logo

Genes within 1Mb (chr1:63425813:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 2.54e-07 -0.464 0.0871 0.233 B L1
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 8.88e-01 0.0136 0.0962 0.233 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 5.35e-01 0.0597 0.0961 0.233 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 3.08e-01 0.0681 0.0667 0.233 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 1.37e-03 -0.337 0.104 0.233 B L1
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 1.21e-01 -0.143 0.0918 0.233 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0107 0.109 0.233 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 1.35e-02 -0.196 0.0789 0.233 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 8.83e-02 0.15 0.0878 0.233 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 4.66e-01 0.0653 0.0893 0.233 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0187 0.0722 0.233 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 5.79e-02 -0.194 0.102 0.233 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 8.65e-01 -0.012 0.0701 0.233 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 9.53e-01 0.00545 0.092 0.233 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 3.46e-02 -0.185 0.087 0.233 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 5.54e-01 0.0574 0.0968 0.233 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 8.76e-01 0.0153 0.0982 0.233 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 5.86e-01 0.0509 0.0932 0.233 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 2.80e-01 -0.113 0.104 0.233 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0186 0.0812 0.233 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 1.10e-01 0.166 0.103 0.233 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0468 0.0967 0.239 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 4.93e-01 0.0686 0.0998 0.239 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0145 0.102 0.239 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 1.95e-01 -0.104 0.0798 0.239 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 1.05e-02 -0.285 0.11 0.239 DC L1
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 2.43e-01 -0.114 0.0974 0.239 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 7.65e-02 -0.172 0.0967 0.239 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0165 0.0953 0.233 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 4.85e-02 0.196 0.0985 0.233 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 5.36e-01 0.0595 0.0961 0.233 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00408 0.065 0.233 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 2.56e-01 -0.117 0.102 0.233 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0206 0.0844 0.233 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 2.04e-01 -0.104 0.0815 0.234 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0429 0.0959 0.234 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0716 0.0789 0.234 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0267 0.0848 0.234 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 6.16e-01 -0.053 0.105 0.234 NK L1
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0436 0.0942 0.234 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 2.06e-01 0.145 0.114 0.234 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 5.99e-01 0.0486 0.0922 0.233 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 4.06e-01 0.077 0.0925 0.233 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0834 0.0944 0.233 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0677 0.0818 0.233 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 2.94e-01 0.0762 0.0724 0.233 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 5.34e-01 0.0392 0.0629 0.233 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00159 0.112 0.233 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 4.78e-02 -0.239 0.12 0.247 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 4.57e-02 -0.231 0.115 0.247 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0744 0.108 0.247 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 8.65e-01 0.0193 0.114 0.247 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0703 0.111 0.247 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 2.13e-01 0.15 0.12 0.247 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 1.16e-01 0.165 0.104 0.247 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 9.34e-02 -0.184 0.109 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 1.83e-01 0.149 0.111 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00785 0.107 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 1.03e-01 -0.147 0.0898 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 1.18e-01 -0.168 0.107 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0446 0.107 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 6.49e-01 0.0486 0.107 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 4.50e-02 -0.215 0.106 0.231 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 3.30e-01 -0.106 0.109 0.231 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0539 0.102 0.231 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 2.51e-01 0.112 0.097 0.231 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 1.53e-01 -0.159 0.111 0.231 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 5.97e-01 0.0595 0.112 0.231 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00665 0.111 0.231 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 1.28e-05 -0.47 0.105 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00155 0.11 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 6.40e-01 0.0495 0.106 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0553 0.0815 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 6.64e-03 -0.291 0.106 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 1.72e-01 -0.13 