logo

Genes within 1Mb (chr1:63382745:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 1.48e-01 0.136 0.0937 0.184 B L1
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 7.70e-01 0.0286 0.0976 0.184 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0797 0.0974 0.184 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 7.81e-01 0.0189 0.0678 0.184 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 1.02e-01 -0.176 0.107 0.184 B L1
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 8.89e-01 0.0131 0.0937 0.184 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 1.75e-01 -0.15 0.11 0.184 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 8.79e-03 0.21 0.0793 0.184 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 2.84e-01 0.0953 0.0887 0.184 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 6.08e-02 -0.168 0.0893 0.184 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 7.49e-01 0.0232 0.0727 0.184 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 8.16e-02 -0.179 0.102 0.184 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 1.45e-01 -0.103 0.0702 0.184 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 8.63e-01 -0.016 0.0926 0.184 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 1.15e-03 0.289 0.0877 0.184 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 9.17e-01 0.0104 0.0992 0.184 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0996 0.1 0.184 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 7.07e-01 0.0359 0.0954 0.184 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 8.69e-03 -0.278 0.105 0.184 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0461 0.0831 0.184 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0768 0.106 0.184 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 6.17e-01 0.0497 0.099 0.185 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 5.01e-01 0.0689 0.102 0.185 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0105 0.105 0.185 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0476 0.0819 0.185 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 2.79e-01 -0.124 0.114 0.185 DC L1
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 5.42e-01 0.061 0.1 0.185 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 6.13e-01 0.0505 0.0997 0.185 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 7.60e-02 0.171 0.0959 0.184 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 6.13e-01 0.051 0.101 0.184 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0356 0.0974 0.184 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0118 0.0659 0.184 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0672 0.104 0.184 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 3.45e-02 0.18 0.0846 0.184 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0051 0.0838 0.185 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 2.79e-02 0.215 0.0972 0.185 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 9.09e-01 0.00924 0.081 0.185 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 5.82e-01 0.0479 0.0869 0.185 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 3.06e-01 -0.111 0.108 0.185 NK L1
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 2.75e-01 0.105 0.0963 0.185 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 8.10e-01 0.0283 0.117 0.185 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 7.47e-01 0.0302 0.0936 0.184 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 8.95e-01 0.0124 0.094 0.184 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0348 0.096 0.184 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 6.05e-02 0.156 0.0824 0.184 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 2.66e-01 -0.082 0.0735 0.184 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0256 0.0639 0.184 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 2.02e-01 -0.145 0.113 0.184 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 7.77e-02 0.227 0.128 0.168 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0393 0.124 0.168 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 2.81e-01 0.124 0.115 0.168 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0105 0.121 0.168 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 8.62e-01 0.0206 0.118 0.168 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0137 0.128 0.168 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 8.93e-01 0.0152 0.112 0.168 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00693 0.113 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 2.17e-01 -0.142 0.114 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0201 0.11 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 5.81e-02 0.175 0.092 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0751 0.11 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 2.44e-01 -0.129 0.11 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 2.70e-01 -0.121 0.109 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0121 0.11 0.183 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 6.12e-01 0.0569 0.112 0.183 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 2.43e-01 -0.123 0.105 0.183 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0254 0.1 0.183 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 2.49e-01 -0.132 0.114 0.183 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0867 0.115 0.183 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 2.35e-01 -0.135 0.113 0.183 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 6.80e-02 0.203 0.111 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 3.11e-01 0.114 0.112 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 7.09e-01 0.0401 0.107 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0153 0.0827 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 2.25e-01 -0.133 0.109 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 2.79e-01 0.104 0.0962 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 7.77e-01 0.0332 0.117 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 1.74e-01 0.151 0.11 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0725 0.116 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 9.92e-01 0.00117 0.111 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 6.80e-01 0.0442 0.107 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 6.44e-02 -0.214 0.115 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0417 0.11 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 3.47e-01 -0.109 0.115 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0299 0.111 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0121 0.117 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 3.48e-01 0.096 0.102 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0865 0.106 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 8.16e-01 0.0264 0.113 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 3.60e-01 0.0986 0.107 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 6.70e-01 0.0459 0.107 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 6.11e-02 0.169 0.09 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 2.42e-01 0.115 0.0982 