logo

Genes within 1Mb (chr1:63387742:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 4.04e-02 0.217 0.105 0.141 B L1
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 3.11e-01 -0.111 0.11 0.141 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 7.05e-01 0.0416 0.11 0.141 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 7.62e-01 0.0232 0.0765 0.141 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 4.58e-21 1.04 0.0986 0.141 B L1
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 6.94e-01 0.0416 0.106 0.141 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 4.93e-05 0.497 0.12 0.141 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 3.38e-01 0.0884 0.0921 0.141 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 1.04e-01 -0.165 0.101 0.141 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 6.63e-01 0.0449 0.103 0.141 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 5.88e-01 0.0452 0.0832 0.141 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 1.25e-31 1.19 0.0854 0.141 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 5.55e-03 0.222 0.0793 0.141 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 1.76e-03 0.329 0.104 0.141 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 4.83e-01 0.0709 0.101 0.141 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 9.38e-01 0.00865 0.111 0.141 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0864 0.113 0.141 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 3.19e-01 -0.107 0.107 0.141 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 1.79e-20 1.01 0.0977 0.141 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 1.97e-01 0.12 0.093 0.141 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 1.48e-05 0.507 0.114 0.141 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 5.05e-01 0.0751 0.112 0.149 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0528 0.116 0.149 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 7.69e-01 0.0349 0.119 0.149 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 4.55e-01 0.0696 0.093 0.149 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 1.22e-04 0.492 0.125 0.149 DC L1
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 4.69e-01 0.0824 0.113 0.149 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 6.17e-03 0.308 0.111 0.149 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 2.11e-01 0.138 0.11 0.141 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 2.92e-03 -0.34 0.113 0.141 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 8.08e-02 0.194 0.111 0.141 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0184 0.0754 0.141 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 7.50e-14 0.836 0.104 0.141 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0166 0.0978 0.141 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0921 0.0928 0.142 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 4.25e-01 -0.087 0.109 0.142 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 8.40e-01 0.0182 0.0898 0.142 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 1.23e-01 0.149 0.0959 0.142 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 1.03e-10 0.739 0.109 0.142 NK L1
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000401 0.107 0.142 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0106 0.13 0.142 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 3.22e-01 0.105 0.105 0.141 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0319 0.106 0.141 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 9.01e-01 0.0135 0.108 0.141 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 4.78e-02 -0.185 0.093 0.141 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 9.60e-02 0.138 0.0827 0.141 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0471 0.0721 0.141 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 9.92e-02 0.211 0.128 0.141 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0235 0.142 0.13 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 9.47e-01 -0.009 0.136 0.13 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0264 0.127 0.13 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0674 0.133 0.13 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 4.17e-03 0.369 0.127 0.13 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0861 0.141 0.13 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 7.32e-01 0.0423 0.123 0.13 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 8.52e-01 0.0237 0.127 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 6.66e-01 0.0557 0.129 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 8.76e-01 0.0193 0.123 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0584 0.104 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 1.90e-05 0.521 0.119 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0248 0.124 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 1.97e-03 0.377 0.12 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 3.38e-01 0.12 0.125 0.142 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 4.14e-01 -0.104 0.127 0.142 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 1.86e-01 0.157 0.119 0.142 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 6.06e-01 0.0585 0.113 0.142 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 6.64e-04 0.435 0.126 0.142 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 4.75e-01 0.0935 0.131 0.142 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 9.43e-03 0.332 0.127 0.142 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 2.89e-01 0.135 0.127 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0674 0.127 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 1.86e-01 -0.161 0.122 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 8.34e-01 0.0197 0.0941 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 2.13e-13 0.862 0.11 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 3.38e-01 0.105 0.11 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 3.72e-03 0.383 0.131 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 7.14e-03 0.34 0.125 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 2.91e-01 -0.14 0.132 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 9.26e-01 0.0119 0.127 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0983 0.123 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 6.42e-14 0.935 0.116 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 7.78e-01 0.0357 0.127 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0504 0.132 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 9.29e-01 0.0116 0.129 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 1.03e-01 0.222 0.136 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0393 0.119 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 1.35e-01 -0.184 0.123 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 9.68e-02 0.219 0.131 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 2.51e-01 0.144 0.125 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 5.56e-01 0.0738 0.125 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 4.92e-01 0.0713 0.104 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 2.99e-02 -0.243 0.111 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 7.29e-01 0.0383 0.111 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 3.26e-01 0.096 0.0976 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 1.04e-22 1.05 0.0951 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 4.16e-02 0.185 0.0904 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 3.64e-02 0.247 0.117 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 1.97e-01 