0.0947 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 1.07e-01 -0.186 0.115 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 3.15e-03 -0.315 0.105 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0504 0.112 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 9.72e-01 0.00377 0.108 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 2.88e-02 0.226 0.103 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 3.10e-02 -0.242 0.111 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0578 0.107 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 7.53e-01 0.0353 0.112 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 5.65e-01 0.063 0.109 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0255 0.116 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 2.07e-01 -0.128 0.101 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0895 0.104 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0848 0.112 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0784 0.106 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0659 0.106 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 1.17e-01 -0.14 0.0889 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 3.91e-02 0.2 0.0962 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 4.04e-01 0.0797 0.0953 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 9.83e-01 -0.0018 0.0844 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 1.20e-01 -0.16 0.103 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0462 0.0787 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 5.17e-01 0.0664 0.102 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 3.73e-02 -0.193 0.0921 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0364 0.108 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 1.80e-01 0.128 0.0953 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0118 0.0932 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 1.69e-01 -0.151 0.109 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 3.33e-01 0.0873 0.0899 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 6.25e-01 -0.052 0.106 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 1.60e-02 -0.261 0.108 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 8.68e-01 0.0182 0.11 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 4.32e-01 0.084 0.107 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0404 0.104 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0677 0.107 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 7.74e-01 0.0291 0.101 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 8.67e-01 0.0186 0.111 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0279 0.0997 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 5.15e-02 0.206 0.105 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 5.83e-01 0.0553 0.101 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 3.18e-01 -0.107 0.107 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0607 0.111 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0315 0.0998 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 1.43e-01 0.167 0.114 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 4.08e-03 -0.286 0.0984 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 4.86e-01 0.0724 0.104 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 6.83e-01 0.0439 0.107 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 4.15e-01 0.0841 0.103 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0536 0.104 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 6.04e-01 0.0458 0.0882 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0549 0.0984 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 1.38e-01 -0.165 0.111 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 2.35e-01 -0.134 0.113 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 6.90e-01 0.0441 0.11 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 9.66e-01 0.00478 0.113 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 6.60e-02 -0.201 0.109 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 1.27e-01 0.161 0.105 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 4.37e-01 0.087 0.112 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 5.52e-01 0.0668 0.112 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0823 0.112 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 8.47e-01 0.0211 0.109 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0807 0.105 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 2.66e-01 -0.126 0.113 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0742 0.108 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 1.37e-01 0.163 0.109 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 4.25e-01 0.0854 0.107 0.234 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 7.43e-01 0.0348 0.106 0.234 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0361 0.101 0.234 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0306 0.107 0.234 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0213 0.107 0.234 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0377 0.106 0.234 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 2.85e-01 -0.118 0.11 0.234 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0364 0.106 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00829 0.108 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0726 0.0938 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0228 0.105 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 1.09e-01 -0.175 0.109 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 9.05e-01 0.0135 0.113 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 9.13e-01 0.0117 0.108 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0286 0.0852 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0166 0.108 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0674 0.0939 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 