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 2.37e-01 -0.115 0.0965 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00244 0.0856 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 6.65e-02 -0.191 0.104 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0474 0.0799 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0454 0.104 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 1.65e-02 0.226 0.0934 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 9.73e-01 0.00366 0.11 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 2.04e-01 -0.124 0.097 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 8.14e-01 0.0223 0.0948 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 2.71e-01 -0.123 0.111 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 8.75e-02 -0.156 0.091 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 6.18e-01 -0.054 0.108 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 1.53e-01 0.161 0.112 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 9.94e-01 0.000783 0.113 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0349 0.11 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0723 0.107 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 2.31e-01 -0.132 0.11 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 1.80e-02 -0.246 0.103 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00839 0.114 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 9.82e-02 0.171 0.103 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0935 0.11 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 7.32e-01 0.036 0.105 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 3.49e-01 -0.105 0.111 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 8.12e-01 0.0275 0.116 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0655 0.104 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 2.19e-01 -0.146 0.118 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 1.56e-05 0.437 0.0987 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 1.38e-01 0.158 0.106 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 6.60e-01 0.0486 0.11 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 2.82e-01 0.114 0.106 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 1.34e-03 -0.341 0.105 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 1.10e-01 -0.145 0.0902 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0116 0.101 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 8.46e-01 0.0222 0.114 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 3.90e-01 -0.099 0.115 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 3.42e-01 -0.107 0.112 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 3.68e-01 0.104 0.115 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0859 0.112 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 2.74e-01 0.118 0.107 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 9.56e-01 0.00626 0.114 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 3.32e-01 -0.114 0.117 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 9.26e-01 0.011 0.118 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 3.81e-02 -0.236 0.113 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 2.88e-01 0.117 0.11 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0666 0.119 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 1.24e-01 0.174 0.113 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 9.90e-01 0.00138 0.115 0.176 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 3.41e-01 -0.104 0.109 0.186 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0449 0.108 0.186 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 3.12e-01 -0.105 0.103 0.186 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 4.84e-01 0.0764 0.109 0.186 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0872 0.109 0.186 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 4.58e-01 0.0806 0.108 0.186 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 9.39e-01 0.00864 0.112 0.186 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 1.89e-01 0.147 0.111 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0311 0.115 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 7.42e-01 0.0328 0.0994 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 9.90e-01 0.00146 0.111 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 7.49e-01 0.0371 0.116 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 2.03e-01 0.152 0.119 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0887 0.114 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0175 0.0857 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 2.73e-01 0.119 0.108 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0505 0.0945 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 2.92e-01 -0.101 0.0959 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0759 0.109 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 7.34e-01 0.0361 0.106 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0982 0.118 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 1.93e-01 0.152 0.116 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 2.67e-01 0.134 0.121 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 8.17e-01 0.0215 0.0927 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 3.39e-01 -0.103 0.108 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 1.81e-01 -0.151 0.113 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 9.78e-01 0.00329 0.119 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 3.75e-01 0.0956 0.108 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0386 0.0956 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 3.73e-01 0.0964 0.108 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 3.87e-01 0.0866 0.1 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 6.49e-02 0.189 0.102 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0282 0.106 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 3.55e-02 0.234 0.11 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 1.37e-01 0.168 0.112 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 1.28e-01 0.207 0.135 0.167 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 5.30e-01 0.0902 0.143 0.167 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 4.35e-02 -0.307 0.15 0.167 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 6.47e-01 0.0613 0.133 0.167 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 5.59e-02 -0.253 0.131 0.167 PB L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 6.17e-01 0.0666 0.133 0.167 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 3.42e-01 0.139 0.146 0.167 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 5.57e-01 -0.062 0.105 0.18 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0663 0.107 0.18 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 9.83e-01 0.00224 0.108 0.18 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0506 0.0942 0.18 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 7.70e-01 0.0277 0.0946 0.18 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0608 0.0649 0.18 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 