logo

Genes within 1Mb (chr1:63395366:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 3.20e-07 -0.461 0.0873 0.231 B L1
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 9.92e-01 0.000973 0.0963 0.231 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 5.77e-01 0.0537 0.0962 0.231 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 3.20e-01 0.0666 0.0668 0.231 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 6.23e-04 -0.36 0.104 0.231 B L1
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 1.27e-01 -0.141 0.0919 0.231 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0384 0.109 0.231 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 1.08e-02 -0.203 0.079 0.231 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 8.74e-02 0.151 0.0879 0.231 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 4.17e-01 0.0727 0.0895 0.231 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0147 0.0723 0.231 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 4.32e-02 -0.207 0.102 0.231 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00694 0.0702 0.231 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 8.93e-01 0.0124 0.0922 0.231 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 4.16e-02 -0.179 0.0872 0.231 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 6.63e-01 0.0423 0.097 0.231 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 8.93e-01 0.0132 0.0983 0.231 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 5.85e-01 0.0511 0.0934 0.231 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 2.34e-01 -0.124 0.104 0.231 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0217 0.0814 0.231 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 1.17e-01 0.163 0.104 0.231 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 5.50e-01 -0.058 0.0968 0.236 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 4.87e-01 0.0695 0.0999 0.236 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0326 0.102 0.236 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 1.42e-01 -0.118 0.0798 0.236 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 6.13e-03 -0.305 0.11 0.236 DC L1
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 2.27e-01 -0.118 0.0975 0.236 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 5.00e-02 -0.191 0.0966 0.236 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0238 0.0955 0.231 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 4.93e-02 0.195 0.0987 0.231 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 4.95e-01 0.0659 0.0962 0.231 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 9.33e-01 0.0055 0.0651 0.231 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 2.13e-01 -0.128 0.103 0.231 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00964 0.0845 0.231 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0987 0.0815 0.232 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0538 0.0958 0.232 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0701 0.0788 0.232 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0167 0.0848 0.232 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0714 0.105 0.232 NK L1
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0481 0.0942 0.232 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 2.43e-01 0.133 0.114 0.232 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 7.34e-01 0.0313 0.0921 0.231 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 3.91e-01 0.0794 0.0924 0.231 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0875 0.0943 0.231 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0744 0.0817 0.231 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 3.53e-01 0.0674 0.0724 0.231 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 5.91e-01 0.0339 0.0628 0.231 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 8.93e-01 0.0151 0.112 0.231 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 3.54e-02 -0.254 0.12 0.245 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 5.88e-02 -0.219 0.115 0.245 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0658 0.108 0.245 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 8.50e-01 0.0216 0.114 0.245 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0817 0.111 0.245 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 3.05e-01 0.124 0.12 0.245 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 8.59e-02 0.181 0.105 0.245 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 8.63e-02 -0.189 0.11 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 2.17e-01 0.138 0.112 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 9.89e-01 0.00146 0.107 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 1.32e-01 -0.136 0.0901 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 1.03e-01 -0.176 0.107 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0416 0.108 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 7.81e-01 0.0298 0.107 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 5.39e-02 -0.206 0.107 0.228 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 2.16e-01 -0.135 0.109 0.228 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0642 0.102 0.228 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 2.67e-01 0.108 0.0971 0.228 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 1.30e-01 -0.169 0.111 0.228 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 5.27e-01 0.0711 0.112 0.228 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 8.49e-01 -0.021 0.111 0.228 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 2.79e-05 -0.453 0.106 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 9.84e-01 0.00217 0.111 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 6.97e-01 0.0414 0.106 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 4.40e-01 -0.063 0.0815 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 3.76e-03 -0.311 0.106 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 