0.137 0.106 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 4.56e-01 0.0923 0.124 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 5.16e-01 0.0712 0.11 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 1.08e-01 0.171 0.106 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 7.22e-18 0.996 0.106 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 4.59e-02 0.205 0.102 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 2.32e-03 0.367 0.119 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 9.02e-01 0.0154 0.126 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 1.38e-01 -0.187 0.126 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0356 0.123 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 1.95e-01 -0.155 0.119 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 3.36e-06 0.56 0.117 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 5.00e-02 0.228 0.116 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 7.37e-01 0.0431 0.128 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0578 0.116 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0876 0.123 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0415 0.117 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0507 0.125 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 6.97e-08 0.676 0.121 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 2.14e-01 0.144 0.116 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 2.81e-02 0.29 0.131 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 7.86e-01 0.0317 0.117 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 5.12e-01 0.0792 0.121 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0276 0.125 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 8.91e-01 0.0164 0.12 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 4.66e-13 0.827 0.107 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 3.12e-01 0.104 0.102 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 1.51e-03 0.359 0.112 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0489 0.126 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 3.11e-01 0.129 0.127 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 8.58e-01 0.0222 0.124 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 7.79e-01 0.0356 0.127 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 1.68e-05 0.519 0.118 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 7.59e-01 0.0365 0.119 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 4.03e-01 0.105 0.125 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 3.85e-01 0.111 0.128 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 9.27e-01 0.0118 0.129 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0497 0.125 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 4.69e-02 -0.237 0.119 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 1.21e-02 0.323 0.128 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 1.95e-01 -0.16 0.123 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 3.13e-01 0.127 0.125 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 6.17e-01 0.0617 0.123 0.143 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 6.95e-01 0.0479 0.122 0.143 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 3.31e-01 -0.114 0.117 0.143 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 2.52e-01 -0.141 0.123 0.143 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 8.61e-05 0.477 0.119 0.143 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 4.01e-01 0.103 0.122 0.143 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 4.83e-01 0.0893 0.127 0.143 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0438 0.124 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 2.18e-01 -0.157 0.127 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 7.93e-01 -0.029 0.11 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0123 0.123 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 2.01e-03 0.392 0.125 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 6.00e-01 0.0695 0.132 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0206 0.127 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 1.03e-01 -0.158 0.0963 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 8.60e-01 0.0217 0.123 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 5.40e-01 0.0656 0.107 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 4.78e-03 0.304 0.107 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 1.20e-04 0.468 0.119 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 3.27e-01 -0.118 0.12 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0782 0.133 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 2.86e-02 0.289 0.131 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 3.65e-01 -0.125 0.137 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0328 0.105 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 1.66e-01 -0.17 0.122 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 3.19e-03 0.376 0.126 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 2.11e-01 -0.168 0.134 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0447 0.122 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0995 0.107 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 3.51e-01 -0.113 0.121 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0459 0.112 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00994 0.115 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 4.90e-07 0.582 0.112 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 5.60e-01 0.073 0.125 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0435 0.127 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 3.49e-02 0.34 0.159 0.126 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 3.00e-01 -0.177 0.17 0.126 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 8.29e-01 0.0396 0.182 0.126 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 9.00e-01 0.0201 0.159 0.126 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 5.44e-03 0.435 0.153 0.126 PB L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 4.69e-01 -0.115 0.158 0.126 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 1.28e-01 0.264 0.172 0.126 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 2.50e-01 0.133 0.115 0.139 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 9.53e-01 0.00699 0.118 0.139 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 2.53e-02 0.263 0.117 0.139 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 5.05e-01 0.0689 0.103 0.139 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 1.61e-04 -0.385 0.1 0.139 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0622 0.0712 0.139 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 2.44e-01 -0.14 0.12 0.139 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 7.21e-01 0.0433 0.121 0.141 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 3.46e-01 -0.122 0.129 0.141 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0432 0.119 0.141 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 1.19e-01 -0.189 0.121 0.141 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 2.74e-03 0.377 0.124 0.141 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 9.54e-01 0.00705 0.123 0.141 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0428 0.121 0.141 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 4.86e-01 0.084 0.12 0.149 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0248 0.122 0.149 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0356 0.12 0.149 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00759 0.104 0.149 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 