0988 0.114 0.175 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 3.50e-01 -0.109 0.117 0.175 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 3.83e-01 -0.107 0.122 0.175 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 2.73e-02 0.257 0.116 0.175 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0761 0.12 0.156 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 9.41e-01 0.0091 0.122 0.156 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 6.64e-01 0.0522 0.12 0.156 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 1.40e-02 0.254 0.102 0.156 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 2.48e-01 0.153 0.131 0.156 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00596 0.106 0.156 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 3.59e-02 -0.225 0.107 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 8.17e-01 0.0251 0.108 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 3.08e-01 0.116 0.114 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 7.29e-01 0.0277 0.0801 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0951 0.113 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 3.72e-01 -0.106 0.119 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0557 0.12 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0819 0.112 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0814 0.0965 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0534 0.109 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0774 0.128 0.17 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0713 0.136 0.17 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 9.08e-01 0.0154 0.134 0.17 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 3.46e-01 -0.121 0.127 0.17 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 2.34e-01 -0.162 0.135 0.17 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 8.12e-01 0.0318 0.134 0.17 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 1.08e-02 -0.301 0.117 0.173 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 6.95e-01 0.0434 0.111 0.173 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 2.49e-01 -0.13 0.113 0.173 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 8.42e-01 0.0215 0.108 0.173 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0191 0.119 0.173 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0431 0.109 0.174 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 8.13e-01 0.0285 0.12 0.174 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 3.02e-01 0.122 0.118 0.174 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0284 0.11 0.174 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 3.29e-02 -0.245 0.114 0.174 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 3.47e-01 -0.131 0.139 0.153 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 2.42e-01 -0.158 0.135 0.153 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 5.60e-01 0.0808 0.138 0.153 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 7.97e-02 -0.217 0.123 0.153 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 3.18e-01 -0.139 0.139 0.153 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 5.94e-01 0.0658 0.123 0.153 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 6.04e-02 0.209 0.111 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 8.74e-01 0.0195 0.123 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0528 0.107 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 2.24e-01 -0.105 0.0862 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0426 0.114 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 7.80e-01 0.0331 0.118 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 4.64e-01 0.085 0.116 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 8.79e-01 0.0181 0.119 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 4.42e-01 0.0858 0.111 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 9.33e-01 0.0072 0.0851 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 3.76e-01 0.107 0.12 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 6.67e-01 0.0521 0.121 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 1.18e-01 -0.171 0.109 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0116 0.106 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 6.51e-01 0.0485 0.107 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0298 0.074 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 2.92e-01 -0.115 0.109 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 3.28e-02 -0.222 0.103 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 5.42e-01 0.0725 0.119 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0641 0.117 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 2.37e-01 0.118 0.0998 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 6.80e-02 -0.212 0.115 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -152889 sc-eQTL 3.88e-01 0.0766 0.0884 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 72947 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0446 0.106 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 752136 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0089 0.0953 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 656390 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0217 0.0951 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 sc-eQTL 3.32e-01 -0.109 0.112 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 sc-eQTL 3.03e-01 -0.128 0.124 0.175 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116652 DLEU2L -106560 eQTL 0.00666 0.0935 0.0344 0.00192 0.0 0.167
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 eQTL 0.000559 0.134 0.0388 0.00165 0.0 0.167
ENSG00000203965 EFCAB7 -82850 eQTL 7.42e-04 0.108 0.0318 0.0 0.0 0.167

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 \N -152889 5.17e-06 4.6e-06 2.5e-06 2.96e-06 1.64e-06 1.57e-06 6.01e-06 6.05e-07 5.06e-06 2.84e-06 4.38e-06 3.34e-06 7.73e-06 1.36e-06 1.39e-06 2.63e-06 2.06e-06 2.76e-06 1.49e-06 1.8e-06 2.77e-06 4.85e-06 4.7e-06 1.76e-06 6.54e-06 1.62e-06 2.72e-06 1.73e-06 4.47e-06 4.1e-06 1.98e-06 2.49e-07 8.1e-07 2.85e-06 2.04e-06 9.21e-07 7.68e-07 1.84e-06 1.19e-06 3.46e-07 2.14e-07 4.9e-06 1.42e-06 1.61e-07 3.12e-07 1.08e-06 8.02e-07 2.26e-07 3.24e-07
ENSG00000142856 ITGB3BP -153199 5.14e-06 4.55e-06 2.5e-06 2.94e-06 1.62e-06 1.57e-06 6.01e-06 6.18e-07 4.97e-06 2.8e-06 4.32e-06 3.34e-06 7.72e-06 1.36e-06 1.43e-06 2.67e-06 2.06e-06 2.76e-06 1.49e-06 1.8e-06 2.79e-06 4.87e-06 4.73e-06 1.76e-06 6.48e-06 1.62e-06 2.68e-06 1.73e-06 4.4e-06 4.02e-06 1.96e-06 2.49e-07 7.94e-07 2.83e-06 2.04e-06 9.03e-07 7.83e-07 1.84e-06 1.19e-06 3.46e-07 2.29e-07 4.86e-06 1.38e-06 1.61e-07 3.12e-07 1.08e-06 8.02e-07 2.26e-07 3.23e-07