1.34e-01 -0.143 0.0947 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 1.17e-01 -0.181 0.115 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 2.37e-03 -0.324 0.105 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0479 0.112 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00661 0.108 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 3.25e-02 0.221 0.103 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 2.07e-02 -0.259 0.111 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0512 0.107 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 8.88e-01 0.0159 0.112 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 7.56e-01 0.0341 0.11 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0564 0.116 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 2.59e-01 -0.114 0.101 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0829 0.105 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0687 0.112 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0655 0.107 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 6.32e-01 -0.051 0.106 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 1.03e-01 -0.146 0.089 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 3.67e-02 0.202 0.0962 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 3.25e-01 0.094 0.0954 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 9.93e-01 0.00077 0.0845 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 9.67e-02 -0.171 0.103 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0428 0.0788 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 4.69e-01 0.0742 0.102 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 3.42e-02 -0.197 0.0922 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0556 0.108 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 2.04e-01 0.122 0.0956 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0107 0.0934 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 1.27e-01 -0.168 0.109 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 3.51e-01 0.0843 0.0901 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0497 0.106 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 1.15e-02 -0.274 0.108 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 7.20e-01 0.0393 0.11 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 4.27e-01 0.0851 0.107 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0265 0.104 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0639 0.107 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 8.74e-01 0.0162 0.102 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 9.53e-01 0.00655 0.111 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0228 0.1 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 4.39e-02 0.214 0.105 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 5.62e-01 0.0587 0.101 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0971 0.107 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0602 0.112 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0219 0.1 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 1.43e-01 0.167 0.114 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 5.11e-03 -0.279 0.0987 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 5.50e-01 0.0622 0.104 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 7.13e-01 0.0396 0.108 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 4.27e-01 0.082 0.103 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0649 0.104 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 6.50e-01 0.0401 0.0884 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0546 0.0985 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 1.25e-01 -0.172 0.111 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 1.89e-01 -0.149 0.113 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 7.02e-01 0.0424 0.111 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 9.88e-01 0.00177 0.113 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 8.36e-02 -0.19 0.109 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 1.19e-01 0.165 0.105 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 5.37e-01 0.0692 0.112 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 6.79e-01 0.0465 0.112 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0912 0.112 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 8.39e-01 0.0221 0.109 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0645 0.105 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 3.22e-01 -0.112 0.113 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0701 0.108 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 1.57e-01 0.155 0.109 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 5.15e-01 0.0698 0.107 0.232 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 7.88e-01 0.0285 0.106 0.232 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0482 0.102 0.232 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0355 0.107 0.232 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0246 0.107 0.232 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0485 0.106 0.232 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 3.49e-01 -0.104 0.11 0.232 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0323 0.106 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0175 0.108 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0772 0.0937 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0215 0.105 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 8.36e-02 -0.188 0.108 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00206 0.113 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000192 0.108 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0283 0.0852 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0328 0.108 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0652 0.0939 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 3.49e-01 0.0894 0.0953 