3.87e-01 0.0827 0.0954 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 3.32e-01 -0.105 0.108 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0347 0.105 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 2.17e-01 0.145 0.117 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 3.13e-01 -0.117 0.116 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00107 0.121 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 3.44e-01 0.0873 0.0921 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0185 0.107 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0489 0.113 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 6.46e-01 0.0542 0.118 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0527 0.107 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00232 0.0932 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0273 0.105 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00487 0.0976 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 2.79e-01 -0.108 0.0996 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 9.84e-01 0.00206 0.103 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 1.45e-01 -0.158 0.108 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 2.17e-01 0.136 0.11 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0217 0.136 0.23 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 6.91e-01 0.0568 0.142 0.23 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 9.50e-03 0.39 0.148 0.23 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0311 0.133 0.23 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0896 0.132 0.23 PB L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 1.16e-01 0.206 0.131 0.23 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 2.61e-01 -0.163 0.145 0.23 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0538 0.101 0.233 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 6.48e-01 0.0469 0.103 0.233 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0735 0.103 0.233 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 2.43e-01 -0.105 0.0898 0.233 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 6.77e-03 0.243 0.0888 0.233 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 6.79e-01 0.0257 0.0621 0.233 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 6.08e-01 0.0539 0.105 0.233 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0709 0.106 0.233 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0661 0.113 0.233 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0634 0.104 0.233 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 2.08e-01 0.134 0.106 0.233 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 3.58e-02 -0.232 0.11 0.233 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 1.74e-01 -0.146 0.107 0.233 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 1.72e-01 -0.145 0.106 0.233 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0769 0.104 0.249 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 2.04e-01 0.134 0.105 0.249 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0603 0.104 0.249 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 9.70e-02 -0.149 0.0895 0.249 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 1.12e-03 -0.368 0.111 0.249 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0166 0.102 0.249 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0205 0.0918 0.249 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 3.61e-01 0.0908 0.0992 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 4.09e-01 0.0822 0.0994 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 3.58e-01 0.0966 0.105 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 8.82e-01 0.011 0.0738 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0723 0.104 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000631 0.0922 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 3.65e-01 -0.1 0.11 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 2.23e-02 0.254 0.111 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000553 0.104 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0282 0.0898 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 3.71e-02 -0.21 0.1 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 6.34e-01 0.0496 0.104 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0461 0.119 0.233 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 8.68e-01 0.0211 0.126 0.233 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 1.34e-01 -0.186 0.123 0.233 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0218 0.118 0.233 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 3.88e-01 0.109 0.126 0.233 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 7.93e-01 0.0312 0.119 0.233 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0939 0.124 0.233 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0762 0.112 0.238 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 7.30e-01 -0.036 0.104 0.238 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 8.82e-01 0.0158 0.106 0.238 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0873 0.101 0.238 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 6.42e-01 -0.052 0.112 0.238 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0745 0.114 0.238 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 2.63e-01 -0.112 0.0994 0.235 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 5.92e-02 0.206 0.109 0.235 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00832 0.108 0.235 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 5.73e-01 0.0568 0.101 0.235 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 3.01e-01 0.109 0.105 0.235 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 2.12e-01 -0.134 0.107 0.235 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 9.19e-01 0.0118 0.116 0.243 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 5.70e-01 0.0642 0.113 