8.07e-03 0.347 0.13 0.149 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 3.16e-01 0.118 0.117 0.149 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 1.14e-01 0.167 0.105 0.149 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 3.93e-01 0.0982 0.115 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 2.05e-01 -0.146 0.115 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 4.08e-01 0.1 0.121 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 8.50e-01 0.0161 0.0853 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 8.09e-09 0.671 0.112 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0369 0.107 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 1.77e-01 0.173 0.128 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 4.82e-02 -0.256 0.129 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 3.81e-01 0.106 0.12 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0868 0.104 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 5.22e-05 0.468 0.113 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 5.73e-01 0.0684 0.121 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 6.07e-01 0.0772 0.15 0.133 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 2.20e-01 0.196 0.159 0.133 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0541 0.157 0.133 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 3.69e-01 0.134 0.149 0.133 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 9.46e-02 0.265 0.157 0.133 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 5.18e-01 0.0974 0.15 0.133 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 4.88e-01 0.109 0.156 0.133 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 8.43e-01 0.0259 0.131 0.14 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 2.89e-01 -0.129 0.122 0.14 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 6.46e-01 0.0572 0.124 0.14 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00802 0.119 0.14 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 1.30e-05 0.558 0.125 0.14 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 4.38e-01 0.103 0.133 0.14 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 1.45e-01 0.17 0.116 0.138 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 2.57e-01 -0.146 0.128 0.138 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 2.44e-01 0.147 0.126 0.138 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000511 0.118 0.138 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 5.01e-03 0.344 0.121 0.138 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 6.94e-01 0.0497 0.126 0.138 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 3.78e-01 0.118 0.133 0.153 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0468 0.13 0.153 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 8.31e-01 0.0284 0.133 0.153 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 4.48e-01 0.0906 0.119 0.153 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 8.97e-02 0.226 0.133 0.153 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0623 0.136 0.153 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 4.36e-02 0.238 0.117 0.153 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 5.95e-01 0.0634 0.119 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 7.79e-01 -0.037 0.132 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 5.83e-01 0.0629 0.114 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 8.10e-01 0.0222 0.0924 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 5.75e-09 0.681 0.112 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 8.34e-01 0.0247 0.118 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 1.41e-04 0.474 0.122 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 1.05e-02 0.316 0.122 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 2.51e-01 -0.147 0.127 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0701 0.119 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 8.41e-01 0.0183 0.0911 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 1.50e-19 1.06 0.106 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 5.11e-01 0.0728 0.111 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 2.76e-02 0.284 0.128 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 3.34e-01 0.114 0.118 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 3.65e-02 -0.238 0.113 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 1.21e-01 0.178 0.114 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0349 0.0795 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 7.62e-11 0.729 0.106 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 8.54e-01 0.0185 0.1 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 2.54e-01 0.129 0.113 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 3.04e-02 -0.278 0.128 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 3.68e-01 0.115 0.127 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0377 0.109 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 6.16e-06 0.558 0.12 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 5.99e-01 0.0625 0.119 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -205669 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0785 0.0943 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 20167 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0533 0.113 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 699356 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00166 0.102 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 603610 sc-eQTL 1.35e-01 0.152 0.101 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 sc-eQTL 5.16e-09 0.675 0.111 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 951445 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0472 0.109 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -135630 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0238 0.133 0.14 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000088035 ALG6 20167 eQTL 2.15e-11 -0.123 0.0181 0.0018 0.00252 0.158
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 eQTL 1.34e-28 0.44 0.0384 0.0122 0.846 0.158
ENSG00000230798 FOXD3-AS1 63301 eQTL 0.00228 -0.111 0.0362 0.00298 0.00258 0.158

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000088035 ALG6 20167 2.02e-05 2.67e-05 4.28e-06 1.34e-05 4.07e-06 1.13e-05 3.25e-05 3.82e-06 2.24e-05 1.22e-05 3.13e-05 1.16e-05 4.19e-05 1.08e-05 5.98e-06 1.24e-05 1.31e-05 1.79e-05 6.96e-06 5.57e-06 1.15e-05 2.43e-05 2.34e-05 7.18e-06 3.59e-05 5.99e-06 9.99e-06 9.67e-06 2.5e-05 2.1e-05 1.61e-05 1.56e-06 2.41e-06 5.65e-06 9.4e-06 4.56e-06 2.76e-06 3.05e-06 3.81e-06 3.04e-06 1.63e-06 3.1e-05 2.67e-06 3.59e-07 2.05e-06 3.47e-06 3.62e-06 1.44e-06 1.37e-06
ENSG00000142856 ITGB3BP -205979 3.53e-06 4.65e-06 6.52e-07 1.8e-06 1.2e-06 1.01e-06 2.5e-06 1.01e-06 3.32e-06 1.94e-06 4.16e-06 2.51e-06 6.37e-06 1.64e-06 1.3e-06 2.28e-06 2e-06 2.12e-06 1.33e-06 1.01e-06 2.35e-06 4.1e-06 3.37e-06 1.8e-06 4.77e-06 1.32e-06 2.15e-06 1.84e-06 3.76e-06 3.32e-06 1.98e-06 4.73e-07 7.51e-07 1.45e-06 1.98e-06 9.01e-07 9.14e-07 4.6e-07 1.32e-06 3.98e-07 2.79e-07 4.88e-06 3.78e-07 1.58e-07 4.13e-07 6.75e-07 7.44e-07 2.72e-07 3.35e-07
ENSG00000230798 FOXD3-AS1 63301 1e-05 1.25e-05 1.88e-06 6.9e-06 2.44e-06 5.26e-06 1.33e-05 2.13e-06 1.07e-05 6.13e-06 1.58e-05 6.09e-06 2.06e-05 4.27e-06 3.71e-06 6.75e-06 6.4e-06 8.19e-06 3.52e-06 3.14e-06 6.79e-06 1.15e-05 1.02e-05 3.4e-06 1.97e-05 4.43e-06 6.66e-06 5.24e-06 1.3e-05 1.03e-05 7.65e-06 1.06e-06 1.23e-06 3.39e-06 5.17e-06 2.68e-06 1.79e-06 2.11e-06 2.17e-06 1.27e-06 9.34e-07 1.57e-05 1.57e-06 2.03e-07 7.68e-07 2.2e-06 1.8e-06 7.2e-07 4.53e-07