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 2.95e-01 -0.114 0.108 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0308 0.105 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 2.48e-01 0.136 0.117 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 2.48e-01 -0.134 0.116 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0107 0.12 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 3.43e-01 0.0873 0.0918 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00199 0.107 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0572 0.112 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 7.86e-01 0.0319 0.118 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0596 0.107 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 9.51e-01 0.00568 0.0932 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0249 0.105 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 1.00e+00 4e-05 0.0976 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0993 0.0996 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0129 0.103 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 1.49e-01 -0.157 0.108 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 1.94e-01 0.143 0.11 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00366 0.136 0.226 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 4.81e-01 0.101 0.143 0.226 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 1.46e-02 0.369 0.149 0.226 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00698 0.133 0.226 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 3.81e-01 -0.117 0.133 0.226 PB L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 4.09e-02 0.269 0.13 0.226 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 2.27e-01 -0.176 0.145 0.226 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 5.25e-01 -0.064 0.101 0.23 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 5.95e-01 0.0546 0.102 0.23 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0618 0.103 0.23 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 2.34e-01 -0.107 0.0897 0.23 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 7.91e-03 0.238 0.0888 0.23 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 6.38e-01 0.0292 0.0621 0.23 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 5.69e-01 0.0597 0.105 0.23 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0753 0.106 0.231 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 6.60e-01 -0.05 0.113 0.231 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0803 0.104 0.231 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 1.77e-01 0.143 0.106 0.231 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 3.95e-02 -0.228 0.11 0.231 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 2.75e-01 -0.118 0.107 0.231 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 2.28e-01 -0.128 0.106 0.231 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0739 0.104 0.246 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 2.37e-01 0.125 0.106 0.246 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0777 0.104 0.246 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 1.02e-01 -0.147 0.0896 0.246 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 5.15e-04 -0.391 0.111 0.246 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0345 0.102 0.246 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 6.02e-01 -0.048 0.0919 0.246 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 3.64e-01 0.0904 0.0993 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 3.80e-01 0.0874 0.0994 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 3.91e-01 0.0901 0.105 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 7.45e-01 0.0241 0.0738 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0908 0.104 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 9.92e-01 0.000909 0.0923 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 3.45e-01 -0.104 0.11 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 2.40e-02 0.252 0.111 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 8.26e-01 0.0229 0.104 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0337 0.0899 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 4.65e-02 -0.201 0.101 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 6.47e-01 0.0479 0.104 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0546 0.119 0.23 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 7.22e-01 0.0451 0.126 0.23 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 1.89e-01 -0.163 0.123 0.23 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0397 0.119 0.23 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 2.67e-01 0.14 0.125 0.23 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 1.00e+00 2.03e-05 0.119 0.23 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 5.89e-01 -0.067 0.124 0.23 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0805 0.112 0.236 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0481 0.104 0.236 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 8.61e-01 0.0187 0.107 0.236 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0808 0.102 0.236 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0597 0.112 0.236 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0586 0.114 0.236 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 2.56e-01 -0.113 0.0995 0.233 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 6.25e-02 0.204 0.109 0.233 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00453 0.108 0.233 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 5.16e-01 0.0656 0.101 0.233 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 3.20e-01 0.105 0.105 0.233 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 2.63e-01 -0.121 0.107 0.233 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0205 0.116 0.24 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 4.78e-01 0.0802 0.113 0.24 