0.243 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 1.33e-01 0.173 0.114 0.243 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 4.09e-01 0.0854 0.103 0.243 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0851 0.116 0.243 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0785 0.118 0.243 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 5.14e-02 -0.199 0.101 0.243 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 2.25e-03 -0.31 0.1 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 6.80e-01 0.0467 0.113 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 8.50e-01 0.0186 0.0982 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0793 0.0792 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 1.53e-02 -0.252 0.103 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0668 0.101 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 2.68e-01 0.12 0.108 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 1.02e-07 -0.553 0.1 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 9.66e-01 0.00469 0.11 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 8.02e-01 0.0259 0.103 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 2.55e-01 0.0895 0.0785 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 4.71e-04 -0.384 0.108 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 1.69e-01 -0.131 0.0952 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 1.86e-01 -0.148 0.111 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 7.74e-01 0.0293 0.102 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 4.42e-02 0.198 0.0977 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 4.45e-01 0.0758 0.0992 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 9.70e-01 -0.0026 0.0686 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 9.51e-02 -0.169 0.101 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 7.54e-01 0.0273 0.0867 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 1.85e-01 -0.128 0.0962 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 3.32e-01 0.106 0.109 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 4.63e-01 0.0797 0.108 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00366 0.0925 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 3.43e-01 0.102 0.107 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0826 0.101 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -167598 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0715 0.0831 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 58238 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0362 0.1 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 737427 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0561 0.0895 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 641681 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0379 0.0894 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0436 0.106 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 989516 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0972 0.096 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -97559 sc-eQTL 2.64e-01 0.131 0.117 0.235 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 -167598 eQTL 3.98e-17 -0.175 0.0204 0.00113 0.0 0.221
ENSG00000088035 ALG6 58238 eQTL 0.0213 0.0362 0.0157 0.0 0.0 0.221
ENSG00000116641 DOCK7 737445 eQTL 0.0027 0.0785 0.0261 0.00379 0.00107 0.221
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 eQTL 3.05e-42 -0.451 0.0315 0.0101 0.00791 0.221
ENSG00000185483 ROR1 -348204 pQTL 0.0312 -0.0346 0.016 0.0 0.0 0.224

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 PGM1 -167598 4.54e-06 4.88e-06 1.35e-06 3.1e-06 1.73e-06 1.5e-06 5.71e-06 1.68e-06 4.66e-06 3.25e-06 6.19e-06 2.98e-06 7.48e-06 1.95e-06 9.55e-07 4.58e-06 2.24e-06 3.87e-06 2.28e-06 2.23e-06 3.04e-06 6.14e-06 4.68e-06 1.92e-06 6.72e-06 2.81e-06 3.62e-06 1.75e-06 5.11e-06 4.33e-06 2.83e-06 9.46e-07 6.67e-07 2.83e-06 2.06e-06 2.07e-06 1.67e-06 8.34e-07 1.36e-06 8.19e-07 9.92e-07 5.7e-06 6.91e-07 1.59e-07 7.64e-07 8.66e-07 9.95e-07 8.03e-07 4.72e-07
ENSG00000088035 ALG6 58238 1.08e-05 1.3e-05 3.99e-06 9.47e-06 3.7e-06 6.86e-06 1.95e-05 3.8e-06 1.64e-05 8.01e-06 1.85e-05 8e-06 2.5e-05 5.4e-06 4.93e-06 1.01e-05 8.27e-06 1.32e-05 6.56e-06 5.17e-06 8.59e-06 1.5e-05 1.47e-05 6.86e-06 2.4e-05 6.16e-06 8.33e-06 6.3e-06 1.69e-05 1.36e-05 1.01e-05 1.62e-06 2.24e-06 7.41e-06 7.35e-06 4.91e-06 3.7e-06 2.97e-06 4.24e-06 3.13e-06 1.82e-06 1.61e-05 2.6e-06 5.86e-07 2.67e-06 3.23e-06 3.71e-06 1.72e-06 1.56e-06
ENSG00000125703 \N 641681 8.85e-07 4.97e-07 2.41e-07 3.58e-07 1.12e-07 2.63e-07 5.8e-07 2.65e-07 6.71e-07 3.17e-07 7.67e-07 5.22e-07 7.19e-07 1.6e-07 2.96e-07 3.57e-07 5.34e-07 4.22e-07 3.74e-07 2.27e-07 2.29e-07 5.18e-07 4.13e-07 2.19e-07 7.01e-07 2.44e-07 4.62e-07 2.7e-07 4.39e-07 5.28e-07 2.73e-07 4.03e-08 4.57e-08 2.17e-07 3e-07 3.32e-07 2.04e-07 1.21e-07 7.5e-08 2.74e-08 1.01e-07 3.55e-07 5.03e-08 1.43e-08 1.23e-07 1.52e-08 1.37e-07 7.28e-08 5.25e-08
ENSG00000142856 ITGB3BP -167908 4.54e-06 4.99e-06 1.35e-06 3.1e-06 1.72e-06 1.56e-06 5.71e-06 1.64e-06 4.66e-06 3.29e-06 6.19e-06 2.98e-06 7.66e-06 1.94e-06 9.37e-07 4.58e-06 2.24e-06 3.87e-06 2.28e-06 2.16e-06 3.08e-06 6.14e-06 4.69e-06 1.95e-06 6.72e-06 2.81e-06 3.64e-06 1.75e-06 5.1e-06 4.29e-06 2.83e-06 9.46e-07 7.03e-07 2.83e-06 2.06e-06 2.12e-06 1.72e-06 8.34e-07 1.36e-06 8.21e-07 1.01e-06 5.7e-06 6.74e-07 1.59e-07 7.51e-07 8.35e-07 9.95e-07 8.03e-07 4.72e-07
ENSG00000203965 \N -97559 7.77e-06 9.51e-06 2.47e-06 5.59e-06 2.39e-06 4.24e-06 1.03e-05 2.53e-06 9.81e-06 5.4e-06 1.2e-05 5.76e-06 1.36e-05 3.84e-06 3.01e-06 6.75e-06 4.92e-06 7.72e-06 3.56e-06 3.23e-06 6.52e-06 1.03e-05 8.25e-06 3.91e-06 1.29e-05 4.86e-06 6.97e-06 3.99e-06 1.1e-05 7.87e-06 5.42e-06 1.2e-06 1.32e-06 4.3e-06 4.76e-06 3.41e-06 2.27e-06 2.02e-06 2.26e-06 1.57e-06 1.67e-06 1.03e-05 1.57e-06 3.73e-07 1.76e-06 2.15e-06 2.21e-06 1.3e-06 1.23e-06