8.06e-01 0.027 0.11 0.18 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0178 0.109 0.184 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 7.24e-01 0.0411 0.116 0.184 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 2.01e-01 -0.136 0.106 0.184 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 2.93e-01 0.115 0.109 0.184 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 9.53e-02 0.19 0.113 0.184 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 2.63e-01 -0.123 0.11 0.184 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 2.74e-01 0.119 0.109 0.184 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0699 0.106 0.185 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 5.93e-01 0.0578 0.108 0.185 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 7.34e-01 0.0361 0.106 0.185 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0437 0.092 0.185 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 3.65e-01 -0.106 0.116 0.185 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 6.92e-01 0.0412 0.104 0.185 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 4.82e-02 0.184 0.0928 0.185 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 4.01e-02 0.207 0.1 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 7.38e-01 0.0339 0.101 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 2.23e-01 -0.13 0.106 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0332 0.0751 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 1.40e-01 -0.157 0.106 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 2.50e-01 0.108 0.0935 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0107 0.111 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 4.21e-01 0.091 0.113 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 6.47e-01 0.048 0.105 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 5.17e-01 0.0588 0.0906 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 1.49e-01 0.147 0.102 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 5.01e-01 0.071 0.105 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 8.39e-01 0.0245 0.12 0.194 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 5.32e-01 0.0803 0.128 0.194 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 4.96e-01 0.0857 0.126 0.194 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 1.56e-01 0.17 0.119 0.194 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 7.34e-01 0.0434 0.128 0.194 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 3.76e-01 -0.107 0.121 0.194 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 3.66e-01 -0.114 0.125 0.194 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 3.84e-01 0.0987 0.113 0.182 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00993 0.106 0.182 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 8.48e-02 0.185 0.107 0.182 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 6.71e-01 0.0438 0.103 0.182 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 2.86e-02 -0.247 0.112 0.182 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0739 0.115 0.182 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 7.43e-02 0.182 0.101 0.183 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 1.29e-01 -0.17 0.112 0.183 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 5.52e-01 0.0657 0.11 0.183 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0866 0.103 0.183 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 9.45e-01 0.00745 0.108 0.183 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 3.48e-01 0.103 0.11 0.183 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 3.71e-01 0.11 0.123 0.175 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0351 0.12 0.175 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 2.97e-01 -0.128 0.122 0.175 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 9.93e-01 0.00092 0.11 0.175 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0312 0.123 0.175 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 8.25e-01 0.0277 0.125 0.175 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 5.91e-01 0.0587 0.109 0.175 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 6.78e-01 0.0435 0.105 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 3.47e-01 -0.109 0.116 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 5.78e-01 -0.056 0.1 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 8.76e-02 0.138 0.0807 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0993 0.107 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0425 0.104 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 1.03e-01 -0.181 0.111 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 2.62e-02 0.241 0.108 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 4.90e-01 0.0775 0.112 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 6.10e-01 0.0535 0.105 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0408 0.08 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 2.09e-01 -0.142 0.113 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 3.88e-01 0.084 0.097 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0606 0.114 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 1.31e-01 0.156 0.103 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 7.97e-01 0.0258 0.1 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0899 0.101 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00389 0.0697 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0106 0.103 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 1.43e-01 0.129 0.0876 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 3.93e-02 0.201 0.097 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0685 0.111 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 6.07e-02 0.206 0.109 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0552 0.0937 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 2.00e-01 -0.139 0.109 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 2.86e-01 0.109 0.102 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -210666 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00934 0.0851 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 15170 sc-eQTL 6.15e-02 0.19 0.101 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 694359 sc-eQTL 7.03e-01 0.035 0.0915 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 598613 sc-eQTL 4.27e-01 0.0726 0.0912 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -210976 sc-eQTL 2.88e-01 -0.115 0.108 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 946448 sc-eQTL 1.86e-01 0.13 0.0978 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -140627 sc-eQTL 5.96e-01 0.0634 0.119 0.185 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 \N -210666 2.04e-06 2.3e-06 3.38e-07 1.53e-06 5.29e-07 7.89e-07 1.3e-06 6.98e-07 1.8e-06 8.51e-07 1.96e-06 1.37e-06 3.33e-06 9.31e-07 6.98e-07 1.54e-06 1.06e-06 1.89e-06 1.04e-06 1.31e-06 1.11e-06 2.67e-06 2e-06 1.06e-06 2.68e-06 1.21e-06 1.27e-06 1.4e-06 1.8e-06 1.64e-06 1.07e-06 3.41e-07 5.18e-07 1.22e-06 9.38e-07 9.27e-07 7.83e-07 4.49e-07 1.09e-06 3.79e-07 2.22e-07 2.7e-06 3.74e-07 2.07e-07 3.04e-07 3.08e-07 7.71e-07 2.4e-07 1.56e-07