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 1.74e-01 0.157 0.115 0.24 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 6.48e-01 0.0473 0.103 0.24 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0965 0.116 0.24 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0731 0.118 0.24 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 6.42e-02 -0.19 0.102 0.24 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 2.22e-03 -0.311 0.1 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 8.25e-01 0.0251 0.113 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 7.75e-01 0.0282 0.0984 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0704 0.0794 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 1.07e-02 -0.265 0.103 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0627 0.101 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 3.75e-01 0.0968 0.109 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 1.45e-07 -0.548 0.101 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 9.36e-01 0.00888 0.111 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 8.89e-01 0.0144 0.103 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 2.96e-01 0.0824 0.0786 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 2.01e-04 -0.408 0.108 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 1.51e-01 -0.137 0.0953 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 1.60e-01 -0.157 0.112 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 7.86e-01 0.0277 0.102 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 4.17e-02 0.2 0.0977 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 4.27e-01 0.0789 0.0993 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 9.50e-01 0.0043 0.0687 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 7.47e-02 -0.181 0.101 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 7.52e-01 0.0274 0.0868 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 1.76e-01 -0.131 0.0963 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 3.57e-01 0.101 0.11 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 4.35e-01 0.0849 0.109 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 9.67e-01 0.00389 0.0927 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 3.83e-01 0.0939 0.107 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0662 0.101 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -198045 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0693 0.0831 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 27791 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0454 0.0999 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 706980 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0529 0.0895 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 611234 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0268 0.0894 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 sc-eQTL 5.71e-01 -0.06 0.106 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 959069 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0977 0.0959 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -128006 sc-eQTL 2.85e-01 0.125 0.117 0.233 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 -198045 eQTL 8.2e-16 -0.169 0.0206 0.0 0.0 0.222
ENSG00000088035 ALG6 27791 eQTL 0.0194 0.0369 0.0158 0.0 0.0 0.222
ENSG00000116641 DOCK7 706998 eQTL 0.00321 0.0776 0.0263 0.00283 0.0 0.222
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 eQTL 9.01e-42 -0.451 0.0317 0.00723 0.00601 0.222
ENSG00000185483 ROR1 -378651 pQTL 0.029 -0.0351 0.0161 0.0 0.0 0.224

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 PGM1 -198045 2.08e-06 2.43e-06 3.2e-07 1.71e-06 4.63e-07 7.82e-07 1.29e-06 6.48e-07 1.74e-06 8.51e-07 1.99e-06 1.38e-06 3.35e-06 1.1e-06 5.5e-07 1.38e-06 9.79e-07 1.85e-06 8.58e-07 1.15e-06 1.11e-06 2.44e-06 2e-06 1.03e-06 2.73e-06 1.36e-06 1.21e-06 1.38e-06 1.87e-06 1.66e-06 1.18e-06 3.41e-07 5.03e-07 1.24e-06 1.07e-06 9.46e-07 8.07e-07 4.39e-07 1.09e-06 3.78e-07 2.11e-07 2.89e-06 5.55e-07 1.99e-07 2.73e-07 3.35e-07 7.4e-07 2.21e-07 1.66e-07
ENSG00000088035 ALG6 27791 1.23e-05 1.33e-05 2.86e-06 8.36e-06 2.79e-06 6.33e-06 1.91e-05 2.45e-06 1.39e-05 6.78e-06 1.79e-05 6.75e-06 2.49e-05 5.28e-06 4.38e-06 9.02e-06 8.15e-06 1.22e-05 4.54e-06 4.13e-06 7.43e-06 1.3e-05 1.36e-05 5.15e-06 2.42e-05 5.34e-06 7.57e-06 5.86e-06 1.61e-05 1.69e-05 9.4e-06 1.25e-06 1.79e-06 5.08e-06 6.28e-06 4.2e-06 2.27e-06 2.73e-06 3.33e-06 2.44e-06 1.67e-06 1.73e-05 2.34e-06 3.62e-07 1.93e-06 2.47e-06 2.56e-06 1.27e-06 1.08e-06
ENSG00000125703 \N 611234 3.71e-07 1.83e-07 6.99e-08 2.43e-07 1.02e-07 1.25e-07 2.74e-07 8.11e-08 1.96e-07 1.21e-07 2.04e-07 1.57e-07 2.94e-07 8.54e-08 6.93e-08 1.1e-07 8.42e-08 2.43e-07 8.68e-08 8.52e-08 1.39e-07 2.06e-07 1.89e-07 4.81e-08 2.48e-07 1.86e-07 1.37e-07 1.44e-07 1.44e-07 1.81e-07 1.35e-07 5.3e-08 5.09e-08 9.61e-08 1.07e-07 5.04e-08 6.48e-08 6.31e-08 4.74e-08 8.61e-08 4.84e-08 1.64e-07 2.94e-08 7.3e-09 5.49e-08 8.24e-09 9.12e-08 0.0 4.66e-08
ENSG00000142856 ITGB3BP -198355 2.04e-06 2.43e-06 3.2e-07 1.71e-06 4.76e-07 8.1e-07 1.3e-06 6.3e-07 1.68e-06 8.51e-07 1.96e-06 1.38e-06 3.33e-06 1.04e-06 5.48e-07 1.38e-06 9.77e-07 1.85e-06 8.58e-07 1.15e-06 1.11e-06 2.43e-06 2e-06 1.03e-06 2.73e-06 1.36e-06 1.21e-06 1.38e-06 1.87e-06 1.66e-06 1.15e-06 3.41e-07 5.2e-07 1.24e-06 1.07e-06 9.27e-07 8.07e-07 4.39e-07 1.09e-06 3.78e-07 2.11e-07 2.9e-06 5.37e-07 1.99e-07 2.87e-07 3.34e-07 7.4e-07 2.21e-07 1.66e-07
ENSG00000203965 \N -128006 4.36e-06 4.68e-06 8.36e-07 2.42e-06 1.47e-06 1.33e-06 3.33e-06 9.23e-07 4.53e-06 2.22e-06 4.38e-06 3.41e-06 7.44e-06 2.15e-06 1.43e-06 3.05e-06 2e-06 3.05e-06 1.41e-06 1.04e-06 2.98e-06 4.53e-06 3.52e-06 1.43e-06 5.12e-06 1.81e-06 2.66e-06 1.78e-06 4.24e-06 4.15e-06 2.23e-06 5.41e-07 4.68e-07 1.52e-06 2.09e-06 1.02e-06 1e-06 4.58e-07 9.24e-07 4.55e-07 7.52e-07 5.14e-06 4.01e-07 1.58e-07 6.09e-07 7.61e-07 1.03e-06 5.51e-07 4.23e-07